Glycolysis is a defining metabolic marker in multiple biological systems. Monitoring glycolysis by measuring the extracellular flux of H+ is common, but requires correction to be quantitative and unambiguous. Here, we demonstrate how to gather and correct extracellular flux data to distinguish between respiratory and glycolytic sources of extracellular acidification.
Extracellular measurement of oxygen consumption and acid production is a simple and powerful way to monitor rates of respiration and glycolysis1. Both mitochondrial (respiration) and non-mitochondrial (other redox) reactions consume oxygen, but these reactions can be easily distinguished by chemical inhibition of mitochondrial respiration. However, while mitochondrial oxygen consumption is an unambiguous and direct measurement of respiration rate2, the same is not true for extracellular acid production and its relationship to glycolytic rate 3-6. Extracellular acid produced by cells is derived from both lactate, produced by anaerobic glycolysis, and CO2, produced in the citric acid cycle during respiration. For glycolysis, the conversion of glucose to lactate– + H+ and the export of products into the assay medium is the source of glycolytic acidification. For respiration, the export of CO2, hydration to H2CO3 and dissociation to HCO3– + H+ is the source of respiratory acidification. The proportions of glycolytic and respiratory acidification depend on the experimental conditions, including cell type and substrate(s) provided, and can range from nearly 100% glycolytic acidification to nearly 100% respiratory acidification 6. Here, we demonstrate the data collection and calculation methods needed to determine respiratory and glycolytic contributions to total extracellular acidification by whole cells in culture using C2C12 myoblast cells as a model.
이 방법의 전체 목표는 정확하게 유속 세포 분석을 이용하여 세포의 당분 속도를 측정하는 방법이다. 세포 외 산성화하여 당분 레이트의 정량적 측정은 많은 실험을 원하는 종점이다. 그러나, 세포 외 산성화의 총 비율은 두 성분의 합이다 : 호흡기 산성화, CO (2 CO 3 다음 HCO 3 해리되어 H로 촉촉 – + H +) (2)의 형태로, 그리고 당분 산성화 형태 + 시간 + – 락 테이트.
총 세포 외 산성화에 CO 2의 기여는 최근까지 여기에 사용되는 측정 플랫폼, XF24 분석기 7 무시할 수있다. 그러나, 2는 세포 외 산성화 4-5의 주요 원인이 될 수있는 CO 여러 다른 시스템에서 명백하다. 다수의 논문이 사기꾼을 인정기여도를,하지만 산 3,8,9을 – 유래 이산화탄소의 직접 정량을 시도하지 않습니다. 우리는 최근에 이산화탄소 생산이 시스템 6 세포 외 산성화의 중요한 원천이다 정량적으로 보여 주었다. 포도당 분해 대사에서 CO 2를 생성 다중 대사 경로도 있지만 게다가, 사람들은 시트르산 사이클에서 매트릭스게나 의해 수행은 압도적 기여자와 모든 다른 소스는 실험 오차 6 내에 CO 2의 양을 생성한다.
이산화탄소 생산을 보정하지 않고, 세포 외 산성화 따라서 당분 속도의 모호한 지표 및 정량적으로 사용할 수 없습니다. 이전 공보 호흡기 CO 2에도 일반적으로 주로 당분 6을 사용하는 것으로 세포에서, 전체 산성화 신호의 대부분을 포함하는 여러 인스턴스를 강조한다. 또한,총 산성화 호흡기 CO 2 기부는 실험의 다른 부분 동안 당분 레이트 정확한 비교 CO 2 보정이 필요하다는 보여주는 공통 대사 프로파일 실험 과정 중에 광범위하게 변한다.
세포 외 산성화 속도를 이용하여 세포의 당분 속도를 측정하기 위해, 생성 된 총 H의 +의 변화 pH 변화로 변환하고, 시트르산 회로의 동작 동안 방출 CO 2에 의한 세포 외 산성화를 감산 할 필요가있다. 여기서는 (O 2 농도의 세포 외 변화로부터) 및 CO 2 제조 (pH의 외 변경 및 보정 분석 배지의 완충력부터) 외 양성자 생성 속도를 측정하기위한 간단한 방법을 설명하고, 당분 레이트를 계산하는 방법을 보여 이러한 측정을 사용.
이 방법은 강도 락 테이트 생산에 의해 정의 된대로 올바르게 당분 속도를 계산하는 데 사용하여 세포 외 산성화 측정 유틸리티 ENS. 호흡기 CO 2 (또는 락트산의 직접 측정)에 대한 보정없이 그것이 판별 불가능하면과 총 산성화 레이트 락트산 생산 직접 측정으로 전체 세포 외 산성화를 이용해 실험 해석 교란, 당분 레이트를 반영 어느 정도이다.
용 계산
이산화탄소와 젖산은 실험 오차 내에서,이다, 근육 모세포의 세포 6 실험을 기반으로 세포 외 산 생산에 두 참여자,. 따라서, 총 세포 외 산성화 (PPR, 양성자 생산 속도)의 속도는 다음과 같이 정의 될 수있다 :
PPR의 TOT = PPR RESP + PPR의 glyc의 식 (1)
. _content "> TOT = 총, RESP = 호흡은, glyc = 당분 당분 PPR은 이렇게이다 :PPR의 glyc = PPR TOT – PPR RESP 식 (2)
이리,
中, TOT = ECAR의 TOT / BP 식 3
여기서 ECAR = 세포 외 산성화 속도 (MPH / 분), 및 BP = 완충력 (MPH / pmol의 H +의 7 μL에서), 반면
PPR RESP = (10의 pH – 피크 1 / (1 + 10의 pH – 피크 1)) (최대 H + / O 2) (OCR TOT – OCR 부패 / MYX) 식 (4)
여기서 K 1 = 이산화탄소 수화와 HCO 3 해리의 결합 평형 상수 – + H +; 최대 H + / O 2 = 일전자 CO 포도당 (6)의 완전 산화 같은 특정 대사 변환 2 유래 산성화; OCR = 산소 소비 속도 (pmol의 O를 2 / 분), 그리고 OCR 부패 / MYX = 비 미토콘드리아 OCR.
수학 식 4의 (미토콘드리아 호흡 독극물 로테 논 및 myxothiazol에 내성 OCR로 정의) 및 최대 H 차지 + 각각의 기판 (최대 H + / O 2 소비 O 2 당 생성 비 미토콘드리아 OCR을 감산함으로써 미토콘드리아 OCR을 분리 ()) 6 참조뿐만 아니라 실험 온도 및 산도 (10 산도 – 피크 1 / (1 + 10 산도 – 피크 1 H의 + 상승을주는 CO 2의 비율). 글루코스의 전체 산화 미토콘드리아 산소 소비율 (OCR)이 CO 2 생성 속도에 정확히 동일하다. 세포 광속 측정의 제한된 분석 부피, CO 2 농산물D는 호흡에 의한 분석 배지에 갇혀 유지된다. H + + – 포획 CO 2 대부분이어서 HCO 3 해리되어 H 2 CO 3로 수화. 작은 부분 용해 남아 있지만 수화하지 않으며, HCO 3 CO 2 수화와 해리의 결합 평형 상수에 의해 열역학적으로 지시로 다른 작은 부분은, 수화하지만 해리 아니다 – + H + 실험 온도 (37 ° C) 및 pH에서 (~ 7.4).
따라서, PPR의 TOT는 PPR로부터의 RESP를 감산하여 PPR g를 계산하기위한 완전한 방정식 :
PPR glyc = ECAR의 TOT / BP – (10 산도 – 피크 1 / (1 + 10의 pH – 피크 1)) (최대 H + / O 2) (OCR TOT – OCR 부패 / MYX) 식 (5)
나는N이 방법, 호흡과 당분,뿐만 아니라 연관된 ATP 생성 비율의 비율은, 정량적으로 직접적인 측정 (산소 소모, 세포 외 산성화, 완충 능력) 및 다른 필요한 값의 수입 또는 계산 (H + / O (2)로부터 결정될 수있다 , P / O, 및 평형 상수 K 1) 6. 여기에 설명 된 실험은 해마 XF24 10, 11 등의 세포 외 유출 분석기는 사용하기위한 표준 기술을 확장; 다른 세포 외 플럭스 측정 형식 (예를 들어, XF 전자 (96), 또는 XFP)를 위해, 아래의 모든 볼륨을 적절하게 조절해야한다.
분석 배지의 완충력은 교정의 pH 프로브를 사용하여 직접적으로 세포 외 플럭스 플랫폼에 개별적으로 또는 표준 곡선의 구성에 의해 측정 될 수있다. 여기서, 외 플럭스 분석 배지로 버퍼링을 측정하기위한 세 가지 옵션 모두를 사용 injecti 포함한 주어진다무 세포 샘플 웰, 또는 세포를 함유하는 웰 (제 1) 또는 외부 pH 측정 (제 2)를 이용하여 마지막 주사 포트를 사용하여 세포 외 플럭스와 분석기 포트. 예를 들어 데이터의 전체 계산에 부착 스프레드 참조.
세포 외 플럭스 인스트루먼트의 pH 검출 기능을 이용하여 버퍼링 전력을 측정하기 위해, 신호의 변화를 최소화하기 위해, 무 세포 웰을 사용하는 것이 안전하다. 그러나, 오차 내에 통계적 차이는 무 세포 및 세포 – 함유이 측정을 수행 할 때 우물 (데이터는 미도시) 사이에 존재하지 않는다. 주 : 단계 1.7에 기재된 변이는 잡음이 신호의 단점과 함께, 추가의 화합물 또는 세포의 존재에 의해 부여되는 버퍼링에 대한 전위 변화를 차지하는 장점을 운반한다. 그러나, 상기 한 바와 같이, 큰 차이는 표 1에 도시 된 무 세포 간의 설계 계산 완충력에서 발견되었고여기에 기술 된 실험 조건으로 표 2의 실험 후 디자인.
또한, 작은 ΔpH 범위 (<0.4 단위, 실험적으로 최고 0.2 단위로 제한)을 통해, 선형 기울기는 Δ의 MPH / pmol의 H를 플롯하여 얻은 + 적절하게 ΔpH와 [시간 +] 사이의 대수 관계가 가깝다. 이 표준 곡선의 기울기에 따라서 pH를 7 μL / nmol의의 H +의 피 시험 분석 배지의 완충력을 나타내고, 또는 마일 / pmol의 H 종 + 7 μL이다. 우리는 중간 버퍼링 전력을 증가 또는 측정 시간 동안 0.2의 pH 변화 부 초과 샘플 세포 밀도를 감소시키는 추천. 측정 시간은 또한 감소 될 수 있지만, 이는 정상 상태의 산성화 속도를 단축 율 계산에 오류를 초래할 수있다.
세포 외 산성화는 세포 신진 대사 속도를 쉽게 측정 지표이다. (락트산 생산에 의해 정의 됨) 적절히 그것을 분석 배지의 완충력을 아는 것이 중요하다 셀룰러 해당 작용의 속도를 결정하고, 생산 속도를 프로톤 산소 소비 및 산성화의 세포 외 플럭스 측정 변환. 이 계산을 행함으로써, 시트르산 사이클에 출시 CO 2에서 얻어진 산성화 락 테이트 생산으로 인한 산성화 남겨 감산 될 수있다.
이 보정에 대한 완충력을 측정하기 위해 여기에 제공된 여러 가지 방법이 서로 다른 장단점을 가지고. 산도 프로브를 사용하여 외부 측정 고도로 정확하고 재현성이지만 분석 플레이트, 분석 중에 화합물 첨가 또는 t의 존재에 포함 형광체에 의해 도입 pH를 검출 작은 차이를 반영하지 않을그는 세포 그 자체. 인 – 판 pH 측정은 이러한 문제를 해결뿐만 아니라, 실험적인 소음의 변화도 소개합니다.
ECAR에 CO 2 보정은 처음 당분 레이트 모호 정량 계산이 가능하게하고, 실험의 과정 전체에 ECAR 호흡과 당분 기여도의 변동을 보여준다. 수학 식 5 및 OCR, ECAR의 측정치를 이용하여, 전력을 버퍼링, 당분 레이트 제공된 간단한 스프레드 시트 (표 6)를 사용하여 계산 될 수있다. 6을 원하는 경우,이 비율은 사후 락트산 측정에 의해 검증 될 수있다. 오탄당 포스페이트 경로는 고도로 활성 인 세포, 예컨대 6 aminonicotinamide 같은 경로 억제제의 사용은 당분 레이트를 분리하는 데 유용 할 수있다. 모두 CO 2의 기여의 계산 – 총과 젖산 파생 H +를 세포 외 산성화 속도와 산소 Consumpt 측정이온 비율은 신진 대사 활동에 대한 강력한 양적 진술을하는 세포 외 플럭스 데이터를 사용하기위한 매우 중요한 도구입니다.
버퍼링 전력을 측정하고, 조사 및 원하는 데이터에서 세포 외 플럭스 실험을 최적화하기위한 각종 변형을 포함하여 여기에 기재된 절차를 사용하여, 그대로 세포에서 해당 작용의 비율은 실험 조건의 넓은 범위에 따라 정량화 될 수있다. 이 방법은 폴리스티렌 표면 (에 부착 될 수 있거나 또는 세포 소기관)에 접착 배양에서 성장할 수있는 세포에 한정되어있다. 배양 된 세포는 균질하고 합류 할 때 유용한 데이터가 여전히 이러한 조건의 범위에서 얻어 질 수 있지만이, 가장 신뢰할 수있다. 계산은 K 세포가있는 경우에는 다른 기판과 부분 산화 6 이상 전체 산화 0.65-1.0 최대 H + / O 등의 2 범위, 세포의 신진 대사에 대한 약간의 지식이 필요합니다nown 포도당을 산화시키기 위해, 1.0의 값을 가정 할 수있다.
시스템에서 사용될 때 모든 대사 특성화와 관련이,이 방법이 특히 유용 할 수 있지만되는 호흡기 및 당분 해 대사 사이의 변화는 세포 ATP 공급 줄기 세포 및 종양 – 유도 된 암세포의 특성을 포함하여, 중요한 표현형이다 유지한다. 이들과 다른 상황에서 대사 제어의 변화를 이해하는 것은 이러한 세포 유형의 실험 설계 및 분석의 정교함과 정확성의 큰 학위를 허용합니다.
The authors have nothing to disclose.
We thank David A. Ferrick and David G. Nicholls for contributing to project conception and presentation, Renata L.S. Goncalves and Akos A. Gerencser for data not shown here and for helpful discussions, Barbara Liepe for XF24 consumables, and Andy Neilson for input in developing Eq. (5).
Pherastar FS | BMG | n/a | microplate reader |
Seahorse XF-24 | Seahorse Bioscience | n/a | extracellular flux instrument |
Seahorse XF assay plate | Seahorse Bioscience | V7-PS | consumable |
XF Calibrant | Seahorse Bioscience | 100840-000 | solution |
HCl standard | Sigma | 38280 | chemical |
oligomycin | Sigma | O4876 | chemical |
FCCP | Sigma | C2920 | chemical |
Rotenone | Sigma | R8875 | chemical |
Myxothiazol | Sigma | T5580 | chemical |
DMEM | Corning | 10-013-CV | medium component |
FBS | Corning | 35-010-CV | medium component |
penicillin/streptomycin | Corning | 30-002-CI | medium component |
carbonic anhydrase | Sigma | C2624 | chemical |
96-well assay plate | Corning | CLS3991 | consumable |
NAD+ | Sigma | N7004 | chemical |
LDH | Sigma | L1254 | chemical |