Mouse embryonic fibroblast can be reprogrammed into induced pluripotent stem cells at low efficiency by the forced expression of transcription factors Oct-4, Sox-2, Klf-4, c-Myc. The rare intermediates of the reprogramming reaction are FACS isolated via labeling with antibodies against cell surface makers Thy-1.2, Ssea-1, and Epcam.
Mature cells can be reprogrammed to a pluripotent state. These so called induced pluripotent stem (iPS) cells are able to give rise to all cell types of the body and consequently have vast potential for regenerative medicine applications. Traditionally iPS cells are generated by viral introduction of transcription factors Oct-4, Klf-4, Sox-2, and c-Myc (OKSM) into fibroblasts. However, reprogramming is an inefficient process with only 0.1-1% of cells reverting towards a pluripotent state, making it difficult to study the reprogramming mechanism. A proven methodology that has allowed the study of the reprogramming process is to separate the rare intermediates of the reaction from the refractory bulk population. In the case of mouse embryonic fibroblasts (MEFs), we and others have previously shown that reprogramming cells undergo a distinct series of changes in the expression profile of cell surface markers which can be used for the separation of these cells. During the early stages of OKSM expression successfully reprogramming cells lose fibroblast identity marker Thy-1.2 and up-regulate pluripotency associated marker Ssea-1. The final transition of a subset of Ssea-1 positive cells towards the pluripotent state is marked by the expression of Epcam during the late stages of reprogramming. Here we provide a detailed description of the methodology used to isolate reprogramming intermediates from cultures of reprogramming MEFs. In order to increase experimental reproducibility we use a reprogrammable mouse strain that has been engineered to express a transcriptional transactivator (m2rtTA) under control of the Rosa26 locus and OKSM under control of a doxycycline responsive promoter. Cells isolated from these mice are isogenic and express OKSM homogenously upon addition of doxycycline. We describe in detail the establishment of the reprogrammable mice, the derivation of MEFs, and the subsequent isolation of intermediates during reprogramming into iPS cells via fluorescent activated cells sorting (FACS).
Эмбриональных стволовых (ЭС) клетки получают из внутренней клеточной массы эмбриона на стадии бластоцисты 1. При соответствующих условиях культивирования они самообновлению и остаются плюрипотентные. В 2006 году Яманака и его коллеги показали, что зрелые клетки могут быть перепрограммированы в так называемый индуцированных плюрипотентных стволовых (плюрипотентных) клеток путем принудительного выражения факторов транскрипции Oct-4, Klf-4, Сокс-2, С-Мус (OKSM) 2. плюрипотентных клеток, как ЭС клеток, может привести к всех типов клеток организма, тем не менее, они свободны от этических ограничений, окружающих поколение ЭС клеток 3. Кроме того, IPS клетки несут обещание персонализированной регенеративной медицины и несет в себе огромный потенциал для таких приложений, как моделирования заболевания и в пробирке наркотиков скрининга 4,5. Для того, чтобы перепрограммировать технику для выполнения этого потенциала, основной механизм ядерного перепрограммирования необходимо в полной мере понимать. Тем не менее, усилия препарировать перепрограммирования погладитьhway были затруднены тем, что только очень небольшое число клеток перепрограммировать (0,1-1%). Успешно перепрограммирования фибробластов были зарегистрированы для прохождения различных серии событий, включая мезенхимальных к эпителиальной перехода 6-10 и, в завершающей стадии перепрограммирования, активации эндогенного основной плюрипотентности сети 11-14. Мы и другие 12,13,15-17 недавно идентифицирован набор маркеров клеточной поверхности, который позволяет для разделения редких промежуточных от огнеупорной объемной населения. Перепрограммирование мышиных эмбриональных фибробластов (MEFs) претерпевают изменения в экспрессии Thy-1.2, Ssea1 и EpCAM (среди прочих) во время 2-недельного процесса перепрограммирования 15. На ранних этапах перепрограммирования подмножество MEFs вниз-регулируют экспрессию фибробластов идентичности маркера (Твое-1.2), а затем начать выражая плюрипотентности связанных маркер SSEA-1 12. Во время заключительных этапах перепрограммирования Ssea1-позитивных клеток Reactivели эндогенные гены плюрипотентности такие как Oct-4 10-13,15. Этот последний переход отмечен на поверхности клетки экспрессии этого из EpCAM (рисунок 1) или в более поздней стадии PECAM 15. В последнее время О'Мэлли и др. Сообщили об использовании CD44 и ICAM1 в качестве альтернативы или дополняют Твоему-1.2 и SSEA-1 для идентификации перепрограммирования промежуточных. Ранее мы уже FACS извлечены перепрограммирования промежуточных со дня 0, 3-й день, 6-й день, День 9 и 12 день перепрограммирования культур, а также от установленных клеточных линий плюрипотентных основе этих маркеров клеточной поверхности 15,18. Для ниже описанной системы и условий перепрограммирования мы показали на одном уровне клетки, что, хотя население тихие однородная, есть определенная степень неоднородности в определенных промежуточных популяций. Следует отметить, что только подмножество клеток в этих популяциях могут прогрессировать к соответствующему следующему STAGE процесса перепрограммирования и порождают колоний плюрипотентных клеток в различной эффективностью, которые широко характеризуются ранее 15,19. Кроме того, эффективность перепрограммирования этих популяций будет зависеть также и от повторных гальванических и культуры условиях. Для увеличения экспериментальную воспроизводимость мы используем перепрограммируемой штамм мыши, которая была разработана специально, чтобы выразить транскрипции трансактиватор (m2rtTA) под контролем локуса Rosa26 и полицистронной OKSM кассеты под контролем доксициклина реагировать промоутер 20,21. Используя эту модель мыши обходит нежелательные побочные эффекты традиционных вирусных методов генерации клеток IPS, т.е., неоднородной отправной населения с клетки к изменчивости клеток в количестве и расположении интеграции сайтов вирусных вставок. Два трансгенные линии мышей (OKSM, m2rtTA), доступные как гомозиготных учредителей животных в лаборатории Джексона, должны быть скрещены в целях установления reprogrammable модель мыши (рисунок 2). В этой рукописи мы подробно описывают, как получить MEFs, генерировать плюрипотентных клеток, и изолировать перепрограммирования промежуточные на различных этапах процесса преобразования по FACS.
Для того, чтобы успешно перепрограммировать MEFs в плюрипотентных клеток и очистить перепрограммирования промежуточные на высоком количестве важно быть в курсе факторов, которые оказывают влияние на общую эффективность. В частности партия FBS используется в дополнение к плюрипотентных СМИ может иметь отрицательное влияние. В общих положительных впечатлений были сделаны с эмбриональными стволовыми квалифицированных FBS (ES) клеток, но пакетном тестирования сывороток от различных поставщиков может определить более дешевую альтернативу.
Другим фактором, который влияет на эффективность перепрограммирования является генотип MEFs 15,20. Хотя MEFs, полученных от мышей, гетерозиготных (HET) как для OKSM и локуса m2rtTA ли перепрограммировать, homozygousity на одном или обоих локусов приводит к более высокой эффективности перепрограммирования. Действительно, MEFs, полученные из потомства OKSM и m2rtTA крестов показывают увеличение эффективности перепрограммирования в следующем порядке (OKSM / m2rtTA): гет / гет <гомо / гет <гет / гомо <гомо /гомо (обратите внимание, что цифры, приведенные в таблице 1, для гет / гет животных). В тех редких случаях мужчины гомо / гомо животное идентифицировано, гарем спаривания с несколькими самками m2rtTA можно настроить. Все потомство от этих крестов будет Het / гомо для OKSM / m2rtTA локусов, соответственно. Кроме того, быстрое генотипирование пометов рекомендуется как крупные пометы получаются при использовании более молодых мышей для разведения (6-15 недельного возраста).
Кроме того, использование низких MEFs прохода для перепрограммирования подчеркивается 23. Если MEFs были получены и разложить в нормоксических культуры ткани инкубаторе мы настоятельно рекомендуем использовать только эти клетки до прохождения 2. Однако, если экспериментатор имеет доступ к инкубатора низкий кислорода (5% кислорода) для вывода и расширения MEFs, цифры выше, чем 3-прежнему будет приносить хорошие результаты 23 прохождение.
В случае экспериментатор сталкивается с проблемами, связанные с перепрограммированием, как указано, наиболее вероятные объяснения высокие цифры прохождение в момент DOX того, неправильное генотипа мышей или использования FBS, которая не способствует генерации IPS клеток. Тем не менее, в редких случаях мы наблюдали, что MEFs не смогли перепрограммировать даже при идеальных условиях. В этих случаях спонтанное заново удаление в открытой рамки считывания в m2rtTA был идентифицирован как основной причине.
Эта методика была успешно адаптирована для извлечения SSEA-1 + промежуточные через изоляции магнитного клеток (MACS). Существует явное преимущество времени при помощи MACS, однако, чистота SSEA-1 + клеточных популяций 'уменьшается до 80-90%, а не больше, чем 95%, что в зависимости от типа эксперимента клетки, предназначенные для может представлять проблемой. Таким образом, вариант заключается в использовании MACS для обогащения SSEA-1 + клеток с последующим FACS увеличить чистоту и / или доли их в SSEA-1 + / EpCAM + и SSEA-1 + / Epcam- клеток.
"> В то время как клетки плюрипотентных произведенные описанным протоколом и мышиной модели было показано, что плюрипотентные и эффективно содействовать всех тканях химерных животных 15,20, снижается способность производить эмбрионы полностью состоит из этих плюрипотентных клеток с помощью дополнения тетраплоидной был показали 24. Аберрантные метилирования на кластере генов Dlk-DIO3 были определены в качестве основной причины 24. Тем не менее, добавление аскорбиновой кислоты в концентрации 50 мкг / мл в СМИ во время перепрограммирования будет производить тетраплоид комплементации компетентные плюрипотентных клеток 24. Доводим до вашего сведения, что альтернативная модель перепрограммируемый мышь, сконструированные для экспрессии факторов перепрограммирования в другом стехиометрии может производить тетраплоидные компетентные плюрипотентных клеток даже в отсутствие лечения аскорбиновой кислоты 25. Тем не менее, в наших руках клеток из этого штамма перепрограммирует на значительно ниже частоты по сравнению к настоящей Методики используются режиме мышил.Методология, описанная в этой рукописи позволяет разделить перепрограммирования промежуточных от огнеупорной массы населения и должны рассматриваться как ценный инструмент разбираются и понять процесс перепрограммирования, удаляя предыдущие ограничения того, чтобы использовать unfractioned населения для профилирования (например, высокий шумовой сигнал от тугоплавких клеток). Сочетание описанных здесь антител позволяет выделения промежуточных продуктов из мышиных клеток с высокой степенью чистоты, однако, возможно, что дополнительные маркеры клеточной поверхности будут обнаружены в будущем, что позволит получить промежуточные продукты при еще более высокой чистоты. Пожалуйста, обратите внимание, что SSEA-1 выражение не является отличительным признаком человека индуцированных плюрипотентных стволовых клеток и, таким этом протоколе не может быть использован на перепрограммирование клетки человеческого происхождения. В заключение, перепрограммировать После выделения промежуточных продуктов с описанным способом, может быть использован для молекулярных анализов в том числе экспрессии Профилинг, хроматин иммунопреципитации, methylome анализа, и белковые анализы.
The authors have nothing to disclose.
Мы хотели бы выразить признательность за финансовую поддержку от Larkins Программы Монаш, а также от NHMRC КОР и проектных грантов NHMRC. Кроме того, мы хотели бы поблагодарить Сью Mei Лим за ее конструктивные предложения, Эдвина McGlinn за ее поддержку и команды Монаш Flowcore (в частности Адама Dinsdale) за помощь в производстве видео.
Anti-mouse CD90.2 (Thy1.2) Pacific Blue | eBioscience | 48-0902-82 | |
Anti-Human/Mouse SSEA-1 Biotin | eBioscience | 13-8813 | |
Streptavidin PE-Cy 7 | eBioscience | 25-4317-82 | |
Anti- Mouse CD326(Epcam) Fitc | eBioscience | 48-5791-82 | |
Sodium pyruvate | Life Technologies | 11360-070 | |
MEM Non-Essential Amino Acids (NEAA) | Life Technologies | 11140-050 | |
Embryonic Stem Cell qualified Foetal Bovine Serum (FBS) | Life Technologies | 10439024 | |
Trypsin-EDTA (0.25%) | Life Technologies | 25200-056 | |
GlutaMAX | Life Technologies | 35050-070 | |
β-Mercaptoethanol | Life Technologies | 21985-023 | |
DMSO (Dimethyl Sulfoxide) | Sigma-Aldrich | D8418 | |
Penicillin/streptomycin | Life Technologies | 15140 | |
Propidium Iodide solution (PI) | Sigma-Aldrich | P4864-10ML | |
Gelatine from porcine skin | Sigma-Aldrich | G1890 | |
Doxycyclin hyclate | Sigma-Aldrich | 33429-100MG-R | |
Leukemia Inhibitory Factor (LIF) | Millipore | ESG1107 | |
DMEM High Glucose | Life Technologies | 11960-044 | |
DPBS (Dulbecco s phosphate buffer saline) | Life Technologies | 14190-144 | |
KnockOut DMEM | Life Technologies | 10829-018 | |
Irradiated MEFs | Life Technologies | S1520-100 | |
75-cm2 Tissue culture flasks | Corning/BD Bioscience | 430641 | |
15-ml centrifuge tubes | Corning/BD Bioscience | 430791 | |
50-ml centrifuge tubes | Corning/BD Bioscience | 430829 | |
Disposable surgical blades | Disposable surgical blades | 201 | |
Cryogenic vials | Corning/BD Bioscience | 430487 | |
70 µm Cell strainer | BD Bioscience | 352340 | |
Taq DNA Polymerase | Life Technologies | 10342-020 |