Recombinant virus adéno-associés (rAAVs) vecteurs sont de plus en plus précieux pour<em> In vivo</em> Les études chez l'animal. Nous décrivons comment rAAVs peuvent être produites dans le laboratoire et la manière dont ces vecteurs peuvent être titrés de donner une lecture précise du nombre de particules infectieuses produites.
Ces dernières années, adéno-associé recombinant vecteurs viraux (AAV) sont devenus de plus en plus précieux pour les études in vivo chez l'animal, et sont également actuellement testé dans des essais cliniques humains. AAV de type sauvage est un membre non-pathogène de la famille des Parvoviridae et intrinsèquement réplication déficiente. Le profil de transduction large, faible réponse immunitaire ainsi que l'expression du transgène forte et persistante obtenus avec ces vecteurs en a fait un outil populaire et versatile pour in vitro et di vivo de gènes. rAAVs peut être facilement et à moindre coût fabriqués en laboratoire et, en fonction de leur profil d'innocuité favorable, sont généralement donnés une classification de sécurité faible. Ici, nous décrivons une méthode pour la production et du titrage rAAVs chimérique contenant les protéines de capside des deux AAV1 et AAV2. L'utilisation de ces vecteurs dits chimérique combine les avantages des deux sérotypes parentale tels que les stocks de titres élevés (AAV1) et de la purificationpar chromatographie d'affinité (AAV2). Ces sérotypes d'AAV sont les mieux étudiés de tous les sérotypes AAV, et individuellement ont un modèle d'infectivité large. Les vecteurs chimériques décrites ici doivent avoir les propriétés infectieuses de AAV1 et AAV2 et peut donc s'attendre à infecter une large gamme de tissus, y compris les neurones, les muscles squelettiques, le pancréas, du rein, entre autres. La méthode décrite ici utilise purification sur colonne d'héparine, une méthode cru donner un titre plus élevé virale et plus propre que les méthodes de préparation virale de purification d'autres, comme la centrifugation à travers un gradient de chlorure de césium. De plus, nous décrivons comment ces vecteurs peuvent être rapidement et facilement titrés de donner une lecture précise du nombre de particules infectieuses produites.
vecteurs rAAV sont de plus en plus précieuse pour les études in vivo chez l'animal. Ici, nous avons décrit un protocole simple et peu coûteuse pour produire rAAVs, ce qui peut faciliter l'application généralisée de ce vecteur utile en évitant l'externalisation coûteuse de la production de virus pour les entreprises. Le protocole (basé sur la référence 1) décrit la production de chimères rAAV1 / 2 vecteurs contenant des protéines de capside des deux sérotypes parental à 4 rapports égaux. La purification des vecteurs rAAV en se liant à l'héparine colonnes repose sur l'expression des protéines de capside AAV2, mais peut être combiné avec d'autres sérotypes que AAV1 décrites ici. En outre, les AAV6 a été signalé à lier à l'héparine, mais avec une affinité réduite, et pourrait potentiellement être purifié par des colonnes d'héparine en utilisant cette procédure 5,6. Il faut noter cependant que d'autres sérotypes nécessitera différentes concentrations de NaCl pour élution sur colonne d'héparine 5,7.
Emballage génomes rAAV a été montré pour être optimal entre 4,1 et 4,9 kb avec une forte réduction de l'efficacité des emballages jusqu'à 5,2 kb 8. Cette limite de l'emballage peut être considéré comme le plus grand inconvénient du système rAAV, puisque le type spécifique de cellules régulation de l'expression du transgène est généralement réalisée par des éléments agissant en cis grands qui ne peuvent pas être logés dans les particules de petite AAV. Pour surmonter lots titre faible, tels que ceux résultant de tenter de gènes colis qui sont proches de la limite d'emballage AAV nous sommes séparés lots combinant virale concentrée à 250 ul dans un lot de 500 ul, plutôt que d'ajouter du PBS comme décrit dans l'étape 6.3. Fiable type cellulaire transduction spécifiques peuvent être obtenus en combinant Cre-pilote des souris et des cassettes rAAV conditionnelle (voir ci-dessous) pour éviter d'étirer à la limite de l'emballage.
Fait à noter, tout ce protocole tente de fournir facile à suivre les instructions sur la production de t hauteITER rAAV, elle nécessite la présence de fragments de protéine de capside AAV2 pour la purification par chromatographie d'affinité d'héparine. Sérotypes autres que AAV2 doit être purifiée en utilisant des procédures de rechange 9. Un avantage de purification sur colonne d'héparine est il est censé produire des vecteurs AAV qui ont un taux plus infectieux que ceux produits en utilisant un gradient de chlorure de césium 10. Cependant, il ya aussi quelques inconvénients à cette méthode. Par exemple, d'autres protéines qui se lient l'héparine peut également être présents dans le stock viral purifié. Alors que le tropisme de l'héparine purifiée vecteurs peuvent être influencés par le titre en vecteur 10, notre approche pour cibler spécifiquement soit 20 excitateurs ou inhibiteurs des neurones (Fig. 2) emploie Cre induit l'activation de l'expression du transgène AAV-médiatisée et est indépendante du titre. Une alternative à la purification sur colonne d'héparine est l'utilisation d'un gradient de densité iodixanol, qui produit un titre supérieur et de la préparation virale plus pur que l'utilisation deun gradient de chlorure de césium 10. Cette méthode peut également être combiné avec purification sur colonne d'héparine pour produire un vecteur qui est supérieure à 99% pur 11. Par conséquent, un examen attentif doit être pris par des groupes individuels quant à la méthode de purification virale est le meilleur pour leur application particulière aval.
Le problème le plus fréquent associé à ce protocole est faible titre viral. Dans notre expérience, cela peut généralement être attribuée à l'efficacité de transfection faible, ou l'élution du virus à partir des colonnes d'héparine. Tous les matériaux de transfection doit être à température ambiante avant la transfection, et transfections test doit être effectué à trouver les conditions optimales dans chaque laboratoire. D'autres méthodes de transfection, tels que la lipofectamine, sont très efficaces, mais peut être prohibitif. En outre, la concentration et du pH des solutions d'héparine élution de la colonne est critique pour l'élution complète des virions à partir witho colonnes d'héparinedommages ut. Un autre point important est que les cellules de conditionnement doit bien adhérer à la surface des boîtes de culture tissulaire. Si les cellules se détachent à un certain stade de la procédure, il est conseillé de mettre fin à l'expérience et le dégivrage d'un nouveau flacon de cellules.
Spatio-temporelle contrôle de l'expression du transgène chez les rongeurs est facilement réalisé en ciblant anatomiques précis et le stade de développement de l'animal. Efficace le transfert de gène AAV-médiatisée a été démontré in utero 12,13. Dans le cerveau adulte, la zone infectée avec des particules rAAV après l'injection stéréotaxique peut être réglée de très petites régions ciblées, à des domaines beaucoup plus grande, non seulement par des changements dans le titre viral mais aussi en modifiant les paramètres d'injection. Il s'agit notamment du volume et de rapidité d'injections et de l'inclusion du mannitol polyol avec la suspension de 14 virus. Le mannitol peut aussi être utilisé pour améliorer l'infection d'une variété de tissus après injection systémique rAAV 15 </ Sup>.
La capacité de conditionnement de rAAV (environ 4,7 kb) est probablement le facteur le plus limitant en termes de gènes qui peuvent être exprimées à partir de ces vecteurs viraux. Cependant, des études récentes ont montré que cela peut être partiellement surmonté par fractionnement gènes plus ou cassettes d'expression dans des vecteurs rAAV séparées et l'introduction d'une séquence de transition, initier l'expression des gènes lors des virions infectent la même cellule 16. Les niveaux d'expression des gènes portés par les vecteurs rAAV peut aussi être grandement améliorée en utilisant l'auto-gratuit vecteurs rAAV 17. Injection stéréotaxique de vecteurs rAAV fournit une méthode rapide, peu coûteux et puissant pour induire l'expression des gènes de façon spécifique à la région. En combinaison avec deux stratégies de génération de l'interférence ARN ND 18 rAAVs peut également être utilisé pour la région spécifique du gène-assommer. rAAVs peut être combiné avec Cre-souris transgéniques ou de type cellulaire promoteurs spécifiques à atteindre et des circuits de type cellulaireSpécifiques à l'expression des gènes, permettant les manipulations génétiques à haute résolution spatiale 2,19-21, tandis rAAVs raccord avec par exemple le système Tet ajoute le contrôle temporel sur le virus de l'expression génique à médiation 22,23. Ces exemples illustrent l'énorme potentiel combinatoire de ces vecteurs et prédisent une augmentation rapide de rAAV études basées sur les années à venir.
The authors have nothing to disclose.
Name of reagent | Company | Catalogue number | Comments |
Amicon Ultra centrifugal filters | Millipore | UFC810024 | 100,000 MWCO |
Benzonase nuclease | Sigma-Aldrich | E1014 | |
Dulbeco’s modified Eagle medium (DMEM) | Invitrogen | 10567014 | Supplement with 10% FCS and 10 units/ml penicillin/100 μg/ml streptomycin |
Hek293 cells | American type culture collection | CRL-1573 | Use at passage less than 30 |
HEPES buffered saline | Sigma-Aldrich | 51558 | |
HiTrap Heparin cartridge | Sigma-Aldrich | 54836 | |
Iscove’s modified Dulbecco’s medium | Invitrogen | 12440-053 | Supplement with 5% FCS |
Sodium deoxycholate | Sigma-Aldrich | D5670 | Make fresh solution for each batch |
15 cm Tissue culture dishes | Fisher Scientific | 157150 | |
Stbl2 competent cells | Invitrogen | 10268-019 | |
Virkon solution | Fisher Scientific | NC9821357 | Leave to disinfect overnight before discarding to drain |
Table 1. Specific reagents required for protocol