Questo articolo descrive la procedura per la formazione e la visualizzazione di un biofilm batterico cresciuto all'interno di un 8-scivolo e da camera
La natura di molte malattie croniche è attribuito alla formazione di biofilm batterici che sono recalcitranti alla tradizionale terapia antibiotica. Biofilm sono comunità di batteri associati collegato a una superficie e racchiusi in una matrice. Il ruolo della matrice extracellulare è multiforme, anche facilitando l'acquisizione di nutrienti, e offre una protezione significativa contro gli stress ambientali (ad esempio risposta immunitaria). Nel tentativo di acquisire una migliore comprensione di come i batteri in un biofilm rispondere agli stress ambientali che abbiamo usato un protocollo in cui noi visualizziamo biofilm batterici che si sono formati in un 8-scivolo e da camera. I biofilm sono stati colorati con la BacLight Live / Dead macchia ed esaminate con un microscopio confocale a caratterizzare la dimensione relativa biofilm, e la struttura in diverse condizioni di incubazione. Z-stack immagini sono state raccolte tramite microscopia confocale e analizzati da COMSTAT. Questo protocollo può essere utilizzato per contribuire a spiegare il meccanismo e cinetica con cui formare biofilm, oltre a identificare i componenti che sono importanti per la struttura biofilm e la stabilità.
Comprendere il meccanismo con cui biofilm forma, così come caratterizzante la loro componenti della matrice, è un'area di grande interesse. Questo protocollo può essere usato per aiutare a identificare le proteine o altri costituenti che contribuiscono alla integrità strutturale del biofilm, così come aiutare a identificare e target le proteine che possono si prestano ad una applicazione terapeutica.
I tempi di incubazione e diluizioni nel protocollo sopra descritti sono stati stabiliti per la formazione di biofilm ottimale nontypeable da Haemophilus influenzae (NTHI). Alcuni lavori preliminari può essere necessaria per ottimizzare questi passaggi per altre specie di batteri (ad esempio diluizione iniziale e tempo di incubazione necessario per raggiungere la metà del log fase di crescita). La diluizione 1:2500 per la semina iniziale delle camere è stato creato per garantire che un biofilm robusta si svilupperebbe in camera di diapositive come indotta da questo organismo e nei tempi di incubazione ha dichiarato, senza il biofilm overgrowing la camera e / o estenuanti sostanze nutritive disponibili . Di conseguenza, la diluizione iniziale e tempi di incubazione possono o devono essere adeguate per le altre specie batteriche.
The authors have nothing to disclose.
Il lavoro è stato finanziato dalla dell'NIDCD / NIH R01DC003915 a LO Bakaletz.
Material Name | Tipo | Company | Catalogue Number | Comment |
---|---|---|---|---|
Chocolate II agar | Fisher | B21267X | ||
8-well chamber slides | Fisher | 12-656-18 | ||
BacLight Live/Dead bacterial viability kit | Fisher | NC9439023 | ||
BHI | Fisher | 211059 | ||
Hemin | Sigma | H5533 | ||
β-NAD | Sigma | N7004 | ||
Permaslip mounting media | Fisher | NC9693613 |