1Bioinformatics and Medicinal Chemistry Laboratory (LABIOQUIM),Oswaldo Cruz Rondônia Foundation, 2National Institute of Epidemiology in the Western Amazon – EPIAMO, 3Postgraduate Program in Experimental Biology,Federal University of Rondônia (UNIR), 4Doctoral Program in Sciences – IOC/Fiocruz Rondônia Cooperation: Computational Biology and Systems (BCS)
Summary
Visual Dynamicsは、Gromacsを使用した分子動力学シミュレーションの実装と学習を加速するオープンソースツールです。提示されたプロトコルでは、ACPYPEで調製したタンパク質-リガンドシミュレーションを簡単に実行するための手順と、他のシミュレーションモデルの一般的な手順をガイドします。
