1Bioinformatics and Medicinal Chemistry Laboratory (LABIOQUIM),Oswaldo Cruz Rondônia Foundation, 2National Institute of Epidemiology in the Western Amazon – EPIAMO, 3Postgraduate Program in Experimental Biology,Federal University of Rondônia (UNIR), 4Doctoral Program in Sciences – IOC/Fiocruz Rondônia Cooperation: Computational Biology and Systems (BCS)
Summary
Visual Dynamics est un outil open-source qui accélère les implémentations et l’apprentissage dans la simulation de dynamique moléculaire à l’aide de Gromacs. Le protocole présenté vous guidera à travers les étapes pour effectuer une simulation protéine-ligand préparée dans ACPYPE avec facilité et les étapes générales vers d’autres modèles de simulation.
