Visual Dynamics هي أداة مفتوحة المصدر تعمل على تسريع عمليات التنفيذ والتعلم في محاكاة الديناميات الجزيئية باستخدام Gromacs. سيرشدك البروتوكول المقدم خلال خطوات إجراء محاكاة بروتين ليجند معدة في ACPYPE بسهولة وخطوات عامة لنماذج المحاكاة الأخرى.