Ici, nous décrivons un protocole pour l’optimisation et la paramétrisation des résidus d’acides aminés modifiés avec des espèces carbonyles réactives, adaptables aux systèmes protéiques. Les étapes du protocole comprennent la conception et l’optimisation de la structure, l’attribution des charges, la construction des paramètres et la préparation des systèmes protéiques.
