Journal
/
Immunologie et infection
/
Transcriptoomanalyse met hoge doorvoer voor het onderzoeken van gastheer-pathogeeninteracties
Journal JoVE
Immunologie et infection
Author Produced
Un abonnement à JoVE est nécessaire pour voir ce contenu.  Connectez-vous ou commencez votre essai gratuit.
Journal JoVE Immunologie et infection
High-Throughput Transcriptome Analysis for Investigating Host-Pathogen Interactions
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Transcriptoomanalyse met hoge doorvoer voor het onderzoeken van gastheer-pathogeeninteracties

3,865 Views

•

14:58 min

•

March 05, 2022

DOI:

10.3791/62324-v

DOI:
10.3791/62324-v

•

14:58 min
March 05, 2022

•

3 Views
, , , , ,
1Laboratory of Pathology of Infectious Diseases, Department of Pathology, Medical School,University of São Paulo, 2Scientific Platform Pasteur USP, 3Department of Clinical and Toxicological Analyses, School of Pharmaceutical Sciences,University of São Paulo, 4Hospital Israelita Albert Einstein

Summary

Automatically generated

Het hier gepresenteerde protocol beschrijft een complete pijplijn om RNA-sequencing transcriptoomgegevens te analyseren, van ruwe reads tot functionele analyse, inclusief kwaliteitscontrole en voorbewerkingsstappen tot geavanceerde statistische analytische benaderingen.

Explore More Videos

– High-throughput Transcriptome Analysis- Host-pathogen Interactions- Quality Control- Sequencing And Annotations- Statistical And Co-expression Analysis- Molecular Degree Of Perturbation Analysis- Functional Analysis- Docker Container- Chikungunya Virus- RNA Sequencing- Reference Genome- Gene Annotation

Read Article

Cite this Article

Aquime Gonçalves, A. N., Escolano Maso, V., Maia Santos de Castro, Í., Pereira Vasconcelos, A., Tomio Ogava, R. L., I Nakaya, H. High-Throughput Transcriptome Analysis for Investigating Host-Pathogen Interactions. J. Vis. Exp. (181), e62324, doi:10.3791/62324 (2022).

Download .ris file

Copy

Share Video

.

Copy