Journal
/
Génétique
/
Metabolik Yol Bilgilerinin GWAS Analizleri için Bir Pathway Association Çalışma Aracı
Journal JoVE
Génétique
This content is Free Access.
Journal JoVE Génétique
A Pathway Association Study Tool for GWAS Analyses of Metabolic Pathway Information
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Metabolik Yol Bilgilerinin GWAS Analizleri için Bir Pathway Association Çalışma Aracı

DOI:
10.3791/61268-v

•

05:01 min

•

July 01, 2020

•

,
1Institute for Genomics, Biocomputing & Biotechnology,Mississippi State University, 2Corn Host Plant Resistance Research Unit,USDA-ARS

Chapitres

  • 00:05Introduction
  • 00:32Genome-Wide Association Study (GWAS) Data Loading
  • 00:57Load Linkage Disequilibrium (LD) Data Loading
  • 01:26Single Nucleotide Polymorphism (SNP) Assignment
  • 01:56Significant Pathway Discovery
  • 02:35Rugplot Visualization
  • 03:21Results: Representative GWAS Analyses of Metabolic Pathway Information
  • 04:21Conclusion

Summary

Traduction automatique

Traduction automatique

Araştırmacılar, Pathway Association Çalışma Aracı'nı (PAST) parlak uygulama veya R konsolu aracılığıyla çalıştırarak, ilgili metabolik yolları araştırarak genom çapındaki ilişki çalışmalarının (GWAS) sonuçlarının biyolojik anlamı hakkında daha derin bir anlayış kazanabilirler.

Tags

GWASGenome-wide Association AnalysisMetabolic PathwayPASTPathway Association Study ToolSNPsLinkage DisequilibriumGene AnnotationPathway AnalysisRug PlotsR ConsoleShiny

Article

Embed

AJOUTER À LA PLAYLIST

Usage Statistics

Vidéos Connexes

Farklı Olarak metile ölçümü<em> INS</em> Bir Biyomarker Islet β Hücre Ölümü İnsan serum Örnekleri DNA Türler

C. elegans gen ifade seviyeleri sırasında ömrü modülasyon altında geniş menzilli diyet kısıtlama tarafından kodlanmış bilginin bir miktar

Metabolik etiketleme ve Transfer RNA Macroarrays kullanarak profil oluşturma

Ultralow giriş genom Kütüphane hazırlık bir tek Tardigrade örnekten sıralama

Mitokondrial DNA metilasyonu doğru algılanması için metodoloji

Gen düzenleyici dizileri dairesel kromozom Conformation yeni nesil sıralama kullanarak yüksek üretilen iş tanımlaması yakalama (4C-seq)

Kromojenik In situ hybridization HPV Ile Ilgili baş ve boyun kanseri tanısı için bir araç ss

İnsan Genomik ve Model Organizma Genetiği Bilgilerini Entegre Eden Web Tabanlı Bir Araç olan MARRVEL'de Gezinme

Kütle spektrometresi tabanlı proteomik analizleri roman proteinler açıklayacak OpenProt veritabanı kullanarak kanonik olmayan açık okuma çerçevesi tercüme

Kromatin Etki Alanlarının De novo Oluşumunu İnceleme Yöntemi

Read Article