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Una herramienta de estudio de asociación de vías para los análisis GWAS de la información de las vías metabólicas
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A Pathway Association Study Tool for GWAS Analyses of Metabolic Pathway Information
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Una herramienta de estudio de asociación de vías para los análisis GWAS de la información de las vías metabólicas

DOI:
10.3791/61268-v

•

05:01 min

•

July 01, 2020

•

,
1Institute for Genomics, Biocomputing & Biotechnology,Mississippi State University, 2Corn Host Plant Resistance Research Unit,USDA-ARS

Chapitres

  • 00:05Introduction
  • 00:32Genome-Wide Association Study (GWAS) Data Loading
  • 00:57Load Linkage Disequilibrium (LD) Data Loading
  • 01:26Single Nucleotide Polymorphism (SNP) Assignment
  • 01:56Significant Pathway Discovery
  • 02:35Rugplot Visualization
  • 03:21Results: Representative GWAS Analyses of Metabolic Pathway Information
  • 04:21Conclusion

Summary

Traduction automatique

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Al ejecutar la Herramienta de Estudio de Asociación pathway (PAST), ya sea a través de la aplicación Shiny o a través de la consola R, los investigadores pueden obtener una comprensión más profunda del significado biológico de los resultados de su estudio de asociación de todo el genoma (GWAS) al investigar las vías metabólicas involucradas.

Tags

GWASGenome-wide Association AnalysisMetabolic PathwayPASTPathway Association Study ToolSNPsLinkage DisequilibriumGene AnnotationPathway AnalysisRug PlotsR ConsoleShiny

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