Opdagelse af CsgD-regulatoriske mål i salmonella biofilm ved hjælp af kromatin Immunopræcipitation og High-gennemløb Sequencing (ChIP-SEQ)

Kromatin immunopræcipitation kombineret med næste generations sekvensering (ChIP-SEQ) er en metode, der anvendes til at etablere interaktioner mellem transkriptionsfaktorer og de genomiske sekvenser, de kontrollerer. Denne protokol skitserer teknikker til at udføre ChIP-SEQ med bakterielle biofilmer, ved hjælp af Salmonella enterica blev typhimurium bakteriel biofilm som et eksempel.