/

/

通过旗-生物素串联纯化通过交叉链接和免疫沉淀对蛋白质-RNA相互作用进行转录组-全过程分析

Journal JoVE
Génétique

Un abonnement à JoVE est nécessaire pour voir ce contenu. Connectez-vous ou commencez votre essai gratuit.

Journal JoVE Génétique

Transcriptome-Wide Profiling of Protein-RNA Interactions by Cross-Linking and Immunoprecipitation Mediated by FLAG-Biotin Tandem Purification

Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

通过旗-生物素串联纯化通过交叉链接和免疫沉淀对蛋白质-RNA相互作用进行转录组-全过程分析

DOI:

10.3791/60730-v

•

08:46 min

•

May 18, 2020

•

Xianju Bi², Xuechun Zhang, Xiaohua Shen

¹Tsinghua-Peking Center for Life Sciences, School of Medicine and School of Life Sciences,Tsinghua University, ²Department of Molecular Biology,University of Texas Southwestern Medical Center

Chapitres

00:04Introduction
00:41Crosslinking
02:44Immunoprecipitation
05:31Dephosphorylation and PNK Treatment
06:53Results: WDR43 and LIN28 ^FbioCLIP-seq
08:17Conclusion

Summary

Traduction automatique

在这里，我们提出了一个改进的 CLIP-seq 协议， ^{称为 Fbio}CLIP-seq 与 FLAG 生物素串联纯化，以确定哺乳动物细胞中RNA结合蛋白（RBPs）的RNA靶点。

Tags

Protein-RNA Interactions CLIP-seq FLAG-Biotin Transcriptome-wide Profiling RBPs Mammalian Cells Direct Protein-bound RNAs Isotope-free SDS-PAGE Membrane Transfer Mouse Embryonic Stem Cells UV Cross-linking Cell Lysis DNase I Treatment FLAG Beads FLAG Peptide Elution

Article

Embed

AJOUTER À LA PLAYLIST

Usage Statistics

Vidéos Connexes

使用染色质免疫沉淀分析c-KIT配体启动子

用 5-Bromouridine 标记和免疫沉淀 RNA 合成的研究

启动子捕获高分辨率, 全基因组的启动子交互分析

小鼠棕色脂肪组织的染色质免疫沉淀

多点PCR和毛细血管电泳对鱼类致病菌的多点变量数串联重复分析

CRISPR/Cas9 核糖核酸蛋白介导的精确基因编辑通过管电穿孔

定量细菌中蛋白质-RNA结合的测定

RNA足迹的识别:通过RNA免疫沉淀在串联中的蛋白质复合物,然后测序(RIPiT-Seq)

转化、基因组编辑和拟合氮的热带大麻树帕拉斯波尼亚安德森

诱导毛茸茸的根由农业细菌根- 在塔特里巴克麦的中介转化（法戈皮鲁姆塔塔里库姆）

Read Article