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Detection of Protein Ubiquitination Sites by Peptide Enrichment and Mass Spectrometry
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Rilevamento di siti di Ubiquitinazione proteica mediante arricchimento dei peptidi e spettrometria di massa

DOI:
10.3791/59079-v

•

11:54 min

•

March 23, 2020

•

, ,
1Proteomics Center,Erasmus University Medical Center

Chapitres

  • 00:05Introduction
  • 01:16Sample Preparation
  • 03:36Offline Peptide Fractionation
  • 06:16Nanoflow LC-MS/MS
  • 07:51Data Analysis
  • 09:00Results: Detection of diGly Peptides Using Nanoflow LC-MS/MS
  • 10:51Conclusion

Summary

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Presentiamo un metodo per la purificazione, il rilevamento e l'identificazione di peptidi diGly che provengono da proteine ubiquitinate da campioni biologici complessi. Il metodo presentato è riproducibile, robusto e supera i metodi pubblicati rispetto al livello di profondità dell'analisi dell'ubiquitinome.

Tags

Keywords: Protein UbiquitinationDiGly PeptidesMass SpectrometrySILACProtein EnrichmentLys-CTrypsin DigestionTFA Precipitation

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