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Explorateur de réseau vasculo-nerveux 2.0 : Un outil Simple pour l’exploration et de partage d’une base de données de la vasomotricité évoquée par Optogenetically dans le Cortex de souris In Vivo
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Journal JoVE Neurosciences
Neurovascular Network Explorer 2.0: A Simple Tool for Exploring and Sharing a Database of Optogenetically-evoked Vasomotion in Mouse Cortex In Vivo
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Explorateur de réseau vasculo-nerveux 2.0 : Un outil Simple pour l’exploration et de partage d’une base de données de la vasomotricité évoquée par Optogenetically dans le Cortex de souris In Vivo

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08:32 min

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May 04, 2018

DOI:

10.3791/57214-v

DOI:
10.3791/57214-v

•

08:32 min
May 04, 2018

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1Department of Radiology,University of California, San Diego, 2Central European Institute of Technology,Brno University of Technology, 3Department of Neurosciences,University of California, San Diego, 4Department of Physics,John Carroll University, 5Department of Biomedical Engineering,Boston University, 6Bioengineering Undergraduate Program,University of California, San Diego, 7Institute of Physical Engineering, Faculty of Mechanical Engineering,Brno University of Technology, 8Martinos Center for Biomedical Imaging,Massachusetts General Hospital, Harvard Medical School

Summary

Automatically generated

Une interface utilisateur graphique pour explorer et partageant une base de données des réponses vasculaires induite par l’optogenetically en souris cortex somatosensoriel dans vivo mesurée par microscopie 2 photons est présentée. Il permet de parcourir les données, fondées sur des critères de sélection, en moyenne, localisation des mesures dans un volume 3D du système vasculaire et l’exportation des données.

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Neurovascular Network Explorer 2.0NNE 2.0MATLABGraphical User InterfaceOptogenetically-evoked Vascular Diameter ChangesTwo Photon Microscopy3D Structure Of Vascular NetworkDatabaseCortical DepthBranching OrderBaseline DiameterVessel MorphologyTime CoursesGroup AverageOnset TimesTime-to-peakPeak AmplitudesSubject IDTree ID

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Uhlirova, H., Tian, P., Kılıç, K., Thunemann, M., Sridhar, V. B., Chmelik, R., Bartsch, H., Dale, A. M., Devor, A., Saisan, P. A. Neurovascular Network Explorer 2.0: A Simple Tool for Exploring and Sharing a Database of Optogenetically-evoked Vasomotion in Mouse Cortex In Vivo. J. Vis. Exp. (135), e57214, doi:10.3791/57214 (2018).

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