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双方向レトロウイルスの統合サイトPCRの方法論と定量的データ解析ワークフロー
10,583 Views
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12:53 min
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June 14, 2017
DOI:
1UCLA AIDS Institute,University of California at Los Angeles (UCLA), 2Department of Microbiology, Immunology, & Molecular Genetics,University of California at Los Angeles (UCLA), 3Departments of Biomathematics and Mathematics,University of California at Los Angeles (UCLA), 4Personalized Genomic Medicine Research Center, Division of Strategic Research Groups,Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology, 5Department of Medicine,University of California at Los Angeles (UCLA), 6Department of Veterinary Biosciences, College of Veterinary Medicine,The Ohio State University (OSU)
Summary
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この原稿では、上流および下流のベクター - 宿主接合DNAを同時に解析できる双方向インテグレーションサイトアッセイの実験手順とソフトウェア解析について説明します。双方向PCR産物は、任意の下流の配列決定プラットフォームに使用することができる。得られたデータは、統合されたDNA標的の高スループット、定量的比較に有用である。
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Cite this Article
Suryawanshi, G. W., Xu, S., Xie, Y., Chou, T., Kim, N., Chen, I. S. Y., Kim, S. Bidirectional Retroviral Integration Site PCR Methodology and Quantitative Data Analysis Workflow. J. Vis. Exp. (124), e55812, doi:10.3791/55812 (2017).
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