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Il ITS2 Database
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The ITS2 Database
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Il ITS2 Database

DOI:
10.3791/3806-v

•

16:17 min

•

March 12, 2012

•

, , , , , , ,
1Department of Bioinformatics, Biocenter,University of Würzburg, 2Institute of Pharmacy and Food Chemistry,University of Würzburg

Chapitres

  • 00:03Titre
  • 01:55Correct Annotation of ITS2 Sequence
  • 03:30Secondary Structure Prediction
  • 06:38Motif Search
  • 08:07Search and Browse
  • 10:21ITS2 BLAST
  • 12:23Multiple Sequence-structure Alignment
  • 13:46Phylogenetic Tree
  • 14:47Additional Software
  • 15:25Conclusion

Summary

Traduction automatique

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Il database ITS2 è un banco di lavoro per la sequenza di inferenza filogenetica simultaneamente e considerando la struttura secondaria del spaziatore interno trascritto 2. Ciò include la raccolta di dati con annotazioni accurate, predizione della struttura, di sequenze multiple-struttura di allineamento e di calcolo albero veloce. In poche parole, questo banco di lavoro semplifica analisi filogenetiche primi pochi click.

Tags

ITS2 DatabaseInternal Transcribed Spacer 2Phylogenetic MarkerITS2 SequenceSecondary StructurePhylogenetic ResolutionSpecies DelimitationNCBI GenBankReannotated SequencesHidden Markov ModelsFold PredictionHomology ModelingMotif DetectionBLAST SearchSequence-structure Information4SALEProfDistS

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