تم عرض بروتوكول مفصل لتوليف الجسيمات النانوية الدهنية (LNPs) باستخدام تقنيات الخلاط النفاث المحصور (CIJ) ، بما في ذلك CIJ ثنائي النفاثات وخلاط دوامة متعدد المدخل رباعي النفاثات (μMIVM). تولد خلاطات CIJ بيئات خلط دقيقة مضطربة وقابلة للتكرار ، مما يؤدي إلى إنتاج LNPs أحادية التشتت.
أثبتت الجسيمات النانوية الدهنية (LNPs) إمكاناتها الهائلة كوسيلة توصيل علاجية ، كما يتضح من الموافقة والاستخدام العالمي لقاحين من الحمض النووي الريبي المرسال (mRNA) ل COVID-19. على نطاق صغير ، غالبا ما يتم تصنيع LNPs باستخدام الموائع الدقيقة. ومع ذلك ، فإن قيود هذه الأجهزة تحول دون استخدامها على نطاق واسع. يتم تصنيع لقاحات COVID-19 بكميات كبيرة باستخدام خلاطات مضطربة محصورة (CIJ). تتيح تقنية CIJ الإنتاج على نطاق المختبر مع الثقة في إمكانية توسيع نطاقه إلى أحجام الإنتاج. المفاهيم الأساسية في خلط CIJ هي أن طول الخلط ومقياس الوقت يتم تحديدهما من خلال شدة الاضطراب في تجويف الخلط وأن تكوين الجسيمات النانوية يحدث بعيدا عن الجدران ، مما يلغي مشكلة الترسب على الأسطح والقاذورات. يوضح هذا العمل عملية صنع LNPs باستخدام تقنية الخلاط النفاث المحصور مع شكلين هندسيين: CIJ ثنائي النفاثات وخلاط دوامة متعدد المدخل رباعي النفاثات (MIVM). تتم مناقشة مزايا وعيوب كل هندسة خلط. في هذه الأشكال الهندسية ، تتشكل LNPs عن طريق الخلط السريع لتيار المذيبات العضوية (عادة الإيثانول الذي يحتوي على الدهون المؤينة ، والدهون المشتركة ، وتثبيت دهون PEG) مع تيار مائي مضاد للمذيبات (عازل مائي يحتوي على الحمض النووي الريبي أو الحمض النووي). يتم تقديم معلمات التشغيل لخلاطات CIJ و MIVM لإعداد LNPs القابلة للتكرار مع الحجم المتحكم فيه ، وإمكانات زيتا ، والاستقرار ، وفعالية النقل. كما يتم عرض الاختلافات بين LNPs المصنوعة من خلط ضعيف (محاليل الماصات) مقارنة بخلط CIJ.
تحمل العلاجات القائمة على mRNA إمكانات كبيرة لعلاج مجموعة واسعة من الأمراض والوقاية منها ، بما في ذلك الأمراض المعدية والاضطرابات الوراثية والسرطانات1. على عكس العلاجات ذات الجزيئات الصغيرة ، والتي يمكن أن تنتشر بشكل سلبي عبر غشاء الخلية ، يجب تغليف الأحماض النووية للتوصيل داخل الخلايا2. يوفر التغليف كلا من البنية والاستقرار ل mRNA ، مما يسهل توصيلها داخل الخلايا عبر المسارات الداخلية وكذلك منع التدهور من المكونات داخل وخارج الخلية مثل النيوكليازات3. تم تطوير مجموعة من المواد والناقلات النانوية لتغليف وتوصيل mRNA ، بما في ذلك الجسيمات النانوية غير العضوية والبوليمرات والدهون والمواد الشبيهة بالدهون1. من بين هذه ، برزت LNPs كمنصة توصيل أبرز للعلاجات القائمة على mRNA4.
تتكون LNPs من أربعة مكونات دهنية: الدهون المؤينة ، والكوليسترول ، والدهون zwitterionic ، ومثبت الدهونPEG-5. تظهر الدهون المؤينة المناسبة لتوصيل mRNA توازنا دقيقا بين الكارهة للماء الدهني وثابت التفكك (pKa) لمجموعة أمين ثلاثية6. عادة ما يكون للدهون المؤينة pKa درجة حموضة بين 6.0 و 6.7 ، مثل KC-2 (DLin-KC2-DMA) و MC-3 (DLin-MC3-DMA) و ALC-03157. يتيح تقييد pKa هذا على الدهون المؤينة تغليف بوليمرات الحمض النووي كأملاح دهنية كارهة للماء والتوصيل داخل الخلايا من خلال عملية “هروب الإندوسوم”. تدخل LNPs الخلية المستهدفة من خلال مسارات البطانة (المختلفة) التي تتضمن جميعها تحمض الإندوسوم من الرقم الهيدروجيني 7.4 إلى الرقم الهيدروجيني ~ 58. يضمن pKa الدهني المؤين أن LNPs لها أسطح محايدة تقريبا في ظل الظروف الفسيولوجية ولكنها تصبح كاتيونية في الإندوسومالحمضي 9. تتيح استجابة الأس الهيدروجيني هذه تعطيلا انتقائيا للغشاء الإندوسومي فقط ، وإطلاق بوليمر الحمض النووي المغلف ، وتحافظ على صلاحية الخلية ، على عكس الدهون الموجبة الدائمة المستخدمة في أنظمة النقل مثل ليبوفيكتامين. الكوليسترول هو جزيء خلالي كاره للماء في بنية LNP يحسن سيولة الدهون. تلعب الدهون zwitterionic دورا هيكليا وتشكل طبقة ثنائية على سطح LNP. بولي (جلايكول الإثيلين) – الدهون (PEG-lipid) هو مثبت غرواني يعزز استقرار LNP عن طريق نقل مثبت ستيريك بوليمري على سطح LNP ، والذي يقاوم تجميع LNPs. هذا يعمل على استقرار LNP ، خاصة أثناء التغيرات في درجة الحموضة التي تجدد الشكل الأساسي الحر للدهون المؤينة التي تتصرف مثل الزيت الكارهة للماء. غالبا ما تستخدم وصفة Onpattro (patisiran) (المشار إليها فيما يلي باسم صياغة LNP) كنقطة انطلاق لصياغة LNP مع الدهون المؤينة MC3 والكوليسترول و distearoylphosphatidylcholine (DSPC) و PEG2000-DMG المذاب في الإيثانول الممزوج بمحلول مائي من RNA10.
يمكن استخدام العديد من التقنيات لتصنيع LNPs التي تغلف بوليمرات الحمض النووي ، حيث يعتمد معظمها على موضوع مشترك يتمثل في الخلط السريع لتيار الإيثانول الذي يحتوي على الدهون مع تيار مائي يتضمن الحمض النووي محل الاهتمام (siRNA أو mRNA أو DNA)9،11،12،13،14. في هذا الصدد ، تقدم عمليات الخلط السائبة مثل خلط الماصة وخلط الدوامة استراتيجية بسيطة لتشكيل LNPs تلغي الحاجة إلى استخدام أدوات متطورة12. ومع ذلك ، لا يوفر الخلط بالجملة توزيعا متجانسا للمكونات ، مما يؤدي إلى توزيع حجم LNP دون المستوى الأمثل جنبا إلى جنب مع تباين كبير من دفعة إلى أخرى15.
تستخدم المختبرات بشكل روتيني تقنيات خلط الموائع الدقيقة للحصول على LNPs القابلة للتكرار من خلال تحقيق تحكم أكثر دقة في ظروف الخلط12،13،16. ومع ذلك ، فإن ظروف التدفق الصفحي في أجهزة الموائع الدقيقة ، والتي تكون متأصلة بسبب مقاييس الطول الصغيرة والسرعات المنخفضة في غرفة الموائع الدقيقة ، تؤدي إلى خلط بطيء نسبيا للمذيبات / مضاداتالمذيبات 17. تحد أبعاد الغرفة الصغيرة بشدة من الإنتاجية وقابلية التوسع اللازمة لإنتاج GMP من LNPs ، لكن الباحثين قاموا بموازاة غرف الموائع الدقيقة لمحاولة توسيع حجم الإنتاج15. لا تقضي هندسة الموائع الدقيقة المتوازية على مشكلة امتزاز الدهون للأسطح أثناء المعالجة ذات الحجم الكبير ، وهي مشكلة يشار إليها عادة باسم “تلوث” جهاز الخلط ، وهناك مشاكل في توحيد واستقرار التدفقات التي تجعل توسيع الموائع الدقيقة تحديا للإنتاج على نطاق صناعي18,19. ليس من المستغرب أن تستخدم شركات الأدوية الخلاطات النفاثة المضطربة لتصنيع لقاح COVID-19 mRNA-LNPs20.
تستلزم عملية إنتاج LNPs المحملة بالحمض النووي الريبي مزج تيار عازل مائي يحتوي على حمولة الحمض النووي الريبي مع تيار إيثانول يحتوي على مكونات الدهون الأربعة المتميزة. تستخدم هذه التركيبات عازلا حمضيا بأس هيدروجيني 4.0 أو أقل ، والذي يشحن الدهون المؤينة مع اختلاط التيارات المائية والإيثانولية. تتفاعل الدهون المؤينة الموجبة الشحنة كهروستاتيكيا مع الحمض النووي الريبي سالب الشحنة ، مكونا ملح دهون الحمض النووي الريبي الكارهة للماء. تترسب أنواع الدهون الكارهة للماء ، بما في ذلك ملح الدهون RNA ، في المذيبات المختلطة وتشكل نوى كارهة للماء. تنمو هذه النوى من خلال ترسيب الدهون zwitterionic والكوليسترول حتى تصل إلى نقطة حرجة حيث تمتص الدهون pegylated كافية على سطح LNPs ، مما يوقف المزيد من النمو – النوى وآلية النمو21،22،23. تتوقف إضافة المخزن المائي إلى محلول الدهون ، إلى الحد الذي تترسب فيه الدهون وتتشكل LNPs ، على مقياسين زمنيين متميزين: فترة خلط المذيبات ومضادات المذيبات ، τmix ، وفترة نمو النوى ، τagg. يجسد رقم Damköhler عديم الأبعاد ، الذي يعرف بأنه Da = τmix / τagg ، التفاعل بين هذه المقاييس الزمنية24. في حالات الخلط البطيء (Da > 1) ، يتم التحكم في الحجم النهائي ل LNPs بالنقل ويختلف مع وقت الخلط. على العكس من ذلك ، أثناء الخلط السريع (Da < 1) ، يتم تجزئة السائل إلى تشققات أو طبقات بطول Kolmogrov ، حيث يتم التحكم في تكوين LNP فقط من خلال الانتشار الجزيئي لكل مكون ، مما يؤدي إلى حركية متجانسة لتشكيل LNP. يتطلب تحقيق السيناريو الأخير أن يتجاوز تركيز الدهون عتبة حرجة ، مما يؤدي إلى حالة من التشبع الفائق تفضي إلى نواة متجانسة موحدة.
تشير التقديرات إلى أن τagg يتراوح من بضع عشرات إلى بضع مئات من المللي ثانية25. في تكوينه الأساسي ، يتم حقن التيارين ، أحدهما يحتوي على الإيثانول مع الدهون والآخر يحتوي على عازل مائي مع شحنة الحمض النووي الريبي ، في غرفة تعرف باسم خلاط “نفاثة اصطدام محصورة” (CIJ). تنتج الدوامات المضطربة مقاييس طول تشقق المذيبات / مضادات المذيبات تبلغ 1 ميكرومتر في غضون 1.5 مللي ثانية عند تشغيلها بسرعات مناسبة. تحدد سرعات التيار وهندسة الخلط تحويل الزخم الخطي إلى دوامات مضطربة تخلط الجداول. يتم تحديد هذا بواسطة الرقم عديم الأبعاد ، رقم رينولدز (Re) ، والذي يتناسب خطيا مع سرعات التدفق. يتم حساب Re من Re = Σ (ViDi / vi) ، حيث Vi هي سرعة التدفق في كل بخار ، v i هي اللزوجة الحركية لكل تيار ، و Di هو قطر مدخل التيار في أجهزة CIJ 2-jet26 أو قطر الغرفة في 4-jet MIVMs27. ملاحظة: تستخدم بعض المراجع الخاصة ب CIJ قطر وسرعة نفاثة واحدة فقط لتعريف Re28. Re في حدود 1-100 في جهاز الموائع الدقيقة ، بينما في أجهزة CIJ ، يمكن تحقيق Re من 125,000. في خلاط CIJ ، تصطدم الجداول ذات الزخم المتساوي ، مما يبدد زخمها عند الاصطدام بالخلط المضطرب ، مما يؤدي إلى خلط دقيق فعال بسبب المقاييس المجهرية الصغيرة ل Kolmogorov ورقم Damköhler الصغير. نوع آخر من الخلاطات هو “خلاط دوامة متعدد المدخلات” (MIVM) ، حيث يتم توجيه أربعة تيارات إلى غرفة مركزية. في هذا الإعداد ، تضمن التدفقات المستمرة إلى غرفة الخلط المحصورة مقياس وقت خلط محدد جيدا. تمر جميع عناصر السوائل عبر منطقة الخلط عالية الطاقة في كلا النوعين من الخلاطات. في المقابل ، لا تحتوي أجهزة الخلط البسيطة مثل تقاطعات T على غرفة توفر منطقة خلط ، مما يؤدي إلى اختلاط أقل بين التيارين بسبب انحراف زخم التيار الوارد إلى حد كبير إلى اتجاه المخرج بدلا من توليد دوامة مضطربة. يمكن تشغيل كل من خلاطات CIJ و MIVM في أوضاع دفعية أو مستمرة ، مما يوفر المرونة لإنتاج LNP على مستويات مختلفة.
يصف هذا البروتوكول كيفية صنع تركيبات LNP المثلى من خلال استخدام تقنيتين نفاثتين محصورتين: 2-jet CIJ وخلاطات MIVM ذات 4 نفاثات. تم إثبات تشغيل خلاطات CIJ و MIVM سابقا لإعداد NPs بمواد أساسية كارهة للماء29. يجب الرجوع إلى هذه المقالة والفيديو كمورد إضافي حول تكوين NPs مع هذه الخلاطات. يركز هذا التحديث على تكوين NP القائم على الدهون. تم إثبات القدرة على ضبط حجم LNPs عن طريق تغيير ظروف الخلط الدقيق. بالإضافة إلى ذلك ، تظهر فائدة تقنيات CIJ في تكوين LNPs مستقرة وأحادية التشتت مع تحسين كفاءات النقل في المختبر في خلايا HeLa عند مقارنتها ب LNPs المصنوعة باستخدام خلط ماصة ضعيف. علاوة على ذلك ، تتم مناقشة مزايا وعيوب كل هندسة خلط CIJ ، إلى جانب الظروف المناسبة اللازمة لتوسيع نطاق هذه الخلاطات.
تم تقديم توليف LNPs المحتوية على بوليمرات الحمض النووي باستخدام خلاطين مضطربين محصورين. عند إجراؤها بسرعات مناسبة ، تضمن الخلاطات المضطربة CIJ أن النطاق الزمني للخلط أقصر من وقت تجميع LNP ، مما ينتج عنه ظروف تشبع فائق متجانسة لتشكيل LNPs صغيرة ذات توزيعات ضيقةالحجم 21. وبالتالي ، فإن LNPs المصنوعة من نفس الكيمياء باستخدام أشكال هندسية مختلفة للخلاط المضطرب (2-jet CIJ وخلاط MIVM 4-jet) تظهر خصائص فيزيائية كيميائية مماثلة وتظهر كفاءات نقل جيدة (الشكل 5 والشكل 6). في المقابل ، ينتج عن LNPs المصنوعة باستخدام الماصة التي تنتج خلطا أقل كثافة في LNPs أكبر وأكثر تشتتا (الشكل 5 أ) مع كفاءة نقل أقل. من المفهوم منذ فترة طويلة أن حركية الخلط والتجميع تلعب دورا مهما في معالجة LNP ؛ لاحظ كوليس وآخرون أن الخلط السريع للحمل الحراري المنتشر للإيثانول والمخزن المؤقت يؤدي إلى تكوين جزيئات صغيرة ذات توزيع ضيق الحجم ، في حين أن الخلط المنتشر البطيء يؤدي إلى جزيئات أكبر ذات توزيعات واسعة الحجم9. ينخفض النطاق الزمني للخلط في الخلاطات المضطربة CIJ بشكل متناسب مع معدلات تدفق مدخل التيارات إلى الخلاط27. يتم قياس ذلك كميا بواسطة رقم رينولدز عديم الأبعاد (Re) ، والذي يقيس النسبة بين قوى القصور الذاتي واللزجة. يحدث الاضطراب داخل غرف الخلط في CIJ و MIVM عند Re عالية بما فيه الكفاية ، بحيث يؤدي تمدد الدوامة المضطربة إلى مقاييس صغيرة من الطول تنتج خلطا سريعا للمذيبات / مضادات المذيبات عن طريق الانتشار. يعتمد مقياس الطول المضطرب على Re وليس على الهندسة المحددة لجهاز الخلط. هذا هو السبب في أن CIJ أو MIVM يصنعان نفس جزيئات LNP ، ولماذا تصنع الأحجام المختلفة لخلاطات MIVM نفس أحجام NP27. عند Re العالية ، المقابلة لسرعات المدخل العالية ، يمكن إجراء LNPs بشكل متكرر دون اختلافات من دفعة إلى أخرى (الشكل 3B).
يتيح هذا البروتوكول صياغة مجموعة متنوعة من mRNA أو DNA أو siRNA LNPs بخصائص فيزيائية كيميائية مختلفة باستخدام خلاطات CIJ المضطربة. بالإضافة إلى السماح بتعدد الاستخدامات في التركيب والتركيزات ، توفر هذه التقنية مسارا واضحا لفحص التركيبات بسرعة عند بيع مقاعد البدلاء (بضعة ملليغرامات) وتوسيع نطاق تركيبات الرصاص إلى أحجام دفعات صناعية أكبر بمعدلات إنتاج تبلغ 5 لتر / دقيقة36. كانت هذه عقبة رئيسية أمام العديد من التقنيات الأخرى ، بما في ذلك الخلط السائب والموائع الدقيقة. على سبيل المثال ، تفشل تقنيات المعالجة السائبة في تصنيع LNPs بشكل متكرر باستمرار ، حتى على مقاييس قليلة ملليلتر. توفر تقنيات الموائع الدقيقة تحسنا كبيرا على تقنيات الخلط السائب لتمكين إنتاج LNPs موحدة وقابلة للتكرار. ومع ذلك ، فهي فقط في نطاق مليغرام29. كما هو مفصل في المقدمة ، يوفر توازي أجهزة الموائع الدقيقة محاولة للتوسع إلى موازين الإنتاج ولكنه لا يلغي مشكلة القاذورات ، ولا يمكن تحجيمها بنجاح مثل الخلاطات القائمة على تقنية النفاثة المحصورة.
بصرف النظر عن هذه المزايا ، ستكون خلاطات CIJ مفيدة في تصنيع الجيل التالي من LNPs التي تظهر قدرات الاستهداف أو إجراء تحرير الجينات. تحتوي تركيبات LNP الحالية على دهون وأحماض نووية لها انتشارات متشابهة ، وبالتالي ، يمكن صنعها حتى مع خلط ضعيف قليلا على نطاق مقاعد البدلاء. ومع ذلك ، قد تتطلب مناهج تحرير الجينات تغليف أنواع الحمض النووي بأوزان جزيئية مختلفة على نطاق واسع ، مثل جزيئات الحمض النووي الريبي الإرشادية الصغيرة ونسخ mRNA الكبيرة ، لترميز بروتين CAS937. إن المقاييس الزمنية المختلفة جدا للانتشار لهذه الأنواع المختلفة تجعل التغليف المنتظم بنسب متكافئة أمرا صعبا. تصبح مشكلة التغليف الموحد أكثر وضوحا عندما تصبح كفاءة الخلط أكثر فقرا. وبالمثل ، قد يحتاج استهداف الخلايا غير الكبدية إلى دمج مثبتات بطيئة الانتشار مرتبطة بقوة (مثل البوليمرات المشتركة ذات الوزن الجزيئي الكبير مع روابط الاستهداف). يمكن اقتران روابط مستهدفة بحجم 14 كيلو دالتون لمنع البوليمرات المشتركة قبل تجميع الجسيمات النانوية ، مما يتيح دمجها بشكل موحد في NPs باستخدام خلط CIJ38. الخلاطات المضطربة CIJ هي أدوات مفيدة لتصنيع LNPs المصنوعة من مكونات لها انتشار مختلف.
بينما تظهر الخلاطات المضطربة CIJ العديد من المزايا على الخلاطات الأخرى لصياغة LNPs ، من المهم ملاحظة القيود المرتبطة بكل هندسة. يتطلب خلاط CIJ 2-jet أن يكون لكل من تيارات المدخل (الإيثانول والماء) لحظات متساوية (في حدود 10٪ -30٪) لتحقيق خلط دقيق مضطرب موحد في الغرفة. حقيقة أن تيار الخروج يتكون من 50:50 مذيب / مضاد للمذيب يحد من مستوى التشبع الفائق في تجويف الخلط حيث يحدث هطول الأمطار29. تتم معالجة هذا العيب بواسطة خلاط MIVM ذو 4 نفاثات ، حيث يمكنه استخدام أربع نفاثات ذات لحظات غير متكافئة لتحقيق ظروف التشبع الفائق العالية في غرفة الخلط. بالإضافة إلى ذلك ، يجب أن يكون كلا الخلاطين في حدود ملليغرام من الكتلة الكلية ، مما يجعلهما خيارا غير مثالي للفحص عالي الإنتاجية للعديد من تركيبات LNP المختلفة. بالنسبة لتركيبات LNP البسيطة ، قد يكون من الأفضل إجراء الفحص باستخدام الموائع الدقيقة أو استراتيجيات السحب على مقاييس ميكروغرام ثم نقلها إلى تقنية النفاثة المحصورة عند تحديد عدد قليل من تركيبات الرصاص. من المهم أيضا مراعاة الأحجام الميتة في الخلاطات. في CIJ ، خلاطان نفاثان ، تكون أحجام الانتظار 50-100 ميكرولتر. يجب طرح هذه الكمية من المواد من الكمية التي تم التقاطها في حمام التبريد عند حساب الاسترداد من العملية. هذه الخسائر ضئيلة عند التشغيل على نطاقات كبيرة ولكنها ستشكل خسائر بنسبة 10٪ عندما يتم إنتاج أحجام إجمالية تبلغ 5 مل ، كما هو موضح هنا. تعد الخلاطات المضطربة النفاثة الاصطدامية أداة قيمة لإنتاج LNPs على نطاق GMP ، كما يتضح من لقاحي COVID-19 المعتمدين من إدارة الغذاء والدواء.
The authors have nothing to disclose.
زمالة NSF إلى BKW (DGA1148900) ، ودعم من Tessera Therapeutics Inc. ، ومؤسسة Bill and Melinda Gates (BMGF ، أرقام العقود OPP1150755 و INV-041182) ، وإدارة الغذاء والدواء بموجب الجائزة 75F40122C00186.
18:0 PC (DSPC) | Avanti Polar Lipids | 850365P | Helper lipid |
21 G x 1-1/2 in. BD PrecisionGlide Needle | BD | 305167 | |
96 Well Black Wall Black Bottom Plate | Fisher Scientific | 07-000-135 | |
96 Well White/Clear Bottom Plate, TC Surface | Thermo Fisher Scientific | 165306 | |
Acetic Acid, Glacial | Fisher Scientific | A38-212 | |
ALC-0315 | Avanti Polar Lipids | 890900 | Ionizable lipid |
Amicon Ultra Centrifugal Filter, 100 kDa MWCO, 15 mL | Millipore Sigma | UFC910024 | |
Amicon Ultra Centrifugal Filter, 100 kDa MWCO, 4 mL | Millipore Sigma | UFC810096 | |
Bright-Glo Luciferase Assay System | Promega | E2620 | |
Cholesterol | Millipore Sigma | C8667 | |
CleanCap FLuc mRNA (5 moU) | Trilink Biotechnologies | L-7202 | |
Confined Impinging Jets Mixer | Holland Applied Technologies, Helix Biotech, Diamond Tool and Die (DTD) | N/A | Contact Holland or DTD for custom orders and the Helix Biotech system is Nova BT. Review text for new mixer validation |
D-Lin-MC3-DMA | MedChemExpress | HY-112251 | Ionizable lipid |
DMEM, high glucose, pyruvate | Thermo Fisher Scientific | 11995065 | |
DMG-PEG 2000 | Avanti Polar Lipids | 880151P | PEG-lipid |
DODMA | Avanti Polar Lipids | 890899P | Ionizable lipid |
Ethanol 200 Proof | Decon Labs, Inc. | 2701 | |
Falcon 15 mL Conical Centrifuge Tubes | Fisher Scientific | 14-959-70C | |
Falcon 50 mL High Clarity Conical Centrifuge Tubes | Fisher Scientific | 14-959-49A | |
Fetal Bovine Serum, certified, United States | Thermo Fisher Scientific | 16000044 | |
HeLa | ATCC | CCL-2 | |
HEPES, free acid | IBI Scientific | IB01130 | |
HSW HENKE-JECT two-part 1 mL Luer | Henke Sass Wolf | 4010.200V0 | |
HSW HENKE-JECT two-part 5 mL (6 mL) Luer Lock | Henke Sass Wolf | 4050.X00V0 | |
Idex 1648 ETFE tubing ” OD 0.093” ID | Idex Health & Science | 1648 | |
Idex P-678 ¼”-28 to Luer fitting | Idex Health & Science | P-678 | |
Idex P-940 ferrule for ETFE tubing | Idex Health & Science | P-940 | |
Lipofectamine 3000 Transfection Reagent | Thermo Fisher Scientific | L3000001 | |
Luer fitting | Idex Health & Science | P-604 | Assemble on CIJ or MIVM mixer inlet with corresponding threads. Idex parts are also available through VWR and many other suppliers |
Mixer stand | Holland Applied Technologies | N/A | See Markwalter & Prud'homme for design.26 Contact Holland for Purchase |
Multi-Inlet Vortex Mixer | Holland Applied Technologies and Diamond Tool and Die (DTD) | N/A | Contact Holland or DTD for custom orders. Review text for new mixer validation |
O-ring (MIVM) | C.E. Conover | MM1.5 35.50 V75 | Order bulk – consumable part. Ensure solvent compatibility if using an alternative source. |
Outlet ferrule – CIJ | Idex Health & Science | P-200 | Assemble with outlet fitting (large end flush with tubing) |
Outlet fitting – CIJ | Idex Health & Science | P-205 | Assemble with ferrule and tubing on CIJ chamber outlet |
Outlet fitting – MIVM | Idex Health & Science | P-942 | Combination with ferrule |
Outlet tubing – CIJ | Idex Health & Science | 1517 | Use a tubing cutter for clean ends. Ensure extra tubing doesn't protrude into mixing chamber |
Outlet tubing – MIVM | N/A | N/A | Fit to ferrule ID. |
PBS – Phosphate-Buffered Saline (10x) pH 7.4, RNase-free | Thermo Fisher Scientific | AM9624 | |
Penicillin-Streptomycin (10,000 U/mL) | Thermo Fisher Scientific | 15140122 | |
PHD 2000 Programmable Syringe Pump | Harvard Apparatus | N/A | |
Plastic two-piece syringe 1 mL | Thermo Fisher Scientific | S7510-1 | |
Plug fitting | Idex Health & Science | P-309 | Assemble on CIJ mixer sides (seal access point from drilling) |
Quant-it RiboGreen RNA Assay Kit and RiboGreen RNA Reagent, RediPlate 96 RiboGreen RNA Quantitation Kit | Invitrogen by Thermo Fisher Scientific | R11491 | |
Resazurin, Sodium Salt | Thermo Fisher Scientific | R12204 | |
RNase AWAY Surface Decontaminant | Thermo Fisher Scientific | 7000TS1 | |
Scintillation vial | DWK Lifesciences | 74504-20 | |
SGE Gas Tight Syringes, Luer Lock, 100 mL | SGE | 100MR-LL-GT | |
SGE Gas Tight Syringes, Luer Lock, 50 mL | SGE | 50MR-LL-GT | |
Slide-A-Lyzer Dialysis Cassettes, 20 K MWCO | Thermo Fisher Scientific | 66012 | |
Sodium Acetate | Millipore Sigma | 32319-500G-R | |
Sodium Hydroxide | Fisher Scientific | S320-500 | |
Sucrose | Millipore Sigma | S7903-1KG | |
Syringe Filters, Sterile | Genesse Scientific | 25-243 | |
Triton X-100 | Millipore Sigma | 9036-19-5 | |
Trypsin-EDTA (0.25%), phenol red | Thermo Fisher Scientific | 25200056 | |
Water, Endotoxin Free | Quality Biological | 118-325-131 | RNAse and DNAse free |
Yeast RNA (10 mg/mL) | Thermo Fisher Scientific | AM7118 |