Este protocolo detalha um método compatível com automação de alto rendimento para isolar células mononucleares do sangue periférico humano para biobancos e outros fins.
As células mononucleares do sangue periférico (PBMCs) são uma população heterogênea de monócitos e linfócitos. As PBMCs criopreservadas têm viabilidade estável no armazenamento de longo prazo, tornando-as um tipo de célula ideal para muitos fins de pesquisa a jusante, incluindo citometria de fluxo, imunoensaios e sequenciamento do genoma. Normalmente, os PBMCs são isolados por centrifugação de gradiente de densidade, no entanto, é um fluxo de trabalho de baixo rendimento que é difícil e caro de escalar. Este artigo apresenta um fluxo de trabalho de alto rendimento usando um método de isolamento PBMC baseado em esferas magnéticas que é rápido de implementar. A concentração celular total, a viabilidade e a distribuição populacional com PBMCs obtidas usando isolamento de gradiente de densidade foram comparadas, e a viabilidade celular e a proporção de tipos de células foram comparáveis para ambas as técnicas. As PBMCs isoladas demonstraram mais de 70% de viabilidade até 9 dias após a coleta de sangue, embora o rendimento tenha diminuído pela metade após 5 dias em comparação com as PBMCs processadas dentro de 24 h após a coleta. Em resumo, este artigo descreve um protocolo PBMC que utiliza uma abordagem baseada em esferas para se adaptar a um fluxo de trabalho de alto rendimento e demonstra que os métodos manuais e automatizados baseados em esferas podem aumentar a capacidade de processamento e fornecer flexibilidade para vários orçamentos.
O isolamento de células mononucleares do sangue periférico (PBMC) é uma técnica que separa e isola linfócitos e monócitos de outros constituintes do sangue total. Os PBMCs são um tipo de célula versátil usado para inúmeras aplicações, incluindo, mas não se limitando a, imunoterapia, desenvolvimento de vacinas, identificação de alvos ou biomarcadores e desenvolvimento de medicamentos de anticorpos/moléculas pequenas 1,2. Essas células podem ser isoladas de indivíduos saudáveis ou doentes e podem ser usadas imediatamente em processos a jusante ou criopreservadas para pesquisas futuras3. Em alguns casos, o propósito a jusante é conhecido, enquanto em outros, como é comum em biobancos, os PBMCs são isolados e armazenados para futuras aplicações não especificadas4.
A centrifugação por gradiente de densidade é a técnica tradicional para isolar PBMCs 5,6,7 do sangue total, utilizando a separação diferencial dos tipos de células constituintes com base na densidade celular durante a centrifugação. Embora possa haver alguma variação neste método, o sangue total é geralmente diluído com solução salina tamponada com fosfato (PBS), em camadas sobre um meio de gradiente de densidade em um tubo de centrífuga especializado ou padrão e, em seguida, girado. Quatro camadas distintas resultam: a camada superior de plasma é enriquecida com plaquetas, uma fina camada de PBMC está acima do meio de gradiente de densidade e, finalmente, a camada inferior consiste em glóbulos vermelhos (RBCs) e granulócitos. Embora esse método tenha sido anteriormente denominado “padrão ouro”8, existem limitações para o aumento de escala, como longo tempo de processamento, capacidade de centrífuga, dificuldade em aliquotar outros produtos sanguíneos (ou seja, plasma e hemácias) e ser trabalhoso para automatizar. Embora a automação seja possível para este método9, ela requer uma programação abrangente de um manipulador de líquidos (com um módulo de centrifugação totalmente automatizado) e continuaria sendo um processo demorado.
A partir de agora, é apresentado um fluxo de trabalho alternativo que usa a separação de esferas imunomagnéticas com um ímã de oito suportes para processamento manual ou um instrumento para processamento totalmente automatizado. Este método utiliza um coquetel de anticorpos que é adicionado às células e se liga a populações de células indesejadas, neste caso, plaquetas, granulócitos e hemácias. Essas populações indesejadas são subsequentemente removidas por separação magnética, deixando as populações de monócitos e linfócitos na fração negativa que estão prontas para processamento a jusante10. Este método de seleção negativa é mais rápido do que os métodos de seleção positiva, que requerem etapas adicionais para remover o anticorpo e o complexo de esferas magnéticas dos PBMCs. A seleção negativa também é vantajosa, pois foi descrita como uma forma de preservar a funcionalidade celular11,12.
PBMCs humanos são tipos de células versáteis usados para vários ensaios; no entanto, o rendimento do isolamento costuma ser uma limitação em muitos laboratórios, incluindo biobancos16. Anteriormente, o NSW Health Statewide Biobank isolou PBMCs usando o método de gradiente de densidade. A automação foi investigada para o método de separação de gradiente de densidade para aumentar a capacidade de processamento, mas foram identificadas barreiras à implementação, incluindo (i) o custo de um manipulador de líquidos com uma unidade de centrifugação a ser totalmente automatizada, com a necessidade adicional de uma unidade HEPA para produzir um produto estéril, (ii) pessoal treinado para programação e (iii) tempo necessário para teste de protocolo. Portanto, este estudo explorou métodos alternativos e identificou o kit PBMC humano obtido comercialmente que poderia ser usado para processamento manual e automatizado. A esterilidade é garantida, pois o equipamento necessário para o processamento se encaixa em uma cabine de segurança biológica padrão (comprimento de 1,2 m). Este artigo detalha as modificações feitas no protocolo14 recomendado pelo fabricante, para aumentar a eficiência e reduzir os custos dos reagentes sem sacrificar a qualidade. Além disso, o protocolo do fabricante foi estendido para detalhar as etapas das amostras do biobanco para pesquisas futuras, incluindo sangue total (etapa 1.2), plasma (etapa 2.2) e hemácias (etapa 2.5) alíquotas do tubo de sangue original, bem como contagem de células e criopreservação.
Neste estudo, três protocolos de isolamento PBMC foram comparados: separação por gradiente de densidade, isolamento manual e automatizado baseado em cordão. Foram feitas modificações no protocolo manual baseado em esferas do fabricante, incluindo a remoção da diluição do revestimento leucocitário antes do isolamento de PBMC e a eliminação da exigência de interrupção para centrifugações, permitindo que os investigadores sigam um protocolo de isolamento PBMC adaptável, econômico e de alto rendimento. Primeiro, oito amostras de sangue total combinadas foram usadas para isolar PBMCs para comparar a separação do gradiente de densidade e a técnica manual baseada em esferas. É importante ressaltar que as distribuições da população celular, a viabilidade celular e a recuperação de PBMCs não foram significativamente diferentes entre os dois métodos comparados, conforme mostrado na Figura 2A-F, Figura 3A e Figura Suplementar 1, respectivamente. Nos dados representativos, as contagens de células foram maiores para o método de separação do gradiente de densidade usando o método de exclusão de azul de tripano, mas não quando um analisador de células hematológicas foi usado. As configurações do tipo de célula PBMC no contador de células empregaram uma faixa de diâmetro de célula de 8-50 μm e, portanto, as contagens incluirão PBMCs, bem como granulócitos (aproximadamente 12-15 μm de diâmetro) ao usar o método de exclusão de azul de tripano17. Embora o contador de células hematológicas tenha oferecido maior especificidade do que o método de exclusão do azul de tripano, alguns cálculos de recuperação foram superiores a 100%, refletindo a margem de erro do instrumento (ver Figura 1 suplementar). Recomenda-se, portanto, que os investigadores apliquem uma combinação de técnicas de contagem de células ao comparar os rendimentos dos protocolos de isolamento de PBMC, pois a maioria das técnicas não oferece contagens diferenciais de células específicas e altamente sensíveis. Além disso, não foram realizados ensaios para comparar a atividade funcional das PBMCs produzidas em ambas as técnicas, o que é uma limitação de nossa análise.
Em seguida, os métodos manuais e automatizados baseados em grânulos foram comparados, e nenhuma diferença significativa entre o rendimento ou a viabilidade do PBMC foi identificada em 8 amostras pareadas (Figura 4A, B). As populações de células não foram comparadas individualmente, pois o mesmo coquetel de isolamento de anticorpos foi usado para ambos os métodos. É importante ressaltar que o tempo prático para processar 8 amostras foi reduzido de 43 min para 22 min usando o protocolo automatizado (Figura 4C). Embora o rendimento, a prevenção do esgotamento do técnico e a consistência do processamento de amostras sejam garantidos usando automação, o custo de reagentes e consumíveis é significativamente maior, 3-4 vezes maior do que o método manual baseado em esferas. Isso ocorre depois de fazer modificações no protocolo do fabricante para usar 1 mL de buffy coat (de um volume de sangue total de 10 mL) em vez da faixa recomendada de 2-5 mL (de um volume de sangue total de 10 mL ou mais). Se o orçamento for uma limitação, optar pelo método manual pode reduzir o tempo de processamento em ~25%, mantendo os custos de reagentes e consumíveis comparáveis aos do método de separação por densidade. Recomenda-se processar no máximo 8 amostras por vez por técnico para garantir o escalonamento adequado das amostras (~30 s/amostra) dentro dos períodos de incubação de 5 minutos (etapas 3.7, 3.11 e 3.14).
Tanto no método manual quanto no automatizado, a remoção do revestimento buffy é uma etapa crítica para garantir o isolamento ideal do PBMC. É importante notar que um buffy coat em vez de sangue total é usado neste protocolo, pois o volume de reagentes é baseado nos volumes de material inicial10. A remoção eficaz de todo o volume do revestimento leucocitário pode ser tecnicamente desafiadora. Inicialmente, esse método detalhava a remoção de 0,5 mL de buffy coat, porém foi aumentado para 1 mL para melhorar a recuperação. Para garantir a recuperação adequada e consistente do buffy coat, detalhar esse processo é importante na documentação e no treinamento do protocolo. Recomenda-se girar a ponta de uma pipeta enquanto aspira o revestimento leucocitário, tomando cuidado para não aspirar muitas hemácias da camada abaixo (etapa 2.3). É importante não saturar o coquetel de anticorpos que se liga às células indesejadas (ou seja, granulócitos e glóbulos vermelhos), o que pode afetar o rendimento e a pureza10. Para minimizar as hemácias coletadas durante a extração do revestimento leucocitário, a ponta da pipeta deve estar entre a camada de plasma e o revestimento leucocitário. O volume do revestimento leucocitário pode ser aumentado de 1 mL; no entanto, deve-se tomar cuidado, conforme descrito acima, para garantir que não mais do que 10% do volume coletado contenha hemácias. Alternativamente, um manipulador automatizado de líquidos pode ser usado para coletar buffy coats de forma consistente18. No entanto, as horas dedicadas necessárias para calibrar e solucionar problemas de protocolos de instrumentos de manuseio de líquidos, especialmente considerando a despesa, podem não ser viáveis para a maioria dos laboratórios.
A transição e aplicação do protocolo baseado em esferas de automação foi essencial, dado o objetivo do NSW Health Statewide Biobank de processar 23.000 PBMCs nos próximos 3 anos. Aqui, foi demonstrado que as PBMCs podem ser isoladas de tubos de ACD até 9 dias após a coleta com viabilidades médias >70%. Embora os rendimentos tenham sido ótimos 24 horas após a coleta, o processamento dentro desse período nem sempre é viável, pois as amostras podem precisar ser transportadas. Foi demonstrado que as PBMCs isoladas com o método manual ou automatizado baseado em esferas podem ter rendimentos de >3 x 105 células/mL de sangue total quando isoladas dentro de 4 dias após a coleta e >1 x 10,5 células/mL de sangue total quando isoladas dentro de 10 dias após a coleta. Números baixos para amostras acima de 5 dias são observados como uma limitação desta análise. Além disso, os dados não foram separados com base na idade, sexo e história clínica dos participantes, pois essas informações não foram disponibilizadas. Embora uma análise comparativa seja necessária para examinar os efeitos dos atrasos nos tempos de processamento para ambos os métodos, foi relatado anteriormente que atrasos no isolamento de PBMC usando o método de gradiente de densidade diminuem a qualidade celular e aumentam significativamente a contaminação de hemácias19,20. Além disso, as proporções de granulócitos aumentam se o processamento for retardado e, portanto, espécimes de “idades” semelhantes devem ser agrupados para análises a jusante 20,21,22. É importante notar que este experimento foi realizado usando sangue anticoagulado com dextrose cítrica ácida (ou seja, citrato trissódico, ácido cítrico e dextrose); no entanto, o rendimento e/ou proporção de tipos celulares pode variar se outros anticoagulantes forem usados23; portanto, os investigadores são aconselhados a escolher um anticoagulante apropriado com base nas análises de PBMC a jusante pretendidas.
Em resumo, um protocolo para isolamento de PBMC usando esferas magnéticas que é adaptável a fluxos de trabalho de alto rendimento é detalhado para atender aos requisitos de dimensionamento sem comprometer a viabilidade celular. Tanto o método manual quanto o automatizado podem ser otimizados para produzir concentrações celulares específicas, alterando os volumes inicial e de ressuspensão. O NSW Health Statewide Biobank fez a transição da extração de ~ 60 PBMCs por mês usando a técnica tradicional de separação de gradiente de densidade para ~ 300 PBMCs por mês usando este método baseado em esferas compatível com automação. O próximo objetivo dos autores é usar a plataforma automatizada para processar até 1200 PBMCs por mês e comparar ainda mais PBMCs isolados por técnicas baseadas em esferas magnéticas (manuais e automatizadas) e gradiente de densidade para orientar a implementação dessa técnica para outros laboratórios com foco particular em biobancos.
The authors have nothing to disclose.
O NSW Health Statewide Biobank agradece o apoio da NSW Health Pathology, do NSW Office for Health and Medical Research e do Sydney Local Health District. Além disso, os autores agradecem à Omico e a outros estudos de pesquisa apoiados pelo NSW Health Statewide Biobank por conceder permissão para publicar dados gerados internamente e usar amostras não utilizadas para fins de pesquisa. Os autores agradecem à professora Jennifer Bryne (NSW Health Pathology, University of Sydney) pela liderança crítica e discussões. A Figura 1 foi criada com BioRender.com.
Cell cryopreservation media CS10, 100 mL (CRYOSTOR) | StemCellTM Technologies | 07930 | |
Class II Biological Safety Cabinet | Thermo ScientififcTM | 51033311 | |
CoolCell 1 mL FX | BioTools | BCS-407P | This is the control rate freezing container used. |
Distilled Water | Bacto Laboratories | 561832 | |
DxH 500 Hematology Analyzer | Beckman Coulter Life Sciences | B40601 | Referred to as external automated cell counter. |
EasyEightsTM EasySepTM Magnet | StemCellTM Technologies | 18103 | |
EasySepTM Direct Human PBMC Isolation Kit | StemCellTM Technologies | 19654 | Kit includes the magnetic bead tube and the cocktail mix tube |
Ethylenediaminetetraacetic acid | Sigma-Aldrich Pty Ltd | E6758-500G | Instructions to make 0.1M EDTA solution from EDTA salt is located in supplemental file 2. |
LymphoprepTM Density Gradient Medium | StemCellTM Technologies | 7851 | |
Megafuge ST4 Plus Centrifuge | Thermo ScientififcTM | THR75009903 | |
Orion Star A211 pH meter electrode | Thermo ScientififcTM | STARA2110 | |
Orion™ ROSS Ultra™ Glass Triode™ pH/ATC Combination Electrodes | Thermo ScientififcTM | 8302BNURCA | |
Phosphate buffered saline (PBS), solution, 1X, 500ml | Life Technologies Australia Pty Ltd | 10010023 | |
Prism | GraphPad | ||
RoboSepTM Buffer 1X | StemCellTM Technologies | 20104 | Software used for statistical analysis. |
RoboSepTM-S | StemCellTM Technologies | 21000 | Fully automated cell separator instrument. |
RoboSep™ Filter Tips | StemCellTM Technologies | 20125 | |
SepMateTM-50 (IVD) tubes | StemCellTM Technologies | 85460 | IVD – In vitro diagnostics. Also known as SepMateTM-50 tubes |
Vi-CELL XR Cell Anlayzer | Beckman Coulter Life Sciences | Internal automated cell counter. Instrument obsolete and no longer available for purchase (as of December 31, 2022). Alternative instrument is the ViCell BLU Cell Viability Analyzer (Product no. C19196). | |
Vi-CELL XR Quad Pack Reagent Kit | Beckman Coulter Life Sciences | 383722 |
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