Akciğer kesitleri oluşturmak için vibratom ve agaroza gömülü akciğer dokusu kullanan bir doku işleme tekniği geliştirdik, böylece akciğer mimarisinin yüksek çözünürlüklü görüntülerinin elde edilmesine izin verdik. Spesifik akciğer yapısal belirteçleri kullanarak uzamsal protein ekspresyonunu gözlemlemek için immünofloresan boyama kullandık.
Doğal yapısal kırılganlığı nedeniyle akciğer, mikroskobik okumalar için işlenmesi en zor dokulardan biri olarak kabul edilir. Kesit için yapısal destek eklemek için, akciğer dokusu parçaları genellikle parafin veya OCT bileşiğine gömülür ve sırasıyla bir mikrotom veya kriyostat ile kesilir. Hassas kesilmiş akciğer dilimleri olarak bilinen daha yeni bir teknik, agaroz infiltrasyonu yoluyla taze akciğer dokusuna yapısal destek ekler ve kültürde birincil akciğer dokusunu korumak için bir platform sağlar. Bununla birlikte, epitop maskeleme ve doku distorsiyonu nedeniyle, bu tekniklerin hiçbiri, çoklu antikor ve türler arasında uyumlu olacak tekrarlanabilir gelişmiş ışık görüntüleme okumalarının geliştirilmesine yeterince katkıda bulunmaz.
Bu amaçla, otomatik vibratom kesitine bağlı olarak sabit akciğer dokusunun agaroz gömülmesini kullanan bir doku işleme boru hattı geliştirdik. Bu, fare, domuz ve insan akciğerlerinde 200 μm ila 70 μm kalınlığında, antijen alımı gerektirmeyen ve doğal izole dokunun en az “işlenmiş” versiyonunu temsil eden akciğer bölümlerinin oluşturulmasını kolaylaştırdı. Bu dilimleri kullanarak, uzamsal protein ekspresyonu akciğer hasarı ve rejenerasyonunun altında yatan mekanizmaları ölçmek ve daha iyi anlamak için kullanılabilecek yüksek çözünürlüklü görüntüler üretebilen bir multipleks görüntüleme okuması ortaya koyuyoruz.
Ex vivo akciğer dokusu dilimleri, akciğer hastalığınınincelenmesinde yaygın olarak kullanılmaktadır 1. Mevcut altın standartlar, özellikle klinik ve translasyonel büyük hayvan çalışmalarında, akciğer disfonksiyonunu değerlendirmek ve derecelendirmek için parlak alan mikroskobu ve gözlemci tabanlı puanlama ile birlikte hematoksilen ve eozin boyamayı kullanır 2,3. Hala değerli bir teknik olsa da, uzamsal çözünürlük ve aynı anda görüntülenebilen işaretleyici sayısı açısından sınırlamalar sergiler. Ayrıca, akciğer dokusunun kapsamlı solvent bazlı yıkamalara tabi tutulması gerekir, bu da son görüntülemeden önce dokunun dehidrasyonu, büzülmesi ve rehidrasyonu ile sonuçlanır4. Bu süreç sadece zaman alıcı olmakla kalmaz, aynı zamanda çevre dostu değildir, protein epitoplarını maskeler ve yapısal doku değişikliklerineneden olabilir 5,6,7,8. Bununla birlikte, akciğer dokusu için, akciğerin yapısal kırılganlığı nedeniyle kesit almadan önce parafine gömülmesi bir zorunluluk olmuştur. Buna karşılık, beyin gibi katı organlar, hem sabit hem de taze dokudatitreşen bir mikrotom (vibratom) kullanılarak kesilebilir 9,10,11,12.
Akciğer dokusunda vibratom kesitini mümkün kılmak için, düşük erime noktalı agarozun hava yolları veya kan damarları yoluyla taze akciğer dokusuna enjekte edildiği ve katılaşmaya bırakıldığı hassas kesilmiş akciğer dilimleri (PCLS) olarak adlandırılan bir yöntem oluşturulmuştur13,14. Hava yollarındaki agaroz, daha sonra vibratom kesitine izin vermek için yeterli yapısal destek sağlar 9,14. Kemirgenlerde, agaroz trakea yoluyla enjekte edilebildiği için bunu başarmak kolaydır; Bununla birlikte, domuz ve insan dokusunda, belirli bir biyopsi içinde uygun bir hava yolu/damar bulmak zor olabilir15,16. Ayrıca, böyle bir hava yolu/damar bulunsa bile, agarozu enjekte etmek için genellikle önemli bir kuvvet gerekir ve bu da sonraki akciğer morfolojisinietkileyebilir 17.
Parafin gömme/kesitleme/boyama ve PCLS iş akışında yaşanan zorlukların üstesinden gelmek için, sabit akciğer dokusu için yeni bir işleme hattı oluşturduk. Bu iş akışı, kesit alma için vibratom kullanımına izin verir, PCLS’den daha ince dilimler üretebilir ve multipleks floresan görüntüleme için antijen alımı gerektirmeyen dilimler verir. Bu yöntem, gelişmiş ışık mikroskobunda kullanılabilecek akciğer kesitleri oluşturmak için “en az işleme” aracı sunar. Ayrıca, görüntüleme okumaları, dokunun hacimsel mimarisini yakalayarak akciğer dokusu içindeki hücrelerin ve anatomik yapıların uzamsal ilişkilerini göstermek için kullanılabilir 18,19,20,21. Bu makale, bu akciğer kesitlerini oluşturmak için protokolü açıklar ve bu dokuların her birine uygulanan multipleks boyaları ve bu gelişmiş görüntüleme verilerinin miktar tayini için nasıl kullanılabileceğini gösterir.
Bu protokolde, akciğer kesitleri oluşturmak için geliştirilmiş vibratom tabanlı bir yöntem sunuyoruz. Parafin bazlı işleme teknikleriyle karşılaştırıldığında, bu yöntem daha uygun maliyetli, zaman açısından verimli ve çevre için daha iyidir22. Ayrıca, bu yöntem pulmoner doku dilimlerinin yapısal bütünlüğünün korunmasına yardımcı olur ve antijen alımına gerek kalmadan gelişmiş immünofloresan görüntülemeye izin verir. Ancak, denemelerimiz sırasında bu iş akışında bazı sınırlamalar da bulduk. Hastalıklı akciğerler, patolojik değişikliklerin neden olduğu doku tahribatı nedeniyle kesme işlemine müdahale edebilir. Vibratomu kesit için kullanırken, hava yolu tıkanıklıkları ve şiddetli fibrotik akciğer dokusu bıçağı engelleyebilir ve bu dokuları dilimleme işlemini daha zor hale getirebilir. Bununla birlikte, bıçak hızını azaltarak ve dokuyu ince bir boya fırçası ile destekleyerek bunun üstesinden gelinebilir. Benzer zorluklar, plörezi, kronik obstrüktif akciğer hastalığı (KOAH) ve idiyopatik pulmoner fibrozda (İPF) yaygın bir sonuç olan plevranın kalınlaşmasından kaynaklanmaktadır23,24,25. Plevra bir deney için ilgi çekici değilse, kesit almadan önce veya plevradan bir akciğer hacmini izole ederek çıkarmanızı öneririz. Plevra gerekliyse, daha yavaş bıçak hızları ve ince bir fırçadan dilim desteği içeren yukarıdakine benzer bir manipülasyon kullanılarak dilimlenebilir.
Hassas kesilmiş akciğer dilimleri, akciğerinüç boyutlu mimarisini ve doğal ortamını koruyabilirken, PCLS oluşturmanın karmaşık ve zaman alıcı bir süreç olduğuna dikkat etmek önemlidir. Akciğer dokusu dilimleri üretmenin başarısı büyük ölçüde agaroz dolgusunun etkinliğine bağlıdır ve bu da elde edilen dokuda sağlam plevra ve canlı enjeksiyon bölgelerinin varlığından etkilenir. Agaroz trakea yoluyla sağlam akciğerlere kolayca sokulabildiğinden, kemirgenlerde bunu başarmak kolaydır27,28,29. Bununla birlikte, büyük hayvan araştırmalarında, bir deney boyunca alınan biyopsiler tipik olarak,kanül 30,31 için yeterince büyük bir hava yolu olmayan distal akciğer segmentlerinden alınır. Bu nedenle, agarozu bronşlara veya kan damarlarına enjekte etmek yerine, akciğer dokusunun, menşe türü veya numune hacmi ne olursa olsun, akciğer dokusu dilimleri oluşturmak için düşük erime noktalı agaroza gömüldüğü bu yöntemi benimsiyoruz. Bu yaklaşım teknik olarak daha kolaydır ve doku hasarını mümkün olduğunca en aza indirmeyi amaçlar. Deneyimlerimize dayanarak, bu yöntem akciğer dokusu kesitlerinin oluşturulmasında daha yüksek verimlilik ve kolaylık göstermiştir. Alveollerin morfolojisini etkili bir şekilde korur ve özellikle akciğer dokusunu kesmek için uygundur ve tekrarlanabilir yüksek çözünürlüklü multipleks floresan görüntülemenin oluşturulmasını sağlar.
Bu çalışmada, üretilen görüntüleme verileri için iki örneklem tabanlı niceleme daha da gösteriyoruz. İlki, tür örnekleri arasında alveolar boyuttaki farklılıkları değerlendirmek için görüntü izlemeyi kullandı. Şaşırtıcı olmayan bir şekilde, fare alveolleri en küçüğüydü, domuz ve insan alveolleri ise benzer boyuttaydı, bu da domuzları akciğer araştırmaları için ilginç bir translasyonel model olarak vurguladı.
İkinci miktar tayini için, yetişkin ve bebek akciğer örneği arasındaki HTII dağılımını karşılaştırdık. Tip 2 pnömositler, distal akciğer epitelinin yapısında hayati bir rol oynar. TII’lerin bu eşsiz yeteneği, alveolar epitelin32 onarımına ve yenilenmesine katkıda bulunur. Sağlıklı yetişkin insan akciğerinde, TII’ler toplam hücre popülasyonunun yaklaşık %15’ini oluştururken, alveolar yüzey alanını kapsama alanlarının yaklaşık %5 olduğu tahmin edilmektedir33. HTII-280, alveolar epitel hücrelerinin gelişimini ve yaralanmaya tepkisini incelemek için yaygın olarak tanınan akciğere özgü bir belirteçtir ve özellikle TII’lerin apikal plazma membranlarına lokalizedir. Deneyde, intraserebral kanama nedeniyle ölen ve eş zamanlı akciğer hasarı olan bir donör hastadan yetişkin dokusu elde edilirken, bebek örneği boğulmaya bağlı bir mortaliteden geldi. Bulgularımız, yetişkin akciğer örneğinde HTII-280 ekspresyonunun bebek örneğine göre anlamlı derecede düşük olduğunu göstermektedir. İlginç bir şekilde, HTII-280, HTII’lerin çoğunda eksprese edilirken, ekspresyonu doku kalitesinden de etkilenebilir ve yaralı insan akciğer dokusunda önemli ölçüde azalır34. Yaşlı akciğer dokuları, genç dokulara kıyasla TII’lerin sayısında ve salgı aktivitesinde önemli bir azalma sergiler ve yaşlı bireyler, bu genç dokulara kıyasla TII’lerin önemli ölçüde daha düşük proliferasyonu, sekresyonu ve anti-apoptotik aktivitesi gösterir35. Buna uygun olarak, insan TII’lerine özgü bir hücre yüzeyi proteininin tanımlanması ve saptanması, akciğer hasarının ciddiyetinin değerlendirilmesine ve akciğer onarımını arttırmayı amaçlayan tedavi yaklaşımlarının değerlendirilmesine yardımcı olabilir36,37. Bu nedenle, bu boru hattını kullanarak, daha geniş insan sağlık ve hastalık kohortlarında alveolar TII çalışmaları yapmak büyük ilgi görecektir.
Sonuç olarak, bu protokol akciğer dokusunun kesilmesi için daha hızlı ve kolay bir yaklaşım sunar. Bu yöntem, sağlam akciğer dokusu yapısının korunmasını sağlayarak akciğer dokusunun hazırlanması, kesilmesi ve boyanması için ayrıntılı talimatlar sağlar. Hem sağlıklı hem de hastalıklı akciğer mimarisini incelemek için modeli optimize ederek deneysel verimliliğin artmasına yol açar. Genel olarak, bu çalışma, türler arasında akciğer dokusu patofizyolojisinde karmaşık uzamsal biyolojiyi araştırmak için umut verici bir yaklaşım ortaya koymaktadır ve bu, hastalık ve onarımda rol oynayan moleküler mekanizmaların daha iyi anlaşılmasına yardımcı olabilir.
The authors have nothing to disclose.
Yazarlar, Wallenberg Moleküler Tıp Vakfı ve Lund Üniversitesi Kök Hücre Merkezi’nden alınan fonları minnetle kabul eder ve Nikon A1RHD’ye erişim için Lund Üniversitesi Biyogörüntüleme Merkezi’ne (LBIC) teşekkür eder.
24 well tissue culture inserts | SARSTEDT | 83.3932.300 | |
4% paraformaldehyde | SOLVECO | 6095714 | |
4’, 6-diamidino-2-phenylindole (DAPI) | Thermo Fisher scientific | D1306 | |
50 mL Falcon tube | SARSTEDT | 2045221 | |
Cluster of differentiation 31 (CD31) | Abcam | ab28364 | |
Confocal microscope | Nikon | A1R HD25 | |
Elastin | Abcam | ab23747 | |
Epredia X1000 Coverslip | Thermo Fisher scientific | 10318963 | |
Epredia SuperFrost Plus Adhesion slides | Thermo Fisher scientific | 10149870 | |
Forceps | AESCULAP | FB395R | |
Goat anti-mouse 647 | Invitrogen | A21235 | |
Goat anti-rabbit 568 | Invitrogen | A11011 | |
Human type II cells | Terrace Biotech | TB-27AHT2-280 | |
Invitrogen Fluoromount-G Mounting Medium | Thermo Fisher scientific | E41473 | |
Low gelling temperature Agarose | Sigma-Aldrich | 1003467046 | |
Lycopersicon Esculentum lectin | Thermo Fisher scientific | 2531965 | |
Phosphate-buffered saline (PBS) | Thermo Fisher scientific | 50-100-8798 | |
Plastic cup | kontorsgiganten | 885221 | |
Scissors | STILLE | 101-8380-18 | |
Smooth muscle actin | Abcam | ab5694 | |
Sodium azide | Sigma-Aldrich | K54329188239 | |
Super glue | LOCTITE | 2721643 | |
Vibrating microtome | Leica | VT1200S |