Bis heute sind Protokolle für die gleichzeitige Isolierung aller wichtigsten Zelltypen des Zentralnervensystems aus derselben Maus ein ungedeckter Bedarf. Das Protokoll zeigt ein Verfahren, das in naiven und experimentellen autoimmunen Enzephalomyelitis-Mäusen angewendet werden kann, um komplexe zelluläre Netzwerke während der Neuroinflammation zu untersuchen und gleichzeitig die erforderliche Anzahl von Mäusen zu reduzieren.
Die experimentelle autoimmune Enzephalomyelitis (EAE) ist das häufigste Mausmodell für Multiple Sklerose (MS) und wird häufig verwendet, um die noch unbekannte Ätiologie der MS weiter aufzuklären und neue Behandlungsstrategien zu entwickeln. Das EAE-Modell des Myelin-Oligodendrozyten-Glykoproteinpeptids 35-55 (MOG35-55) reproduziert einen selbstlimitierenden monophasischen Krankheitsverlauf mit aufsteigender Lähmung innerhalb von 10 Tagen nach der Immunisierung. Die Mäuse werden täglich mit einem klinischen Scoring-System untersucht. MS wird durch verschiedene Pathomechanismen mit einem bestimmten zeitlichen Muster angetrieben, daher ist die Untersuchung der Rolle von Zelltypen des Zentralnervensystems (ZNS) während des Krankheitsverlaufs von großem Interesse. Das einzigartige Merkmal dieses Protokolls ist die gleichzeitige Isolierung aller wichtigsten ZNS-residenten Zelltypen (Mikroglia, Oligodendrozyten, Astrozyten und Neuronen), die bei erwachsenen EAE und gesunden Mäusen anwendbar sind. Auf die Dissoziation des Gehirns und des Rückenmarks von erwachsenen Mäusen folgt die magnetisch aktivierte Zellsortierung (MACS), um Mikroglia, Oligodendrozyten, Astrozyten und Neuronen zu isolieren. Die Durchflusszytometrie wurde verwendet, um Qualitätsanalysen der gereinigten Einzelzellsuspensionen durchzuführen, die die Lebensfähigkeit nach der Zellisolierung bestätigten und die Reinheit jedes Zelltyps von etwa 90 % angaben. Zusammenfassend lässt sich sagen, dass dieses Protokoll eine präzise und umfassende Möglichkeit bietet, komplexe zelluläre Netzwerke in gesunden und EAE-Mäusen zu analysieren. Darüber hinaus kann die Anzahl der benötigten Mäuse erheblich reduziert werden, da alle vier Zelltypen aus denselben Mäusen isoliert werden.
Multiple Sklerose (MS) ist eine chronisch-entzündliche Autoimmunerkrankung des Zentralnervensystems (ZNS), die durch Demyelinisierung, axonale Schäden, Gliose und Neurodegeneration gekennzeichnet ist. Trotz zahlreicher Forschungsansätze auf diesem Gebiet ist die Pathophysiologie der MS noch nicht vollständig verstanden 1,2,3,4. Das häufigste Tiermodell zur Untersuchung von MS ist die durch Myelin-Oligodendrozyten induzierte experimentelle autoimmune Enzephalomyelitis (EAE) mit Myelin-Oligodendrozyten-Glykoproteinpeptid 35-55 (MOG35-55), die viele ihrer klinischen und pathophysiologischen Merkmale aufweist 5,6,7,8,9 . Sie basiert auf der Reaktion des Immunsystems auf ZNS-spezifische Antigene, die zu Entzündungen, Demyelinisierung und neuroaxonaler Degeneration führen. Die experimentelle autoimmune Enzephalomyelitis (EAE) ist ein geeignetes Modell für die Untersuchung neuroinflammatorischer Signalwege und Signalkaskaden bei MS.
Derzeitige Therapiemöglichkeiten bei MS sind nur bedingt wirksam und konzentrieren sich vor allem auf die initiale Entzündungsphase der Erkrankung. Die neurodegenerative Komponente der MS scheint jedoch die größte Herausforderung für langfristige Therapieansätze zu sein. Daher sind reproduzierbare und präzise Zellisolationsprotokolle erforderlich, um molekulare und zelluläre Mechanismen bei Autoimmunerkrankungen umfassend zu untersuchen. Auch wenn einige Protokolle für die Isolierung eines einzelnen Zelltyps existieren 10,11,12,13,14,15, besteht ein ungedeckter Bedarf an der gleichzeitigen Isolierung mehrerer ZNS-residenter Zellpopulationen auf einmal. Bisherige Protokolle zur Isolierung von ZNS-residenten Zellen sind nicht in der Lage, die zelluläre Funktionalität und Reinheit zu erhalten, was zu einer Kokultivierung mit benachbarten Zellenführt 16,17,18 oder der Ungeeignetheit für komplexe Analysen intrazellulärer Netzwerke ex vivo19,20,21,22.
Das Ziel dieses Protokolls war es, eine reproduzierbare und umfassende Methode zur gleichzeitigen Isolierung von reinen, lebensfähigen Einzelzellsuspensionen aller wichtigsten ZNS-residenten Zelltypen zu etablieren, die in adulten gesunden und EAE-Mäusen anwendbar sind. Die verschiedenen Zelltypen wurden mittels magnetisch aktivierter Zellsortierung (MACS) isoliert23. Die Zelltrennung kann entweder durch positive Selektion, d.h. magnetische Markierung von zelltypspezifischen Oberflächenmarkern, oder durch negative Selektion durch Biotinylierung und Depletion aller unerwünschten Zellen erfolgen. Die Durchflusszytometrie wurde angewendet, um eine Reinheit von über 90 % und eine Viabilität von mindestens 80 % der isolierten Einzelzellsuspensionen sicherzustellen.
Zusammenfassend war das Hauptziel, ein Protokoll für die gleichzeitige Isolierung aller wichtigen ZNS-residenten Zelltypen als vielseitiges Werkzeug für die Untersuchung neuroinflammatorischer Signalwege zu etablieren, das eine umfassende und präzise Analyse komplexer zellulärer Netzwerke und biochemischer Signalkaskaden in gesunden und EAE-Mäusen ermöglicht.
Bisher bieten Methoden zur Kartierung von ZNS-residenten Zellen ex vivo durch die Kombination von Massenspektrometrie und RNA-Sequenzierung ein sehr präzises zelluläres Profiling in Gesundheit und Krankheit, erfordern jedoch ehrgeizige technische Kenntnisse und Expertise auf diesem Gebiet50,51. Darüber hinaus erlauben sie keine Funktionsanalysen und sind sehr teuer. Darüber hinaus bieten mikrofluidische Brain-on-a-Chip-Systeme ein schnelles und kostengünstiges Screening auf Krankheitsmechanismen und die Erprobung neuer therapeutischer Ansätze mit der Einschränkung des Zellwachstums und der Zellmigration 52,53,54,55. ZNS-Organoide könnten in Zukunft auch eine gleichwertige Alternative für die Untersuchung von zellulärer Modellierung, interzellulären Verbindungen und Interaktionen während Krankheitsverläufen darstellen 56,57,58,59. Fluoreszenz- und magnetisch aktivierte Zellsortierung sind jedoch derzeit die effektivsten Methoden, um reine und lebensfähige Einzelzellsuspensionen ex vivo zu erzeugen 35,60,61. Auch wenn andere etablierte Fertigungsprotokolle zur Isolierung von ZNS-residenten Zelltypen hinsichtlich der einzelnen Schritte der magnetischen Isolierung und der vorangegangenen Zelldissoziation ähnlich sind, sollen sie für jeden Zelltyp separat durchgeführt werden. Im Gegensatz dazu integriert das derzeitige Protokoll verschiedene Isolationsmethoden für jeden ZNS-residenten Zelltyp in einen logischen Kontext, so dass sie gleichzeitig und aus einer einzigen ZNS-Zellsuspension durchgeführt werden können (Tabelle 1, Tabelle 2). So ermöglicht es Multi-Omics-Analysen aus einer einzigen ZNS-Zellsuspension und schließlich die Erforschung komplexer neuronaler Netzwerke. Auch wenn es nicht unbedingt notwendig ist, mehrere Gewebe von mehreren Tieren zu poolen, um dieses Protokoll durchzuführen, stellt dieses Pooling eine ausreichende Anzahl isolierter Zellen für die weitere nachgeschaltete Analyse sicher. Die Verwendung verschiedener Mäuse zur Isolierung der einzelnen Zelltypen würde die Analyse möglicher zellulärer Interaktionen ausschließen. Darüber hinaus spart die Kombination individueller Isolationsmethoden für die verschiedenen ZNS-Zelltypen, die alle einer vorherigen ZNS-Dissoziation folgen, Materialkosten, indem eine dissoziierte ZNS-Zellsuspension für alle folgenden magnetischen Isolationsschritte verwendet wird. Darüber hinaus wird eine mögliche technische Verzerrung, die durch die Verwendung verschiedener Mäuse verursacht wird, minimiert.
Eine Einschränkung des Protokolls könnte die fast ausschließliche Verwendung von weiblichen C57BL/6J-Mäusen sein. Das EAE-Immunisierungsprotokoll wurde für weibliche Mäuse entwickelt und etabliert, so dass dieses Zellisolationsprotokoll auch bei weiblichen C57BL/6J-Mäusen implementiert wurde. Nichtsdestotrotz wurden bei der Entwicklung dieses Protokolls auch naive männliche Mäuse verwendet, ohne einen Einfluss auf die resultierende Zellzahl oder Reinheit zu erkennen. Eine weitere Einschränkung betrifft die magnetische Zellisolierung von Neuronen, da es keine spezifischen Mikrokügelchen für die Isolierung von Neuronen im Sinne einer positiven Selektion gibt. Es wurde angenommen, dass eine reine Einzelzellsuspension durch Biotinmarkierung und Depletion aller nicht-neuronalen Zellen erhalten werden kann (Tabelle 2). Diese Annahme wurde durch die Verwendung von NeuN als spezifischer nukleärer Marker für Neuronen verifiziert, der in das erwähnte Durchflusszytometrie-Reinheitspanel integriert ist. Eine weitere Einschränkung betrifft die Isolierung von Mikroglia in EAE-Mäusen. Hier sind die resultierenden Zellausbeuten im Vergleich zu den anderen Zelltypen aufgrund des zusätzlichen Sortierschritts nach dem MACS-Protokoll geringer. Darüber hinaus könnte man argumentieren, dass die Sortierung die mechanische Belastung der Mikroglia im Vergleich zu den anderen Zellpopulationen erhöht. Individuelle Sortierstrategien können zu unterschiedlich hohen Zellausbeuten führen. Wenn die Anzahl der isolierten Zellen geringer ist als erwartet oder gewünscht, wird empfohlen, den Gating-Aufbau anzupassen und/oder die Unterscheidung zwischen lebend und tot zu verbessern.
Ein kritischer Schritt im Protokoll stellt die Entfernung von Ablagerungen dar. Der Farbverlauf muss sehr langsam und sanft geschichtet werden, um die drei gewünschten separaten Phasen zu erzeugen (Abbildung 2A). Nur wenn das Myelin und andere Trümmerrückstände in den beiden oberen Phasen vollständig entfernt werden (Abbildung 2E), können reine Einzelzellsuspensionen erzeugt und weitere Kontaminationen reduziert werden. Wenn es den resultierenden Zellsuspensionen an Reinheit mangelt, ist dies wahrscheinlich der Abschnitt des Protokolls, der neben der Sicherstellung der richtigen Verwendung aller Mikrokügelchen zuerst verbessert werden sollte.
Das Erreichen eines hohen Reinheits- und Lebensfähigkeitsniveaus kann bei dieser Art von Experimenten eine Herausforderung sein. Einige Empfehlungen zur Fehlerbehebung sind:
-Das Arbeiten unter sterilen Bedingungen ist zwingend erforderlich, um eine Kontamination der verschiedenen Mikrokügelchen zu verhindern und eine wiederholte Verwendung zu ermöglichen, insbesondere für die anschließende Kultivierung.
-Es wird dringend empfohlen, jedes Röhrchen zu beschriften, um Verwechslungen zu vermeiden.
-Vermeiden Sie die Verwendung von ungekühlten Reagenzien/Puffern. Lagern Sie alle Zellsuspensionen während des gesamten Experiments auf Eis, um eine hohe Lebensfähigkeit zu gewährleisten.
-Halten Sie die Zeit zwischen den verschiedenen Arbeitsschritten so kurz wie möglich. Es gibt keinen bestimmten Teil im Protokoll, in dem das Anhalten des Experiments empfohlen wird.
-Es ist von hoher Relevanz, die angegebenen Inkubationszeiten einzuhalten.
Zusammenfassend lässt sich sagen, dass dieses aktuelle Protokoll zur gleichzeitigen Isolierung aller wichtigen ZNS-residenten Zelltypen aus einem ZNS-Replikat die Möglichkeit bietet, komplexe neuronale Netzwerke und neuroinflammatorische Signalwege ex vivo aus einer ZNS-Zellsuspension zu analysieren. So können ZNS-residente Zellen in verschiedenen Stadien von Krankheitsverläufen untersucht werden, z.B. während der Neuroinflammation, Neurodegeneration und/oder Remission bei EAE. Darüber hinaus können Zell-Zell-Interaktionen und biochemische Signalwege auf individueller Ebene untersucht und die Variabilität innerhalb von Versuchsgruppen reduziert werden. Es besteht auch die Möglichkeit, Fraktionen der isolierten ZNS-Zellen in Monokulturen für weitere funktionelle Assays und Validierungen zu kultivieren. Alles in allem bietet dieses Protokoll bedeutende Fortschritte, die sich potenziell auf präklinische und klinische Forschungsansätze auswirken.
The authors have nothing to disclose.
Die Figuren wurden mit Adobe Illustrator (Version 2023) und Servier Medical Art (https://smart.servier.com) erstellt. Antonia Henes wurde von der Jürgen Manchot Stiftung unterstützt.
70 μm cell strainers | Corning, MA, USA | 352350 | CNS tissue dissociation |
ACSA-2 Antibody, anti-mouse, PE-Vio 615 (clone REA-969) | Miltenyi Biotec, Bergisch Gladbach, NRW, Germany | 130-116-244 | Flow cytometry, store at 4 °C |
Adult Brain Dissociation Kit, mouse, and rat | Miltenyi Biotec, Bergisch Gladbach, NRW, Germany | 130-107-677 | Tissue dissociation,contains debris and red blood cell removal solutions; prepare aliquots of enzyme A and P upon arrival and store them at -20 °C; store the remaining kit at 4 °C |
Anti-ACSA-2 MicroBead Kit, mouse | Miltenyi Biotec, Bergisch Gladbach, NRW, Germany | 130-097-678 | MACS of astrocytes, store at 4 °C |
Anti-mouse CD16/32 antibody | BioLegend, London, UK | 101301 | Flow cytometry, store at 4 °C |
Anti-O4 MicroBeads, human, mouse, rat | Miltenyi Biotec, Bergisch Gladbach, NRW, Germany | 130-094-543 | MACS of oligodendrocytes, store at 4 °C |
AstroMACS Separation buffer | Miltenyi Biotec, Bergisch Gladbach, NRW, Germany | 130-091-221 | MACS of astrocytes, store at 4 °C |
Biotin Antibody, PE (clone Bio3-18E7) | Miltenyi Biotec, Bergisch Gladbach, NRW, Germany | 130-113-853 | Flow cytometry, store at 4 °C |
BRAND Neubauer counting chamber | Thermo Fisher Scientific,Waltham, MA, USA | 10195580 | Cell counting |
Brilliant Violet 510 anti-mouse CD45 Antibody (clone 30-F11) | BioLegend, London, UK | 103137 | Flow cytometry, store at 4 °C |
CD11b MicroBeads, human, mouse | Miltenyi Biotec, Bergisch Gladbach, NRW, Germany | 130-049-601 | MACS of microglia, store at 4 °C |
DNAse I, recombinant, Rnase-free | Merck KGaA, Darmstadt, Germany | 4716728001 | Flow cytometry, store at -20° C |
D-PBS with Calcium, Magnesium, Glucose, Pyruvat | Thermo Fisher Scientific,Waltham, MA, USA | 14287080 | Buffer, store at 4 °C |
D-PBS, without calcium, without magnesium | Thermo Fisher Scientific,Waltham, MA, USA | 14190250 | Buffer, store at 4 °C |
eBioscience Fixable Viability Dye eFluor 780 | Thermo Fisher Scientific,Waltham, MA, USA | 65-0865-14 | Flow cytometry, store at 4 °C |
eBioscience Foxp3/Transcription factor staining buffer set | Thermo Fisher Scientific,Waltham, MA, USA | 00-5523-00 | Flow cytometry, store at 4°C |
Falcon (15 mL) | Thermo Fisher Scientific,Waltham, MA, USA | 11507411 | Cell tube |
Falcon (50 mL) | Thermo Fisher Scientific,Waltham, MA, USA | 10788561 | Cell tube |
Falcon Round-Bottom Polystyrene Test Tubes with Cell Strainer Snap Cap, 5 mL | Thermo Fisher Scientific,Waltham, MA, USA | 08-771-23 | Flow cytometry |
FcR Blocking Reagent, mouse | Miltenyi Biotec, Bergisch Gladbach, NRW, Germany | 130-092-575 | MACS of oligodendrocytes, store at 4 °C |
Female C57BL/6J mice | Charles River Laboratories, Sulzfeld, Germany | Active EAE induction | |
Fetal calf serum (FCS) | Merck KGaA, Darmstadt, Germany | F2442-50ML | Flow cytometry, store at -5 to -20 °C |
FITC Rat Anti-CD 11b (clone M1/70) | BD Biosciences, San Jose, CA, USA | 553310 | Flow cytometry, store at 4 °C |
Freund’s Complete adjuvant | Merck KGaA, Darmstadt, Germany | AR001 | Active EAE induction, store at 4 °C |
GentleMACS C Tubes | Miltenyi Biotec, Bergisch Gladbach, NRW, Germany | 130-093-237 | CNS tissue dissociation |
GentleMACS Octo Dissociator with Heaters | Miltenyi Biotec, Bergisch Gladbach, NRW, Germany | 130-096-427 | CNS tissue dissociation |
Graphpad Prism 8.4.3 | Graphpad by Dotmatics | Graphical Analysis | |
Isoflurane | AbbVie, North Chicago, IL, USA | Active EAE induction, store at 4 °C | |
Kaluza Analysis Software V2.1.1 | Beckman Coulter, Indianapolis, IN, USA | Flow cytometry analysis | |
LS Columns | Miltenyi Biotec, Bergisch Gladbach, NRW, Germany | 130-042-401 | MACS |
MACS BSA Stock Solution | Miltenyi Biotec, Bergisch Gladbach, NRW, Germany | 130-091-376 | PB-buffer |
MACS MultiStand | Miltenyi Biotec, Bergisch Gladbach, NRW, Germany | 130-042-303 | MACS |
MOG35–55 peptide | Charité, Berlin, Germany; alternatives: Genosphere Biotechnologies (Paris, France) or sb-Peptide (Saint Egrève, France) | Active EAE induction, store at -20 °C | |
Mycobacterium tuberculosis strain H37 Ra | Becton, Dickinson and Company (BD),Franklin Lakes, NJ, USA | Active EAE induction, store at 4 °C | |
Neuron Isolation Kit, mouse | Miltenyi Biotec, Bergisch Gladbach, NRW, Germany | 130-115-390 | MACS of neurons, store at 4 °C |
O4 Antibody, anti-human/mouse/rat, APC, (clone REA-576) | Miltenyi Biotec, Bergisch Gladbach, NRW, Germany | 130-119-897 | Flow cytometry, store at 4 °C |
Pertussis toxin in glycerol | Hooke Laboratories Inc., Lawrence, MA, USA | BT-0105 | Active EAE induction; store at -20 °C |
pluriStrainer Mini 100 μm | pluriSelect Life Science UG, Leipzig, Sachsen, Germany | 43-10100-40 | Flow cytometry |
QuadroMACS Separator | Miltenyi Biotec, Bergisch Gladbach, NRW, Germany | 130-090-976 | MACS |
Recombinant Alexa Fluor 647 Anti-NeuN antibody (clone EPR12763) | Abcam, Cambridge, UK | EPR12763 | Flow cytometry, store at -20 °C |
Stainless Steel Brain Matrices, 1 mm | Ted Pella, Redding, CA, USA | 15067 | CNS tissue dissection |
Trypan blue solution, 0.4% | Thermo Fisher Scientific,Waltham, MA, USA | 15250061 | Cell counting |
UltraPure 0.5 M EDTA, pH 8.0 | Thermo Fisher Scientific,Waltham, MA, USA | 15575020 | Flow cytometry, store at room temperature |