עוברי אפרוחים משמשים לחקר גידולי מוח מסוג גליובלסטומה אנושית (GBM) בתרביות משותפות של פרוסות מוח ב-ovo וב-ex vivo. ניתן לתעד התנהגות תאי GBM במיקרוסקופ בהילוך מהיר בתרביות משותפות ex vivo, וניתן לנתח את שני התכשירים בנקודת הקצה של הניסוי על ידי ניתוח קונפוקלי תלת-ממדי מפורט.
עובר האפרוחים היה מערכת מודל אידיאלית לחקר התפתחות בעלי חוליות, במיוחד למניפולציות ניסיוניות. השימוש בעובר האפרוח הורחב לחקר היווצרותם של גידולי מוח מסוג גליובלסטומה אנושית (GBM) in vivo ופולשניות תאי הגידול לרקמת המוח הסובבת אותו. גידולי GBM יכולים להיווצר על ידי הזרקה של תרחיף של תאים המסומנים באופן פלואורסצנטי לחדר E5 של המוח התיכון (טקטום אופטי) באובו.
בהתאם לתאי GBM, גידולים קומפקטיים נוצרים באופן אקראי בחדר ובתוך דופן המוח, וקבוצות תאים פולשות לרקמת דופן המוח. קטעי רקמה עבים (350 מיקרומטר) של טקטה E15 קבועה עם גידולים יכולים להיות מוכתמים חיסונית כדי לגלות כי תאים פולשים לעתים קרובות נודדים לאורך כלי הדם כאשר מנותחים על ידי שחזור תלת ממדי של תמונות z-stack קונפוקליות. ניתן לתרבית פרוסות חיות של E15 במוח התיכון ובמוח הקדמי (250-350 מיקרומטר) על תוספות ממברנה, שם ניתן להחדיר תאי GBM המסומנים באופן פלואורסצנטי למיקומים לא אקראיים כדי לספק תרביות משותפות ex vivo לניתוח פלישת תאים, שיכולה להתרחש גם לאורך כלי הדם, במשך תקופה של כשבוע. ניתן לנטר תרביות משותפות ex-vivo אלה באמצעות מיקרוסקופ פלואורסצנטי רחב או קונפוקלי בהילוך מהיר כדי לצפות בהתנהגות תאים חיים.
לאחר מכן ניתן לתקן, לצבוע את מערכת החיסון ולנתח אותן באמצעות מיקרוסקופ קונפוקלי כדי לקבוע אם הפלישה התרחשה לאורך כלי דם או אקסונים. בנוסף, מערכת התרבית המשותפת יכולה לשמש לחקר אינטראקציות אפשריות בין תאים על ידי הצבת אגרגטים של סוגי תאים וצבעים שונים במקומות מדויקים שונים והתבוננות בתנועות התא. טיפולים תרופתיים יכולים להתבצע בתרביות ex vivo , בעוד שטיפולים אלה אינם תואמים את מערכת in ovo . שתי גישות משלימות אלה מאפשרות ניתוח מפורט ומדויק של התנהגות תאי GBM אנושיים והיווצרות גידולים בסביבת מוח של בעלי חוליות הניתנת למניפולציה רבה.
מחקרי מבחנה של התנהגויות תאים סרטניים משמשים לעתים קרובות לניתוח מנגנונים פוטנציאליים הפועלים במהלך ההתנהגות המורכבת יותר שנצפתה במהלך היווצרות הגידול ופלישת תאים במודלים in vivo xenograft. לדוגמה, עם גליובלסטומה (GBM), מחקרי מבחנה חשפו מנגנונים של האופן שבו L1CAM פועל באופן פוטנציאלי במהלך היווצרות הגידול והפלישה למוח בעובר אפרוח חדש xenograft מודלגידול מוח 1,2,3,4,5. למרות שניסויי in vitro ו– in vivo משלימים זה את זה בדרכים שימושיות, הם משאירים פער משמעותי באופן שבו התוצאות יכולות להיות מתואמות. לדוגמה, ניתוחים מכניסטיים של תנועתיות תאי GBM על צלחת הם מצב מלאכותי ביותר, ומודלים של xenograft in vivo יכולים לחשוף רק נקודות זמן סטטיות או ניתוחי נקודות קצה של היווצרות גידולים והתנהגות תאים. מחקרי In vivo המשתמשים במכרסמים או בעוברי אפרוחים אינם מתאימים בקלות לניטור התנהגות התא בזמן שהתאים פולשים לרקמת המוח במודלים אלה של xenograft. עם זאת, מודל xenograft עובר אפרוח הוכיח כי חלבון ההידבקות L1CAM ממלא תפקיד מגרה ביכולת הפולשנות של תאי T98G GBM אנושיים 2,5.
פתרון מתאים לבעיה זו ניתן להגיע על ידי גישור הן בשיטות in vivo והן בשיטות in vitro באמצעות מודל תרבית פרוסת מוח אורגנוטיפית, המכונה מודל ex vivo. במודל ex vivo זה, רקמת מוח חיה יכולה להישמר בעובי של כמה מאות מיקרונים למשך עד מספר שבועות, מה שמאפשר להשתיל תאים סרטניים, לצפות בהתנהגותם ברקמה בפועל לאורך זמן, ולאחר מכן לבצע ניתוח סמן מפורט יותר בנקודת הסיום של הניסוי.
שיטה פופולרית לתרבית פרוסות אורגנוטיפיות הייתה תרבית פרוסת מוח בעובי של כמה מאות מיקרונים על גבי קרום נקבובי שקוף או שקוף, מה שמשאיר את הרקמה חשופה לאוויר, אך מאפשר למדיה התזונתית לקיים את הרקמה מתחת לקרום (עיין Stoppini et al.6). וריאציות שונות של שיטה זו שימשו למחקרים שונים, כולל שימוש במדיה שונה או בתוספות ממברנה שונות. תוספות קרום שונות כוללות תוספת קרום בקוטר 30 מ”מ, תוספת קרום נקבובית (0.4 מיקרומטר) בצלחת תרבית 35 מ”מ 6, ותוספות תרבית תאים (0.4 מיקרומטר) עבור לוחות6 בארות7. מדיות שונות כוללות 50% MEM/HEPES + 25% סרום סוס מומת בחום + 25% תמיסת מלח מאוזנת Hanks (HBSS)8, 50% מדיה מופחתת בסרום + 25% סרום סוס + 25% HBSS9, כמו גם אחרים. אם משתמשים בקרום שקוף או שקוף יחד עם תאי GBM המסומנים באופן פלואורסצנטי, ניתן לצלם תרביות כאלה מלמטה באמצעות שדה רחב הפוך או מיקרוסקופ פלואורסצנטי קונפוקלי 10,11,12,13,14,15.
בעוד שמודלים רבים של גידול מוח אורתוטופי de vivo xenograft ו- ex vivo organotypic brain slice model הוקמו באמצעות מכרסמים, כפי שצוטט לעיל, עובר האפרוח (Gallus gallus) לא נוצל למטרות אלה. עם זאת, עובר הגוזל הוכח כמסוגל לשמש כמודל invivo אורתוטופי xenograft לחקר פלישת גליומה אנושית וחולדה 1,2,5. תאים שהושתלו במוחות של עוברי אפרוחים הציגו דפוסי פלישה דומים לאלה שנצפו במודלים של מכרסמים, מה שתומך עוד יותר בשימוש בעוברי אפרוחים כמודל in vivo לניתוח תאי גידול מסוג GBM. עוברי אפרוחים הם גם זולים, ניתנים לתחזוקה בקלות רבה יותר מאשר מכרסמים (כלומר, בקליפות הביצים שלהם באינקובטור מעבדה), והרבה יותר קל לעבוד איתם, מה שהופך אותם לאופציה אטרקטיבית למחקרי GBM קצרי טווח in vivo. מאמר שפורסם לאחרונה תיאר את השימוש בתרביות פרוסות מוח של עוברי אפרוח להיווצרות וצמיחה של אקסונים במהלך התפתחות מוחית תקינה, כאשר הפרוסות היו בנות קיימא לפחות 7 ימים16. עם זאת, השימוש בתרביות פרוסות מוח עוברי אפרוח כאלה לניתוח ex vivo של התנהגות תאי GBM בסביבת רקמה לוקה בחסר. במאמר זה מתוארת השתלה של תאי GBM אנושיים ותאי גזע מסוג GBM (GSCs) במוח העובר המוקדם של אפרוח de vivo, כמו גם החדרת תאי GBM לתרביות פרוסות מוח של עוברי אפרוח חיים ex vivo. כמה דוגמאות מייצגות של גידולים כתוצאה מכך דפוסי פלישה תאים המתקבלים תכשירים אלה מסופקים גם.
שלבים קריטיים בפרוטוקול הזרקת התאים לחדר המוח התיכון (טקטום אופטי) כוללים הימנעות מפגיעה בכלי הדם בקרום הכוריאואלנטואי בביצית או סביב העובר לפני ההזרקה ובמהלכה, אם כי ניתן למשוך בעדינות את קרום מי השפיר המקיף את העובר ולהחזיקו כדי למקם את הראש בעת הזרקת התאים למוח האמצעי. מי השפיר קשיחים יחסית וניתן למשוך אותם בעזרת מלקחיים עדינים כדי למקם את הראש ולהחזיק אותו יציב ביד אחת, לצורך הזרקת תאים ביד השנייה לטקטום האופטי, שהוא המבנה הגדול והעגול במרכז המוח. בדרך כלל, הכדאיות של עוברים מוזרקים נעה בין 25% ל -75%, תלוי בגורמים לא ידועים, וכמעט כל עובר ששורד מכיל לפחות גידול קטן בטקטום האופטי. שלבים קריטיים ביצירת פרוסות מוח בנות קיימא כוללים ניקוי הרקמה של נוזלים עודפים כך שהאגרוז נצמד למוח במהלך החיתוך ולשמור על רקמות ופרוסות קרות עד שהונחו על החדרת הממברנה. מכיוון שסוגי תאים שונים יוצרים ספרואידים באופן שונה (במהירות ובגודל), צפיפות התאים המצופים על לוחות poly-HEMA ומשך הזמן לפני קצירת ספרואידים צריכים להיות אופטימליים עבור כל סוג תא.
העבודה כאן לא הייתה כפופה למחקר אורך רשמי של כדאיות פרוסת המוח. יאנג ועמיתיו השתמשו בתרביות פרוסות מוח עוברי אפרוח דומות לאלה המשמשות כאן והראו כדאיות טובה של הפרוסות לפחות 7 ימים16. עבודות קודמות הראו שכאשר רקמת OT נשמרה במדיה תת-אופטימלית, הופיעו גרעינים פיקנוטיים רבים ברקמה, מה שלא התרחש בפרוסות בעבודה כאן. בנוסף, כאשר פרוסות מתנוונות בתנאים תת-אופטימליים, כלי הדם מתפצלים ומופיעים כשורות של כדורים חיוביים למינין (לא מוצגים). לכן, למרות שהכדאיות כאן לא נבדקה בשיטות כגון אלקטרופיזיולוגיה או ביטוי קספאז-3 פעיל, אף אחד מהאינדיקטורים למוות תאי שנצפו בתנאי תרבית תת-אופטימליים לא הופיע כאן.
ה- OT התמקד בניסויים בגידולי מוח in vivo מכיוון שהוא האזור המוזרק ביותר בקלות עם החדר הגדול ביותר. ב- E5, שהוא היום האחרון שבו העובר קטן מספיק כדי להישאר נגיש על גבי החלמון, יש לבצע זריקות לחדר, שכן כל אזורי המוח אינם אלא אזור חדר דק. עם זאת, זריקות אלה גורמות בהצלחה לגידולים משובצים עם תאים הפולשים לפרנכימה במוח. לפעמים, גידולים כתוצאה מכך נמצאים במוח הקדמי או במוח הקטן, אבל זה לא נפוץ. פרוסות Ex vivo של טקטום אופטי E15 שימשו בעיקר לניסויים כאן, כך שתוצאות התרבית המשותפת ex vivo יכולות להיות מתואמות עם ניסויי הזרקת in vivo. עם זאת, פרוסות המוח הקדמי מתאימות גם הן ויש להן שטח פנים גדול יותר וחדר דק מאוד בהשוואה לטקטום האופטי, מה שעשוי להפוך את המוח הקדמי למתאים יותר לתרביות משותפות ex vivo שאינן מתואמות עם זריקות in vivo.
הוכח כאן כי זריקות in vivo , ובעקבותיהן קיבוע רקמות, חתך רקמה רוטט וצביעה חיסונית עבור למינין וסמנים אחרים, הביאו לתמונות ברזולוציה גבוהה של תאי GBM ו- GSCs ברקמת המוח בקרבת כלי דם. היכולת לקבוע את יחסי הגומלין בין תאי הגידול וכלי הדם הקלה מאוד על ידי יצירת עיבודי נפח תלת-ממדיים מערימות z של מקטעים אופטיים קונפוקליים באמצעות תוכנת קונפוקל והוראות היצרן. הדמיה בהילוך מהיר באמצעות מיקרוסקופ פלואורסצנטי רחב שדה של GFP, mCherry ותאים המסומנים ב- DiD הייתה אפשרית; עם זאת, תאים נודדים שהיו קרובים לספרואידים הפלואורסצנטיים מאוד הוסתרו לעיתים על ידי ה”זוהר” מהספרואידים. ניתן למזער במידת מה את האפקט הבלתי רצוי הזה על ידי התאמה קפדנית של זמני החשיפה לאיסוף תמונות בשדה רחב. הדמיה בהילוך מהיר באמצעות ערימות z קונפוקליות לאורך זמן (4D) ביטלה את הזוהר הלא ממוקד מהספרואידים והביאה לתאים נודדים מוגדרים בחדות עם רקע כהה. זה לא תואר בפרוטוקול, אך בוצע בדומה להדמיית קיטועי זמן בשדה רחב, שבוצעה בזמן שפרוסות המוח היו על תוספות הממברנה השקופות בלוח פלסטיק בן 6 בארות. אף על פי שהדמיית קיטועי זמן קונפוקלית מביאה לתמונות ברורות יותר באופן ניכר של תאים בודדים והתנהגותם, ניסוי רב-נקודתי בהילוך מהיר האוסף ערימות z של 10 מישורי z לנקודה, במרווחים של 10 דקות על פני תקופה של 20 שעות, הוא שימוש נרחב בגלוונומטרים של ראש הסריקה. מכיוון שזה יכול להפחית באופן משמעותי את תוחלת החיים של גלוונומטרים, שיטה זו משמשת בתבונה.
למרות שמערכת עוברי האפרוחים מתאימה מאוד הן להזרקת de vivo והן לניסויי תרבית משותפת ex vivo החוקרים התנהגות תאי GBM, ישנן מספר מגבלות למערכת מודל זו. כמו בכל מערכת קסנוגרפט, הסביבה שבה מושתלים תאים אנושיים אינה המוח האנושי, אך נראה כי התנהגות תאי GBM מחקה זאת במודלים של מכרסמים ובחולים אנושיים. לאחר ביצוע ניסויים בהזרקת in vivo על E5, גידולים מורשים בדרך כלל להיווצר במשך 10 ימים, עד E15. ברור שזה לא מספיק זמן כדי לחקור את כל ההיבטים של גידולים ופלישה לתאים. עם זאת, הוכח כאן כי גידולים מוצקים נוצרים בפרנכימה של המוח, תאים מתקשרים ומסדרים את עצמם מחדש בתוך הגידול, ופלישה מוחית משמעותית מתרחשת הן לאורך כלי הדם והן באופן מפוזר בפרק זמן קצר יחסית זה. מגבלה נוספת למערכת עוברי האפרוחים in vivo היא שהיא אינה מתאימה לטיפולים תרופתיים או אחרים בגלל החלמון הגדול ומערכת הדם החוץ-עוברית הפועלת במהלך התפתחות עובר האפרוחים. טיפול תרופתי מקומי בנוזל יגרום לריכוז משתנה מאוד ולא ידוע במוח עקב דיפוזיה הרחק מהעובר לתוך מסת החלמון הגדולה בהרבה. באופן דומה, הזרקה תוך ורידית של תרופות למערכת הדם החוץ-עוברית העדינה מאוד תדלוף או תתפזר החוצה מכלי הדם וגם תגרום לריכוזים לא ידועים במוח. זוהי אחת הסיבות העיקריות לכך שאומצה שיטת תרבית פרוסות ex vivo – כך שלא רק שניתן היה לצפות בהתנהגות התא ולעקוב אחריה באמצעות מיקרוסקופ בהילוך מהיר, אלא גם כדי שניתן יהיה לבחון טיפולים שהצליחו לשנות את התנהגות תאי GBM בצלחת4 בסביבת רקמת מוח רלוונטית יותר.
פיתוח מערכת מודל גידולי מוח אורתוטופיים לעובר אפרוח נתפס כתוספת משמעותית למערכות ולכלים הזמינים לחקר היווצרות גידולי GBM והתנהגות תאים פולשניים. ביצי תרנגולת מופרות צפויות להיות זמינות ברוב האזורים, הן זולות בהשוואה למכרסמים, אין עלויות טיפול בבעלי חיים, העוברים עמידים מאוד ועמידים בפני זיהומים (כלומר, רוב העבודה נעשית על ראש ספסל), העוברים ניתנים למניפולציה גבוהה וניתן לגדל אותם בתרבית ללא קונכייה19, ועוברי אפרוחים אינם נחשבים לבעלי חוליות ולכן אינם דורשים אישור IACUC על פי הנחיות NIH (דרישות מוסדיות עשוי להשתנות). לפיכך, יתרונות מרובים אלה הופכים את מערכת עוברי האפרוחים לאטרקטיבית מאוד אם מגבילים את שאלותיהם וניסוייהם לאלה הנופלים במגבלותיה. מחקרים מרובים של תאי GBM בוצעו על ידי אחרים באמצעות עובר אפרוח, אך אלה השתמשו כמעט אך ורק בקרום הכוריאואלנטואי (CAM) של העובר 20,21,22,23,24,25,26,27,28,29 וניצן הגפיים 30ולא המוח., דווח גם על השתלת מדולובלסטומה במוח הגוזל ב-E231. אין ספק, השימוש בעובר אפרוח כמערכת מודל קסנוגרפט אורתוטופית, כפי שמתואר כאן, אמור להניב תוצאות שהן הרבה יותר משמעותיות לביולוגיה של גידולי GBM אנושיים מאשר מחקרים המשתמשים ב- CAM.
למרות שמחקרים אלה רק החלו לנצל באופן מלא את מערכת מודל הגידול במוח של עוברי אפרוח למחקרים על התנהגות תאי GBM אנושיים ו- GSC, יש לקוות שאחרים ירחיבו את השימושים וימצאו יישומים פוטנציאליים נוספים. ניתן היה לדמיין כי לא רק שמערכת זו תחשוף מנגנונים המווסתים את היווצרות הגידול בגליובלסטומה ואת התנהגות התא, אלא גם תאפשר בדיקות פרה-קליניות של תרופות וחומרים ספציפיים על תאים ספציפיים של חולים. לדוגמה, אם תרביות פרוסות מוח נקבעו מראש, אז תאים סרטניים, חתיכות מכריתות גידולים כירורגיות, או אורגנואידים GBM32 שמקורם במטופל יכולים להיות ממוקמים ישירות בתרבית משותפת ex vivo , וטיפולים שונים יכולים להיות מוערכים בתוך ימים ספורים. באופן דומה, תאי חולים מנותקים יכולים להיות מוזרקים ישירות לתוך המוח התיכון E5 ב ovo כדי להעריך את יכולתם ליצור גידולים ולפלוש parenchyma המוח. לפיכך, יש לקוות כי תיאורי השיטות והתוצאות המייצגות כאן יקלו ויעודדו שימוש מוגבר במערכת בלתי מנוצלת זו לחקר סרטן המוח.
The authors have nothing to disclose.
עבודה זו מומנה בחלקה על ידי מענק ל- D.S.G. מהמכון הלאומי לסרטן (R03CA227312) ועל ידי מענק נדיב מקרן ליסה דין מוסלי. דגימות חיות של GBM הושגו בהסכמת המטופל באמצעות המרכז לרכישת רקמות במרכז הסרטן ומכון המחקר ע”ש הלן פ. גרהם. המימון לא.ר. ניתן על ידי המרכז הלאומי למשאבי מחקר והמרכז הלאומי לקידום מדעי התרגום, המכונים הלאומיים לבריאות (UL1TR003107). מלגות מחקר קיץ לתואר ראשון ל- N.P., A.L., Z.W. ו- K.S. ניתנו על ידי תוכנית המחקר לתואר ראשון באוניברסיטת דלאוור.
1 cm x 1 cm square hole paper punch | Birabira | N/A | |
1 mm biopsy punch pen | Robbins Instruments | 20335 | |
6 well insert plate (Corning Transwell) | Millipore Sigma | CLS3450 | |
9" Disposable Pasteur Pipets | Fisher Scientific | 13-678-20C | |
15 mL centrifuge tubes | Fisher Scientific | 05-539-12 | |
24 well plate | Corning Costar | 3526 | |
50 mL centrifuge tubes | Fisher Scientific | 05-539-9 | |
Agar | Fisher BioReagents | BP1423-500 | for embedding fixed brains |
Alexafluor 488-conjugated GAM IgG | Jackson Immunoresearch | 115-605-146 | |
Alexafluor 647-conjugated GAM IgG | Jackson Immunoresearch | 115-545-146 | |
Aluminum foil | ReynoldsWrap | N/A | |
Ampicillin | Sigma Aldrich | A-9518 | |
anti-integrin alpha-6 monoclonal antibody GOH3 | Santa Cruz Biotechnology | sc-19622 | |
anti-L1CAM monoclonal antibody UJ127 | Santa Cruz Biotechnology | sc-53386 | |
anti-laminin monoclonal antibody | Developmental Studies Hybridoma Bank | 3H11 | |
anti-nestin monoclonal antibody 10c2 | Santa Cruz Biotechnology | sc-23927 | |
anti-Sox2 monoclonal antibody E-4 | Santa Cruz Biotechnology | sc-365823 | |
B27 supplement without vitamin A | GIBCO | 17504-044 | |
bisbenzimide (Hoechst 33258) | Sigma-Aldrich | B2883 | nuclear stain |
Cell culture incubator | Forma | standard humidified CO2 incubator | |
Centrifuge | Beckman Coulter | ||
Confocal microscope | Nikon Instruments | C2si+ | With custom-made cell incubator chamber |
Confocal microscope objective lenses | Nikon Instruments | Plan Apo lenses, except S Plan Fluor ELWD 20x 0.45 NA objective lens for confocal time-lapse imaging | |
Confocal microscope software | Nikon Instruments | NIS Elements | Version 5.2 |
Curved foreceps | World Precision Intruments | 504478 | |
Curved scissors | Fine Science Tools | ||
Curved spatula | Fisher Scientific | 14-375-20 | |
Cyanoacrylate glue | Krazy Glue | KG-585 12R | |
D-Glucose | Millipore Sigma | G8270 | |
DiD far red fluorescent dye | Invitrogen | V22887 | Vybrant DiD |
DMEM | Sigma Aldrich | D5671 | |
DMEM/F12 | Sigma Aldrich | D8437 | |
DMSO | Sigma Aldrich | D4540 | |
Dulbecco's Phosphate buffered saline (PBS) | Sigma Aldrich | P5493-1L | |
egg incubator | Humidaire | ||
electrical tape (10 mil thick/254 µm) | Scotch | N/A | |
Ethanol 200 proof | Decon Laboratories | 2701 | |
Fast green FCF dye | Avocado Research Chemicals | 16520 | |
FBS | Gemini Bio-products | 900-108 | |
filter paper | Fisher Scientific | ||
Gauze | Dynarex | 3353 | |
Glass Capillaries for microinjection | World Precision Instruments | TW100-4 | |
Glycerol | Fisher BioReagents | BP228-1 | for mounting media |
GSCs (human glioblastoma stem cells) | Not applicable | Isolated from patient GBM specimens in Galileo laboratory in GSC media and then transduced with a GFP encoding lentiviral vector. Cells used were between passage 10 and 30. | |
Hanks Balanced Salt Solution (HBSS) | Corning | 21-020-CV | |
Hemacytometer | Hausser scientific | ||
Heparin | Fisher Scientific | BP2524-100 | |
HEPES buffer | Sigma Aldrich | H0887 | |
Horse Serum (HI) | Gibco | 26050-088 | |
Human FGF-2 | BioVision | 4037-1000 | |
Human TGF-α | BioVision | 4339-1000 | |
Inverted phase contrast microscope | Nikon Instruments | TMS | for routine viewing of cultured cells |
KCl | Fisher Scientific | BP366 | |
KH2PO4 | Fisher Scientific | P284 | |
Laboratory film | Parafilm | ||
Labquake Shaker | LabIndustries | T400-110 | |
L-Glut:Pen:Strep | Gemini Bio-products | 400-110 | |
Low-melt agarose | Fisher Scientific | BP1360 | for embedding live brains |
Matrix | Corning Matrigel | 354234 | |
Medium 199 | GIBCO | 11150-059 | |
MEM | Corning | 10-010-CV | |
Metal vibratome block | |||
Micropipette tips (20, 200, 1,000 µL) | Fisherbrand | ||
Micropipettors (20, 200, 1,000 µL) | Gilson | ||
Microscope Coverglass (no. 1.5 thickness) | Fisherbrand | 12544A | |
NaCl | Fisher Scientific | S271 | |
NaH2PO4 + H2O | Fisher Scientific | S369 | |
NaHCO3 | Fisher Scientific | BP328 | |
Normal goat serum | Millipore Sigma | 526-M | |
N-propyl gallate | Sigma Aldrich | P3130 | for mounting media |
Parafilm | Parafilm | ||
Paraformaldehyde | Electron Microscopy Sciences | 15710 | |
PBS | Sigma Aldrich | P5493-1L | |
Pencil | |||
Plain Microscope slides | Fisherbrand | 12-550-A3 | |
Plastic 35 mm Petri dish | Becton Dickinson | 351008 | |
pneumatic picopump | World Precision Intruments | PV830 | |
Poly(2-hydroxyethyl methacrylate) (poly-HEMA) | Sigma Aldrich | P-3932 | |
razor blade- double edge | PACE | for cutting fixed brain slices | |
sapphire knife | Delaware Diamond Knives | for cutting live brain slices | |
Scalpel | TruMed | 1001 | |
Sodium cacodylate buffer 0.2 M pH 7.4 | Electron Microscopy Sciences | 11652 | |
Specimen chamber for vibratome | custom-made | ||
Stereo Dissecting Microscope | Nikon Instruments | SMZ1500 | Equipped with epifluorescence |
straight foreceps | World Precision Intruments | 500233 | |
straight scissors | Fine Science Tools | ||
Sucrose | Mallinckrodt | 7723 | |
Time-lapse fluorescence microscope (widefield fluorescence) | Nikon Instruments | TE2000-E | With custom-made cell incubator chamber (see Fotos et al., 2006) |
Tissue culture dish polystyrene 100 mm | Thermo Fisher Scientific | 130182 | for cell culturing |
Tissue culture dish polystyrene 60 mm | Becton Dickinson | 353004 | for cell culturing |
Transfer pipette | American Central Scientific Co. | FFP011 | |
Transparent tape | Scotch | ||
Triton X-100 | Sigma Aldrich | T-8787 | |
Trypsin (0.25%) + 2.21 mM EDTA | Corning | 25-053-CI | |
U-118 MG human GBM cell line | ATCC | HTB-15 | Cells were transduced with a lentiviral vector encoding the entire ectodomain sequence of the L1CAM adhesion protein and then with lentiviral vector pUltra-hot encoding mCherry. Passage numbers are unknown. |
Vacuum pump | Cole-Parmer | EW-07532-40 | "Air Cadet" |
Vibrating tissue slicer | Vibratome | 3000 | for cutting live and fixed brain slices |