In dieser Arbeit stellen wir ein Hochdurchsatzprotokoll vor, mit dem Millionen von Maisprotoplasten transient transfiziert werden können, um große Bibliotheken von Plasmiden in Mais-Mesophyllzellen zu testen.
Bei der Transfektion von Mais-Mesophyllzellen werden häufig die pflanzlichen Zellwände verdaut, um Protoplasten zu bilden, und dann DNA durch Elektroporation oder Polyethylenglykol (PEG) eingefügt. Bisherige Methoden wurden entwickelt, um Zehntausende von transfizierten Protoplasten auf einmal herzustellen. In dieser Arbeit beschreiben wir eine einfache Methode zur Isolierung und Transfektion von Millionen von Blatt-Mesophyll-Protoplasten in Mais (Zea mays L.). Durch diesen optimierten Prozess entfallen bestimmte gängige Protoplasting-Schritte, wie z. B. das Waschen in W5. Darüber hinaus wurden Schritte wie Zentrifugation, PEG-vermittelte Transfektion und Inkubation modifiziert, um mit einer größeren Anzahl von Protoplasten zu arbeiten. Die Fähigkeit, große Bibliotheken von Plasmidkonstrukten zu exprimieren, ermöglicht Experimente auf Genomebene, wie z. B. massiv parallele Reporter-Assays in Mais.
Die transiente Genexpression ist ein mächtiges Werkzeug in der Pflanzenbiologie. Pflanzenzellen sind jedoch schwer zu transfizieren, da sie von einer Zellwand umgeben sind. Diese Barriere für den DNA-Eintritt ist in anderen häufig untersuchten Zelltypen wie Säugetier- oder Insektenzellen nicht vorhanden. Frühere Forschungen haben sich dieser Herausforderung angenommen, indem sie Protoplasten eingesetzt haben: Pflanzenzellen, deren Zellwände verdaut und entfernt wurden. Im Gegensatz zu unverarbeitetem Blattgewebe sind pflanzliche Protoplasten in Suspension leicht zu verarbeiten und eignen sich für Transfektionstechniken, die durch Elektroporation oder Polyethylenglykol (PEG) vermittelt werden1. Pflanzenzellen behalten auch nach der Entfernung der Zellwand einen Großteil ihrer Funktionalität. Daher werden Protoplasten in einer Vielzahl von Pflanzen verwendet, um die Gen- und Proteinfunktion 2,3 zu untersuchen, die Signaltransduktion4 zu verstehen und mögliche Ziele für die Pflanzenzüchtung5 zu identifizieren. Protoplasten sind auch ein geeignetes Vehikel für das Screening von Genom-Editing-Konstrukten in verschiedenen Nutzpflanzenarten wie Weizen und Kartoffeln 6,7. Kurz gesagt, transiente Assays in Protoplasten sind für die landwirtschaftliche Biotechnologie unverzichtbar.
Mais (Zea mays L.) ist die weltweit führende Getreideernte nach Tonnage; Als solches ist es ein Schwerpunkt der grundlagen- und angewandten pflanzenwissenschaftlichen Forschung8. Anders als in Modellpflanzen wie Nicotiana tabacum9 wird die transiente Transgenexpression in intakten Maisblättern jedoch nicht routinemäßig durchgeführt. Protoplasting wurde verwendet, um Mesophyllzellen von Maisblättern zu erhalten und zu transfizieren10,11. Bisherige Methoden haben Transfektionseffizienzen von bis zu 75 % durch Elektroporation erreicht und transfizierte Protoplasten im Maßstab von Zehntausenden hergestellt10,15.
Dieses Protokoll beschreibt, wie Millionen von Mais-Mesophyllzellen protoplastiert und mit einer Effizienz transfiziert werden können, die mit früheren Methoden vergleichbar ist. Die Hauptschritte sind die Züchtung von etiolierten Maiskeimlingen, die Ernte des Blattgewebes, die Verdauung der pflanzlichen Zellwand und die Abgabe von Plasmid-DNA in die Zellen mithilfe von PEG. Der Hauptbeitrag dieses Protokolls ist die Fähigkeit, die Protoplastentransfektion zu skalieren und gleichzeitig die Zellviabilität zu erhalten, die für funktionelle Assays erforderlich ist. Dies ermöglicht den Einsatz von Experimenten auf Genomebene, wie z. B. massiv parallelen Reporter-Assays, mit denen die Funktion von Hunderttausenden von Regionen im gesamten Maisgenom getestet werden kann. Diese Methode wurde kürzlich verwendet, um große Bibliotheken von cis-regulatorischen DNA-Elementen, einschließlich Enhancern und Promotoren, zu untersuchen12,13,14.
Wie bereits berichtet, ist die Qualität des Pflanzenmaterials, das für Protoplasting verwendet wird, entscheidend für die Gewinnung hochwertiger Protoplasten16,17,18. Es ist wichtig, gesunde, makellose Blätter auszuwählen. In dieser Arbeit wurde die populäre Forschungsmaissorte B73 verwendet. Andere Sorten haben wir nicht getestet. Die Maiskeimlinge, die für dieses Protokoll verwendet wurden, wurden in der Dunkelheit gezüchtet, da etiolierte Blätter 16 Stunden nach der Transfektion Protoplasten mit größerer Lebensfähigkeit produzieren als Protoplasten aus grünen Blättern. Für Anwendungen, die keine Inkubation über Nacht erfordern, wäre die Verwendung von grünem oder grünem Blattmaterial möglich.
Ein kritischer Schritt ist das richtige Schneiden des Blattmaterials in dünne Scheiben vor der enzymatischen Verdauung. Dieser Prozess vergrößert die Oberfläche, auf der die Mesophyllzellen der Enzymlösung ausgesetzt werden können, was die Anzahl der gewonnenen Protoplasten erhöht. Die distalen Blattspitzen werden verworfen und dünne (≤1 mm) Scheiben mit neuen Rasierklingen geschnitten, die sofort ausgetauscht werden, wenn sie stumpf werden. Für eine bestimmte Menge an Gewebe ergeben dünnere Scheiben mehr Protoplasten, vorausgesetzt, die richtige Technik wird angewendet, um die Quetschung der Blätter zu minimieren.
Wichtig ist auch das richtige Waschen der Protoplasten, da sie nach der Zellwandentfernung sehr empfindlich sind. Nach der Verdauung werden alle Lösungen auf Eis gelegt und die dunkel gewachsenen Protoplasten vor Licht geschützt. Die Osmolarität und der pH-Wert werden gepuffert, indem die Waschvorgänge in MMG-Lösung durchgeführt werden. Um die Protoplasten von den weniger dichten Zelltrümmern zu isolieren, erfolgt die Zentrifugation bei 100 x g. Protoplasten, die bei 200 x g zentrifugiert wurden, zeigen nach der Isolierung eine ähnliche Lebensfähigkeit, aber eine geringere Lebensfähigkeit am nächsten Tag, und sie transformieren sich etwa halb so gut. Wir empfehlen, die Lebensfähigkeit der Protoplasten durch Färbung mit FDA (Fluorescein-Diacetat) unmittelbar nach der Isolierung zu überprüfen; Die normale Lebensfähigkeit liegt zwischen 70 % und 90 %. Protoplasten mit einer Viabilität von weniger als 40% nach Isolation liefern nur wenige Transformanten.
Das Pelletieren und Waschen ist bei der Arbeit mit vielen Protoplasten einfacher, da nach der Transfektion ein deutlich sichtbares Pellet erhalten wird. Aus diesem Grund wird die Transfektion mit 1 Million oder mehr Protoplasten durchgeführt. Bei der Skalierung des Protokolls sollte ein Gefäß geeigneter Größe für die Inkubationsschritte ausgewählt werden (1,5 ml, 15 ml oder 50 ml Zentrifugenröhrchen), und das für die Waschschritte verwendete Lösungsvolumen sollte entsprechend skaliert werden. In jedem Fall ist es von Vorteil, in ≤10-ml-Aliquoten zu zentrifugieren, um sicherzustellen, dass die Protoplasten nicht im Überstand verbleiben. Eine Neuerung dieses Protokolls ist der Wegfall des 1-stündigen Inkubations- und Waschschritts in W5-Lösung, der in anderen Protokollen14,19 aufgeführt ist und sich in unseren Händen als unnötig erwies.
Wie in anderen Studien gezeigt wurde, sind sowohl die Menge als auch die Qualität der DNA entscheidend für eine erfolgreiche Transfektion19. Für Plasmide im Bereich von 4-6 kb werden 15 μg DNA pro 1 Million Protoplasten verwendet. Minderwertige DNA-Präparate können zu einer verminderten Lebensfähigkeit nach der Transfektion führen, daher empfehlen wir die Verwendung eines handelsüblichen DNA-Extraktionskits, wenn Plasmide aus Bakterien isoliert werden. Die Inkubation der Protoplasten über Nacht erfolgt bei Raumtemperatur im Dunkeln, um die Transkription des Plasmids oder der Plasmidbibliothek zu ermöglichen und gleichzeitig den Stress zu minimieren. Nach der Inkubation über Nacht wird etwa die Hälfte der ursprünglich transfizierten Protoplasten gewonnen. Protoplasten werden für die Inkubation über Nacht auf eine Konzentration von 500-1.000 Zellen/μl verdünnt. Protoplasten, die über Nacht in Konzentrationen von mehr als 1.000 Zellen/μl inkubiert werden, haben geringere Wiederfindungsraten und eine geringere Lebensfähigkeit. In höheren Konzentrationen können Trümmer von beschädigten und toten Protoplasten zum Absterben benachbarter Protoplasten beitragen. Das Waschen der Protoplasten nach der Inkubation über Nacht dient sowohl dazu, diese Ablagerungen als auch das überschüssige Plasmid zu entfernen.
Protokolle wie diese haben die Einschränkung, dass nicht alle Pflanzenarten oder Gewebetypen für das Protoplasting geeignet sind. Darüber hinaus können Unterschiede in der Genexpression durch den Protoplasting Prozess induziert werden.
Zusammenfassend haben wir ein einfaches und skalierbares Protokoll zur Isolierung und Transfektion von Millionen lebensfähiger Protoplasten aus dem Grundnahrungsmittel Z. mays detailliert beschrieben. Mit dieser Methode können viel mehr Protoplasten mit PEG transfiziert werden, wobei die Transformationseffizienz fast so hoch ist wie bei elektroporationsbasierten Methoden15. Die größere Nettoanzahl von Transformatoren ermöglicht die Prüfung von Hunderten oder Tausenden von Konstrukten in groß angelegten Experimenten wie massiv-parallelen Reporter-Assays12,13. Zukünftige Experimente auf Genomebene in Mais werden es den Wissenschaftlern ermöglichen, die Genexpression und Genregulation von Mais besser zu verstehen.
The authors have nothing to disclose.
Diese Arbeit wurde vom National Human Genome Research Institute Interdisciplinary Training in Genomic Sciences (T32 Training Grant Nr. HG000035 an J.T.) und dem National Institute of Health (NIGMS 1R35GM139532 an C.Q.) sowie von der National Science Foundation (RESEARCH-PGR IOS-1748843 und PlantSynBio 2240888 an CQ) unterstützt. Wir danken Andrea Gallovatti von der Rutgers University für das Geschenk der Maiskörner.
1.5 mL graduated microcentrifuge tubes | VWR | 490004-444 | |
15 mL Falcon conical centrifuge tube | Corning | 05-527-90 | |
250 mL Pyrex glass beaker | Fisher | 50-121-5005 | |
40 um nylon mesh cell strainer | Fisher | 22363547 | |
50 mL Falcon tube | Corning | 14-432-22 | |
72 cell propagation tray | T.O. Plastics | 725607C | |
Aluminum foil | VWR | 89107-732 | |
Bell jar | Bel-Art | F42022-0000 | |
Benchtop centrifuge | Eppendorf | 5424-R | |
Beta-mercaptoethanol | Sigma-Aldrich | M6250-250ML | Dissolve in ultrapure H2O to make a 1M stock solution. Store at room temperature. |
Bovine serum albumin | Sigma-Aldrich | A2153 | |
Calcium chloride dihydrate (CaCl2*2H2O) | PhytoTech Labs | C135 | Dissolve in ultrapure H2O to make a 1M stock solution. Store at room temperature. |
Cellulase Onozuka R-10 | Duchefa Biochemie | C8001.0010 | |
D-Mannitol | PhytoTech Labs | M562 | |
Dissecting scope | Reichert | Microstar IV | |
Fluorescein Diacetate (FDA) | Thermofischer Scientific | F1303 | Dissolve in acetone at 0.5% weight/volume to make a 1000X stock solution. Protect from light and store at -20 °C. |
Fluorescence Illumination Systems | Prior | Lumen200 | |
Fluorescence microscope | Leica | MDG36 | |
High-capacity centrifuge | Eppendorf | 5810 R | |
Macerozyme | Duchefa Biochemie | M8002.0005 | |
Magnesium chloride (MgCl2) | Sigma-Aldrich | M292-1KG | Dissolve in ultrapure H2O to make a 1M stock solution. Store at room temperature. |
Maize seeds | B73 | USDA-ARS | https://npgsweb.ars-grin.gov/gringlobal/accessiondetail?accid=PI+550473 |
Medium binder clip | Uline | S-24649 | |
MES | Sigma-Aldrich | M5287-250G | Dissolve in ultrapure H2O to make a 1M stock solution. Adjust pH to 5.7 using KOH. Protect from light and store at room temperature. |
Micropipette 20-200 uL | Gilson | F123601G | |
Nanodrop microvolume spectrophotometer | Thermofischer Scientific | ND-1000 | |
NEB 5-alpha competent E. coli | New England BioLabs | C2987H | |
Neubauer hemocytometer | Daigger Scientific | EF16034F | |
No. 9 Single-edge razor blade | Excel | 20009 | |
Orbital shaker | VWR | 89032-104 | |
Poly(ethylene) glycol 4,000 | Sigma-Aldrich | 81240-1KG | |
Potassium chloride (KCl) | Sigma-Aldrich | P9541-1KG | Dissolve in ultrapure H2O to make a 1M stock solution. Store at room temperature. |
Professional Grade Vermiculite | NK Lawn & Garden | G208 | |
Round-bottom glass centrifuge tube 30 mL | Kimble Chase | 45500-30 | |
Rubber adapter for Corex centrifuge tubes | Corning | CLS8445AO | |
Sphagnum peat moss | Premier Horticulture | 0128P | |
TRIzol Reagent | Thermofischer Scientific | 15596018 | |
Tygon vacuum tubing | VWR | 76336-844 | |
Vacuum gauge | Wika | 4269978 |