Здесь представлен набор протоколов для генерации и криоконсервации сердечных сфероидов (КС) из индуцированных человеком плюрипотентных кардиомиоцитов, полученных из стволовых клеток, культивируемых в высокопроизводительном многомерном формате. Эта трехмерная модель функционирует как надежная платформа для моделирования заболеваний, высокопроизводительных скринингов и сохраняет свою функциональность после криоконсервации.
Индуцированные человеком плюрипотентные кардиомиоциты, полученные из стволовых клеток (hiPSC-CM), имеют первостепенное значение для моделирования и лечения сердечных заболеваний человека. Недавно мы опубликовали экономически эффективную стратегию массового расширения hiPSC-CM в двух измерениях (2D). Двумя основными ограничениями являются незрелость клеток и отсутствие трехмерного (3D) расположения и масштабируемости на платформах скрининга с высокой пропускной способностью (HTS). Чтобы преодолеть эти ограничения, расширенные кардиомиоциты образуют идеальный источник клеток для создания 3D-культуры сердечных клеток и методов тканевой инженерии. Последний обладает большим потенциалом в сердечно-сосудистой сфере, обеспечивая более продвинутую и физиологически значимую ВТШ. Здесь мы описываем HTS-совместимый рабочий процесс с простой масштабируемостью для генерации, обслуживания и оптического анализа сердечных сфероидов (CS) в формате 96 лунок. Эти небольшие CS необходимы для заполнения пробела, присутствующего в современных моделях заболеваний in vitro и/или генерации для 3D-платформ тканевой инженерии. CS представляют собой высокоструктурированную морфологию, размер и клеточный состав. Кроме того, hiPSC-CM, культивируемые как CS, демонстрируют повышенное созревание и некоторые функциональные особенности человеческого сердца, такие как спонтанное обращение с кальцием и сократительная активность. Автоматизируя весь рабочий процесс, от генерации CS до функционального анализа, мы повышаем воспроизводимость внутри и между партиями, о чем свидетельствуют высокопроизводительные (HT) визуализации и анализ обработки кальция. Описанный протокол позволяет моделировать кардиологические заболевания и оценивать лекарственные/терапевтические эффекты на уровне отдельных клеток в сложной 3D-клеточной среде в полностью автоматизированном рабочем процессе HTS. Кроме того, в исследовании описывается простая процедура долгосрочного сохранения и биобанкирования цельных сфероидов, тем самым предоставляя исследователям возможность создать функциональное хранилище тканей следующего поколения. HTS в сочетании с долгосрочным хранением внесет существенный вклад в трансляционные исследования в широком спектре областей, включая открытие и тестирование лекарств, регенеративную медицину и разработку персонализированных методов лечения.
Открытие индуцированных человеком плюрипотентных стволовых клеток (ИПСК) открыло беспрецедентные возможности для изучения развития и болезней человека на клеточном уровне. За последнее десятилетие на основе уроков развития были разработаны различные протоколы, обеспечивающие эффективную дифференцировку ИПСК в кардиомиоциты (КМ)1,2,3,4. Кардиомиоциты, полученные из hiPSC (hiPSC-CM), могут служить ресурсом для моделирования генетически наследуемых сердечно-сосудистых заболеваний (ССЗ), тестирования сердечной безопасности для новых лекарств и сердечных регенеративных стратегий 5,6,7,8. Несмотря на направленную сердечную дифференцировку ИПСК, неопределенное количество КМ остается проблемой в области сердца, поскольку зрелые ИПСК-КМ обычно не являются пролиферативными, а первичные клетки человека недоступны в больших количествах.
Недавно мы описали, что сопутствующая активация передачи сигналов Wnt с культурой низкой плотности клеток приводила к массивному пролиферативному ответу (до 250 раз) hiPSC-CMs 9,10. Эта экономически эффективная стратегия массового расширения hiPSC-CM за счет последовательного пассажирования в формате колбы для культивирования облегчает стандартизацию и контроль качества большого количества функциональных hiPSC-CM. Кроме того, чтобы не отставать от спроса на большие партии hiPSC-CM от различных доноров, было описано биобанкирование hiPSC-CM10. Однако монослои кардиомиоцитов, посеянные в эти стандартные чашки для культивирования, не являются репрезентативными для сложной 3D-структуры, присутствующей в сердце. Кроме того, незрелость hiPSC-CM остается препятствием, таким образом, не имитируя биологический и физиологический фенотип сердечно-сосудистой среды in vivo.
Были разработаны новые 3D-модели in vitro, в которых hiPSC-CM демонстрируют более близкое физиологическое поведение, такое как самоорганизация 11,12, ремоделирование внеклеточного матрикса (ECM) 13, ускоренное созревание 14,15,16 и синхронизированное сокращение17,18,19 . 3D-модели использовались для открытия лекарств, тестирования кардиотоксичности лекарств, моделирования заболеваний, регенеративной терапии и даже первых клинических испытаний 20,21,22,23,24. Одной из наиболее часто используемых моделей является инженерная сердечная ткань на основе фибрина (EHT), которая демонстрирует тканеподобное расположение и сократимость сердца13,17,25. Ранее мы показали, что EHT, генерируемые из расширенных hiPSC-CM, демонстрируют сравнимую сократимость с таковыми из нерасширенных hiPSC-CM, демонстрируя нескомпрометированную клеточную функциональность после расширения9. Тем не менее, несмотря на то, что генерация EHT из hiPSC-CM хорошо налажена, ожидается дальнейшее развитие событий в отношении создания платформы оценки HT. Здесь быстрая генерация большого количества самоагрегирующих сердечных сфероидов (КС) в 96-луночном формате позволяет улучшить 3D-условия для целей высокопроизводительного скрининга (HTS).
В целом, преимуществом CS как 3D-культуры клеток является их высокая воспроизводимость и масштабируемость. В частности, CS в сочетании с роботизированной обработкой образцов могут стандартизировать и автоматизировать культуру CS, медикаментозное лечение и анализ с высоким содержанием20. Здесь мы описываем оптимизированные протоколы для создания высокочистых и высококачественных CS, которые могут быть эффективно криоконсервированы и проверены на сердечную функцию путем выполнения переходных измерений Ca2+ с использованием оптической системы сбора и анализа кальция. Эта модель представляет собой простой, но мощный инструмент для выполнения высокопроизводительных экранов на сотнях и тысячах сфероидов17,18.
Открытие сердечных препаратов затруднено из-за зависимости от нечеловеческих животных и клеточных моделей с недостаточной пропускной способностью и физиологической точностью для точного выполнения показаний. Биология hiPSC-CM в сочетании с приборами HT и физиологическими зондами может повторно ввести человеческие модели на самые ранние стадии моделирования сердечных заболеваний и открытия лекарств. Мы разработали метод 3D-генерации сердечной ткани, который позволяет получать высококачественные и функциональные CS для оптимального моделирования сердечных заболеваний и платформы скрининга лекарств. Кроме того, сочетание сфероидной технологии в 3D-биореакторных системах для промышленного производства электромобилей позволяет сделать необходимый шаг к клиническому переводу терапии на основе электромобилей. Описанный здесь метод опирается на несколько решающих факторов и является вариантом существующих протоколов 9,10,28,29. Эти методы включают в себя: 1) генерацию 3D-тканевых конструкций, 2) оптимальное количество клеток и время перед скринингом, 3) повышение чувствительности и высокой пропускной способности инструментов и 4) возможность замораживания сфероидов перед любым функциональным анализом. В отличие от ранее описанных протоколов, предлагаемый протокол описывает генерацию до 1,500 сфероидов в день и пригодность для HTS. Обычный анализ ста соединений в дозах 6 x 0,5 log для 10 реплик с использованием существующих 96-луночных систем визуализации кальция или 24-луночных мультиплексированных инженерных тканей сердца требует от примерно 500 миллионов до 3 миллиардов hiPSC-CM31,32. Предлагаемое применение делает кардиологические скрининги менее дорогостоящими и эффективными по времени по сравнению с традиционными системами, поскольку для 96-луночных планшетов требуется только 10% плотности посева по сравнению с описанным методом. Кроме того, по сравнению с предыдущими протоколами, такими как метод подвешивания, генерация сфероидов путем самоагрегации в пластинах со сверхнизким креплением позволяет получать высококачественную автоматизированную визуализацию отдельных микротканей33.
Эта небольшая 3D-модель имитирует биологический и физиологический фенотип сердечно-сосудистой среды in vivo . Как было показано ранее, кальциевые переходные процессы резко увеличиваются в 3D-конструкциях сердечной ткани по сравнению с 2D-монослойными клеточными культурами34.
Затем мы обнаружили, что плотность посева и правильное время культивирования также являются критическими факторами для успешного скрининга CS. Плотность 10K-20K hiPSC-CM на сфероид и скрининг между 2-3 неделями после генерации были оптимальными, тогда как слишком маленькие или слишком старые сфероиды демонстрируют нарушенную обработку кальция (рис. 2 и рис. 3). Поэтому важно поддерживать как можно более постоянную плотность посева, поскольку размер влияет на функциональные параметры. Кроме того, хотя этот оптический метод обеспечивает хорошие результаты для живых 3D-культур как целой ткани, получение данных в более крупных сфероидах на (суб)клеточном уровне является сложной задачей, не полагаясь на трудоемкие методы гистологии. В последнее время было опубликовано несколько подходов, в которых используется «оптическая очистка», которая позволяет получать целые 3D-сфероиды с возможностью количественного определения маркеров в одной клетке. Здесь мы адаптировали 3-дневный протокол сбора CS к анализу изображений, который оптимизирован для 3D-визуализации с использованием конфокальной микроскопии29 (рис. 1C и рис. 4D).
Наконец, с увеличением числа 3D-приложений сердечной ткани и коммерческих применений растет спрос на долгосрочное хранение и биобанкинг для конкретных пациентов от различных доноров. Криоконсервация является эффективной стратегией создания HTS-планшетов из нескольких партий с течением времени. Замораживание hiPSC-CM было описано ранее и не отличается от других культивируемых типов клеток 10,35,36. Недавно были описаны подходы к замораживанию пластин с 2D-ячейками37. Здесь мы обнаружили, что набор для криоконсервации PSC является наиболее оптимальным состоянием по сравнению с тремя другими (данные не показаны), и использовали эту среду для эффективного замораживания сфероидов. После криоконсервации жизнеспособность остается высокой (рис. 4B, C), но это влияет на электрофизиологические свойства CS, и требуется период инкубации после размораживания. Действительно, через 1 неделю после размораживания CS проявляли спонтанную биение и обработку кальция. Однако было описано, что свежие и восстановленные hiPSC-CM не всегда проявляют идентичные молекулярные и физиологические свойства38. Это ограничение необходимо учитывать, когда криоконсервированные hiPSC-CM используются для оценки индуцированных лекарством сердечных показаний. Более того, хотя мы эффективно модулируем количество клеток на сфероид и оптимальное время переходной визуализации кальция, сердечные сфероиды могут быть улучшены путем смешивания кардиомиоцитарных клеток, полученных из hiPSC, с эндотелиальными клетками, фибробластами, клеточно-клеточными соединениями и внеклеточными матрицами, такими как хитозан, коллаген IV, фибронектин, матригель или ламинин, имитируя сердечную среду in vivo 39, 40. В целом, мы предлагаем пошаговый протокол для эффективного создания CS, которые подходят для последующих приложений, таких как моделирование заболеваний и скрининг лекарств HT.
The authors have nothing to disclose.
Мы хотели бы поблагодарить VALA sciences за программный пакет Cyteseer и оптимизацию автоматизированного 3D-анализа кальция. Мы хотели бы выразить признательность за грантовую поддержку от Фонда PLN (RM). P.A.D. и F.S. поддерживаются CUREPLaN Leducq. J.P.G.S. поддерживается H2020-EVICARE (#725229) Европейского исследовательского совета (ERC). J.W.B. поддерживается клинической стипендией UMC в Утрехте, стипендией Нидерландского института сердца и грантом для молодых талантов CVON-Dosis; Нидерландский фонд сердца (CVON-Dosis 2014-40). N.C. поддерживается гравитационной программой «Регенерация, управляемая материалами» Нидерландской организации научных исследований (RegmedXB #024.003.013) и Действиями Марии Склодовской-Кюри (грантовое соглашение RESCUE #801540). В.С.-. поддерживается Фондом Альянса (UMCU, UU, TU/e). A.v.M. поддерживается финансируемым ЕС проектом BRAVE (H2020, ID:874827)
24 wells suspenion plate | Corning | 3738 | |
96 wells Ultra-Low Attachment Multiple Well Plate | Corning | CLS3474-24EA | |
Albumax | Thermo Fisher Scientific | 11020021 | |
Anti-α-Actinin (Sarcomeric) antibody | Sigma-Aldrich | A7811 | Dilution: 1:200 |
Anti-Cardiac Troponin T antibody (ab45932) | Abcam | ab45932 | Dilution: 1:200 |
Ascorbic acid | Sigma-Aldrich | A8960 | |
B-27 supplement | Thermo Fisher Scientific | 17504-044 | |
Biotin | Sigma-Aldrich | B4639 | |
Bovine serum albumin fraction V (BSA) | Roche | 10735086001 | |
Cal-520, AM | Abcam | ab171868 | |
Confocal microscope | Leica | DMi8 | |
Confocal microscope software | Leica | Las X | |
Conical tubes 15 mL | Greiner Bio-One | 5618-8271 | |
Creatine monohydrate | Sigma-Aldrich | C3630 | |
DAPI | Thermo Fisher Scientific | D3571 | Concentration: 1 µg/mL |
DMEM no glucose | Thermo Fisher Scientific | 11966025 | |
EDTA | Thermo Fisher Scientific | 15575020 | |
Fructose | Sigma-Aldrich | 76050771.05 | |
Glucose | Sigma-Aldrich | G7021 | |
Glycerol | Boom | 76050771.05 | |
Goat anti-mouse Alexa Fluor 488 | Invitrogen | A11029 | Dilution: 1:500 |
Goat anti-rabbit Alexa Fluor 568 | Invitrogen | A11011 | Dilution: 1:500 |
Horizontal shaker | IKA | 4003000 | |
Human induced pluripotent stem cell lines | (Stanford Cardiovascular Institute (S-CVI) Biobank) | CVI-273 (control 1) | |
Human induced pluripotent stem cell lines | Germany | 141 (control 2) 144 (control 3) | |
Hydrochloric acid (HCl) | Ajax Firechem | 265.2.5L-PL | 10 M stock solution, corrosive |
Isotype control, FITC mouse IgM κ isotype | BD | 556652 | |
KnockOut Serum Replacement | Thermo Fisher Scientific | 10828 | Protect from light |
L-carnitine | Sigma-Aldrich | C0283 | |
Myocyte calcium and contractility system | Leica | Thunder, DMi8 | |
Non essential amino acids (NEAA) | Thermo Fisher Scientific | 11140 | |
Paraformaldehyde solution 4% in 1x PBS, pH 7.0–7.6 | Santa Cruz | SC281692 | Hazardous |
PBS, pH 7.4 | Thermo Fisher Scientific | 10010023 | |
Penicillin/streptomycin | Thermo Fisher Scientific | 15140 | |
PES Membrane Vacuum Filter system | Corning | 431097 | |
PI/RNase Staining Solution | Invitrogen | F10797 | Dilution: 1:1000 |
Pluronic F-127 | Sigma-Aldrich | P2443 | |
PSC Cryopreservation Kit | Thermo Fisher Scientific | A2644601 | |
RevitaCell | Thermo Fisher Scientific | A2644501 | |
RPMI 1640 medium | Thermo Fisher Scientific | 11875 | |
Silicone Elastomer Kit | SYLGARD | 184 | |
Sodium dodecyl sulfate solution (10%) | Sigma-Aldrich | 71736 | |
Sodium L-Lactate | Sigma-Aldrich | 71718 | |
Taurine | Sigma-Aldrich | T0625 | |
Tris Fisher | Scientific | 11486631 | |
Triton X-100 | Merck | X100-1L | Hazardous |
Trypan blue solution, 0.4% | Thermo Fisher Scientific | 15250061 | |
TrypLE Select Enzyme (10x) | Thermo Fisher Scientific | A1217701 | |
Tween-20 | Sigma-Aldrich | P1379 | |
Urea | Sigma-Aldrich | 51456 | |
Vitamin B12 | Sigma-Aldrich | V6629 | |
Y-27632 dihydrochloride (Rho-kinase inhibitor) | Tocris | 1254 | Protect from light |