Summary

Isolement et reprogrammation neuronale directe des astrocytes de souris

Published: July 07, 2022
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Summary

Nous décrivons ici un protocole détaillé pour générer des cultures hautement enrichies d’astrocytes dérivés de différentes régions du système nerveux central de souris postnatales et leur conversion directe en neurones fonctionnels par l’expression forcée de facteurs de transcription.

Abstract

La reprogrammation neuronale directe est une approche puissante pour générer des neurones fonctionnels à partir de différentes populations de cellules de départ sans passer par des intermédiaires multipotents. Cette technique est non seulement très prometteuse dans le domaine de la modélisation des maladies, car elle permet de convertir, par exemple, les fibroblastes pour les patients souffrant de maladies neurodégénératives en neurones, mais représente également une alternative prometteuse pour les thérapies de remplacement cellulaires. Dans ce contexte, une percée scientifique majeure a été la démonstration que des cellules non neurales différenciées dans le système nerveux central, telles que les astrocytes, pouvaient être converties en neurones fonctionnels in vitro. Depuis lors, la reprogrammation directe in vitro des astrocytes en neurones a fourni des informations substantielles sur les mécanismes moléculaires sous-jacents à la conversion forcée de l’identité et les obstacles qui empêchent une reprogrammation efficace. Cependant, les résultats d’expériences in vitro réalisées dans différents laboratoires sont difficiles à comparer en raison des différences dans les méthodes utilisées pour isoler, cultiver et reprogrammer les astrocytes. Ici, nous décrivons un protocole détaillé pour isoler et cultiver de manière fiable des astrocytes de haute pureté provenant de différentes régions du système nerveux central de souris à des âges postnatals via le tri de cellules magnétiques. De plus, nous fournissons des protocoles pour reprogrammer les astrocytes cultivés en neurones par transduction virale ou transfection de l’ADN. Ce protocole rationalisé et standardisé peut être utilisé pour étudier les mécanismes moléculaires sous-jacents au maintien de l’identité cellulaire, à l’établissement d’une nouvelle identité neuronale, ainsi qu’à la génération de sous-types neuronaux spécifiques et à leurs propriétés fonctionnelles.

Introduction

Le système nerveux central (SNC) des mammifères est très complexe, composé de centaines de types cellulaires différents, y compris un grand nombre de sous-types neuronaux différents 1,2,3,4,5,6. Contrairement à d’autres organes ou tissus 7,8,9, le SNC des mammifères a une capacité de régénération très limitée; La perte neuronale à la suite d’un traumatisme crânien ou d’une neurodégénérescence est irréversible et entraîne souvent des déficits moteurs et cognitifs10. Visant à sauver les fonctions cérébrales, différentes stratégies pour remplacer les neurones perdus font l’objet d’une enquête intense11. Parmi eux, la reprogrammation directe des cellules somatiques en neurones fonctionnels émerge comme une approche thérapeutique prometteuse12. La reprogrammation directe, ou transdifférenciation, est le processus de conversion d’un type de cellule différencié en une nouvelle identité sans passer par un état prolifératif ou pluripotent intermédiaire 13,14,15,16. Pionnière par l’identification de MyoD1 comme facteur suffisant pour convertir les fibroblastes en cellules musculaires17,18, cette méthode a été appliquée avec succès pour reprogrammer plusieurs types de cellules en neurones fonctionnels 19,20,21.

Les astrocytes, la macroglie la plus abondante du SNC22,23, sont un type cellulaire particulièrement prometteur pour la reprogrammation neuronale directe pour plusieurs raisons. Tout d’abord, ils sont largement et uniformément répartis dans le SNC, fournissant une source abondante en loco pour de nouveaux neurones. Deuxièmement, les astrocytes et les neurones sont étroitement liés sur le plan du développement, car ils partagent un ancêtre commun au cours du développement embryonnaire, les cellules gliales radiales24. L’origine embryonnaire commune des deux types de cellules semble faciliter la conversion neuronale par rapport à la reprogrammation des cellules de différentes couches germinales 19,21. En outre, les informations de modelage héritées par les astrocytes à travers leur origine gliale radiale sont également maintenues dans les astrocytes adultes 25,26,27, et semblent contribuer à la génération de sous-types neuronaux 28,29,30 appropriés à la région. Par conséquent, l’étude et la compréhension de la conversion des astrocytes en neurones sont un élément important pour atteindre le plein potentiel de cette technique pour les stratégies de remplacement cellulaires.

La conversion d’astrocytes cultivés in vitro en neurones a conduit à plusieurs percées dans le domaine de la reprogrammation neuronale directe, notamment : i) l’identification de facteurs de transcription suffisants pour générer des neurones à partir d’astrocytes 15,19,31, ii) le démêlage des mécanismes moléculaires déclenchés par différents facteurs de reprogrammation dans le même contexte cellulaire 32 , et iii) mettre en évidence l’impact de l’origine développementale des astrocytes sur l’induction de différents sous-types neuronaux 28,29,33. En outre, la conversion directe in vitro des astrocytes a permis de surmonter plusieurs obstacles majeurs qui limitent la reprogrammation neuronale directe34,35, tels que l’augmentation de la production d’espèces réactives de l’oxygène (ROS)34 et les différences entre le protéome mitochondrial des astrocytes et des neurones35. Par conséquent, ces observations soutiennent fortement l’utilisation de cultures primaires d’astrocytes comme modèle de reprogrammation neuronale directe pour étudier plusieurs questions fondamentales en biologie12, liées au maintien de l’identité cellulaire, aux obstacles empêchant les changements de destin cellulaire, ainsi qu’au rôle du métabolisme dans la reprogrammation.

Nous présentons ici un protocole détaillé pour isoler les astrocytes de souris à l’âge postnatal (P) avec une très grande pureté, comme démontré en isolant les astrocytes de la moelle épinière murine29. Nous fournissons également des protocoles pour reprogrammer les astrocytes en neurones par transduction virale ou transfection de plasmides d’ADN. Les cellules reprogrammées peuvent être analysées 7 jours après la transduction (7 DPT) pour évaluer divers aspects, tels que l’efficacité de la reprogrammation et la morphologie neuronale, ou peuvent être maintenues en culture pendant plusieurs semaines, pour évaluer leur maturation au fil du temps. Il est important de noter que ce protocole n’est pas spécifique aux astrocytes de la moelle épinière et peut être facilement appliqué pour isoler les astrocytes de diverses autres régions du cerveau, y compris la matière grise corticale, le mésencéphale et le cervelet.

Protocol

La procédure suivante suit les directives de soins aux animaux du Helmholtz Zentrum Munich conformément à la directive 2010/63/UE sur la protection des animaux utilisés à des fins scientifiques. Veuillez vous assurer de vous conformer aux directives de soins aux animaux de l’établissement où la dissection est effectuée. 1. Préparation du matériel de dissection, de dissociation et de culture REMARQUE: Préparez tous les réactifs de culture…

Representative Results

Les cultures primaires d’astrocytes atteignent généralement une confluence de 80 % à 90 % entre 7 et 10 jours après le tri et le placage de la MAC (figure 1B). Généralement, une seule fiole de culture T25 donne environ 1-1,5 x 106 cellules, ce qui est suffisant pour 20-30 couvertures lors de l’ensemencement de cellules à une densité de 5-5,5 x 104 cellules par puits. Le lendemain du placage, les cellules couvrent généralement 50 % à 60 % de la surface du …

Discussion

Les cultures primaires d’astrocytes murins sont un système modèle in vitro remarquable pour étudier la reprogrammation neuronale directe. En fait, bien qu’isolées à un stade postnatal, les cellules expriment des marqueurs astrocytaires typiques29, conservent l’expression des gènes de motif 28,29 et maintiennent la capacité de proliférer, semblable aux astrocytes in vivo à un âge comparablede 38 ans.

Divulgations

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Nous tenons à remercier Ines Mühlhahn pour le clonage des constructions pour la reprogrammation, Paulina Chlebik pour la production virale, et Magdalena Götz et Judith Fischer-Sternjak pour les commentaires sur le manuscrit.

Materials

0.05% Trypsin/EDTA Life Technologies 25300054
4', 6-Diamidino-2-phenyindole, dilactate (DAPI) Sigma-Aldrich D9564
anti-mouse IgG1 Alexa 647 Thermo Fisher A21240
anti-Mouse IgG1 Biotin Southernbiotech Cat# 1070-08; RRID: AB_2794413
anti-mouse IgG2b Alexa 488 Thermo Fisher A21121
anti-rabbit Alexa 546 Thermo Fisher A11010
Aqua Poly/Mount Polysciences Cat# 18606-20
B27 Supplement Life Technologies 17504044
BDNF Peprotech 450-02
bFGF Life Technologies 13256029
Bovine Serum Albumine (BSA) Sigma-Aldrich Cat# A9418
cAMP Sigma Aldrich D0260
C-Tubes Miltenyi Biotec 130-093-237
DMEM/F12 Life Technologies 21331020
Dorsomorphin Sigma Aldrich P5499
EGF Life Technologies PHG0311
Fetal Bovine Serum PAN Biotech P30-3302
Forskolin Sigma Aldrich F6886
GDNF Peprotech 450-10
gentleMACS Octo Dissociator Miltenyi Biotec 130-096-427
GFAP Dako Cat# Z0334; RRID: AB_100013482
Glucose Sigma Aldrich G8769
GlutaMax Life Technologies 35050038
HBSS Life Technologies 14025050
Hepes Life Technologies 15630056
Lipofectamine 2000 (Transfection reagent) Thermo Fisher Cat# 11668019
MACS SmartStrainer 70µm Miltenyi Biotec 130-098-462
MiniMACS Seperator Miltenyi Biotec 130-042-102
Mouse anti-ACSA-2 MicroBeat Kit  Miltenyi Biotec 130-097-678
Mouse IgG1 anti-Synaptophysin 1 Synaptic Systems Cat# 101 011 RRID:AB_887824)
Mouse IgG2b anti-Tuj-1 (βIII-tub) Sigma Aldrich T8660
MS columns Miltenyi Biotec 130-042-201
N2 Supplement Life Technologies 17502048
Neural Tissue Dissociation Kit  Miltenyi Biotec 130-092-628
NT3 Peprotech 450-03
octoMACS Separator Miltenyi Biotec 130-042-109
OptiMEM – GlutaMAX (serum-reduced medium) Thermo Fisher Cat# 51985-026
Penicillin/Streptomycin Life Technologies 15140122
Poly-D-Lysine Sigma Aldrich P1149
Rabbit anti-RFP Rockland Cat# 600-401-379; RRID:AB_2209751
Rabbit anti-Sox9 Sigma-Aldrich Cat# AB5535; RRID:AB_2239761
Streptavidin Alexa 405 Thermo Fisher Cat# S32351
Triton X-100 Sigma-Aldrich Cat# T9284

References

  1. Johnson, T. S., et al. Spatial cell type composition in normal and Alzheimers human brains is revealed using integrated mouse and human single cell RNA sequencing. Scientific Reports. 10 (1), 18014 (2020).
  2. Lake, B. B., et al. Neuronal subtypes and diversity revealed by single-nucleus RNA sequencing of the human brain. Science. 352 (6293), 1586-1590 (2016).
  3. Mayer, C., et al. Developmental diversification of cortical inhibitory interneurons. Nature. 555 (7697), 457-462 (2018).
  4. Nowakowski, T. J., et al. Spatiotemporal gene expression trajectories reveal developmental hierarchies of the human cortex. Science. 358 (6368), 1318-1323 (2017).
  5. Sagner, A., Briscoe, J. Establishing neuronal diversity in the spinal cord: a time and a place. Development. 146 (22), (2019).
  6. Zeisel, A., et al. Molecular architecture of the mouse nervous system. Cell. 174 (4), 999-1014 (2018).
  7. Iismaa, S. E., et al. Comparative regenerative mechanisms across different mammalian tissues. NPJ Regenerative Medicine. 3, 6 (2018).
  8. Lange, C., Brand, M. Vertebrate brain regeneration – a community effort of fate-restricted precursor cell types. Current Opinion in Genetics & Development. 64, 101-108 (2020).
  9. Poss, K. D. Advances in understanding tissue regenerative capacity and mechanisms in animals. Nature Reviews Genetics. 11 (10), 710-722 (2010).
  10. Grade, S., Gotz, M. Neuronal replacement therapy: previous achievements and challenges ahead. NPJ Regenerative Medicine. 2, 29 (2017).
  11. Barker, R. A., Gotz, M., Parmar, M. New approaches for brain repair-from rescue to reprogramming. Nature. 557 (7705), 329-334 (2018).
  12. Bocchi, R., Masserdotti, G., Gotz, M. Direct neuronal reprogramming: Fast forward from new concepts toward therapeutic approaches. Neuron. 110 (3), 366-393 (2022).
  13. Di Tullio, A., et al. CCAAT/enhancer binding protein alpha (C/EBP(alpha))-induced transdifferentiation of pre-B cells into macrophages involves no overt retrodifferentiation. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 108 (41), 17016-17021 (2011).
  14. Fishman, V. S., et al. Cell divisions are not essential for the direct conversion of fibroblasts into neuronal cells. Cell Cycle. 14 (8), 1188-1196 (2015).
  15. Heinrich, C., et al. Directing astroglia from the cerebral cortex into subtype specific functional neurons. PLoS Biology. 8 (5), 1000373 (2010).
  16. Treutlein, B., et al. Dissecting direct reprogramming from fibroblast to neuron using single-cell RNA-seq. Nature. 534 (7607), 391-395 (2016).
  17. Tapscott, S. J., et al. MyoD1: a nuclear phosphoprotein requiring a Myc homology region to convert fibroblasts to myoblasts. Science. 242 (4877), 405-411 (1988).
  18. Taylor, S. M., Jones, P. A. Multiple new phenotypes induced in 10T1/2 and 3T3 cells treated with 5-azacytidine. Cell. 17 (4), 771-779 (1979).
  19. Berninger, B., et al. Functional properties of neurons derived from in vitro reprogrammed postnatal astroglia. Journal of Neuroscience. 27 (32), 8654-8664 (2007).
  20. Marro, S., et al. Direct lineage conversion of terminally differentiated hepatocytes to functional neurons. Cell Stem Cell. 9 (4), 374-382 (2011).
  21. Vierbuchen, T., et al. Direct conversion of fibroblasts to functional neurons by defined factors. Nature. 463 (7284), 1035-1041 (2010).
  22. Bass, N. H., Hess, H. H., Pope, A., Thalheimer, C. Quantitative cytoarchitectonic distribution of neurons, glia, and DNa in rat cerebral cortex. The Journal of Comparative Neurology. 143 (4), 481-490 (1971).
  23. Yoon, H., Walters, G., Paulsen, A. R., Scarisbrick, I. A. Astrocyte heterogeneity across the brain and spinal cord occurs developmentally, in adulthood and in response to demyelination. PLoS One. 12 (7), 0180697 (2017).
  24. Taverna, E., Gotz, M., Huttner, W. B. The cell biology of neurogenesis: toward an understanding of the development and evolution of the neocortex. Annual Review of Cell and Developmental Biology. 30, 465-502 (2014).
  25. Batiuk, M. Y., et al. Identification of region-specific astrocyte subtypes at single cell resolution. Nature Communication. 11 (1), 1220 (2020).
  26. Boisvert, M. M., Erikson, G. A., Shokhirev, M. N., Allen, N. J. The aging astrocyte transcriptome from multiple regions of the mouse brain. Cell Reports. 22 (1), 269-285 (2018).
  27. Ohlig, S., et al. Molecular diversity of diencephalic astrocytes reveals adult astrogenesis regulated by Smad4. The EMBO Journal. 40 (21), 107532 (2021).
  28. Herrero-Navarro, A., et al. Astrocytes and neurons share region-specific transcriptional signatures that confer regional identity to neuronal reprogramming. Science Advances. 7 (15), (2021).
  29. Kempf, J., et al. Heterogeneity of neurons reprogrammed from spinal cord astrocytes by the proneural factors Ascl1 and Neurogenin2. Cell Reports. 36 (3), 109409 (2021).
  30. Mattugini, N., et al. Inducing Different Neuronal Subtypes from Astrocytes in the Injured Mouse Cerebral Cortex. Neuron. 103 (6), 1086-1095 (2019).
  31. Heins, N., et al. Glial cells generate neurons: the role of the transcription factor Pax6. Nature Neuroscience. 5 (4), 308-315 (2002).
  32. Masserdotti, G., et al. Transcriptional mechanisms of proneural factors and REST in regulating neuronal reprogramming of astrocytes. Cell Stem Cell. 17 (1), 74-88 (2015).
  33. Rao, Z., et al. Molecular mechanisms underlying Ascl1-mediated astrocyte-to-neuron conversion. Stem Cell Reports. 16 (3), 534-547 (2021).
  34. Gascon, S., et al. Identification and successful negotiation of a metabolic checkpoint in direct neuronal reprogramming. Cell Stem Cell. 18 (3), 396-409 (2016).
  35. Russo, G. L., et al. CRISPR-mediated induction of neuron-enriched mitochondrial proteins boosts direct glia-to-neuron conversion. Cell Stem Cell. 28 (3), 524-534 (2021).
  36. Guo, S., et al. Nonstochastic reprogramming from a privileged somatic cell state. Cell. 156 (4), 649-662 (2014).
  37. Hu, X., et al. Region-restrict astrocytes exhibit heterogeneous susceptibility to neuronal reprogramming. Stem Cell Reports. 12 (2), 290-304 (2019).
  38. Ge, W. P., Miyawaki, A., Gage, F. H., Jan, Y. N., Jan, L. Y. Local generation of glia is a major astrocyte source in postnatal cortex. Nature. 484 (7394), 376-380 (2012).
  39. Price, J. D., et al. The Ink4a/Arf locus is a barrier to direct neuronal transdifferentiation. The Journal of Neuroscience. 34 (37), 12560-12567 (2014).
  40. Heinrich, C., et al. Generation of subtype-specific neurons from postnatal astroglia of the mouse cerebral cortex. Nature Protocols. 6 (2), 214-228 (2011).
  41. Batiuk, M. Y., et al. An immunoaffinity-based method for isolating ultrapure adult astrocytes based on ATP1B2 targeting by the ACSA-2 antibody. The Journal of Biological Chemistry. 292 (21), 8874-8891 (2017).

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Citer Cet Article
Hersbach, B. A., Simon, T., Masserdotti, G. Isolation and Direct Neuronal Reprogramming of Mouse Astrocytes. J. Vis. Exp. (185), e64175, doi:10.3791/64175 (2022).

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