Questo protocollo descrive un metodo per lo studio delle proteine di membrana elettrogeniche misurando le variazioni del potenziale di membrana. Questo test fornisce una piattaforma per la lettura funzionale di più canali ionici espressi endogenamente in linee cellulari epiteliali.
Gli studi basati sulla fluorescenza sono adatti per saggi di lettori di piastre ad alta produttività di cellule in coltura. Sono stati comunemente impiegati per campagne di scoperta di farmaci mirate alle proteine dei canali ionici ricombinanti sovraespresse in cellule come le cellule HEK-293. Tuttavia, vi è una crescente enfasi sull’uso di linee cellulari rilevanti per i tessuti per studiare gli effetti degli interventi di piccole molecole. Il seguente protocollo descrive l’adattamento di un saggio di potenziale di membrana basato sulla fluorescenza per lo studio dei canali ionici espressi endogenamente in linee cellulari epiteliali. Il test del potenziale di membrana descrive in dettaglio un test ad alto rendimento per l’attività dei canali del cloruro del regolatore di conduttanza transmembrana della fibrosi cistica (CFTR) in due linee cellulari epiteliali comunemente studiate, Caco-2 e Calu-3. Inoltre, questo articolo descrive una nuova applicazione di questo sistema per misurare l’attività del canale epiteliale del sodio (ENaC) in un formato ad alto rendimento nelle stesse linee cellulari epiteliali. Insieme, questi saggi basati sulla fluorescenza forniscono una piattaforma robusta e flessibile per lo studio di modulatori di piccole molecole, mirati a due canali epiteliali in un contesto cellulare rilevante.
I saggi basati sulla fluorescenza e ad alta produttività delle proteine dei canali ricombinanti sono stati altamente efficaci nell’identificare modulatori di piccole molecole che hanno il potenziale per diventare terapie future 1,2,3,4. Un metodo comune per lo screening delle librerie di piccole molecole per i modulatori dei canali ionici è attraverso la misurazione dei cambiamenti nel potenziale di membrana. Tipicamente, questi schermi sono condotti utilizzando canali ricombinanti espressi eterologamente in linee cellulari come le cellule HEK-293 5,6,7.
Tuttavia, vi è la necessità di convalidare i “colpi” nei tipi di cellule rilevanti. Proponiamo che sia auspicabile uno screening secondario in linee cellulari rilevanti che esprimono endogenamente i canali di interesse. Tale screening secondario identificherà quei modulatori che hanno maggiori probabilità di essere efficaci nei test di convalida finale che si basano su tessuti umani primari meno accessibili.
C’è anche la necessità di sistemi di analisi che abbiano la flessibilità di segnalare l’attività di più bersagli di canali ionici nello stesso tipo di tessuto. Ad esempio, esiste una letteratura pubblicata sostanziale che supporta il concetto che CFTR e ENaC interagiscono funzionalmente 8,9,10. Sebbene diverse linee cellulari epiteliali ben studiate siano note per esprimere sia CFTR che ENaC, ad oggi, le condizioni di analisi per studiare entrambe in modo ad alto rendimento non sono state descritte.
Questo saggio del potenziale di membrana basato sulla fluorescenza è versatile, in quanto impiega una sonda chimica esogena per misurare la funzione di CFTR e ENaC, bypassando la necessità di sonde geneticamente codificate11. Come prova di principio, due linee cellulari epiteliali comunemente usate sono studiate come esempi per evidenziare i passaggi critici necessari per misurare l’attività del canale sia di CFTR che di ENaC.
Qui, abbiamo descritto metodi basati sulla fluorescenza per misurare l’attività CFTR ed ENaC nella linea cellulare di cancro colorettale epiteliale, Caco-2, e nella linea cellulare di cancro del polmone epiteliale umano, Calu-3. Questi saggi del potenziale di membrana in linee cellulari epiteliali possono essere utilizzati per confermare l’efficacia di composti modulatori di piccole molecole, precedentemente identificati in sistemi di espressione eterologa, prima della convalida finale in vitro in colture epiteliali primarie derivate dal paziente.
È imperativo confermare che le misurazioni di cui sopra siano adeguatamente attribuite al canale di interesse. Ad esempio, la misurazione attribuita al CFTR dovrebbe mostrare dipendenza dall’espressione della proteina CFTR e dalla forza elettrochimica trainante del cloruro, che è modulata dalla forskolina e dall’inibitore CFTRInh-172. Allo stesso modo, i cambiamenti potenziali di membrana causati dall’amiloride da 10 μM possono essere attribuiti a ENaC, se dipendono dall’espressione proteica di ENaC e da una forza motrice di sodio verso l’interno. Sebbene abbiamo confermato queste proprietà di ENaC nelle cellule MDCK dopo trasfezione con tutte e tre le subunità di ENaC 2, non abbiamo ancora confermato formalmente che la risposta amiloride misurata nelle celluleCaco-2 e Calu-3 sia conferita da ENaC. Ciò è particolarmente importante, in quanto l’amiloride può modulare la funzione dello scambiatore sodio-protone NHE3 oltre a ENaC13. Plausibilmente, l’iperpolarizzazione indotta dall’amiloride osservata in questo test potrebbe parzialmente riflettere gli effetti indiretti dell’acidificazione intracellulare su altri canali. Per confermare che l’iperpolarizzazione indotta da amiloride misurata utilizzando questo colorante sensibile al potenziale di membrana è conferita da ENaC nelle suddette linee cellulari e nei sistemi cellulari più complessi, come i tessuti derivati da iPSC, confermiamo che questa attività viene persa eliminando una subunità ENaC obbligata (beta) in queste linee.
Il successo di questi test richiede attenzione a diversi fattori. In primo luogo, le colture epiteliali devono essere confluenti e ben differenziate. Per la misurazione della funzione CFTR ed ENaC, circa 145.000 celle devono essere placcate per pozzetto in piastre a 96 pozzetti o 45.000 celle per pozzetto in piastre a 384 pozzetti. Una volta che le cellule epiteliali raggiungono la confluenza (entro 3-4 giorni dalla placcatura), lasciare 2-5 giorni di differenziazione. Questa tempistica è stata determinata in precedenza sulla base della massima espressione proteica CFTR mediante immunoblotting14. Allo stesso modo, è stata determinata la tempistica ottimale per l’espressione funzionale di ENaC in entrambe le linee cellulari, Calu-3 e Caco-2.
Monostrati non confluenti o crescita eccessiva delle cellule portano a una bassa riproducibilità tra le repliche tecniche. Nei casi in cui le cellule nei singoli pozzetti non raggiungano la confluenza allo stesso tempo, queste piastre devono essere scartate. Inoltre, letture basali instabili o mancanza di risposte di stimolazione possono essere un’indicazione di scarsa qualità cellulare, che deve essere esclusa dall’analisi. Risposte ridotte all’attivatore CFTR, forskolin, o all’inibitore ENaC, amiloride, potrebbero potenzialmente riflettere l’uso di cellule eccessivamente passate15. Sebbene non sia un problema per le cellule Calu-3 e Caco-2, altre cellule o tessuti potrebbero non aderire bene alle piastre e potrebbero richiedere il prerivestimento dei pozzetti. Ad esempio, in studi precedenti, le colture di colangiociti 2D sono state attaccate alle piastre utilizzando il rivestimento di collagene16. In alternativa, l’aderenza dei tessuti intestinali 2D è stata aumentata utilizzando Poly-L-Lisina2.
Inoltre, nel testare la modulazione dei canali ionici da parte di piccole molecole utilizzando un saggio basato sulla fluorescenza, è fondamentale che vengano affrontati i potenziali artefatti conferiti dalle proprietà fluorescenti delle piccole molecole. Per confermare la specificità delle risposte funzionali, i saggi del potenziale di membrana possono essere ulteriormente convalidati utilizzando metodi elettrofisiologici convenzionali, come gli studi di Ussing17.
Dopo aver confermato che la risposta rilevata dai coloranti sensibili al potenziale di membrana è specificamente conferita dal canale di interesse, questi test hanno un enorme potenziale per convalidare modulatori promettenti dei canali ionici epiteliali nel loro contesto cellulare pertinente. Questa piattaforma può colmare il divario tra gli schermi modulatori ad alto rendimento nei sistemi di espressione eterologa e le misurazioni bioelettriche che richiedono molto tempo nei tessuti primari di difficile accesso.
The authors have nothing to disclose.
Gli autori desiderano ringraziare Christopher Fladd e SPARC BioCentre presso l’Hospital for Sick Children per il loro aiuto nella conduzione dei saggi del potenziale di membrana che misurano CFTR ed ENaC. Questo lavoro è stato sostenuto dal programma CFIT con finanziamenti forniti da CF Canada e dalla Sick Kids Foundation. Questo lavoro è stato finanziato dal governo del Canada attraverso Genome Canada e l’Ontario Genomics Institute (OGI-148). Questo studio è stato finanziato dal governo dell’Ontario. S.X. è stato supportato dalla Canadian Association of Gastroenterology (CAG) Ph.D. Scholarship.
Amiloride | Spectrum Chemical | TCI-A2599-5G | Dissolved in DMSO and stored at -20 °C |
CFTRInh-172 | CF Foundation Therapeutics | Dissolved in DMSO and stored at -20 °C | |
EMEM, 1xs | Wisent | 320-005-CL | |
Fetal Bovine Serum (FBS) | Wisent | 080-450 | |
FLIPR Membrane Potential Dye | Molecular Devices | R8042 | Stored at 4 °C |
Forskolin | Sigma-Aldrich | F3917 | Dissolved in DMSO and stored at -20 °C |
Gluconic acid lactone or (D-(+)-Gluconic acid δ-lactone) | Sigma-Aldrich | G4750 | Stored at room temperature |
HEPES | Bioshop | HEP001.5 | Stored at room temperature |
Human Bronchial Adenocarcinoma Cell Line (Calu-3) | ATCC | HTB-55 | |
Human Epithelial Colorectal Adenocarcinoma Cell Line (Caco-2) | ATCC | HTB-37 | |
N-Methyl-D-glucamine (NMDG | Sigma-Aldrich | M2004 | Stored at room temperature |
Penicillin-Streptomycin Solution | Wisent | 450-200-EL | |
Phosphate-Buffered Saline (PBS) | Wisent | 311-010-CL | |
Potassium Gluconate | Sigma-Aldrich | P1847 | Stored at room temperature |
Sodium Gluconate | Sigma-Aldrich | G9005 | Stored at room temperature |