Dieses Protokoll beschreibt eine Methode zur Untersuchung von elektrogenen Membranproteinen durch Messung von Änderungen des Membranpotentials. Dieser Assay bietet eine Plattform für die funktionelle Auslesung mehrerer Ionenkanäle, die endogen in Epithelzelllinien exprimiert werden.
Fluoreszenzbasierte Studien eignen sich für Hochdurchsatz-Plate-Reader-Assays von Zellen in Kultur. Sie werden häufig für Wirkstoffforschungskampagnen eingesetzt, die auf rekombinante Ionenkanalproteine abzielen, die in Zellen wie HEK-293-Zellen überexprimiert werden. Es wird jedoch zunehmend Wert auf die Verwendung geweberelevanter Zelllinien gelegt, um die Auswirkungen von niedermolekularen Interventionen zu untersuchen. Das folgende Protokoll beschreibt die Adaption eines fluoreszenzbasierten Membranpotential-Assays für die Untersuchung von Ionenkanälen, die endogen in Epithelzelllinien exprimiert werden. Der Membranpotential-Assay beschreibt einen Hochdurchsatz-Assay für die Chloridkanalaktivität des Mukoviszidose-Transmembran-Leitfähigkeitsregulators (CFTR) in zwei häufig untersuchten Epithelzelllinien, Caco-2 und Calu-3. Darüber hinaus beschreibt diese Arbeit eine neuartige Anwendung dieses Systems zur Messung der Aktivität des epithelialen Natriumkanals (ENaC) in einem Hochdurchsatzformat in denselben Epithelzelllinien. Zusammen bieten diese fluoreszenzbasierten Assays eine robuste und flexible Plattform für die Untersuchung von niedermolekularen Modulatoren, die auf zwei Epithelkanäle in einem relevanten zellulären Kontext abzielen.
Fluoreszenzbasierte Hochdurchsatz-Aktivitätsassays von rekombinanten Kanalproteinen haben sich als hochwirksam bei der Identifizierung von niedermolekularen Modulatoren erwiesen, die das Potenzial haben, zukünftige Therapien zu werden 1,2,3,4. Eine gängige Methode zum Screening von Kleinmolekülbibliotheken auf Ionenkanalmodulatoren ist die Messung von Änderungen des Membranpotentials. Typischerweise werden diese Screenings unter Verwendung rekombinanter Kanäle durchgeführt, die heterolog in Zelllinien wie HEK-293-Zellen 5,6,7 exprimiert werden.
Es besteht jedoch Bedarf an der Validierung von “Treffern” in relevanten Zelltypen. Wir schlagen vor, dass ein sekundäres Screening in relevanten Zelllinien, die die interessierenden Kanäle endogen exprimieren, wünschenswert ist. Ein solches sekundäres Screening identifiziert diejenigen Modulatoren, die in abschließenden Validierungsassays, die auf weniger zugänglichem primärem menschlichem Gewebe beruhen, am wahrscheinlichsten wirksam sind.
Es besteht auch ein Bedarf an Assay-Systemen, die flexibel genug sind, um die Aktivität mehrerer Ionenkanalziele im selben Gewebetyp zu melden. Zum Beispiel gibt es substanzielle veröffentlichte Literatur, die das Konzept unterstützt, dass CFTR und ENaC funktionell interagieren 8,9,10. Obwohl mehrere gut untersuchte Epithelzelllinien bekannt sind, die sowohl CFTR als auch ENaC exprimieren, wurden die Assay-Bedingungen für die Untersuchung beider im Hochdurchsatz bisher nicht beschrieben.
Dieser fluoreszenzbasierte Membranpotential-Assay ist vielseitig einsetzbar, da er eine exogene chemische Sonde verwendet, um die Funktion von CFTR und ENaC zu messen, wodurch die Notwendigkeit genetisch kodierter Sondenumgangen wird 11. Als Beweis für das Prinzip werden zwei häufig verwendete Epithelzelllinien als Beispiele untersucht, um die kritischen Schritte aufzuzeigen, die für die Messung der Kanalaktivität sowohl von CFTR als auch von ENaC erforderlich sind.
In dieser Arbeit haben wir fluoreszenzbasierte Methoden zur Messung der CFTR- und ENaC-Aktivität in der epithelialen Darmkrebszelllinie Caco-2 und der humanen epithelialen Lungenkrebszelllinie Calu-3 beschrieben. Diese Membranpotential-Assays in Epithelzelllinien können verwendet werden, um die Wirksamkeit von niedermolekularen Modulatorverbindungen, die zuvor in heterologen Expressionssystemen identifiziert wurden, vor der endgültigen In-vitro-Validierung in primären Epithelkulturen von Patienten zu bestätigen.
Es muss unbedingt bestätigt werden, dass die oben genannten Messungen dem interessierenden Kanal angemessen zugeordnet werden. Zum Beispiel sollte die Messung, die CFTR zugeschrieben wird, eine Abhängigkeit von der CFTR-Proteinexpression und der elektrochemischen Antriebskraft von Chlorid zeigen, die durch Forskolin und den Inhibitor CFTRInh-172 moduliert wird. In ähnlicher Weise können die durch 10 μM Amiloride verursachten Membranpotentialänderungen auf ENaC zurückgeführt werden, wenn sie von der ENaC-Proteinexpression und einer nach innen gerichteten Natriumantriebskraft abhängen. Obwohl wir diese Eigenschaften von ENaC in MDCK-Zellen nach Transfektion mit allen drei Untereinheiten von ENaC 2 bestätigt haben, haben wir noch nicht formal bestätigt, dass die in Caco-2- und Calu-3-Zellen gemessene Amiloridantwort durch ENaC vermittelt wird. Dies ist besonders wichtig, da Amilorid neben ENaC13 auch die Funktion des Natrium-Proton-Austauschers NHE3 modulieren kann. Es ist denkbar, dass die in diesem Assay beobachtete Amilorid-induzierte Hyperpolarisation teilweise die indirekten Effekte der intrazellulären Ansäuerung auf andere Kanäle widerspiegelt. Um zu bestätigen, dass die Amilorid-induzierte Hyperpolarisation, die mit diesem membranpotentialsensitiven Farbstoff gemessen wurde, durch ENaC in den oben genannten Zelllinien und komplexeren Zellsystemen, wie z.B. aus iPSC-abgeleiteten Geweben, übertragen wird, bestätigen wir, dass diese Aktivität verloren geht, indem eine obligate ENaC-Untereinheit (beta) in diesen Linien ausgeschaltet wird.
Der Erfolg dieser Assays erfordert die Beachtung mehrerer Faktoren. Zunächst müssen die Epithelkulturen konfluent und gut differenziert sein. Für die Messung der CFTR- und ENaC-Funktion sollten ca. 145.000 Zellen pro Well in 96-Well-Platten oder 45.000 Zellen pro Well in 384-Well-Platten plattiert werden. Sobald die Epithelzellen die Konfluenz erreicht haben (innerhalb von 3-4 Tagen nach der Beschichtung), warten Sie 2-5 Tage der Differenzierung. Dieser Zeitpunkt wurde zuvor anhand der maximalen CFTR-Proteinexpression durch Immunoblotting14 bestimmt. In ähnlicher Weise wurde das optimale Timing für die funktionelle ENaC-Expression in beiden Zelllinien, Calu-3 und Caco-2, bestimmt.
Nichtkonfluente Monoschichten oder Zellüberwucherung führen zu einer geringen Reproduzierbarkeit über technische Replikate hinweg. In Fällen, in denen Zellen in einzelnen Vertiefungen nicht gleichzeitig Konfluenz erreichen, sollten diese Platten verworfen werden. Darüber hinaus können instabile Ausgangswerte oder fehlende Stimulationsreaktionen ein Hinweis auf eine schlechte Zellqualität sein, die von der Analyse ausgeschlossen werden muss. Ein vermindertes Ansprechen auf den CFTR-Aktivator Forskolin oder den ENaC-Inhibitor Amilorid könnte möglicherweise auf die Verwendung von übermäßig passageierten Zellen zurückzuführensein 15. Obwohl dies für Calu-3- und Caco-2-Zellen kein Problem darstellt, haften andere Zellen oder Gewebe möglicherweise nicht gut an den Platten und erfordern möglicherweise eine Vorbeschichtung der Wells. In früheren Studien wurden beispielsweise 2D-Cholangiozytenkulturen mit einer Kollagenbeschichtung auf die Platten aufgebracht16. Alternativ wurde die Adhärenz von 2D-Darmgewebe mit Poly-L-Lysin2 erhöht.
Darüber hinaus ist es bei der Prüfung der Modulation von Ionenkanälen durch kleine Moleküle mit einem fluoreszenzbasierten Assay von entscheidender Bedeutung, dass potenzielle Artefakte, die durch die Fluoreszenzeigenschaften der kleinen Moleküle entstehen, berücksichtigt werden. Um die Spezifität funktioneller Antworten zu bestätigen, können Membranpotential-Assays mit konventionellen elektrophysiologischen Methoden, wie z.B. Ussing-Studien17, weiter validiert werden.
Nachdem bestätigt wurde, dass die von membranpotentialsensitiven Farbstoffen detektierte Antwort spezifisch durch den zu untersuchenden Kanal vermittelt wird, haben diese Assays ein enormes Potenzial, vielversprechende Modulatoren von epithelialen Ionenkanälen in ihrem relevanten zellulären Kontext zu validieren. Diese Plattform kann die Lücke zwischen Hochdurchsatz-Modulator-Screens in heterologen Expressionssystemen und zeitaufwändigen, bioelektrischen Messungen in schwer zugänglichen Primärgeweben schließen.
The authors have nothing to disclose.
Die Autoren bedanken sich bei Christopher Fladd und dem SPARC BioCentre am Hospital for Sick Children für ihre Hilfe bei der Durchführung der Membranpotential-Assays zur Messung von CFTR und ENaC. Diese Arbeit wurde durch das CFIT-Programm mit Mitteln von CF Canada und der Sick Kids Foundation unterstützt. Diese Arbeit wurde von der kanadischen Regierung über Genome Canada und das Ontario Genomics Institute (OGI-148) finanziert. Diese Studie wurde von der Regierung von Ontario finanziert. S.X. wurde durch das Ph.D.-Stipendium der Canadian Association of Gastroenterology (CAG) unterstützt.
Amiloride | Spectrum Chemical | TCI-A2599-5G | Dissolved in DMSO and stored at -20 °C |
CFTRInh-172 | CF Foundation Therapeutics | Dissolved in DMSO and stored at -20 °C | |
EMEM, 1xs | Wisent | 320-005-CL | |
Fetal Bovine Serum (FBS) | Wisent | 080-450 | |
FLIPR Membrane Potential Dye | Molecular Devices | R8042 | Stored at 4 °C |
Forskolin | Sigma-Aldrich | F3917 | Dissolved in DMSO and stored at -20 °C |
Gluconic acid lactone or (D-(+)-Gluconic acid δ-lactone) | Sigma-Aldrich | G4750 | Stored at room temperature |
HEPES | Bioshop | HEP001.5 | Stored at room temperature |
Human Bronchial Adenocarcinoma Cell Line (Calu-3) | ATCC | HTB-55 | |
Human Epithelial Colorectal Adenocarcinoma Cell Line (Caco-2) | ATCC | HTB-37 | |
N-Methyl-D-glucamine (NMDG | Sigma-Aldrich | M2004 | Stored at room temperature |
Penicillin-Streptomycin Solution | Wisent | 450-200-EL | |
Phosphate-Buffered Saline (PBS) | Wisent | 311-010-CL | |
Potassium Gluconate | Sigma-Aldrich | P1847 | Stored at room temperature |
Sodium Gluconate | Sigma-Aldrich | G9005 | Stored at room temperature |