Dit protocol beschrijft het gebruik van commerciële, celvrije eiwitexpressiekits om membraaneiwitten te produceren die worden ondersteund in nanodisc die kunnen worden gebruikt als antigenen in subunitvaccins.
Subunitvaccins bieden voordelen ten opzichte van meer traditionele geïnactiveerde of verzwakte van hele cellen afgeleide vaccins op het gebied van veiligheid, stabiliteit en standaardproductie. Om een effectief op eiwitten gebaseerd subunitvaccin te bereiken, moet het eiwitantigeen vaak een inheems-achtige conformatie aannemen. Dit is vooral belangrijk voor pathogeen-oppervlakte-antigenen die membraangebonden eiwitten zijn. Celvrije methoden zijn met succes gebruikt om correct gevouwen functioneel membraaneiwit te produceren door de co-translatie van nanolipoproteïnedeeltjes (NLP’s), algemeen bekend als nanodiscs.
Deze strategie kan worden gebruikt om subunitvaccins te produceren die bestaan uit membraaneiwitten in een lipidegebonden omgeving. De celvrije eiwitproductie is echter vaak beperkt tot kleinschaligheid (<1 ml). De hoeveelheid eiwit die in kleinschalige productieruns wordt geproduceerd, is meestal voldoende voor biochemische en biofysische studies. Het celvrije proces moet echter worden opgeschaald, geoptimaliseerd en zorgvuldig worden getest om voldoende eiwit te verkrijgen voor vaccinstudies in diermodellen. Andere processen die betrokken zijn bij de productie van vaccins, zoals zuivering, adjuvante toevoeging en lyofilisatie, moeten parallel worden geoptimaliseerd. Dit artikel rapporteert de ontwikkeling van een opgeschaald protocol om een membraangebonden eiwitsubeenheidvaccin tot expressie te brengen, te zuiveren en te formuleren.
Geschaalde celvrije reacties vereisen optimalisatie van plasmideconcentraties en -verhoudingen bij gebruik van meerdere plasmide-expressievectoren, lipidenselectie en adjuvante toevoeging voor productie op hoog niveau van geformuleerde nanolipoproteïnedeeltjes. De methode wordt hier gedemonstreerd met de expressie van een chlamydiaal major outer membrane protein (MOMP), maar kan op grote schaal worden toegepast op andere membraaneiwitantigenen. De effectiviteit van antigeen kan in vivo worden geëvalueerd door middel van immunisatiestudies om de productie van antilichamen te meten, zoals hier wordt aangetoond.
Prokaryote of eukaryote lysaten voor celvrije expressie van eiwitten zijn gemakkelijk verkrijgbaar als commerciële producten voor het synthetiseren van eiwitten van belang (voor een volledig overzicht, zie 1). Deze expressiesystemen zijn beschikbaar op verschillende schalen en maken gebruik van lysaten van verschillende organismen, waaronder E. coli, tabaksplanten en zoogdierculturen. Celvrije lysaten bieden meerdere voordelen ten opzichte van traditionele recombinante eiwitproductiebenaderingen, waaronder gebruiksgemak en robuuste, snelle eiwitproductie. Hoewel deze benaderingen voornamelijk worden gebruikt om oplosbare eiwitten te produceren, heeft deze groep een baanbrekende aanpak ontwikkeld voor het gebruik ervan om membraaneiwitten tot expressie te brengen.
Deze nieuwe benadering brengt kleine wijzigingen aan in bestaande celvrije expressiesystemen door DNA op te nemen dat codeert voor twee eiwitproducten voor expressie, een apolipoproteïne en het membraaneiwit van belang. Het tot expressie gebrachte apolipoproteïne (derivaten van ApoA1 of ApoE4) interageert met lipiden die aan het celvrije lysaat worden toegevoegd om spontaan (~ 20 nm) NLP’s samen te stellen. Wanneer het membraaneiwit wordt gecombineerd met een membraaneiwit van belang, vormen het NLP- en membraaneiwit een oplosbaar nanodeeltjescomplex waarin het membraaneiwit is ingebed in de NLP-lipidebilaag. Het membraaneiwit is dus toegankelijker voor downstream-toepassingen, omdat het zich in oplosbare, discrete deeltjes bevindt. Deze aanpak kan functionele oligomere eiwitcomplexen produceren binnen de NLP bilayer2 en kan de antigeencomponent van een subunitvaccin produceren, die vervolgens wordt gemengd met lipofiele adjuvantia om een nanodeeltjesvaccin te vormen met co-gelokaliseerd antigeen en adjuvans dat geschikt is voor in vivo beoordeling.
Deze huidige methode is aangepast van een eerder gepubliceerd protocol3. Belangrijke modificaties zijn gericht op de opschaling van de celvrije reactie en de daaropvolgende zuivering van het eiwit-NLP-complex. Een verdere wijziging omvat de toevoeging van een amfifiel polymeer dat bekend staat als een telodendrimeer, dat eerst wordt gemengd met de lipiden voordat het wordt toegevoegd aan de celvrije reactie. Co-translatie van de plasmiden in aanwezigheid van de telodendrimer en de lipiden levert een telodendrimer NLP (tNLP) op. De toevoeging van de telodendrimer helpt ook bij het moduleren van de grootte en monodispersiteit van de resulterende tNLP nanodeeltjes4. Dit protocol is specifiek geoptimaliseerd voor grootschalige vaccinstudies om een membraangebonden subeenheidsantigeeneiwit te produceren, chlamydiaal MOMP 5,6. De methode produceert recombinant MOMP geassocieerd met tNLP om een zeer oplosbaar MOMP-tNLP-complex te vormen dat MOMP-oligomerisatie behoudt. Een typische opschalingsproductie van 3 ml levert >1,5 mg gezuiverde MOMP op. De celvrij geproduceerde MOMP-tNLP is vatbaar voor snelle adjuvante toevoeging voor in vivo immunogeniciteitstests.
Chlamydia is de meest voorkomende seksueel overdraagbare aandoening die zowel mannen als vrouwen treft. Hoewel vaccinonderzoek naar Chlamydia tientallen jaren beslaat, is een veilig en effectief vaccin dat kan worden opgeschaald naar massaproductie ongrijpbaar gebleven13. De chlamydia MOMP wordt beschouwd als de belangrijkste kandidaat als een beschermend vaccinantigeen; MOMP is echter zeer hydrofoob en gevoelig voor onjuiste vouwing14,15. Verdere studie heeft aangetoond dat MOMP bestaat in oligomere toestanden die essentieel zijn voor de immunogeniciteit11. Hier wordt een gevalideerde, celvrije co-expressiemethode beschreven die oligomere MOMP produceert die wordt gevormd in tNLP-nanodeeltje als een vaccin, met opbrengsten van ongeveer 1,5 mg gezuiverde MOMP per 3 ml lysaat. Deze volledig gecollifieerde procedure kan verder worden opgeschaald voor industriële productie, waardoor de vooruitzichten als een nuttige benadering voor het genereren van vaccins worden vergroot.
We hebben eerder gepubliceerd over het gebruik van celvrije expressie om membraaneiwitten te produceren die zijn ingebed in NLPs 3,16, evenals expressie in telodendrimer-gestabiliseerde schijven. Deze laatste techniek produceerde echter membraaneiwitdeeltjes met een grotere heterogeniteit en lagere oplosbaarheid. 4 Bovendien is de immunogeniciteit van MOMP-telodendrimer-deeltjes onduidelijk in vergelijking met MOMP-tNLP-deeltjes6.
Deze procedure kan worden aangepast om de expressie van bacteriële membraaneiwitten op te schalen die veelbelovende kandidaten zijn als antigenen voor gebruik in subunitvaccins. Niet alleen produceert deze procedure opgelost bacterieel membraaneiwit, maar de algehele nanodeeltjesstructuur is vatbaar voor verdere modificatie met behulp van een verscheidenheid aan lipofiele vaccinadjuvantia, waaronder, maar niet beperkt tot, CpG geconjugeerd aan een cholesterolgroep of FSL-1. Expressie van andere kandidaat-antigenen uit bacteriën is haalbaar, hoewel parameters zoals expressietemperatuur, lipidenkeuze en type expressiesysteem mogelijk moeten worden onderzocht om optimale opbrengsten te bereiken.
Bovendien zijn plasmidekeuze en -verhouding van cruciaal belang in dit proces. Beide gebruikte plasmiden moeten uit dezelfde ruggengraat worden opgebouwd. Als de inserts ongeveer even lang zijn, kunnen de verhoudingen worden gebaseerd op de massa van het toegevoegde plasmide, zoals hier beschreven. Verhoudingen op basis van moedervlekken zullen echter meer reproduceerbare resultaten opleveren, vooral bij het schalen van de reacties. Verhoudingen die goed werken in reacties op schermschaal (< 0,5 ml) zijn mogelijk niet van toepassing op grotere reacties en vereisen mogelijk extra optimalisatie. Niet-membraaneiwitten kunnen nog steeds tot expressie worden gebracht met behulp van celvrije kits, maar vereisen mogelijk niet dat het lipide nanodeeltje (co-expressie) een oplosbaar product produceert. Bovendien, terwijl dit protocol adjuvanting met CpG en FSL-1 beschrijft, is dit systeem vatbaar voor formulering met andere lipofiele adjuvantia of vermenging met oplosbare adjuvantia naar wens.
Het is essentieel om besmetting te voorkomen bij het opzetten van de celvrije expressiereactie, omdat dit de opbrengst kan beïnvloeden. Alle additieven voor de reactie, inclusief de plasmiden zelf, moeten zeer zuiver zijn. Bovendien mogen de tot expressie gebrachte eiwitten alleen in contact komen met materialen en oplossingen die vrij zijn van endotoxinebesmetting. Endotoxinebesmetting in kandidaatformuleringen kan leiden tot inconsistente en valse resultaten van immunologische testen en kan in voldoende hoeveelheden schadelijk zijn. Hoewel hier niet beschreven, kan aanvullende zuivering na nikkelaffiniteitschromatografie nodig zijn als veel verontreinigingen worden waargenomen in volgende analysestappen, zoals via SDS-PAGE. Dit kan worden bereikt met SEC, hoewel de omstandigheden mogelijk optimalisatie per formulering vereisen.
The authors have nothing to disclose.
Dit werk werd ondersteund door de Public Health Service grant R21 AI20925 en U19 AI144184 van het National Institute of Allergy and Infectious Diseases. Dit werk werd uitgevoerd onder auspiciën van het Amerikaanse ministerie van Energie door Lawrence Livermore National Laboratory onder contract DE-AC52-07NA27344 [LLNL-JRNL-822525, LLNL-VIDEO-832788].
1,2-dimyristoyl-sn-glycero-3-phosphocholine (DMPC) as powder | Avanti Polar Lipids | 850345 | |
1.5 mL endotoxin-free centrifuge tubes | Eppendorf | 2600028 | |
1 M Trizma hydrochloride solution | Millipore Sigma | T2194 | |
Acetic acid, glacial, ACS reagent, ≥99.7% | Millipore Sigma | 695092 | |
Bio-Dot apparatus | Bio-Rad | 1706545 | |
Buffer Dam for XCell SureLock | Life Technologies | EI0012 | |
C24 Incubator shaker | New Brunswick Scientific | ||
Cell-Free Expression System: RTS 500 ProteoMaster E. coli HY Kit | BiotechRabbit | BR1400201 | |
cOmplete His-Tag Purification Resin | Roche Molecular Diagnostics | 5893682001 | |
cOmplete, EDTA-free Protease Inhibitor Cocktail | Roche Molecular Diagnostics | 4693132001 | |
CpG-ODN1826 | Biosearch Technologies | T9449 | |
D-(+)-Trehalose dihydrate | Millipore Sigma | 71509 | |
Dialysis tubes D-Tube Dialyzer Maxi | Millipore Sigma | 71508-3 | |
Disposable, polypropylene fritted columns 10 mL capacity | Bio-Rad | 7311550EDU | |
Dulbecco’s Phosphate-buffered Saline (PBS) | Millipore Sigma | D8537 | |
Electrophoresis Power Supply | |||
Endosafe PTS cartridge | Thermo Fisher Scientific | NC9594798 | |
Endosafe-PTS Testing System | Charles River | ||
Gel wash solution: 10% methanol, 7% acetic acid | |||
HCl and NaOH solutions for pH adjustment | |||
HPLC with UV-vis diode array detector | Shimadzu | ||
HyClone HyPure culture-grade water | VWR | 82007-328 | |
iBlot 2 Dry Blotting System | Life Technologies | ||
iBlot 2 Transfer Stacks, PVDF | Life Technologies | IB24001 | |
Image Studio V2.0 software | Li-COR Biiosciences | ||
Imidazole | Millipore Sigma | I5513 | |
Immun-Blot PVDF Membrane | Bio-Rad | 1620177 | |
LI-COR Odyssey Fc imager | Li-COR Biiosciences | ||
Lyophilizer | Labconco | ||
Methanol (≥99.9%) | Millipore Sigma | 34860 | |
Microcentrifuge | |||
Microwave oven | |||
NanoDrop One/OneC Microvolume UV-Vis Spectrophotometer | Thermo Fisher Scientific | ND-ONE-W | |
NuPAGE 4 to 12%, Bis-Tris, 1.0 mm | Life Technologies | NP0321 | |
NuPAGE LDS Sample Buffer (4x) | Life Technologies | NP0007 | |
NuPAGE MES SDS Running Buffer (20x) | Life Technologies | NP000202 | |
NuPAGE Sample Reducing Agent (10x) | Life Technologies | NP0009 | |
Odyssey Blocking Buffer in TBS containing 0.2% Tween 20 | Li-COR Biosciences | 927-50000 | |
Orbital Shaker | |||
PBS-T (1x PBS, 0.2% Tween 20, pH 7.4) | |||
PEG5K-CA8 Telodendrimer (custom synthesis product) | |||
pIVEX2.4d vector | Roche Molecular Diagnostics | ||
Plasmid Maxi Kit | Qiagen | 12162 | |
Primary antibody: MAb40 (monoclonal antibody to the variable domain 1 (VD1) of C. muridarum MOMP, de la Maza laboratory)4 | |||
Primary antibody: MAbHIS, Penta-His antibody | Qiagen | 34660 | |
Probe sonicator | |||
Qubit 3.0 Fluorometer | Life Technologies | Q33216 | |
Qubit Protein Assay Kit | Life Technologies | Q33212 | |
Rainin Pipette tips: LTS 1000 µL | Rainin | 17002428 | |
Rainin Pipette tips: LTS 20 µL | Rainin | 17002429 | |
Rainin Pipette tips: LTS 200 µL | Rainin | 17002426 | |
Rainin Pipettes | Rainin | ||
Secondary antibody: IRDye 800CW goat (polyclonal) anti-mouse IgG (heavy and light) | Li-COR Biosciences | 926-32210 | |
SeeBlue Plus2 Pre-stained Protein Standard | Life Technologies | LC5925 | |
Sodium chloride NaCl | Millipore Sigma | S7653 | |
Sodium phosphate monobasic NaH2PO4 | Millipore Sigma | S0751 | |
Superdex 200, 5/150 GL column | Cytiva | GE28-9909-45 | |
Synthetic diacylated lipoprotein-TLR2/6 FSL-1 | Invivogen | tlrl-fsl | |
SYPRO Ruby Protein Gel Stain | Life Technologies | S12001 | |
TWEEN 20 | Millipore Sigma | P1379 | |
UV light source | |||
Vacufuge Bench Top Centrifuge | Eppendorf | ||
Vortexer | |||
VWR 15 mL conicals (89039-666) | VWR | ||
VWR 50 mL conicals (89039-656) | VWR | ||
XCell SureLock Mini-Cell (Life Technologies ) | Life Technologies | EI0001 |