Экспланты бластодерм рыбок данио генерируются путем выделения эмбриональных клеток из эндогенных сигнальных центров в раннем эмбрионе, производя относительно наивные кластеры клеток, которыми легко манипулировать и культивировать ex vivo. В этой статье приведены инструкции по изготовлению таких эксплантов и демонстрируется их полезность путем опроса ролей узловой сигнализации во время гаструляции.
Благодаря своей оптической ясности и быстрому развитию, эмбрионы рыбок данио являются отличной системой для изучения поведения клеток и процессов развития. Однако из-за сложности и избыточности эмбриональных сигналов может быть сложно различить полную роль любого отдельного сигнала во время раннего эмбриогенеза. При эксплантировании животной области бластодермы рыбок данио образуются относительно наивные кластеры эмбриональных клеток, которые можно легко культивировать и манипулировать ex vivo. Вводя интересующий ген путем инъекции РНК перед эксплантацией, можно оценить влияние этой молекулы на экспрессию генов, поведение клеток и другие процессы развития в относительной изоляции. Кроме того, клетки эмбрионов различных генотипов или состояний могут быть объединены в один химерный эксплант для изучения взаимодействия клеток и тканей и тканеспецифических функций генов. В этой статье приведены инструкции по генерации эксплантов бластодермы рыбок данио и показано, что одной сигнальной молекулы – узлового лиганда – достаточно, чтобы индуцировать образование зародышевого слоя и морфогенез расширения в наивных эмбриональных тканях. Из-за их способности рекапитулировать поведение эмбриональных клеток, морфогенные градиенты и паттерны экспрессии генов в упрощенной системе ex vivo, эти экспланты, как ожидается, будут очень полезны для многих исследователей рыбок данио.
Извечная цель области биологии развития состоит в том, чтобы разгадать сложность развивающихся эмбрионов, чтобы понять происхождение формы и функции животных. Даже ранние эмбрионы содержат сложную попурри из сигнальных молекул, клеточных и тканевых взаимодействий и механических сил, подверженных строгой пространственной и временной регуляции. По этой причине часто бывает сложно точно определить точную роль конкретного сигнала в интересуемом процессе развития. Удаляя эмбриональные ткани из их эндогенной среды, эксплантация эмбрионов создает упрощенную платформу, в которой можно различить роли развития отдельных тканей и молекул в относительной изоляции. Методы эксплантации, пожалуй, наиболее известны в Xenopus laevis,где они использовались для изучения индукции тканей, клеточной сигнализации, клеточной адгезии и морфогенеза, среди других процессов1,2,3,4. Так называемые экспланты шляпок животных, в которых животная область эмбрионов Xenopus стадии бластулы выделяется перед индуктивными взаимодействиями5,6,7,являются широко распространенной и мощной эксплантной техникой. Неманипулированным шляпкам животных суждено стать эктодермой7,8. Тем не менее, они компетентны реагировать на несколько индуктивных факторов, что позволяет им формировать ткани всех трех зародышевых слоев и подвергаться соответствующим тканям морфогенетическим движениям9,10,11. Тем не менее, ограниченные генетические инструменты и неоптимальная пригодность для живой визуализации предотвращают использование эксплантов Xenopus для многих биологов развития. Эксплантируя клетки бластодермы из эмбрионов рыбок данио, исследователи могут объединить полезность анализа шляпки животных с оптической ясностью, обилием генетических инструментов и другими экспериментальными преимуществами модельной системы рыбок данио.
На сегодняшний день исследователи использовали два вкуса эксплантов рыбок данио: так называемые пескоиды и экспланты бластодермы. В пескоидной модели вся бластодерма, включая краевую зону, выделена из желтка и может развиваться ex vivo без внеэмбрионального синцитиального слоя желтка (YSL)12,13. Таким образом, пескоиды имеют заметное сходство с эксплантами Fundulus, созданными десятилетия назад Джейн Оппенгеймер и Дж.П. Тринкаусом14,15. Эти экспланты повторяют многие аспекты эмбрионального паттерна и морфогенеза12,13. Однако, поскольку эти изоляты содержат эндогенные сигнальные центры (эмбриональный край), они не упрощены в отношении их молекулярной среды. В качестве альтернативы, исследователи могут генерировать относительно наивные бластодермные экспланты рыбок данио, исключая маргинальную зону16,17,18,19,20,21. Неманипулированные экспланты бластодермы рыбок данио экспрессируют высокие уровни морфогенов костного морфогенетического белка (BMP)19 и дают начало ненейронной эктодерме и обволакивающим слою (EVL) при культивировании ex vivo18. Тем не менее, они повторяют многие аспекты осевого паттерна и морфогенеза в ответ на экзогенные сигнальные градиенты19,20,21,похожие на капсулы животных Xenopus. По этой причине экспланты бластодермы являются предпочтительной моделью для изучения роли данного морфогена (или морфогенов) в спецификации зародышевого слоя, морфогенетических движениях клеток и сигнальных градиентах в упрощенной сигнальной среде. Кроме того, бластодермы из эмбрионов различных генотипов или условий могут быть объединены в один химерный эксплант19,21 для исследования автономии клеток / тканей и индуктивных взаимодействий.
Экспланты бластодермы рыбок данио могут быть использованы для исследования роли эмбриональных сигналов (например, узловых) в морфогенезе и спецификации тканей при гаструляции. Путем инъекции синтетической РНК ndr2 (кодирующей узловой лиганд) на одноклеточной стадии, узловая сигнализация активируется по всей бластодерме эмбриона. Экспланты из этих эмбрионов генерируют узловые сигнальные градиенты, образуют все три зародышевых слоя и подвергаются конвергенции и расширению (C & E) гаструляционных движений, как видно у интактных эмбрионов20. Кроме того, химерные экспланты используются для иллюстрации способности тканей мезодермы индуцировать нейроэктодерму из неинжелированной (наивной) бластодермы. Этот протокол предоставляет инструкции по созданию эксплантов бластодермы рыбок данио и демонстрирует их полезность в определении роли узловой сигнализации в индукции тканей и морфогенезе.
В этой статье описано, как генерировать экспланты бластодермы рыбок данио и обсуждаются два практических применения этих эксплантов в решении роли узловой морфогенной сигнализации в гаструляции. Этот метод резки и культивирования эксплантов обеспечивает чистый лист наивных клеток, которыми можно манипулировать с помощью инъекций РНК и обработки соединениями малых молекул для исследования молекулярного пути, представляющим интерес.
Критические шаги
В этом протоколе есть четыре шага, которые особенно важны для его успеха. Первый заключается в введении эмбрионам соответствующего количества узлов. Этот протокол рекомендует 10 пг РНК ndr2, и хотя диапазон доз способствует расширению, слишком много или слишком мало Nodal будет препятствовать оптимальному расширению эксплантата20. Вторым шагом является дехорионирование эмбрионов. Если эмбрионы остаются в проназе слишком долго, желтки лопнут, и эмбрионы не удастся разрезать. Если они не находятся в проназе достаточно долго, хорионы не будут ослаблены мытьем и вместо этого потребуют трудоемкой ручной дехорионации. Третьим критическим шагом является резка эксплантов. Рекомендуется разрезать 3-кратный раствор Данио, так как более низкое содержание соли в 0,3х раствора Данио или яичной воды не способствует заживлению и выживанию эксплантов.
Кроме того, экспланты должны быть разрезаны примерно на половину высоты бластодермы, чтобы обеспечить наивность клеток. Если их разрезать слишком близко к желтку, они будут содержать сигналы от края (включая эндогенный узел), которые способствуют спецификации тканей и морфогенезу. Четвертый и последний критический шаг заключается в исцелении химерных эксплантов. Два эксплантата не будут сливаться, образуя химеры, если их срезанные края не будут аккуратно спрессованы вместе сразу после их разреза.
Изменения и устранение неполадок
Критические шаги, описанные выше, предоставляют возможности для устранения неполадок. Ниже представлены некоторые общие вопросы и предлагаемые решения.
Если экспланты не распространяются в присутствии узловой сигнализации, есть некоторые возможные решения. (A) Вводить эмбрионы на стадии одной клетки, чтобы гарантировать, что РНК равномерно рассеивается по всему эмбриону. (B) Избегайте инъекций слишком большого количества узловой РНК, убедив, что введенный объем является правильным, используя микрометр для измерения инъекционного болюса. (C) Избегайте инъекций слишком малого количества узловой РНК, измеряя ее концентрацию, чтобы убедиться, что она не деградировала. (D) Оставить некоторых совпадающих по возрасту неповрежденных братьев и сестер, чтобы сделать вывод об эквивалентной стадии эксплантов. Экспланты достигают максимального расширения, когда неповрежденные братья и сестры достигают стадии 2-5 сомит. Если экспланты собрать слишком рано, то оптимальное расширение не будет достигнуто.
Если желтки лопаются после дехорионации, и эмбрионы не жизнеспособно разрезают, удалите эмбрионы из раствора проназы, как только хорионы начнут сморщиваться и 1-2 эмбриона сбросят свой хорион. Затем сразу же смойте в яичной воде.
Если экспланты появляются пузырьков по краям, есть некоторые решения. (A) Сокращать экспланты только в течение определенных сроков разработки. Хотя экспланты, разрезанные на любой стадии от 128 до 1000 клеток, могут выживать и расширяться в культуре, те, которые разрезаются на стадиях от 256 до 512 клеток, как правило, являются наиболее надежными. (B) Убедитесь, что экспланты разрезаны в 3x растворе Данио, чтобы обеспечить надлежащее заживление. (C) Вырезать экспланты чисто, но осторожно. Избегайте растяжения или раздвигания ячеек во время процесса резки.
Если неинъекированные контрольные экспланты расширяются, экспланты, вероятно, будут разрезать слишком близко к желтку. Чтобы экспланты были наивными, убедитесь, что разрезы сделаны на полпути между желтком и верхней частью бластодермы.
Если химерные экспланты не сливаются, это, вероятно, потому, что тенденция эксплантов в 3-кратном растворе Данио после разреза заключается в том, чтобы округлиться и заживать над краем разреза. Чтобы убедиться, что две бластодермы заживают друг для друга, а не для себя, сжимайте их вместе сразу после разреза. Используйте щипцы, чтобы оказать мягкое давление на недавно соединенные бластодермы в агарозном колодце, чтобы побудить их к совместному исцелению.
Ограничения
Хотя эти экспланты являются ценным инструментом для изучения роли данного морфогена (или другой молекулы, представляющих интерес) в относительной изоляции, наблюдения, сделанные в любой модели ex vivo, должны интерпретироваться с осторожностью. Экспланты демонстрируют C&E морфогенез, который очень похож на наблюдаемый in vivo20,но они не повторяют все аспекты гаструляции, например, движения эпиболии. Им также не хватает многих других регуляторных факторов и сигнальных молекул, которые присутствуют в интактном эмбрионе. Хотя это является значительным экспериментальным преимуществом эксплантов, оно также может привести к выводам, которые не выдерживают in vivo. Например, поскольку экспланты, которые не получают экзогенные узловые лиганды, не экспрессированы маркерами нейроэктодермы, можно сделать вывод только из эксплантов, что для спецификации нейроэктодермы требуется узловая сигнализация. Однако нейроэктодерма образуется внутри интактных эмбрионов, лишенных всех узловых сигналов23,24,демонстрируя жизненно важную роль других сигнальных молекул в нейронной спецификации32. Экспланты могут сказать нам, на что способен морфоген в изолированной среде. Тем не менее, все такие результаты должны быть подтверждены / сопоставлены с интактными эмбрионами, чтобы результаты были тщательно интерпретированы. Другими словами, экспланты не могут занять место развивающегося эмбриона. Вместо этого они являются дополнительным инструментом для определения роли и отношений морфогена с окружающей средой. Имея в виду эти ограничения, бластодермы рыбок данио являются ценным инструментом для многих исследовательских вопросов.
Значение по отношению к существующим методам
С возобновлением интереса к синтетической эмбриологии для моделирования аспектов эмбрионального развития регулярно используется несколько подходов ex vivo и in vitro. Например, 2- и 3-мерные гаструлоиды, состоящие из мышиных или эмбриональных / индуцированных плюрипотентных стволовых клеток, могут быть соучены путем применения экзогенных сигнальных молекул для рекапитуляции некоторых паттернов и/ или морфогенетических событий гаструляции, сегментации и нейруляции33,34,35,36,37 . Несмотря на есть мощные, эти методы требуют трудоемких и длительных методов культивирования как для непрерывного поддержания плюрипотентных стволовых клеток, так и для выращивания гаструлоидов, которым требуется много дней, чтобы достичь стадий гаструляции. Напротив, экспланты рыбок данио не требуют поддержания культур стволовых клеток, так как эмбрионы просто собираются по мере необходимости. Они относительно просты в генерации и достигают стадий гаструляции в течение нескольких часов, так же, как эмбрионы рыбок данио. Это подчеркивает еще одно преимущество эксплантов рыбок данио, их неповрежденные часы развития. Поскольку возраст развития эмбриональных и индуцированных плюрипотентных стволовых клеток может быть переменным и весьма обсуждаемым, эмбриональные экспланты, возможно, лучше подходят для исследования временной регуляции развития. Наконец, в то время как экспланты пескоидных рыбок данио (которые содержат эмбриональный край) аналогичным образом распространяются в культуре12,13,они делают это в ответ на эндогенные сигнальные центры. Вместо этого экспланты, описанные здесь, позволяют исследователям исследовать молекулы, представляющие интерес, с относительно небольшим вмешательством от таких эмбриональных сигналов.
Потенциальные будущие применения
Здесь экспланты были использованы, чтобы продемонстрировать, что узловая сигнализация необходима и достаточна для морфогенеза C & E. Тем не менее, ожидается, что они могут и будут использоваться для определения роли многих различных молекул во многих других процессах развития, например, регуляции экспрессии генов, сигнальных градиентов и дополнительных морфогенетических программах. Кроме того, поскольку эти экспланты жизнеспособны по крайней мере до 24 л.с.19, можноожидать, что их полезность будет выходить за рамки гаструляции в такие процессы, как сегментация и органогенез, любой процесс, в котором исследователи хотят получить чистый лист развития.
The authors have nothing to disclose.
Эта работа была поддержана NICHD R00HD091386 для MLKW и NIEHS T32ES027801 для AAE.
1 mm glass beads | Millipore-Sigma | Z250473 | |
4% Paraformaldehyde | VWR | J19943-K2 | |
6-well plates | Fisher | FB012927 | |
Agarose | Thermo-Fisher | 16500500 | |
Ca(NO3)2 .4H2O | Thermo-Fisher | 12364-36 | |
DMEM/F12 media | Gibco | 11330032 | |
Dumont #5 watchmakers forceps | World Precision Instruments | 500341 | |
Embryo injection mold | Adaptive Science Tools | I-34 | |
Glass crystalizing dishes | Fisher | 08-741A | |
Glass Petri dishes | Fisher | 08-748A | |
HEPES | VWR | JT4018-1 | |
Instant Ocean sea salts | Instant Ocean | SS15-10 | |
KCl | VWR | BDH9258-500G | |
Low temperature incubator | Fisher | 15-015-2632 | |
MgSO4.7H2O | VWR | 97062-134 | |
Microloader pipette tips | Eppendorf | 930001007 | |
Micromanipulator | World Precision Instruments | M3301R | |
Micrometer | SPI supplies | 02265-AB | |
Mineral oil | VWR | MK635704 | |
NaCl | VWR | BDH9286-500G | |
Newborn Calf Serum | Invitrogen | 26010-066 | |
Pasteur pipettes | Fisher | 13-678-30 | |
Penicillin-Streptomycin Solution | Thermo-Fisher | 15140122 | |
Pico-pump pneumatic injector | World Precision Instruments | SYS-PV820 | |
Pipet pump | Fisher | 13 683C | |
Plastic Petri dishes 100 mm | Fisher | FB0875712 | |
Plastic Petri dishes 60 mm | Fisher | FB0875713A | |
Plastic wash bottles | Fisher | 03-409-10E | |
Pronase | Millipore-Sigma | 10165921001 | |
Tween-20 | VWR | 200002-836 |