ここでは、shRNAのレンチウイルス伝達を用いて樹状細胞(DC)の開発に関与する潜在的な転写因子をスクリーニングするためのプロトコルを提供し、 インビトロ DC分化のための安定したノックダウン細胞株を得る。
樹状細胞(DC)は、自然免疫応答と適応免疫応答を結ぶ重要な抗原提示細胞です。DC は異種であり、従来の DC (cDC) とプラズマサイトイド DC (pDC) に分割できます。cDCは、ナイーブT細胞に抗原を提示し、活性化することを専門としています。一方、pDCはウイルス感染中にI型インターフェロン(IFN-I)を大量に産生する可能性がある。DC の仕様は、骨髄 (BM) の DC 前駆物質の初期段階で発生し、転写因子 (TF) のネットワークによって定義されます。たとえば、cdc は ID2 を高度に表現し、pDC は E2-2 を高度に表現します。DC のサブセットが増えるため、DC 開発を制御する特定の TF を理解することに関心が高まっています。ここでは、短いヘアピンRNA(shRNA)を含むレンチウイルスを不死化造血幹細胞および前駆細胞(iHSPCs)ラインに送達することにより、 インビトロで DC分化に不可欠なTFをスクリーニングする方法を確立します。選択および インビトロ 分化後、安定したノックダウン細胞株のcDCおよびpDC電位は、フローサイトメトリーによって分析される。このアプローチは、 インビトロの前駆物質からDC運命を支配する可能性のある遺伝子を同定するためのプラットフォームを提供します。
DC は、自然免疫と適応性イミュニティ1の主要なレギュレータです。DC は、主に 2 つの機能的に異なる集団、すなわち pDC と cDC に分類されます。さらに、cdc は 2 つのサブセット、すなわち、タイプ I とタイプ II cDC または cDC1s と cDC2s をそれぞれ 2 から構成します。pDCは、マウス3,4におけるCD11cのBST2、Siglec-H、および中間レベルを発現し、炎症およびウイルス感染時に大量のIFN-Iを分泌することができる細胞である5。また、その堅牢なIFN-I産生能により、全身性エリテマトース(SLE)6を含む自己免疫疾患の進行に重要な役割を果たしていると考えられています。cDC1sは、マウス7におけるXCR1、CD8a、CLEC9AおよびCD103の表面発現によって定義され、抗原クロスプレゼンテーションを通じて細胞傷害性CD8+T細胞(CTLs)の活性化および分極化に特化し、細胞内病原体および癌に応答してI型免疫を始める8,9。一方、cDC2sは、ヒトとマウスの両方でCD11bおよびCD172α(Sirpαとも呼ばれる)を発現し、CD4+T細胞を活性化し、アレルゲンおよび寄生虫10に対するII型免疫応答を促進し、ならびに細胞外細菌および微生物叢認識に続くIII型免疫を調節することができる11,12。
DCの多様化は、造血幹細胞および前駆細胞(HSPCs)から取得したTF群によって決定される。対照的に、DNA結合2(ID2)の阻害剤はcDCの仕様を駆動し、Eタンパク質活性を遮断してpDCの発達を阻害する15。さらに、cDC1sの開発にはIRF8とBATF3が必要ですが、cDC2sの分化はIRF416に大きく依存しています。最近の研究では、pDC17とccdcの異質性とその転写規則18を探っています。DC ネットワークは複雑であるため、DC の開発と機能を制御する他の TF を識別するプラットフォームを確立する必要があります。
ここでは、BM細胞(Hoxb8-FL細胞とも呼ばれる)19においてホックスb8のエストロゲン制御核転座を発現して生成したiHSPCを用いた。iHSPCsは増殖し、βエストラジオールおよびFlt3リガンド(FL)の存在下で未分化段階にとどまる一方、βエストラジオール19の離脱時にFLの存在下で異なるDCタイプに分化し始める。この特徴を踏まえて、前駆細胞で目的の遺伝子を倒し、続いてpDCやCCの インビトロ 分化に及ぼす影響を調べることができる。したがって、この方法は、DCの開発と機能を調節する遺伝子を発見するための強力なツールです。
レンチウイルスベースのshRNAベクターは、ウイルスによる細胞への導入による遺伝子サイレンシングに使用されることが多く、宿主ゲノムへの安定的な統合が可能です。しかし、様々な細胞種における様々な導入効率を考慮する必要があり、この問題を克服するために多くのアプローチがとられている。
ポリブレンは、細胞膜上の電荷を中和し、それによって細胞への?…
The authors have nothing to disclose.
Tz-Ling Chen博士の技術サポートに感謝しています。私たちは、shRNAレンチウイルス(http://rnai.genmed.sinica.edu.tw)を提供してくれた国立RNAiコア施設(台湾のアカデミア・シニカ)に感謝します。この研究は、台湾の科学技術省(MOST 108-2320-B-002-037-MY3およびMOST 109-2320-B-002-054-MY3)によって支援されました。
Antibodies | |||
APC/Cy7 anti-mouse CD11c Antibody | Biolegend | 117324 | (Clone: N418) |
FITC anti-mouse/human CD11b Antibody | Biolegend | 101206 | (Clone: M1/70) |
PE anti-mouse/human B220 Antibody | Biolegend | 103208 | (Clone: RA3-6B2) |
Cell culture | |||
1.5 mL Micro tube | ExtraGene | TUBE-170-C | |
12-well tissue culture-treated plate | Falcon | 353043 | |
Fetal bovine serum (FBS) | Corning | 35-010-CV | |
RPMI 1640 medium | gibco | 11875-085 | |
Reagent | |||
β-estradiol | Sigma-Aldrich | E2758-250MG | |
β-mercaptoethanol (β-ME) | Sigma-Aldrich | M6250 | |
FACS buffer | home-made | Formula: 1xPBS+0.5 %FBS+0.1%NaN3 | |
Flt3 ligand (FL) | home-made | ||
Polybrene | Sigma-Aldrich | TR-1003-G | |
Puromycin | Invivogen | ant-pr-1 | |
TRIsure | BIOLINE | BIO-38032 | |
shRNA (Taregt sequence/clone ID) | Company | ||
shId2 (GCTTATGTCGAATGATAGCAA/TRCN0000054390) | The RNAi Consortium (TRC) | ||
shLacZ (CGCGATCGTAATCACCCGAGT/TRCN0000072224) | The RNAi Consortium (TRC) | ||
shTcf4 (GCTGAGTGATTTACTGGATTT/TRCN0000012094) | The RNAi Consortium (TRC) |