Протоколы, представленные здесь, иллюстрируют три альтернативных способа оценки эффективности генетически модифицированных комаров, предназначенных для борьбы с переносчиками в лабораторных испытаниях в небольших клетках. Каждый протокол адаптирован к конкретной модификации штамма комара (генный драйв или негенный драйв) и типам измеряемых параметров.
Борьба с переносимыми комарами патогенами с использованием генетически модифицированных переносчиков была предложена в качестве перспективного инструмента в дополнение к традиционным стратегиям борьбы. Системы самонаведения генов на основе CRISPR сделали трансгенные технологии более доступными в научном сообществе. Оценка эффективности трансгенных комаров и сравнение с аналогами дикого типа в небольших лабораторных испытаниях в клетках дают ценные данные для разработки последующих полевых экспериментов в клетках и экспериментальных оценок для уточнения стратегий профилактики заболеваний. Здесь мы представляем три различных протокола, используемых в лабораторных условиях для оценки распространения трансгенов у анофелиновых комаров-переносчиков малярии. К ним относятся индовые высвобождения (без системы генного драйва) и перекрывающиеся и неперекрывающиеся испытания генерации ген-драйва. Три испытания различаются по ряду параметров и могут быть адаптированы к желаемым экспериментальным условиям. Более того, инсектарные исследования в небольших клетках являются частью прогрессивного перехода инженерных насекомых из лаборатории в открытые полевые выбросы. Таким образом, протоколы, описанные здесь, представляют собой бесценные инструменты для обеспечения эмпирических ценностей, которые в конечном итоге помогут внедрению на местах новых технологий для элиминации малярии.
Стратегии, основанные на генетически модифицированных комарах, реализуются для борьбы с передачей трансмиссивных патогенов, таких как те, которые вызывают малярию1. К ним относятся технологии 1), направленные на уменьшение численности и плотности комаров Anopheles (подавление популяции), или 2) направленные на снижение способности переносчиков передавать паразитов, ответственных за болезни человека (модификация популяции, замена или изменение), в которых штаммы векторов спроектированы для экспрессии эффекторных генов, предотвращающих передачу патогенов. Эти генетические подходы были подкреплены появлением генных драйвов на основе CRISPR / Cas9, с доказательствами концепции у комаров-паразитов, передающих эффективное распространение признаков полезной нагрузки, а также антипаразитарных эффекторных молекул в популяциях в клетках.
Небольшие лабораторные испытания в клетках представляют собой первый шаг к оценке характеристик трансгенных штаммов в рамках поэтапного подхода к их дальнейшему развитию в полевых условиях2. Конкретные соображения результата включают наследуемость введенной ДНК в конкурентной среде, пенетрантность и экспрессивность фенотипа и стабильность. Соответствующие экспериментальные конструктивные особенности включают размер клеток, плотность комаров, количество реплик, перекрывающиеся или неперекрывающиеся поколения, возрастные целевые популяции, одиночные или множественные выбросы инженерных штаммов, выбросы только для самцов, женщин или смешанных полов, коэффициенты высвобождения, источники кровяной муки (искусственные или живые животные) и процедуры скрининга.
Здесь мы описываем протоколы, используемые для оценки штаммов анофелиновых комаров на предмет затопления (без системы генного драйва) и те, которые несут автономные системы генного драйва, опосредованные эндонуклеазами Cas9 и направляющими РНК (гРНК). Применение этих протоколов приводится в Pham et al. (2019) 2, Карбаллар-Лехарасу и др. (2020) 3, и Адольфи и др. (2020) 4.
Испытания на интопное высвобождение оценивают скорость распространения разработанного трансгена под менделевским наследованием после многократного высвобождения большого количества трансгенных комаров в дикую популяцию. Без прикрепления трансгена к системе привода данные испытаний с индовым высвобождением предоставляют информацию о пригодности и динамике трансгена, представляющего интерес для стабилизированной популяции.
Когда популяции комаров содержат автономную систему генного драйва, небольшие клеточные испытания предназначены для оценки динамики распространения желаемого трансгена путем определения скорости увеличения доминантного маркера после однократного введения трансгенных самцов. Автономные элементы генного драйва несут гены, кодирующие нуклеазу Cas9, гРНК и доминантный маркер, связанные таким образом, чтобы быть активными в последующих поколениях.
«Перекрывающиеся» поколения относятся к одновременному присутствию нескольких поколений в одной клетке для создания возрастной структурированной непрерывной популяции, в то время как «неперекрывающаяся» относится к отдельным дискретным поколениям в каждой последовательной популяции в клетке2. Эксперименты с клеткой генного драйва могут быть прекращены после определения начальной динамики скорости драйва (конверсии) (8-10 поколений в зависимости от конструкции), и, хотя они предоставляют информацию о краткосрочной стабильности трансгена в популяции комаров, они могут не раскрывать, что происходит, когда и если доминирующие частоты маркеров достигают или близки к полному внедрению (каждый комар, несущий по крайней мере одну копию системы генного драйва).
Генетически модифицированные комары, которые обладают способностью блокировать патогены или несут гены стерильности, представляют собой новые инструменты для борьбы с трансмиссивными болезнями. Учитывая множественность параметров, составляющих эти альтернативные подходы, критическим шагом в их исследованиях являются лабораторные экспериментальные оценки, которые позволяют быстро и безопасно прогнозировать потенциальные результаты высвобождения синтетических трансгенов для целей контроля1.
Поскольку мониторинг динамики трансгенов в популяциях в клетках может длиться в течение нескольких месяцев, одним из центральных аспектов протоколов является согласованность в экспериментальном проектировании между репликами (включая выращивание комаров, размер клетки, возрастные структурированные популяции, фиксированные коэффициенты высвобождения, стабильные источники кровяной муки и минимально инвазивные процедуры скрининга).
Выбросы только для самцов считаются идеальными, потому что самцы комаров не передают патогены и не питаются людьми, поэтому они могут безопасно вводить наследственные характеристики в дикие популяции. В лабораторных клеточных экспериментах можно обнаружить трансгенные штаммы со сниженной соревновательностью самцов при спаривании и другими фитнес-нагрузками, связанными с трансгенной интеграцией. Тем не менее, прямые и конкретные эксперименты, такие как те, которые проводятся в больших клетках10, могут быть проведены для правильного анализа мужской конкурентоспособности, а также женской плодовитости при более естественной плотности комаров2. Кроме того, эмпирические данные испытаний в клетках могут быть использованы для параметризации моделей динамики популяции клеток, включая формирование устойчивых аллелей, и предоставления полезной информации об эффективности и возможных корректировках предлагаемой технологии.
Протоколы, описанные здесь, могут быть легко адаптированы к другим экспериментальным проектам по мере необходимости, с минимальными требованиями в отношении регулярной инсектарной инфраструктуры и условий. Кроме того, за исключением коммерческих клеток и микроскопов, большинство материалов являются недорогими и позволяют недорогие множественные реплики и итерации испытаний. Примечательно, что это также позволяет предварительно проверять несколько трансгенных штаммов в небольших клеточных испытаниях, чтобы определить приоритеты наиболее эффективных кандидатов, которые будут продвигаться вперед по поэтапному пути тестирования, и приостановить тестирование на тех, кто показывает неоптимальные характеристики.
Наконец, озабоченность по поводу использования генетически измененных организмов мотивирует разработку рамок для разработки, оценки и применения генетических стратегий профилактики болезней, переносимых комарами5,8,9. Актуальность и исполнение протоколов, определенных здесь, согласуются с этими руководящими принципами.
The authors have nothing to disclose.
Мы благодарны Друзилле Стиллингер, Кионе Паркер, Пэрриш Пауэлл и Мадлен Ноттоли за разведение комаров. Финансирование было предоставлено Инициативой по борьбе с малярией в Ирвине Калифорнийского университета. AAJ является профессором Дональда Брена в Калифорнийском университете в Ирвине.
Artificial feeders | Hemotek | SP6W1-3 | Starter pack – 6 feeders with 3ml reservoirs |
Cage, commercial | BioQuip | 1450D | Collapsible Cage, 24 X 24 X 24" – 0.216 m3 (60 cm3) |
Cage tub (popcorn) | Amazon.com | VP170-0006 | 0.005 m3 (170 fl oz) |
Dissecting microscope with fluorescence light and filters | Leica | M165FC | |
Glue sticks | Michaels | 88646598807 | Gluesticks 40 pk, 0.4X4” |
Hot glue gun | Woodwards Ace | 2382513 | Stanley, 40 watt, GR20 |
Nylon screen (netting) | Joann.com | 1102912 | Tulle 108" Wide x 50 Yds – ~35.6 cm2 (14 in2) |
Oviposition cups | Fisher | 259126 | Beaker PP grad 50 mL |
Razor cutting tool | Office Depot | 487899 | Box cutters |
Scissors | Office Depot | 978561 | Scotch Precision Ultra Edge Titanium Non-Stick Scissors, 8" |
Stapler | Office Depot | 908194 | Swingline Commercial Desk Stapler |
Surgical sleeve (stockinette) | VWR | 56612-664 | ~48 cm (19”) cut from bolt ~15 cm (6”) X ~23 m (25y) |
Zip ties | Home Depot | 295715 | Pk of 100, 14” cable ties – 35.6 cm (14 in) |