Presentamos la preparación de lonchas de tejido pancreático agudo y su uso en microscopía de barrido láser confocal para estudiar la dinámica del calcio simultáneamente en un gran número de células vivas, durante largos períodos de tiempo, y con alta resolución espaciotemporal.
La rebanada aguda de tejido pancreático de ratón es una preparación in situ única con comunicación intercelular preservada y arquitectura tisular que implica significativamente menos cambios inducidos por la preparación que los islotes aislados, acinos, conductos o células dispersas descritas en estudios in vitro típicos. Al combinar la rebanada de tejido pancreático agudo con imágenes de calcio de células vivas en microscopía de barrido láser confocal (CLSM), las señales de calcio se pueden estudiar en un gran número de células endocrinas y exocrinas simultáneamente, con una resolución unicelular o incluso subcelular. La sensibilidad permite la detección de cambios y permite el estudio de las ondas intercelulares y la conectividad funcional, así como el estudio de la dependencia de las respuestas fisiológicas de las células en su localización dentro de los islotes y la relación paracrina con otras células. Finalmente, desde la perspectiva del bienestar animal, el registro de señales de un gran número de células a la vez reduce el número de animales requeridos en los experimentos, lo que contribuye al principio de reemplazo, reducción y refinamiento de las 3R.
El páncreas de los mamíferos es una gran glándula exocrina y endocrina. La parte exocrina constituye el 96-99% del volumen total del páncreas y consiste en acinos y conductos. La parte endocrina está formada por un gran número de islotes de Langerhans que representan el 1-4% restante del volumen total del páncreas1. La parte exocrina secreta enzimas digestivas importantes que descomponen los polímeros ricos en energía en los alimentos, así como un líquido rico en bicarbonato, que se combina con otras secreciones gastrointestinales para proporcionar un ambiente adecuado para la acción de las enzimas. La parte endocrina secreta hormonas que regulan la distribución postprandial, el almacenamiento y la liberación interprandial de nutrientes ricos en energía. Aunque el tejido exocrino está relativamente subdesarrollado y el endocrino relativamente bien desarrollado al nacer, el primero crece rápidamente en exceso el segundo al destetar 2,3,4. Los primeros estudios de la función pancreática marcaron el nacimiento de la fisiología moderna, y los principales avances metodológicos en el campo han sido seguidos por importantes rupturas científicas5. Trabajar con el páncreas es técnicamente un desafío debido a la intrincada estructura de la glándula, pero también es una gran motivación debido a enfermedades como el cáncer de páncreas, la pancreatitis y la diabetes que presentan grandes amenazas para la salud pública, y para las cuales se necesitan nuevos enfoques terapéuticos.
Los islotes aislados6,acini 7,8 y fragmentos ductales se habían desarrollado y utilizado durante décadas como métodos estándar de oro debido a sus ventajas en comparación con las líneas celulares y las células endocrinas, acinares y ductales dispersas primarias 9,10. A pesar de la función notablemente mejorada de los colectivos celulares aislados, estos métodos todavía implican un estrés mecánico y enzimático considerable, aíslan las células del tejido circundante y, por lo tanto, carecen de interacciones paracrinas y soporte mecánico, y lo más importante, se acompañan de cambios significativos en la fisiología normal 11,12,13 . La rebanada aguda de tejido pancreático de ratón se desarrolló en 2001 a partir de una necesidad percibida de desarrollar una plataforma experimental similar al cerebro, la hipófisis y las rebanadas suprarrenales con contactos intercelulares preservados, interacciones paracrinas, mesénquima y arquitectura tisular, así como sin algunas de las deficiencias más importantes del método estándar de oro en la investigación de islotes de ese momento: los islotes aislados12, 14. Entre estas deficiencias se encuentran el daño a las capas más externas, la falta de accesibilidad de las áreas de los islotes centrales y la necesidad de cultivo con efectos posiblemente importantes sobre la identidad celular y la fisiología12,15. Además, el método de corte de tejido permite estudios en modelos animales con una arquitectura de islotes extremadamente desquiciada donde es imposible aislar islotes, o cuando el rendimiento de los islotes es extremadamente bajo por el aislamiento tradicional 16,17,18,19,20,21.
Además, la rebanada es más adecuada para estudiar los cambios morfológicos durante el desarrollo de la diabetes y la pancreatitis, por ejemplo, ya que permite una mejor visión general de todo el tejido y también es compatible con el estudio de las diferencias regionales. Es importante destacar que, a pesar del enfoque temprano en la parte endocrina, el método de corte de tejido permite inherentemente el estudio de los componentes exocrinos 9,22,23. Durante la primera década después de su introducción, el método se empleó para estudios electrofisiológicos de células beta 14,24,25,26,27,28,29 y alfa 30,31, así como para examinar la maduración morfológica y funcional del páncreas 2,3 . Una década más tarde, en 2013, el método se adaptó con éxito para la obtención de imágenes de calcio de células vivas de células de islotes utilizando CLSM para caracterizar sus respuestas a la glucosa32, sus patrones de conectividad funcional33 y la relación entre el potencial de membrana y el calcio intracelular mediante la combinación de un colorante de calcio fluorescente con un colorante de potencial de membrana34. Más tarde en el mismo año, el método también se utilizó para evaluar la dinámica del calcio en las células acinares22,35. En los años siguientes, las rodajas de tejido pancreático se han utilizado en una serie de estudios diferentes y se han adaptado con éxito al tejido de cerdo y humano 9,36,37,38,39,40,41. Sin embargo, en conjunto, las imágenes de calcio, en cortes de tejido pancreático de ratón en general y en islotes en particular, todavía se realizan principalmente por este grupo. Una de las principales razones de esto puede estar en la combinación de una preparación de corte de tejido técnicamente desafiante, la necesidad de un microscopio confocal y un análisis de datos bastante complejo. El objetivo principal del presente documento es hacer que este poderoso método sea más accesible para otros usuarios potenciales.
Ya existen algunos excelentes artículos metodológicos que tratan en detalle la preparación de rodajas de tejido y el uso de rodajas para estudios estructurales y de secreción, pero no para imágenes de calcio confocal 9,42,43. Por lo tanto, este documento se centra en algunos consejos y trucos adicionales durante la preparación de rebanadas, en los pasos críticos para la carga exitosa del tinte, la adquisición de imágenes, así como en los pasos principales del análisis básico de datos de calcio. Por lo tanto, esta contribución debe considerarse complementaria y no como una alternativa al método antes mencionado. Del mismo modo, las imágenes de calcio en rodajas de tejido pancreático de ratón se considerarán un enfoque experimental que se utilizará para responder a preguntas específicas y, por lo tanto, es complementario en lugar de una alternativa absoluta para otros enfoques de imágenes de calcio en fisiología pancreática, como conductos aislados o acini, islotes aislados, organoides, islotes trasplantados en la cámara anterior del ojo, y grabaciones in vivo 11,44,45,46,47,48. La promesa de las imágenes de calcio en cortes de tejido pancreático de ratón probablemente se ilustra mejor con registros exitosos recientes de la dinámica del calcio en células mesenquimales de islotes como pericitos49 y macrófagos50, así como en células ductales23.
El método de rebanada de tejido pancreático es un método experimental rápido para estudiar la morfología y fisiología de las partes endocrinas y exocrinas del páncreas en una preparación más conservada e in situ. Muchas de las ventajas ya se han señalado en la Introducción. Vale la pena señalar que en general (es decir, no solo para las imágenes de calcio), el enfoque de corte para estudiar la fisiología pancreática ahorra tiempo porque no implica un período de recuperación después del aislamiento. Este último no es absolutamente necesario con todo tipo de experimentos y usos de islotes aislados de diferentes especies, pero generalmente se emplea para aumentar la pureza, restaurar la viabilidad y la funcionalidad, y a veces para recolectar islotes de varios donantes 59,60,61,62,63,64 . Sin embargo, en el contexto de las imágenes de calcio, se ha encontrado que las respuestas de las células beta dependen de la duración y las condiciones del cultivo, y esta es una fuente importante de variación que debe tenerse en cuenta cuando se utilizan islotes aislados15,65. El mismo problema debe considerarse para las rebanadas de tejido si su cultivo a largo plazo se convierte en una opción ampliamente utilizada en el futuro22,36. El método de corte de tejido también tiene un alto rendimiento y, por lo tanto, reduce potencialmente el sufrimiento de los animales y aumenta el poder estadístico. Además, se pueden preparar tantas rebanadas a partir de un solo animal y debido a que las rebanadas sobreviven durante largos períodos, es factible incluir el mismo animal o incluso el mismo islote tanto en el grupo experimental como en el de control.
A medida que se conservan la arquitectura original y las comunicaciones de célula a célula, y debido a que es compatible con una serie de análisis estructurales, electrofisiológicos, métodos de imagen y ensayos de secreción hormonal, este método es especialmente útil para estudiar las funciones pancreáticas que dependen de interacciones no perturbadas entre células individuales, por ejemplo, sensibilidad a secretagogos, interacciones paracrinas e inmunes entre diferentes tipos de células, patrones de actividad eléctrica, propiedades de la dinámica del calcio y la secreción de diferentes hormonas. Para las imágenes de calcio específicamente, las principales ventajas de usar rodajas son la exposición del núcleo de los islotes y la posibilidad de adquirir señales de muchos tipos de células diferentes con alta resolución. Dependiendo de los requisitos del experimento y la edad de los animales, el grosor puede variar, las rebanadas pueden ser transfectadas u obtenidas de animales con reporteros codificados genéticamente. Como se explica con más detalle a continuación, estos dos últimos enfoques también permiten la identificación funcional específica y la caracterización de las respuestas de las células no beta 31,66. Además, los islotes de partes bien definidas del órgano se pueden estudiar para detectar diferencias en la capacidad de respuesta o la susceptibilidad a la enfermedad. Aunque no requieren un período de incubación de recuperación, se pueden incubar fácilmente con diferentes agentes farmacológicos, ácidos grasos, glucosa alta y citoquinas.
Lo más importante es que, dado que la alta resolución se puede lograr en combinación con la resolución unicelular o incluso subcelular, la imagen de calcio confocal en rodajas es uno de los métodos más adecuados para analizar las ondas de calcio, la conectividad funcional y las diferentes funciones funcionales de las células en distintas partes de un islote54,67. A pesar de una serie de ventajas, el enfoque de corte de tejido tiene limitaciones importantes. En primer lugar, sigue siendo, al menos en parte, perjudicial para la arquitectura de los islotes y exocrinas, especialmente en la superficie de corte, y se necesitan precauciones, como baja temperatura, intercambio frecuente de soluciones y manipulación suave y rápida, durante la preparación para evitar daños enzimáticos mecánicos y endógenos adicionales. En segundo lugar, los patrones de entrega de nutrientes y secretagogos siguen siendo inferiores a la ruta in vivo, la preparación está separada de la inervación sistémica y la retroalimentación interorgánica, como entre el islote y sus tejidos diana, es imposible, en contraste con los enfoques in vivo. En tercer lugar, el grosor máximo de la rebanada está limitado por la oxigenación, el suministro de nutrientes y la regulación del pH a ~ 200 μm9. Además, tanto la preparación de rebanadas como las imágenes necesitan mucha capacitación, y los análisis en profundidad de datos de calcio de series de tiempo largas y de muchas células requieren conocimientos especializados que a menudo no se incluyen en el conjunto de herramientas de un fisiólogo clásico y requieren la ayuda de físicos o científicos de datos. La ventaja de que se conservan las interacciones homo y heterotípicas también puede complicar el análisis de muestras debido a la presencia de señales de otras células en regiones de interés. Dependiendo de los protocolos, la activación de otras células puede conducir a la estimulación adicional indirecta o la inhibición de una célula observada.
Esto solo puede resolverse de manera concluyente mediante enfoques de deconvolución, mediante protocolos de estimulación más complejos que incluyan sustancias que bloqueen algunos de los efectos indirectos, mediante el uso de animales knock-out específicos y mediante una comparación cuidadosa de los resultados con los resultados de otros estudios que emplean metodologías más reduccionistas. Además, si las mediciones de secreción son necesarias, debe tenerse en cuenta que algunas rebanadas pueden carecer de islotes, y la masa total de tejido endocrino en una sola rebanada suele ser baja. La preparación de cortes agudos de tejido pancreático para imágenes implica varios pasos críticos discutidos en las siguientes secciones y resumidos en la Tabla 1, donde el lector también puede encontrar consejos cortos pero importantes para la solución de problemas. Primero, al preparar la solución de agarosa, el polvo de agarosa debe disolverse por completo, de lo contrario las partículas no disueltas pueden obstruir la inyección. Mantenga la solución homogénea de agarosa a 37-45 ° C para evitar el endurecimiento de la agarosa debido a una temperatura demasiado baja, por un lado, y para evitar daños en los tejidos debido a temperaturas demasiado altas, por otro lado. Después de su uso, la agarosa restante puede almacenarse a 4 ° C y recalentarse, aunque el recalentamiento repetido puede resultar en un aumento de la densidad debido a la evaporación del agua, lo que eventualmente dificulta o imposibilita la inyección.
El siguiente paso crítico en la preparación es sujetar correctamente la papila duodenal principal. Una mancha blanca en el duodeno indica la unión del conducto biliar común y el duodeno. Una abrazadera colocada demasiado proximalmente dará como resultado la obstrucción de algunas ramas pancreáticas laterales del conducto común, inhabilitando la inyección de estas partes, mientras que una abrazadera colocada demasiado distalmente dará como resultado que la agarosa se filtre a través de la ruta de resistencia inferior directamente hacia el duodeno. Antes de la canulación del conducto biliar común, el tejido adiposo circundante se puede extirpar cuidadosamente para una mejor visualización del conducto y un mayor control durante la inyección. La precisión insuficiente durante la extracción del tejido circundante puede resultar en la perforación del conducto. La selección del diámetro de la aguja utilizada para la inyección de agarosa también es importante. En ratones, se usa preferiblemente una aguja de 30 G; Las agujas más pequeñas (32 o 33 G) requieren más esfuerzo debido a la alta viscosidad de la solución de agarosa y son más propensas a la obstrucción. Sin embargo, si se usan en combinación con una solución de agarosa de menor densidad, pueden ser muy útiles en cepas de ratones más pequeñas y animales más jóvenes. Durante los primeros días postnatales, la agarosa puede inyectarse alternativamente por vía subcapsular en lugar de intraductal2. El uso de agujas con mayor diámetro en ratones probablemente resultará en dañar el conducto biliar común. Esto también puede suceder con el diámetro correcto de la aguja, y un fórceps puede ayudar a mantener la aguja en su lugar durante la inyección. Las agujas de mayor diámetro pueden ser la única solución en caso de conductos más grandes, como se encuentra en las ratas. Si la aguja es demasiado estrecha para garantizar un sello hermético que evite la fuga hacia atrás, se puede colocar una ligadura a su alrededor al ingresar con éxito al conducto.
La inyección de agarosa requiere cierto esfuerzo debido a la viscosidad de la solución, y una vez que el proceso de inyección ha comenzado, no debe interrumpirse ya que la solución de agarosa de bajo punto de fusión puede solidificarse en la aguja o en las partes más grandes del árbol ductal antes de que se complete la inyección. Esto resultará en una mala penetración del tejido y un peor soporte durante el corte. El conducto siempre debe canularse en el punto donde el conducto hepático izquierdo y el conducto cístico se unen para formar el conducto biliar común. Si el conducto biliar común se perfora, intente repetidamente canular más cerca del duodeno. Cuando el páncreas está suficientemente estabilizado con solución de agarosa y extraído de la cavidad peritoneal, se cortan pequeños trozos de tejido bien inyectado. Antes de incrustarlos en la agarosa, es crucial eliminar todos los tejidos adiposos y conectivos, ya que sus residuos hacen que el corte sea más desafiante. Lo mismo se aplica a los vasos sanguíneos y los residuos de conductos, excepto cuando son el foco del experimento. En este caso, asegúrese de colocarlos de tal manera que se obtenga la sección transversal deseada. Al incrustar el tejido en agarosa, asegúrese de que la temperatura sea adecuada (37 ° C) y que el tejido esté completamente rodeado de agarosa, ya que las fuerzas durante el corte del vibratomo pueden arrancar el tejido del páncreas de los bloques de agarosa.
Secar rápidamente los bloques de tejido antes de colocarlos en agarosa colocándolos brevemente sobre un pañuelo de papel puede ayudar a prevenir el contacto deficiente entre el tejido y la agarosa durante este paso. Durante la solidificación de los bloques de agarosa, coloque la placa de Petri horizontalmente y evite el contacto entre el tejido del páncreas y la parte inferior de la placa de Petri. Si el páncreas no se inyecta completamente, el proceso de corte será un desafío. Por lo tanto, trate de reducir la velocidad de corte para obtener rodajas de tejido. Para minimizar el daño celular durante el corte del vibratomo, reemplace el SEC (y los cubitos de hielo hechos de ECS) en la cámara de corte regularmente. Este último reducirá la actividad de las enzimas pancreáticas liberadas del tejido acinar durante el corte. El grosor de las rodajas también es de crucial importancia. Para la dinámica del calcio y los experimentos electrofisiológicos, generalmente se cortan rodajas de 140 μm; sin embargo, de acuerdo con el objetivo del estudio, el grosor de la rebanada puede variar de 90 μm a 200 μm. Tenga en cuenta que en rodajas más gruesas, la difusión de oxígeno y nutrientes será limitada, pero incluirán más tejido. Además, se puede esperar que la proporción de islotes sin cortar aumente con el aumento del grosor de la rebanada. Las rebanadas pueden almacenarse en un SEC intercambiado regularmente a temperatura ambiente durante varias horas o incluso cultivarse en un medio celular apropiado durante varios días; sin embargo, esto puede eventualmente afectar la fisiología normal de las células de losislotes 3,22.
Al preparar la solución de tinte, asegúrese de una mezcla cuidadosa de todos los componentes y evite la exposición a la luz ambiental. La rebanada pancreática se compone de muchas capas celulares, y la absorción de colorante de calcio se limita a las primeras capas celulares más superficiales, como se describió anteriormente para los islotes aislados58,68 y las rodajas hipofisarias69. Sin embargo, a diferencia de los islotes aislados donde la cápsula circundante y las capas celulares externas dificultan la penetración del tinte en capas más profundas, las rodajas de tejido permiten el acceso a toda la superficie de la sección transversal del islote, lo que permite la medición simultánea de la dinámica del calcio en cientos de células de todas las capas de un islote. Los indicadores fluorescentes Ca2+ son los más utilizados para medir la dinámica del calcio, y junto con CLSM, permiten grabaciones con alta resolución temporal, alcanzando varios cientos de Hertz. Al seleccionar el indicador fluorescente Ca2+ más apropiado, considere diferentes factores, incluida la forma del indicador, que influye en el método de carga celular, el modo de medición (cualitativo o cuantitativo) y la constante de disociación (Kd) que debe estar en el rango de concentración de Ca2+ de interés y depende del pH, la temperatura, la presencia de Mg2+ y otros iones, así como la unión a proteínas. Como las señales celulares de Ca2+ suelen ser transitorias, también se debe considerar la constante de velocidad de unión de Ca2+. Para medir la dinámica [Ca2+]IC en células pancreáticas, este grupo utiliza principalmente el colorante indicador Ca2+ permeable a la célula descrito en este protocolo (Tabla de Materiales) ya que es un indicador de longitud de onda larga con las longitudes de onda de emisión en el espectro donde la autofluorescencia celular suele ser menos problemática, y la energía de la luz de excitación es baja, lo que reduce el potencial de fotodaño celular. Debido a que este colorante es fluorescente a bajas concentraciones de Ca2+, esto facilita la determinación de la ci basal [Ca2+] y aumenta la visibilidad celular antes de la estimulación. Después de unir Ca2+, la intensidad de fluorescencia del tinte aumenta 14 veces, lo que permite detectar incluso ligeros cambios en [Ca2+]IC.
Para el éxito de las imágenes de calcio de células vivas, se deben considerar varios parámetros de hardware cruciales, como se describe en la sección de protocolo. Para las imágenes de células vivas en las que las amplitudes de la señal son bajas y las posibilidades de fototoxicidad son altas, los objetivos con un NA más alto se utilizan preferiblemente para recolectar más luz de la muestra. Si la dinámica del calcio debe registrarse con una alta resolución temporal, utilice el escáner resonante en lugar de galvanómetros lineales. Además de elegir el objetivo correcto, el uso de detectores altamente sensibles, como los detectores híbridos que requieren menos potencia láser, evita la fototoxicidad y el fotoblanqueo. Esto es de especial importancia para las imágenes de calcio de larga duración. Otros pasos importantes en las imágenes de calcio son la configuración de parámetros de calidad de imagen para adquisiciones de series temporales. Los más importantes son la resolución temporal y la espacial. Como la dinámica del calcio per se determina la resolución temporal aceptable más baja, la frecuencia de muestreo debe ser al menos dos veces mayor que la frecuencia de señal esperada para detectar la señal o incluso 10 veces mayor para detectar la forma de la señal de manera confiable. En las rebanadas agudas de tejido pancreático, la dinámica del calcio se puede medir en cientos de células simultáneamente y, por lo tanto, la resolución espacial también es importante. Esto se puede mejorar aumentando el número de píxeles o aumentando el promedio de línea durante la adquisición en vivo. Sin embargo, debido a la relación inversa entre la resolución espacial y la temporal, se necesita una compensación entre ambas configuraciones.
Si se deben realizar imágenes de calcio en una población celular específica dentro del páncreas, es necesario un estímulo capaz de diferenciar funcionalmente las células dentro de la rebanada. La glucosa alta activa de manera confiable y rápida las células beta a un patrón oscilatorio que se superpone a un nivel elevado de calcio y está altamente sincronizado entre todas las células dentro de un islote 32,58,70. Las células beta son el tipo de célula más numerosa dentro de un islote y se encuentran principalmente en el núcleo del islote en ratones. El mismo protocolo de estimulación disminuye y a veces no cambia apreciablemente el estallido en las células alfa 30,32,58,70,71,72. Para discriminar funcionalmente a las células alfa, se puede utilizar glucosa baja (3 mM), glutamato o adrenalina para aumentar su frecuencia o basal [Ca2+]IC 21,72,73,74,75. Representan el 10-20% de las células de los islotes y se detectarán en la periferia de los islotes1. Las células delta también se encuentran en la periferia. Constituyen solo ~ 5% del número total de células endocrinas en un islote y son típicamente activas en glucosa de 6 mM y responden a la estimulación de la glucosa con una mayor actividad de estallido irregular desde el inicio o un nivel de calcio ligeramente elevado 1,32,71,76. La grelina se puede utilizar para la estimulación específica de las células delta 21,77,78,79 en experimentos de imágenes de calcio. Sin embargo, aún no se han definido protocolos para la identificación funcional específica de células PP y épsilon. Además, la acetilcolina de 25 nM activa de manera confiable las células acinares en actividad de estallido 35,80,81. Además, una serie de otros secretagogos, como la ceruleína, la colecistoquinina y la carbamilocolina, se pueden utilizar para evocar respuestas de calcio en las células acinares 22,40,82,83.
Finalmente, el ácido quenodesoxicólico de 1 mM evoca de manera confiable las respuestas de calcio en las células ductales en rodajas de tejido; la angiotensina II, ATP y algunos otros secretagogos también se pueden usar 11,23,84,85. Cuando una identificación funcional basada en respuestas características a secretagogos e inhibidores específicos no sea suficiente, se puede emplear animales marcados genéticamente31, células transfectadas73 o inmunocitoquímica para la identificación de diferentes tipos de células 9,22,71,86 . Durante los últimos años, el método de corte de tejido se ha adaptado con éxito al tejido humano, abriendo muchas nuevas vías de investigación importantes tanto en la fisiología exocrina41 como en la endocrina 9,36,37,39. Curiosamente, una evaluación detallada de la dinámica del calcio en los islotes humanos ha sido notoriamente difícil y aún no se ha investigado con mayor detalle87. Combinado con la microscopía confocal avanzada, el método de corte de tejido pancreático ha permitido muchos nuevos conocimientos sobre la dinámica del calcio en ratones y, con suerte, hará lo mismo con el tejido humano.
The authors have nothing to disclose.
El trabajo presentado en este estudio fue financiado por la Agencia Eslovena de Investigación (fondos básicos de investigación nos. P3-0396 e I0-0029, así como proyectos de investigación nos. J3-9289, N3-0048 y N3-0133) y por el Fondo Austriaco para la Ciencia / Fonds zur Förderung der Wissenschaftlichen Forschung (subvenciones bilaterales I3562–B27 e I4319–B30). Agradecemos a Maruša Rošer, Maša Čater y Rudi Mlakar por su excelente asistencia técnica.
Equipment | |||
Analytical balance KERN ALJ 120-4 | KERN & SOHN GmbH | ALJ 160-4A | |
Confocal microscope Leica TCS SP5 II Upright setup | Leica | 5100001578 | |
Confocal microscope Leica TCS SP5 AOBS Tandem II setup | Leica | ||
Cork pad 15 cm x 15 cm | |||
Corning 15 mL centrifuge tubes | Merck KGaA, Darmstadt, Germany | CLS430790 | |
Corning Round Ice Bucket with Lid, 4 L | Fischer Scientific, Leicestershire, UK | 432124 | |
Double edge razor blade | Personna, USA | ||
Dumont #5 – Fine Forceps | FST, Germany | 11254-20 | |
Eppendorf Safe-Lock Tubes 0.5 mL | Eppendorf | 0030 121.023 | |
Erlenmeyer flask 200 mL | IsoLab, Germany | 027.01.100 | |
Fine Scissors – ToughCut | FST, Germany | 14058-11 | |
Flat orbital shaker IKA KS 260 basic | IKA | Ident. No.: 0002980200 | |
Glass lab bottle 1000 mL | IsoLab, Germany | 091.01.901 | |
Hartman Hemostat, curved | FST, Germany | 13003-10 | |
HCX APO L 20x/1.00 W HCX APO L (water immersion objective, 20x, NA 1.0) | Leica | 15507701 | |
Measuring cylinder 25 mL | IsoLab, Germany | 015.01.025 | |
Micromanipulator Control box SM-7, Keypad SM-7 | Luigs & Neumann | 200-100 900 7311, 200-100 900 9050 | |
Microwave owen | Gorenje, Slovenia | MO20MW | |
Osmometer Gonotec 010 | Gonotec, Berlin, Germany | OSMOMAT 010 Nr. 01-02-20 | |
Paint brush | Faber-Castell, No.2 | Any thin soft round paint brush No.2, preferably black | |
Paper towels | |||
Perifusion pumps | Ismatec | ISM 827 | Reglo Analog MS – 4/8 |
Petri dish 100/20 mm | Sarstedt | 83.3902 | |
Petri dish 35/10 mm | Greiner bio-one | 627102 | |
Petri dish 35 x 10 mm Nunclon Delta | Thermo Fischer Scientific, Waltham, MA USA | 153066 | NON-STICKY for agarose blocks |
pH meter inoLab pH Level 1 | WTW, Weilheim, Germany | E163694 | |
Pipette 1000 mL | Eppendorf | 3121 000.120 | |
Pipette 50 mL | Eppendorf | 3121 000.066 | |
Push pins 23 mm | Deli, Ningbo, China | E0021 | |
Screw cap tube, 15 mL | Sarstedt | 62.554.502 | |
Semken Forceps | FST, Germany | 11008-13 | |
Stabilizing ring for Erlenmeyer flask | IsoLab, Germany | 027.11.048 | |
Stereomicroscope Nikon SMZ 745 | Nikon, Melville, NY USA | ||
Syringe Injekt Solo 5 mL | Braun, Melsungen, Germany | 4606051V | |
Syringe needle 0.30 x 12 mm (30 G x 1/2") | Braun, Melsungen, Germany | 4656300 | |
Temperature controller | Luigs & Neumann | 200-100 500 0150, 200-150-500-145 | Slice mini chamber, Temperature controller TC 07 |
Tubings for perifusion system | Ismatec | SC0310 | Ismatec Pharmed 1.14 mm(ID) + silicone tubing 1.0 (ID) x 1.8 mm(OD) |
Ultrasonic bath Studio GT-7810A | Globaltronics | ||
Vibrotome Leica VT 1000 S | Leica, Nussloch, Germany | 14047235613 | |
Volumetric flask 1000 mL | IsoLab, Germany | 013.01.910 | |
Vortex mixer Neolab 7-2020 | Neolab | 7-2020 | |
Water bath Thermo Haake open-bath circulator | Thermo Fisher Scientific | Z527912 | |
Material/Reagent | |||
Calcium chloride dihydrate – CaCl2.2H2O | Sigma Aldrich, Germany | C5080-500G | |
D-(+)-glucose | Sigma Aldrich, Germany | G8270-1KG | |
Dimethyl sulfoxide | Sigma Aldrich | D4540-100ML | |
DL-lactic acid | Sigma Aldrich, Germany | L1250-500ML | |
Dulbecco’s Phosphate Buffered Saline | Merck KGaA, Darmstadt, Germany | D8662-500ML | |
Gas mixture containing 95% O2 and 5% CO2 at barometric pressure | |||
Glue Wekem sekundenkleber WK-110 | Wekem GmbH, Bergkamen, Germany | WK 110-020 | |
HEPES | Sigma Aldrich, Germany | H3375-250G | |
L-(+)-ascorbic acid | Sigma Aldrich, Germany | A9,290-2 | |
LIVE/DEAD Viability/Cytotoxicity Kit, for mammalian cells | Thermo Fischer Scientific, Waltham, MA USA | L3224 | |
Magnesium chloride hexahydrate – MgCl2.2H2O | Sigma Aldrich, Germany | M2670-500G | |
Myo-inositol | Sigma Aldrich, Germany | I5125-100G | |
Oregon Green 488 BAPTA-1, AM | Invitrogen (Thermo FisherScientific) | O6807 | cell-permeable Ca2+ indicator (excitation/emission: 495/523 nm) |
Pluronic F-127 (20% Solution in DMSO) | Invitrogen (Thermo Fisher Scientific) | P3000MP | polaxamer: nonionic triblock copolymer |
Potassium chloride – KCl | Sigma Aldrich, Germany | 31248 | |
SeaPlaque GTG agarose | Lonza, Rockland, USA | 50111 | |
Sodium bicarbonate – NaHCO3 | Honeywell, Germany | 31437-500G | |
Sodium chloride – NaCl | Honeywell, Germany | 31434-1KG | |
Sodium hydroxide – NaOH | Sigma Aldrich, Germany | 30620 | |
Sodium phosphate monobasic- NaH2PO4 | Sigma Aldrich, Germany | S0751-500G | |
Sodium pyruvate | Sigma Aldrich, Germany | 15990-100G | |
Software | |||
FIJI | FIJI is an open source project | ||
LASAF | Leica microsystems, Inc. | ||
Matlab | Mathworks | ||
Python | Python Software Foundation | Python is an open source project |