Apresentamos a preparação de fatias agudas de tecido pancreático e seu uso em microscopia de escaneamento a laser confocal para estudar a dinâmica do cálcio simultaneamente em um grande número de células vivas, durante longos períodos de tempo, e com alta resolução espástica.
A fatia aguda de tecido pancreático do rato é uma preparação única in situ com comunicação intercelular preservada e arquitetura tecidual que implica significativamente menos alterações induzidas pela preparação do que ilhotas isoladas, acini, dutos ou células dispersas descritas em estudos in vitro típicos. Combinando a fatia aguda de tecido pancreático com imagens de cálcio de células vivas na microscopia de varredura a laser confocal (CLSM), os sinais de cálcio podem ser estudados em um grande número de células endócrinas e extrinas simultaneamente, com uma resolução única ou mesmo subcelular. A sensibilidade permite a detecção de alterações e permite o estudo de ondas intercelulares e conectividade funcional, bem como o estudo da dependência das respostas fisiológicas das células em sua localização dentro da ilhota e relação paracrina com outras células. Finalmente, do ponto de vista do bem-estar animal, o registro de sinais de um grande número de células em um momento reduz o número de animais necessários em experimentos, contribuindo para a substituição, redução e princípio de refinamento 3R.
O pâncreas mamífero é uma grande glândula exócrina e endócrina. A parte exócrina representa 96-99% do volume total do pâncreas e consiste em acini e dutos. A parte endócrina é composta por um grande número de ilhotas de Langerhans representando os 1-4% restantes do volume total do pâncreas1. A parte exócrina secreta grandes enzimas digestivas que quebram polímeros ricos em energia na comida, bem como um fluido rico em bicarbonato, que combina com outras secreções gastrointestinais para fornecer um ambiente adequado para a ação de enzimas. A parte endócrina secreta hormônios que regulam a distribuição pós-preria, o armazenamento e a liberação interprandial de nutrientes ricos em energia. Embora o tecido exocrino seja relativamente subdesenvolvido e o endócrino relativamente bem desenvolvido ao nascer, o primeiro rapidamente supera o último após o desmamar 2,3,4. Estudos iniciais da função pancreática marcaram o nascimento da fisiologia moderna, e os principais avanços metodológicos no campo têm sido seguidos por grandes quebra-panorticas científicas5. Trabalhar com pâncreas é tecnicamente desafiador devido à estrutura intrincada da glândula, mas também é uma grande motivação por causa de doenças como câncer de pâncreas, pancreatite e diabetes que apresentam grandes ameaças à saúde pública, e para as quais novas abordagens terapêuticas são necessárias.
Ilhotas isoladas6, acini 7,8 e fragmentos ductais foram desenvolvidos e utilizados por décadas como métodos padrão-ouro devido às suas vantagens em comparação com linhas celulares e células endócrinas, acinar e ductal 9,10 dispersas primárias. Apesar da função marcadamente melhorada dos coletivos celulares isolados, esses métodos ainda envolvem considerável estresse mecânico e enzimático, isolam as células do tecido circundante e, portanto, carecem de interações paracrinas e suporte mecânico, e o mais importante, são acompanhados por mudanças significativas na fisiologia normal 11,12,13 . A fatia aguda de tecido pancreático do camundongo foi desenvolvida em 2001 a partir de uma necessidade percebida de desenvolver uma plataforma experimental semelhante ao cérebro, pituitária e fatias suprarrenais com contatos intercelulares preservados, interações paracrinas, mesenquime e arquitetura tecidual, bem como sem algumas das deficiências mais importantes do método padrão ouro na pesquisa de ilhotas da época- ilhotas isoladas12, 14 anos. Entre essas deficiências estão danos nas camadas mais externas, falta de acessibilidade das áreas de ilhotas do núcleo e a necessidade de cultivo com efeitos possivelmente importantes na identidade celular e fisiologia 12,15. Além disso, o método de fatia de tecido permite estudos sobre modelos animais com arquitetura de ilhotas grosseiramente desordenada, onde é impossível isolar ilhotas, ou quando o rendimento da ilhota é extremamente baixo pelo isolamento tradicional 16,17,18,19,20,21.
Além disso, a fatia é mais adequada para estudar alterações morfológicas durante o desenvolvimento de diabetes e pancreatite, por exemplo, pois permite uma melhor visão geral de todo o tecido e também é compatível com o estudo de diferenças regionais. É importante ressaltar que, apesar do foco inicial na parte endócrina, o método de fatia de tecido permite inerentemente o estudo dos componentes exócrinos 9,22,23. Durante a primeira década após sua introdução, o método foi empregado para estudos eletrofisiológicos de células beta 14,24,25,26,27,28,29 e alfa 30,31, bem como para examinar a funcionalidade morfológica e maturada do pâncreas 2,3 . Uma década depois, em 2013, o método foi adaptado com sucesso para imagens de cálcio de células vivas de células ilhotas usando CLSM para caracterizar suas respostas à glicose32, seus padrões de conectividade funcional33, e a relação entre potencial de membrana e cálcio intracelular, combinando um corante de cálcio fluorescente com um corante potencial de membrana34. Mais tarde, no mesmo ano, o método também foi utilizado para avaliar a dinâmica do cálcio em células acinar22,35. Nos anos seguintes, as fatias de tecido pancreático têm sido utilizadas em diversos estudos e adaptadas com sucesso ao tecido suíno e humano 9,36,37,38,39,40,41. No entanto, juntos, as fatias de tecido pancreático de imagem de cálcio em geral e em ilhotas em particular – ainda é realizada principalmente por esse grupo. Uma das principais razões para isso pode estar na combinação de uma preparação tecnicamente desafiadora de fatias teciduais, a necessidade de um microscópio confocal e uma análise de dados bastante complexa. O principal objetivo do presente artigo é tornar esse método poderoso mais acessível a outros usuários em potencial.
Já existem alguns excelentes artigos metodológicos que tratam em detalhes com a preparação de fatias teciduais e o uso de fatias para estudos estruturais e de secreção, mas não para imagens de cálcio confocal 9,42,43. Portanto, este artigo foca em algumas dicas e truques adicionais durante a preparação de fatias, em etapas críticas para o sucesso do carregamento de tingimento, aquisição de imagem, bem como nos principais passos da análise básica de dados de cálcio. Portanto, essa contribuição deve ser vista como complementar e não como alternativa para o método acima mencionado. Da mesma forma, a imagem de cálcio em fatias de tecido pancreático de camundongos deve ser vista como uma abordagem experimental a ser usada para responder a perguntas específicas e, portanto, é complementar ao invés de uma alternativa absoluta para outras abordagens de imagem de cálcio na fisiologia pancreática, como dutos isolados ou acini, ilhotas isoladas, organoides, ilhotas transplantadas na câmara anterior do olho, e gravações in vivo 11,44,45,46,47,48. A promessa de imagem de cálcio em fatias de tecido pancreático de camundongos é provavelmente melhor ilustrada por gravações recentes bem sucedidas de dinâmica de cálcio em células mesenquimais de ilhotas, como pericítes49 e macrófagos50, bem como em células ductais23.
O método de fatia de tecido pancreático é um método experimental rápido para estudar a morfologia e fisiologia das partes endócrina e exócrina do pâncreas em uma preparação mais conservada, in situ. Muitas das vantagens já foram apontadas na Introdução. Vale ressaltar que, em geral (ou seja, não apenas para a imagem de cálcio), a abordagem fatia para estudar fisiologia pancreática economiza tempo porque não envolve um período de recuperação após o isolamento. Este último não é absolutamente necessário com todos os tipos de experimentos e usos de ilhotas isoladas de diferentes espécies, mas é tipicamente empregado para aumentar a pureza, restaurar a viabilidade e funcionalidade, e às vezes coletar ilhotas de vários doadores 59,60,61,62,63,64 . No entanto, no contexto da imagem de cálcio, as respostas das células beta têm sido encontradas dependendo da duração e condições da cultura, e esta é uma importante fonte de variação que deve ser levada em conta ao usar ilhotas isoladas15,65. O mesmo problema deve ser considerado para fatias de tecido se sua cultura de longo prazo se tornar uma opção amplamente utilizada no futuro22,36. O método de fatia de tecido também tem um alto rendimento e, portanto, potencialmente reduz o sofrimento animal e aumenta o poder estatístico. Além disso, como muitas fatias podem ser preparadas a partir de um único animal e porque as fatias sobrevivem por longos períodos, incluindo o mesmo animal ou mesmo a mesma ilhota tanto no experimental quanto nos grupos de controle torna-se viável.
Como a arquitetura original e as comunicações célula-células são preservadas, e por ser compatível com uma série de análises estruturais, eletrofisiológicas, métodos de imagem e ensaios de secreção hormonal, este método é especialmente útil para estudar funções pancreáticas que dependem de interações não perturbadas entre células individuais, por exemplo, sensibilidade a secretagogues, paracrinos e interações imunológicas entre diferentes tipos de células, padrões de atividade elétrica, propriedades da dinâmica do cálcio, e a secreção de diferentes hormônios. Para a imagem de cálcio especificamente, as principais vantagens do uso de fatias são a exposição do núcleo ilhota e a possibilidade de adquirir sinais de muitos tipos de células diferentes com alta resolução. Dependendo dos requisitos do experimento e da idade dos animais, a espessura pode ser variada, as fatias podem ser transfeccionadas ou obtidas de animais com repórteres geneticamente codificados. Conforme explicado em mais detalhes abaixo, as duas últimas abordagens também permitem identificação funcional específica e caracterização de respostas de células não beta 31,66. Além disso, ilhotas de partes bem definidas do órgão podem ser estudadas por diferenças de capacidade de resposta ou suscetibilidade à doença. Embora não exijam um período de incubação de recuperação, eles podem ser facilmente incubados com diferentes agentes farmacológicos, ácidos graxos, alta glicose e citocinas.
Mais importante, como a alta resolução é alcançável em combinação com resolução unicelular ou mesmo subcelular, a imagem de cálcio confocal em fatias é um dos métodos mais adequados para analisar ondas de cálcio, conectividade funcional e os diferentes papéis funcionais das células em partes distintas de uma ilhota54,67. Apesar de uma série de vantagens, a abordagem da fatia de tecido tem limitações importantes. Em primeiro lugar, ainda é pelo menos parcialmente disruptivo para a arquitetura ilhota e exócrina, especialmente na superfície cortada, e precauções, como baixa temperatura, troca frequente de soluções e manipulação suave e rápida, são necessárias durante a preparação para evitar danos mecânicos e enzimáticos adicionais. Em segundo lugar, os padrões de distribuição de nutrientes e de nutrição ainda são inferiores à rota in vivo, a preparação é desvinculada da inervação sistêmica, e o feedback inter-órgão, como entre a ilhota e seus tecidos alvo, é impossível, em contraste com abordagens in vivo. Em terceiro lugar, a espessura máxima da fatia é limitada pela oxigenação, entrega de nutrientes e regulação do pH a ~200 μm9. Além disso, tanto a preparação de fatias quanto a imagem precisam de muito treinamento, e análises aprofundadas de dados de cálcio de séries de longa data e de muitas células requerem conhecimento especializado que muitas vezes não está incluído no kit de ferramentas de um fisiologista clássico e requer ajuda de físicos ou cientistas de dados. A vantagem de que as interações homo-e heterotípicas são preservadas também pode complicar a análise das amostras devido à presença de sinais de outras células em regiões de interesse. Dependendo dos protocolos, a ativação de outras células pode levar a estimulação adicional indireta ou inibição de uma célula observada.
Isso só pode ser resolvido conclusivamente por abordagens de desconvolução, por protocolos de estimulação mais complexos, incluindo substâncias que bloqueiam alguns dos efeitos indiretos, utilizando animais de knock-out específicos, e por comparação cuidadosa de resultados com resultados de outros estudos que empregam metodologias mais reducionistas. Além disso, se as medidas de secreção forem necessárias, deve-se ter em mente que algumas fatias podem não ter ilhotas, e a massa total de tecido endócrino em uma única fatia é tipicamente baixa. A preparação de fatias agudas de tecido pancreático para imagem envolve várias etapas críticas discutidas nas seções a seguir e resumidas na Tabela 1, onde o leitor também pode encontrar dicas curtas, mas importantes para a solução de problemas. Primeiro, ao preparar a solução agarose, o pó de agarose deve dissolver-se completamente, caso contrário as partículas não resolvidas podem obstruir a injeção. Mantenha a solução homogênea agarose a 37-45 °C para evitar o endurecimento da agarose devido a uma temperatura muito baixa por um lado e para evitar danos teciduais devido a temperaturas muito altas, por outro lado. Após o uso, a restante da agarose pode ser armazenada a 4 °C e reaquecida, embora o reaquecimento repetido possa resultar em aumento da densidade devido à evaporação da água, tornando a injeção difícil ou impossível.
O próximo passo crítico na preparação é fixar corretamente a papila duodenal principal. Uma mancha branca no duodeno indica a junção do ducto biliar comum e do duodeno. Um grampo colocado proximicamente resultará na obstrução de alguns ramos pancreáticos laterais do duto comum, desativando a injeção dessas partes, enquanto um grampo colocado muito distralmente resultará em vazamento de ágarose através do caminho de resistência inferior diretamente para o duodeno. Antes da canulação do ducto biliar comum, o tecido adiposo circundante pode ser cuidadosamente removido para melhor visualização do duto e maior controle durante a injeção. A precisão insuficiente durante a remoção do tecido circundante pode resultar em perfuração do duto. A seleção do diâmetro da agulha usada para a injeção de agarose também é importante. Em camundongos, uma agulha de 30 G é de preferência usada; agulhas menores (32 ou 33 G) requerem mais esforço devido à alta viscosidade da solução agarose e são mais propensas à obstrução. No entanto, se usados em combinação com uma solução de agarose de menor densidade, eles podem ser muito úteis em cepas de camundongos menores e animais mais jovens. Durante os dias pós-natal iniciais, a agarose pode, alternativamente, ser injetada subcapsularmente em vez de intradutalmente2. O uso de agulhas com maior diâmetro em camundongos provavelmente resultará em danificar o ducto biliar comum. Isso também pode acontecer com o diâmetro correto da agulha, e um fórceps pode ajudar a manter a agulha no lugar durante a injeção. Agulhas de diâmetro maior podem ser a única solução no caso de dutos maiores, como encontrado em ratos. Se a agulha estiver muito estreita para garantir uma vedação apertada prevenindo o vazamento de costas, uma ligadura pode ser colocada ao seu redor após a entrada bem sucedida no duto.
A injeção de Agarose requer algum esforço devido à viscosidade da solução, e uma vez que o processo de injeção tenha começado, ela não deve ser interrompida, pois a solução de agarose de ponto de fusão baixo pode se solidificar na agulha ou nas maiores partes da árvore ductal antes que a injeção seja concluída. Isso resultará em má penetração tecidual e pior suporte durante o corte. O duto deve ser sempre cânulado no ponto onde o ducto hepático esquerdo e o ducto cístico se unem para formar o ducto biliar comum.. Se o ducto biliar comum for perfurado, tente repetidamente cânulando mais perto do duodeno. Quando o pâncreas é suficientemente estabilizado com solução de agarose e extraído da cavidade peritoneal, pequenos pedaços de tecido bem injetado são cortados. Antes de incorporá-los à agarose, é crucial remover todos os tecidos adiposos e conjuntivos, pois seus resíduos tornam o corte mais desafiador. O mesmo se aplica aos vasos sanguíneos e resíduos de dutos, exceto quando eles são o foco do experimento. Neste caso, certifique-se de posicioná-los de tal forma que a seção transversal desejada será obtida. Ao incorporar o tecido em agarose, certifique-se de que a temperatura é apropriada (37 °C), e que o tecido esteja completamente cercado por agarose, pois forças durante o corte de vibratome podem arrancar o tecido do pâncreas dos blocos de agarose.
Secar rapidamente os blocos de tecido antes de colocá-los em agarose, colocando-os brevemente em um tecido de papel pode ajudar a evitar o mau contato entre tecido e agarose durante esta etapa. Durante a solidificação dos blocos de agarose, coloque a placa de Petri horizontalmente, e evite o contato entre o tecido do pâncreas e o fundo da placa de Petri. Se o pâncreas não for totalmente injetado, o processo de corte será desafiador. Portanto, tente reduzir a velocidade de corte para obter fatias de tecido. Para minimizar os danos celulares durante o corte de vibratome, substitua o ECS (e os cubos de gelo feitos de ECS) na câmara de corte regularmente. Esta última reduzirá a atividade de enzimas pancreáticas liberadas do tecido acinar durante o corte. A espessura das fatias também é de importância crucial. Para a dinâmica do cálcio e experimentos eletrofisiológicos, as fatias de 140 μm geralmente são cortadas; no entanto, de acordo com o objetivo do estudo, a espessura da fatia pode variar de 90 μm a 200 μm. Tenha em mente que em fatias mais grossas, a difusão de oxigênio e nutrientes será limitada, mas eles incluirão mais tecido. Além disso, espera-se que a proporção de ilhotas não cortadas aumente com o aumento da espessura das fatias. As fatias podem ser armazenadas em um ECS regularmente trocado à temperatura ambiente por várias horas ou até mesmo cultivadas em um meio celular apropriado por vários dias; no entanto, isso pode eventualmente afetar a fisiologia celular normalda ilhota 3,22.
Ao preparar a solução de corante, certifique-se de uma mistura cuidadosa de todos os componentes e evite a exposição à luz ambiente. A fatia pancreática é composta de muitas camadas celulares, e a absorção de corante de cálcio é limitada às primeiras camadas celulares mais superficiais, como descrito anteriormente para ilhotas isoladas58,68, e fatias pituitárias69. No entanto, em contraste com ilhotas isoladas onde a cápsula circundante e as camadas celulares externas dificultam a penetração do corante em camadas mais profundas, as fatias de tecido permitem o acesso a toda a superfície transversal da ilhota, permitindo a medição simultânea da dinâmica do cálcio em centenas de células de todas as camadas de uma ilhota. Os indicadores fluorescentes Ca2+ são os mais utilizados para medir a dinâmica do cálcio, e juntamente com o CLSM, permitem gravações com alta resolução temporal, atingindo várias centenas de Hertz. Ao selecionar o indicador fluorescente ca2+, considere diferentes fatores, incluindo a forma indicadora, que influencia o método de carregamento celular, o modo de medição (qualitativo ou quantitativo), e a constante de dissociação (Kd) que precisa estar na faixa de concentração ca2+ de interesse e depende de pH, temperatura, presença de Mg2+ e outros íons, bem como a ligação de proteínas. Como os sinais de Ca2+ celulares geralmente são transitórios, a constante de taxa de ligação Ca2+ também deve ser considerada. Para medir a dinâmica [Ca2+]IC em células pancreáticas, esse grupo utiliza principalmente o corante indicador Ca2+ permeável celular descrito neste protocolo (Tabela de Materiais), pois é um indicador de comprimento de onda longo com os comprimentos de onda de emissão no espectro onde a autofluorescência celular é geralmente menos problemática, e a energia da luz de excitação é baixa, o que reduz o potencial de fotodamagem celular. Como este corante é fluorescente em baixas concentrações ca2+, isso facilita a determinação da linha de base [Ca2+]IC e aumenta a visibilidade celular antes da estimulação. Após a ligação de Ca2+, a intensidade de fluorescência do corante aumenta 14 vezes, permitindo a detecção de mesmo pequenas alterações no IC [Ca2+].
Para uma imagem de cálcio com células vivas bem sucedidas, vários parâmetros cruciais de hardware precisam ser considerados, conforme descrito na seção de protocolo. Para imagens de células vivas, onde as amplitudes de sinal são baixas e as chances de fototoxicidade são altas, os objetivos com uma NA mais alta são de preferência usados para coletar mais luz do espécime. Se a dinâmica do cálcio deve ser registrada com uma alta resolução temporal, use o scanner ressonante em vez de galvanizômetros lineares. Além de escolher o objetivo certo, o uso de detectores altamente sensíveis – como detectores híbridos que requerem menos energia a laser evita fototoxicidade e fotobleaching. Isso é de especial importância para imagens de cálcio de longa duração. Outros passos importantes na imagem de cálcio são as configurações de parâmetros de qualidade de imagem para aquisições em séries temporizais. O mais importante é o temporal e a resolução espacial. Como a dinâmica do cálcio em si determina a menor resolução temporal aceitável, a taxa de amostragem precisa ser pelo menos duas vezes maior do que a frequência de sinal esperada para detectar o sinal ou até mesmo 10 vezes maior para detectar a forma do sinal de forma confiável. Em fatias agudas de tecido pancreático, a dinâmica do cálcio pode ser medida em centenas de células simultaneamente e, portanto, a resolução espacial também é importante. Isso pode ser melhorado aumentando o número de pixels ou aumentando a média da linha durante a aquisição ao vivo. No entanto, devido à relação inversa entre o espaço e a resolução temporal, é necessária uma troca entre ambas as configurações.
Se a imagem de cálcio tiver que ser realizada em uma população celular específica dentro do pâncreas, é necessário um estímulo capaz de diferenciar funcionalmente as células dentro da fatia. A alta glicose ativa as células beta de forma confiável e rápida para um padrão oscilatório que é sobreposto a um nível elevado de cálcio e é altamente sincronizado entre todas as células dentro de umailhota 32,58,70. As células beta são o tipo de célula mais numerosa dentro de uma ilhota e estão localizadas principalmente no núcleo da ilhota em camundongos. O mesmo protocolo de estimulação diminui e, às vezes, não altera consideravelmente o estouro em células alfa 30,32,58,70,71,72. Para discriminar as células alfa funcionalmente, a baixa (3 mM) glicose, glutamato ou adrenalina podem ser usadas para aumentar sua frequência ou basal [Ca2+]IC 21,72,73,74,75. Eles representam 10-20% das células ilhotas e serão detectados na periferia da ilhota1. Células delta também são encontradas na periferia. Eles compõem apenas ~5% do número total de células endócrinas em uma ilhota e são tipicamente ativos em glicose de 6 mM e respondem à estimulação de glicose com uma atividade de estouro irregular aumentada da linha de base ou um nível de cálcio ligeiramente elevado 1,32,71,76. A grelina pode ser usada para estimulação específica de células delta 21,77,78,79 em experimentos de imagem de cálcio. No entanto, ainda estão a ser definidos protocolos para identificação funcional específica de células PP e epsilon. Além disso, 25 nM acetilcolina ativa de forma confiável as células acinar em atividade de estouro 35,80,81. Além disso, uma série de outras secretagogues, como ceruleina, colecistocina e carbamylcolina, podem ser usadas para evocar respostas de cálcio em células acinar 22,40,82,83.
Finalmente, 1 mM ácido chenodeoxíclico evoca de forma confiável as respostas de cálcio em células ductais em fatias de tecido; angiotensin II, ATP e alguns outros secretagogues também podem ser usados 11,23,84,85. Sempre que uma identificação funcional baseada em respostas características a secretagogues e inibidores específicos não é suficiente, animais geneticamente rotulados31, células transfeinadas73 ou imunocytoquímica podem ser empregados para a identificação de diferentes tipos celulares 9,22,71,86 . Nos últimos dois anos, o método de fatia de tecido foi adaptado com sucesso ao tecido humano, abrindo muitas novas importantes vias de pesquisa tanto na exocrina41 quanto na fisiologia endócrina 9,36,37,39. Curiosamente, uma avaliação detalhada da dinâmica do cálcio nas ilhotas humanas tem sido notoriamente difícil e continua a ser investigada com maior detalhe87. Combinado com a microscopia confocal avançada, o método de fatia de tecido pancreático permitiu muitas novas percepções sobre a dinâmica do cálcio em camundongos e, esperançosamente, fará o mesmo para o tecido humano.
The authors have nothing to disclose.
O trabalho apresentado neste estudo foi apoiado financeiramente pela Agência de Pesquisa eslovena (núcleo de pesquisa nos. P3-0396 e I0-0029, bem como projetos de pesquisa nos. J3-9289, N3-0048 e N3-0133) e pelo Fundo austríaco de Ciência / Fonds zur Förderung der Wissenschaftlichen Forschung (bolsas bilaterais I3562-B27 e I4319-B30). Agradecemos a Maruša Rošer, Maša Čater e Rudi Mlakar pela excelente assistência técnica.
Equipment | |||
Analytical balance KERN ALJ 120-4 | KERN & SOHN GmbH | ALJ 160-4A | |
Confocal microscope Leica TCS SP5 II Upright setup | Leica | 5100001578 | |
Confocal microscope Leica TCS SP5 AOBS Tandem II setup | Leica | ||
Cork pad 15 cm x 15 cm | |||
Corning 15 mL centrifuge tubes | Merck KGaA, Darmstadt, Germany | CLS430790 | |
Corning Round Ice Bucket with Lid, 4 L | Fischer Scientific, Leicestershire, UK | 432124 | |
Double edge razor blade | Personna, USA | ||
Dumont #5 – Fine Forceps | FST, Germany | 11254-20 | |
Eppendorf Safe-Lock Tubes 0.5 mL | Eppendorf | 0030 121.023 | |
Erlenmeyer flask 200 mL | IsoLab, Germany | 027.01.100 | |
Fine Scissors – ToughCut | FST, Germany | 14058-11 | |
Flat orbital shaker IKA KS 260 basic | IKA | Ident. No.: 0002980200 | |
Glass lab bottle 1000 mL | IsoLab, Germany | 091.01.901 | |
Hartman Hemostat, curved | FST, Germany | 13003-10 | |
HCX APO L 20x/1.00 W HCX APO L (water immersion objective, 20x, NA 1.0) | Leica | 15507701 | |
Measuring cylinder 25 mL | IsoLab, Germany | 015.01.025 | |
Micromanipulator Control box SM-7, Keypad SM-7 | Luigs & Neumann | 200-100 900 7311, 200-100 900 9050 | |
Microwave owen | Gorenje, Slovenia | MO20MW | |
Osmometer Gonotec 010 | Gonotec, Berlin, Germany | OSMOMAT 010 Nr. 01-02-20 | |
Paint brush | Faber-Castell, No.2 | Any thin soft round paint brush No.2, preferably black | |
Paper towels | |||
Perifusion pumps | Ismatec | ISM 827 | Reglo Analog MS – 4/8 |
Petri dish 100/20 mm | Sarstedt | 83.3902 | |
Petri dish 35/10 mm | Greiner bio-one | 627102 | |
Petri dish 35 x 10 mm Nunclon Delta | Thermo Fischer Scientific, Waltham, MA USA | 153066 | NON-STICKY for agarose blocks |
pH meter inoLab pH Level 1 | WTW, Weilheim, Germany | E163694 | |
Pipette 1000 mL | Eppendorf | 3121 000.120 | |
Pipette 50 mL | Eppendorf | 3121 000.066 | |
Push pins 23 mm | Deli, Ningbo, China | E0021 | |
Screw cap tube, 15 mL | Sarstedt | 62.554.502 | |
Semken Forceps | FST, Germany | 11008-13 | |
Stabilizing ring for Erlenmeyer flask | IsoLab, Germany | 027.11.048 | |
Stereomicroscope Nikon SMZ 745 | Nikon, Melville, NY USA | ||
Syringe Injekt Solo 5 mL | Braun, Melsungen, Germany | 4606051V | |
Syringe needle 0.30 x 12 mm (30 G x 1/2") | Braun, Melsungen, Germany | 4656300 | |
Temperature controller | Luigs & Neumann | 200-100 500 0150, 200-150-500-145 | Slice mini chamber, Temperature controller TC 07 |
Tubings for perifusion system | Ismatec | SC0310 | Ismatec Pharmed 1.14 mm(ID) + silicone tubing 1.0 (ID) x 1.8 mm(OD) |
Ultrasonic bath Studio GT-7810A | Globaltronics | ||
Vibrotome Leica VT 1000 S | Leica, Nussloch, Germany | 14047235613 | |
Volumetric flask 1000 mL | IsoLab, Germany | 013.01.910 | |
Vortex mixer Neolab 7-2020 | Neolab | 7-2020 | |
Water bath Thermo Haake open-bath circulator | Thermo Fisher Scientific | Z527912 | |
Material/Reagent | |||
Calcium chloride dihydrate – CaCl2.2H2O | Sigma Aldrich, Germany | C5080-500G | |
D-(+)-glucose | Sigma Aldrich, Germany | G8270-1KG | |
Dimethyl sulfoxide | Sigma Aldrich | D4540-100ML | |
DL-lactic acid | Sigma Aldrich, Germany | L1250-500ML | |
Dulbecco’s Phosphate Buffered Saline | Merck KGaA, Darmstadt, Germany | D8662-500ML | |
Gas mixture containing 95% O2 and 5% CO2 at barometric pressure | |||
Glue Wekem sekundenkleber WK-110 | Wekem GmbH, Bergkamen, Germany | WK 110-020 | |
HEPES | Sigma Aldrich, Germany | H3375-250G | |
L-(+)-ascorbic acid | Sigma Aldrich, Germany | A9,290-2 | |
LIVE/DEAD Viability/Cytotoxicity Kit, for mammalian cells | Thermo Fischer Scientific, Waltham, MA USA | L3224 | |
Magnesium chloride hexahydrate – MgCl2.2H2O | Sigma Aldrich, Germany | M2670-500G | |
Myo-inositol | Sigma Aldrich, Germany | I5125-100G | |
Oregon Green 488 BAPTA-1, AM | Invitrogen (Thermo FisherScientific) | O6807 | cell-permeable Ca2+ indicator (excitation/emission: 495/523 nm) |
Pluronic F-127 (20% Solution in DMSO) | Invitrogen (Thermo Fisher Scientific) | P3000MP | polaxamer: nonionic triblock copolymer |
Potassium chloride – KCl | Sigma Aldrich, Germany | 31248 | |
SeaPlaque GTG agarose | Lonza, Rockland, USA | 50111 | |
Sodium bicarbonate – NaHCO3 | Honeywell, Germany | 31437-500G | |
Sodium chloride – NaCl | Honeywell, Germany | 31434-1KG | |
Sodium hydroxide – NaOH | Sigma Aldrich, Germany | 30620 | |
Sodium phosphate monobasic- NaH2PO4 | Sigma Aldrich, Germany | S0751-500G | |
Sodium pyruvate | Sigma Aldrich, Germany | 15990-100G | |
Software | |||
FIJI | FIJI is an open source project | ||
LASAF | Leica microsystems, Inc. | ||
Matlab | Mathworks | ||
Python | Python Software Foundation | Python is an open source project |