Bu makale, farelerde yatay hipokampal beyin dilimleri elde etmek için sistematik bir protokolü tanımlamayı amaçlamaktadır. Bu metodolojinin amacı, dentat girus ile ilgili nörolojik süreçleri değerlendirmek için perforant yol ve yosunlu lif yolu gibi hipokampal lif yollarının bütünlüğünü korumaktır.
Hipokampus, beyinde limbik sistemin bir parçası olan ve alzheimer hastalığı ve epilepsi de dahil olmak üzere ağır beyin bozukluklarının tezahürünün yanı sıra hafıza oluşumu ve konsolidasyonunda yer alan son derece organize bir yapıdır. Hipokampus, iç ve dış beyin yapıları ile uygun bir iletişimi güvence altına alarak yüksek derecede bağlantı içi ve ara bağlantı alır. Bu bağlantı, fiber yollar şeklinde farklı bilgi akışları ile gerçekleştirilir. Beyin dilimleri hipokampüsün nörofizyolojik fonksiyonlarını keşfederken sıkça kullanılan bir metodolojidir. Hipokampal beyin dilimleri, elektrofizyolojik kayıtlar, hafif mikroskobik ölçümlerin yanı sıra çeşitli moleküler biyolojik ve histokimyasal teknikler de dahil olmak üzere birkaç farklı uygulama için kullanılabilir. Bu nedenle, beyin dilimleri protein fonksiyonlarını değerlendirmek, nörolojik bozukluklarda yer alan patofizyolojik süreçleri araştırmak ve ilaç bulma amacıyla ideal bir model sistemi temsil eder.
Dilim hazırlamanın birkaç farklı yolu vardır. Vibratomlu beyin dilimi preparatları, doku yapısının daha iyi korunmasını sağlar ve dilimleme sırasında yeterli oksijen kaynağını garanti eder, bu da bir doku helikopterinin geleneksel kullanımına göre avantajlar sunar. Ayrıca vibratom beyin dilimi preparatları için farklı kesme düzlemleri uygulanabilir. Burada, fare beyinlerinin vibratom kesimli yatay hipokampal dilimlerinin başarılı bir şekilde hazırlanması için ayrıntılı bir protokol sağlanmaktadır. Diğer dilim preparatlarının aksine, yatay dilimleme, hipokampal giriş yolunun liflerini (perforant yol) bir dilim içinde tamamen bozulmamış bir durumda tutmaya izin verir, bu da entorhinal-hipokampal etkileşimlerin araştırılmasını kolaylaştırır. Burada, murine beyninin diseksiyonu, ekstraksiyonu ve akut yatay dilimlemesi için kapsamlı bir protokol sunuyoruz ve bu tekniğin zorluklarını ve potansiyel tuzaklarını tartışıyoruz. Son olarak, diğer uygulamalarda beyin dilimlerinin kullanımı için bazı örnekler göstereceğiz.
Hipokampüsün kapsamlı keşfi, Scoville ve Milner’ın şiddetli epilepsi tedavisi olarak hipokampus ve yakındaki temporal lob yapılarının cerrahi olarak çıkarılmasından sonra bir hastanın (H.M.) yeni, bildirimsel hafıza oluşturamadığı bildirildiğinde başladı1. O andan itibaren, hipokampus genel nöronal özelliklerden ve işlevlerden başlayarak epilepsi ve Alzheimer hastalığı 2 ,3,4,5gibi ağır beyin bozukluklarının gelişimine kadar kapsamlı bir şekilde incelenmiştir. Hipokampus, duygu ve hafıza oluşumunda yer alan bir grup ilgili beyin yapısından oluşan limbik sistemin bir parçasıdır6,7. Birkaç fiber yoldan oluşan yoğun bir ağ, iç ve dış beyin yapılarına sıkı bir hipokampal bağlantı sağlar. Bu yollar medial ve lateral perforant yolu (girus, CA3 – CA1 ve subiculum dentate için entorhinal korteks)8,yosunlu lif yolu (dentat girus CA3)9 ve Schaffer kollateral/derneksel komiser yolu (CA3 ila CA1)10 (Şekil 1). Hipokampus, nöronal tabaka oluşumunun yüksek oranda korunmuş laminar organizasyonu ve hayati nöronal kültürleri ve beyin dilimlerini göreceli kolaylıkla elde etme imkanı nedeniyle şimdiye kadar en geniş olarak keşfedilen beyin alanlarından birini sunar5.
Şekil 1: Farklı hipokampal bölgeleri ve ana lif yollarını gösteren karikatür. Farklı hipokampal bölgeler düz renkli çizgilerle belirtilir: entorhinal korteks (EC; siyah), dentat girus (DG; turuncu), Cornu Ammonis (CA) 3 (siyan), 2 (sarı) ve 1 (macenta) ve subikülum (yeşil). Lif yolları renkli noktalı bir çizgi ile gösterilir: medial (MPP, kırmızı) ve lateral perforant yolu (LPP, mavi) (entorhinal korteksten dentat girusa, CA3, CA1 ve subiculum), yosunlu lif yolu (MF, mor) (dentat girusundan CA3’e) ve Schaffer teminatı (SC, kahverengi) (CA3’ten CA1’e kadar ipsilateral)/ilişkisel komiserlik yolları (AC, açık yeşil) (CA3’ten CA1’e karşıt). Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.
Beyin dilimi protokolleri genellikle daha uzak beyin bölgelerinden ilgi alanına bağlantıların kaybolmasına neden sonuçlanır5. Ayrıca, kılcal damarlar artık işlevseldeğildir 5 ve kan dolaşımı11. Bu sınırlamalara rağmen, beyin dilimleri bir dizi avantaj nedeniyle hipokampüsün nörofizyolojik işlevlerinin araştırılması için hala kullanılmaktadır. İlk olarak, hipokampüsün ekstraksiyonu hızlı12’dir ve çok fazla malzeme gerektirmez. Tek temel aletler arasında diseksiyon kiti, laboratuvar su banyosu, karbojene erişim ve titreşimli mikrotom (vibratom)13bulunur. Beyin dilimi tekniğinin diğer varlıkları, kan-beyin bariyerinin (BBB) atlatılması ve deney başlamadan önce endojen olarak salınan moleküllerinyıkanmasıdır 5, bu da nispeten hassas dozaj kontrolü ile ilaçların etkisini incelemeyi mümkün kılar14. Ayrıca, beyin dilimleri hipokampus15,16içindeki sito mimarisini ve sinaptik devreleri korur Nöroanatomi ve nöronal bağlantı ve karmaşık nöron-glia etkileşimleri ile yerel çevre4,11,17korunur. Ek olarak, hipokampal lif bağlantıları ağırlıklı olarak tek yönlüdür ve hipokampal nöronlar, nörolojik süreçleri anlamak için yüksek kaliteli elektrofizyolojik kayıtların toplanmasını ve yorumlanmasını muazzam derecede basitleştiren yüksek sinaptik plastisiteye sahiptir18,19. Daha da önemlisi, beyin dilimleri, moleküler biyolojik tekniklerden görüntüleme kayıtlarına kadar elektrofizyolojik ölçümlere kadar çok çeşitli bilimsel tekniklerde uygulanabilir değerli bir varlık sunar12,20,21,22,23,24,25,26.
Yukarıda özetlendiği gibi, hipokampal beyin dilimleri sinaptik bağlantının yapısal ve fonksiyonel özelliklerini incelemek için güçlü bir deneysel araç sunar. Bu, kimyasalların veya mutasyonların nöronal genişletilebilirlik ve plastisite üzerindeki etkilerini değerlendirme fırsatı sunar16.
Akut beyin dilimi preparatları nispeten hassas bir teknik sunuyor ve optimal dilim kalitesi, hayvanın yaşı, ötanazi yöntemi, diseksiyon ve dilimleme hızı, dilimleme çözeltileri ve parametreleri (örneğin, dilimleme hızı) ve dilim kurtarma koşulları da dahil olmak üzere ideal deneysel koşullara oldukça bağlıdır4. Bu nedenle, iyi tasarlanmış bir protokol son derece önemlidir ve farklı araştırma birimlerinde tekrarlanabilirliği güvence altına13.
Burada, hipokampal lateral ve medial perforant yolun bütünlüğünü ve yosunlu lif yolunu korumak amacıyla akut yatay hipokampal dilim preparatları için ayrıntılı bir protokol sunuyoruz, dentat girus ile ilgili süreçlerin araştırılmasına izin veriyoruz9. Temel koşullar altında ve vahşi tip C57BL/6J farelerdeki beyin dilimlerinde LTP indüksiyon protokolleri sırasında kalsiyum-mikroflüorimetrik kayıtların ve alan uyarıcı postsinaptik potansiyel kayıtların (fEPSP’ ler) temsili sonuçlarının ardından, murine beynini parçalamak, ayıklamak ve yatay olarak dilimlemenin temel adımlarını ayrıntılı olarak açıklayacağız.
Nörobilim topluluğu arasında yaygın olarak kullanılmasına rağmen, beyin dilimi preparatları da çeşitli dezavantajlarla karşı karşıyadır. Örneğin, ilgi çekici beyin alanlarına giriş ve çıkış bağlantıları artık bir beyin diliminde bağlı değildir. Ayrıca, izole edildikten sonra, doku zamanla yavaşça bozulmaya başlar ve bu işlem beyin diliminin fizyolojik koşullarını değiştirebilir. Özellikle bu konu çok endişe vericidir, çünkü çoğu beyin dilimi kaydı birkaç dakika ila saatler sürer, bu da deney başlamadan önce 6-8 saate kadar izole edilen doku üzerinde gerçekleştirilen kayıtlarla uzun deneysel günlerle sonuçlanır. Ayrıca, beyin omurilik sıvısı ve kan dolaşımı dilim preparatları sırasında kesilir ve bu da bir beyin dilimi içinde önemli endojen bileşiklerin olmamasına neden olabilir. Ve en açık şekilde, dilimleme prosedürünün kendisi elde edilen sonuçları tehlikeye atabilecek mekanik doku hasarına neden olabilir. Bununla birlikte, beyin dilimi preparatlarının gerçek yararları hala dezavantajlarından daha ağır basmaktadır, bu yüzden nörobilim araştırmalarında çok değerli ve kullanılan bir teknik sunarlar.
Akut hipokampal beyin dilimleri, nöronal süreçleri moleküler düzeyden karmaşık beyin devresi çalışmalarına kadar araştırmak için güçlü ve bu nedenle yaygın olarak kullanılan bir teknik sunar. Bu, bir dilim hazırlamada kolayca korunabilen hipokampüsün ideal nöroanatomisini temel18. Sonuç olarak, hipokampal beyin dilimleri, ilaç taramaları17, bilişsel işlevlerde yer alan nöronal ve sinaptik özelliklerin çalışmaları40 , 41ve patolojik beyin durumlarının araştırılması14,42,43dahil olmak üzere çok çeşitli bilimsel araştırma projelerinde kullanılmaktadır. Bununla birlikte, geniş bir farklı uygulama yelpazesi, diğerlerinin yanı sıra diseksiyon koşulları ve kesme düzlemi yönlendirmesi gibi çeşitli parametrelerde farklılık gösterebilen çok çeşitli kullanılabilir dilim hazırlama protokollerine de neden olur. Bu nedenle, uygun bir dilim hazırlama protokolünün seçilebilmesi için bilimsel bir projenin tam araştırma sorusunun belirlenmesi gerekir.
Doku helikopteri hipokampal beyin dilimlerini hazırlamak için kullanılan en eski tekniklerden birini sunar44,45. Bu hazırlık yönteminin en büyük avantajları arasında helikopterin düşük maliyeti ve hızlı ve kolay kullanımı46. Bununla birlikte, doku helikopterleri morfolojik değişikliklere ve hücre ölümüne neden olan mekanik strese neden olur47. Buna karşılık, vibratom oldukça pahalı bir makinedir ve dilim hazırlama süresi önemli ölçüde artar ve bu da dilimin kalitesi üzerinde bir etkiye sahip olabilir. Bununla birlikte, vibratom genellikle dilimleri dokudan ayırmak için daha yumuşak bir şekilde sunar ve beynin tüm izolasyon prosedürü boyunca güzelce soğutulmasını ve oksijenlenmesini sağlar, böylece dilim özelliklerini geliştirir46. Bu nedenle, birkaç grup bu tekniği standart olarak kullanmaktadır ve vibratom16,30,48 kullanılarak akut hipokampal beyin dilimlerinin hazırlanması için protokollergetirmiştir. Bazı protokoller dilimlemenin kendisi için sadece birkaç ayrıntı sağlarken, bunun yerine bu tür dilim hazırlığının belirli bir uygulamasına odaklanır48, diğerleri bu maddede verilen kesme düzlemi veya diğer protokol ayrıntılarında (örneğin, agarose gömme veya dilimleme / kurtarma çözümleri) farklılık gösteren ayrıntılı dilim protokolleri sağlar27,30.
Burada açıklanan protokol, genç hayvanlardan yüksek kaliteli akut yatay hipokampal fare beyin dilimleri hazırlamak için basit bir yöntem sunar. Protokol, entorhinal korteksten hipokampus8,49,50‘ye kadar projelenen hipokampal giriş yolunu sunan perforant yolu (medial ve lateral) korumak için özellikle yararlıdır. Sagittal, koronal ve izole hipokampus enine dilim preparatları, çoğunlukla entorhinal korteksin Katman II ve V’sinden kaynaklanan ve hipokampus18içindeki çeşitli alanlara projelenen perforant yolu düzgün bir şekilde korumaz. Entorhinal korteksin hipokampusa göre anatomik olarak konumlandırılması nedeniyle, yatay beyin dilimleri, dilim hazırlığı içinde tamamen bozulmamış perforant yol liflerini korumak için bir gerekliliktir31. Ek olarak, yatay dilimleme ideal olarak dentat girusundan hipokampus 9,30,50içindekiCA3nöronlarına kadar projelendirici yosunlu lifleri korur. Bu nedenle, bu hazırlık yöntemi hipokampal giriş yollarını ve DG ile ilgili süreçleri araştıran çalışmalar için yüksek değerlidir. Ek olarak, bu protokol Schaffer teminat yolunun araştırılmasına izin verir50. Bununla birlikte, sagittal ve koronal beyin dilimi preparatları, CA3 ila CA1 lif projeksiyonları araştırılırken, muhtemelen yüksek kaliteli dilimler elde etme şansını artırabilecek biraz daha hızlı hazırlık süreleri nedeniyle daha yaygın olarak kullanılmaktadır. Bununla birlikte, yatay hipokampal dilim preparatları, tek dilim yarımküre içindeki tüm hipokampal lif yollarının korunmasına ve araştırılmasına izin verdiğinden güçlü bir araştırma aracı sunar. Bu, özellikle devre yanıtları incelendiğinde, örneğin çoklu elektrot tahlil kayıtlarında yararlı olabilir.
Beyin dilimleri hazırlanırken önemli bir endişe, beyin dokusunun uygun şekilde korunmasıdır. Bu, hızlı bir diseksiyon, dokunun sürekli ve yeterli oksijenlenmesi ve soğutulması ve düşük sodyumlu, yüksek sakkaroz dilimleme çözeltisi39,51ile koruyucu kesme yöntemi kullanılarak beyin dokusunun korunması dahil olmak üzere protokolümüzdeki birkaç kritik adımla gerçekleştirilir. Burada açıklanan protokolün % 90 civarında bir başarı oranı vermesine rağmen, yaşlı veya genetik olarak çeşitli hayvanlardan elde edilen dokularla çalışırken veya belirli bir hücre popülasyonu korunmaya çalışırken potansiyel olarak ek koruyucu adımlar gerekebilir. Hassas beyin dokusu preparatlarını korumak için çeşitli yöntemler zaten bildirilmiştir. Bu yöntemler arasında sodyum geçirgenliğini azaltmak için NMDG bazlı dilimleme çözeltilerinin kullanılması52, NMDA reseptör aktivitesini engellemek için dilimleme çözeltisinde yüksek magnezyum seviyelerinin kullanılması53ve kurtarma süresi boyunca koruyucu çözeltilerin uzun süreli kullanımı23. Tüm bu önlemler eksotoksisitenin azalmasına neden olacaktır. Ek olarak, buz gibi koruyucu ACSF çözeltileri ile trans-kardiyak perfüzyon genellikle yaşlı hayvanlarla çalışırken kullanılır ve gereklidir27.
Akut hipokampal beyin dilimleri, nispeten kalın (300-500 μm) akut beyin diliminden elde edilebilen ve yüksek sinyalden gürültü oranı11’igaranti eden yüksek genlik sinyalleri gibi nedenlerle elektrofizyolojik çalışmalar için idealdir ve yaygın olarak kullanılır. Standart olarak kullanılan elektrofizyolojik uygulamalar arasında hücre dışı alan kayıtları ve gerilim veya akım kelepçe modunda hücre içi tam hücre kayıtları bulunur. Yüksek kaliteli elektrofizyolojik veriler elde etmek için, dilim sağlığı birincil endişe kaynağıdır ve sunulan protokole kesinlikle uyularak garanti edilebilir. Bununla birlikte, dilim preparatları son derece hassas bir teknik sunduğundan, her deney başlamadan önce rutin olarak bir kalite kontrolü eklenmelidir. Çeşitli parametreler dilimin kalite kontrolü olarak kullanılabilir ve standart olarak Giriş-Çıkış eğrileri ve temel fEPSP veya EPSC kayıtları19ile değerlendirilir. Bununla birlikte, yetersiz elektrofizyolojik özelliklerin elektrot konumlandırma, oryantasyon ve hatta hasar gibi deneysel hatalardan kaynaklanabileceği ve sadece hazırlanan dilimin sağlığını temsil etmediğini belirtilmelidir. Bu nedenle, basit görselleştirme ve hücrelerin 40x amaç veya DAPI çekirdeği boyama altında değerlendirilmesi gibi ek kalite kontrollerinin yapılması önerilir. Bu tür kalite kontrolleri, birkaç dilim hazırlama oturumu boyunca sabit dilim sağlığını onaylamak için kullanılabilir.
Kalsiyum mikroflüorimetrisi hipokampal beyin dilimlerini incelemek için daha az kullanılan bir teknik sunar. Bununla birlikte, bu teknik, nöronal ve sinaptik sinyalizasyonda yüksek öneme sahip hücre içi kalsiyum akılarını görselleştirmeye ve ölçmeye izin verdiği için standart hücre dışı ve hücre içi elektrot kayıtlarına ek değerdedir. Hücre içi kalsiyum konsantrasyonlarındaki değişiklikler nörotransmitter vezikül salınımı, postsinaptik potansiyel nesil, sinaptik plastisitenin düzenlenmesi ve aksonal sinir iletiminde rol oynar54,55,56. Bu tekniğin bir örneği olarak (Şekil 4), piyasada bulunan bir kalsiyum boyası kullandık. Tartışmasız, doku dilimlerinin kalsiyum boyalarla tedavisi, daha yüksek deneysel zaman diliminin yanı sıra alt konumdaki nöronal hücrelerin verimsiz yüklenmesi gibi zorluklar doğurabilir. Bununla birlikte, bu teknik teknik üzerindeki varyasyonlar bu teknik zorlukları atlatmak için kullanılabilir. Örneğin, kalsiyum ölçümlerini ve yama kelepçe kayıtlarını hipokampal dilimlerde birleştirmek mümkündür. Bu şekilde, bir kalsiyum floresan boyası yama pipet aracılığıyla belirli bir hücreye yüklenebilir ve belirli bir ilgi hücresindeki kalsiyum dinamiklerinin ölçülebilmesini sağlar57. Alternatif olarak, kalsiyum göstergesini ifade eden genetik olarak tasarlanmış hayvanlar, GCaMP58, tüm beyinde veya hücreye özgü bir promotör tarafından yönlendirilebilir. İlginçtir ki, GCaMP hayvanlarından gelen ve ilgi çekici bir proteine doğrudan bağlantı sağlayan beyin dokusu, nöronal ekspresyon modelini belirlemek veya kalsiyum kıvılcımlarına ve dalgalarına katılımı araştırmak için fırsatlar sağlayabilir.
Tamamen, elektrofizyolojik ve görüntüleme kayıtları için farelerden sağlıklı ve uygulanabilir yatay hipokampal beyin dilimlerinin başarılı bir şekilde hazırlanması için kılavuzlar sunuyoruz. Bu metodoloji, dentat girusunda tanımlanan beyin patolojilerinde meydana gelen nörolojik değişikliklere erişmek için çok yararlıdır.
The authors have nothing to disclose.
Dr. Keimpe Wierda ve Prof. Dr. Joris De Wit gözetimindeki VIB-KU Leuven Beyin ve Hastalık Araştırmaları Merkezi Elektrofizyoloji birimine araştırma olanaklarını kullandıkları için teşekkür ederiz. Ayrıca, KU Leuven’deki İyon Kanalı Araştırma Laboratuvarı ve Endometrium, Endometriozis ve Üreme Tıbbı Laboratuvarı’nın tüm üyelerine yararlı tartışmaları ve yorumları için teşekkür ederiz.
Bu proje Araştırma Vakfı-Flanders (G.084515N ve G.0B1819N’den J.V.’ye) ve KU Leuven Araştırma Konseyi’nden (C1-funding C14/18/106 to J.V.) fon almıştır. K.P. bir FWO [PEGASUS]2 Marie Skłodowska-Curie Fellow ve Araştırma Vakfı Flanders (FWO) (12T0317N) ile Marie Skłodowska-Curie hibe anlaşması (665501) kapsamında Avrupa Birliği’nin Horizon 2020 araştırma ve inovasyon programından fon aldı. K.H., Belçika Flanders Araştırma Vakfı’nın Doktora Sonrası Üyesidir (12U7918N).
Anesthesia chamber | home made – Generic | N/A | plexiglas |
Anesthesia vaporizer | Dräger & MSS International Ltd | Isoflurane Vapor 19.3 & MSS Isoflurane | to vaporize isoflurane for rodent anesthetization |
Barrels for the perfusion system | TERUMO | Hypodermic syringes without needle | https://www.terumotmp.com/products/hypodermics/terumo-hypodermic-syringes-without-needle.html |
Bicuculline methiodide | hellobio | HB0893 | https://www.hellobio.com/bicuculline-methiodide.html |
Borosilcate glass capillaries | Science Products | GB150F-8P | https://science-products.com/en/shop/micropipette-fabrication-1/capillary-glass-for-micropipette-pullers/borosilicate-glass-capillaries/borosilicate-filament-polished |
Calcium chlorid dihydrate | Merck | 102382 | https://www.merckmillipore.com/BE/en/product/Calcium-chloride-dihydrate,MDA_CHEM-102382?ReferrerURL=https%3A%2F%2Fwww.google.com%2F |
Calcium Imaging software | Till Photonics | LiveAcquisition v2.3.0.18 | |
Carbogen tank | Air Liquide | Alphagaz mix B50 | Gasmixture CO2/O2: 5/95, purity 5 |
Cluster microelectrode | FHC | CE2C55 | https://www.fh-co.com/product/cluster-microelectrodes/ |
Culture dish (35 mm) | Corning Life Sciences | 353001 | https://ecatalog.corning.com/life-sciences/b2c/US/en/Cell-Culture/Cell-Culture-Vessels/Dishes%2C-Culture/Falcon®-Cell-Culture-Dishes/p/353001 |
Culture dish (90 mm) | Thermo Fisher Scientific | 101VR20 | https://www.thermofisher.com/order/catalog/product/101R20#/101R20 |
Curved forceps | Fine Science tools | 11270-20 | https://www.finescience.de/de-DE/Products/Forceps-Hemostats/Dumont-Forceps/Dumont-7b-Forceps/11270-20 |
D-AP5 | hellobio | HB0225 | https://www.hellobio.com/dap5.html |
D-(+)-Glucose monohydrate | Sigma Aldrich | 16301 | https://www.sigmaaldrich.com/catalog/product/sial/16301?lang=en®ion=BE |
Digital CMOS camera | HAMAMATSU | ORCA-spark C11440-36U | https://www.hamamatsu.com/eu/en/product/type/C11440-36U/index.html |
Dissection scissors | Fine Science tools | 14058-09 | https://www.finescience.de/de-DE/Products/Scissors/Standard-Scissors/Fine-Scissors-ToughCut®/14058-09 |
DNQX | hellobio | HB0262 | https://www.hellobio.com/dnqx-disodium-salt.html |
EMCCD camera | Andor | iXon TM + DU-897E-CSO-#BV | https://andor.oxinst.com/products/ixon-emccd-cameras?gclid=CjwKCAjw97P5BRBQEiwAGflV6ULsKjXfhN2YZxtvsWAmF4QghyXZKuqYHVMa6KU9JyS80ATQkSKeBBoCIM0QAvD_BwE |
EPC10 USB Double Patch Clamp Amplifier | HEKA Elektronik | 895278 | https://www.heka.com/sales/brochures_down/bro_epc10usb.pdf |
Filter paper | VWR | 516-0818 | grade 413 |
Fine brush | Raphael Kaerell | 8204 | Size #1 |
18G needle | Henke Sass Wolf Fine-Ject | 18G X 1 1/2" 4710012040 | https://www.henkesasswolf.de/cms/de/veterinaer_produkte/produkte_vet/einmalkanuelen/hsw_henke_ject_einmalkanuelen/ |
Isoflurane | Dechra Veterinary Products | Iso-Vet 1000mg/g | 250 ml bottle |
Loctite 406 | Henkel Adhesive technologies | Loctite 406 | Super glue |
Magnesium sulfate heptahydrate | Merck | 105886 | https://www.merckmillipore.com/BE/en/product/Magnesium-sulfate-heptahydrate,MDA_CHEM-105886?ReferrerURL=https%3A%2F%2Fwww.google.com%2F |
Micromanipulator | Luigs & Neumann | SM-10 with SM-7 remote control system | https://www.luigs-neumann.org |
Microscope (for calcium imaging) | Olympus | BX51WI | https://www.olympus-lifescience.com/de/microscopes/upright/bx61wi/ |
Microscope (for ephys recordings) | Zeiss | Axio Examiner.A1 | https://www.micro-shop.zeiss.com/de/de/system/axio+examiner-axio+examiner.a1-aufrechte+mikroskope/10185/ |
Microscope light source | CAIRN Research | dual OptoLed power supply | https://www.cairn-research.co.uk/product/optoled/ |
Monochromator | Till Photonics | Polychrome V | |
N-Methyl-D-aspartic acid (NMDA) | Sigma Aldrich | M3262 | https://www.sigmaaldrich.com/catalog/product/sigma/m3262?lang=en®ion=BE |
Oregon Green® 488 BAPTA-1 | Invitrogen Molecular Probes | #06807 | 10x50ug |
Osmometer | Wescor | 5500 vapor pressure osmometer | to verify osmolarity of salt solutions |
Peristaltic pump | Thermo Fisher Scientific | Masterflex C/L 77120-62 | https://www.fishersci.be/shop/products/masterflex-peristaltic-c-l-dual-channel-pump-2/p-8004229 |
pH meter | WTW | inoLab series pH 720 | https://www.geminibv.nl/wp-content/uploads/manuals/wtw-720-ph-meter/wtw-inolab-ph-720-manual-eng.pdf |
Pipette puller | Sutter Instrument | P-1000 | https://www.sutter.com/MICROPIPETTE/p-1000.html |
Potassium chlorid | Chem-lab | CL00.1133 | https://www.chem-lab.be/#/en-gb/prod/1393528 |
Potassium dihydrogen phosphate | Merck | 104873 | https://www.merckmillipore.com/BE/en/product/Potassium-dihydrogen-phosphate,MDA_CHEM-104873?ReferrerURL=https%3A%2F%2Fwww.google.com%2F |
Razor blade to prepare hemispheres | SPI supplies | Safety Cartridge Dispenser – Pkg/10 | GEM Scientific Single Edge Razor Blades |
Razor blade for vibratome | Ted Pella Inc | 121-6 | double edge breakable style razor blades (PTFE-coated stainless steel) |
Recovery chamber | home made – Generic | N/A | to collect and store brain slices in (see details in manuscript) |
Scissors | Any company | N/A | Blade should be well sharpened and at least 15 cm long for easy decapitation |
Silver electrode wire | Any company | for recording and reference electrodes | |
Sodium dihydrogen phosphate dihydrate | Merck | 106342 | https://www.merckmillipore.com/BE/en/product/Sodium-dihydrogen-phosphate-dihydrate,MDA_CHEM-106342?ReferrerURL=https%3A%2F%2Fwww.google.com%2F |
Sodium hydrogen carbonate | Alfa Aesar | 14707 | https://www.alfa.com/en/catalog/014707/ |
Sodium chlorid | Fisher Scientific | S/3160/60 | https://www.fishersci.co.uk/shop/products/sodium-chloride-certified-ar-analysis-meets-analytical-specification-ph-eur/10428420 |
Software for field recordings | HEKA Elektronik | PatchMaster | https://www.heka.com/downloads/software/manual/m_patchmaster.pdf |
Spatula | Sigma Aldrich | S9147-12EA | https://www.sigmaaldrich.com/catalog/product/sigma/s9147?lang=en®ion=BE |
Stimulator | A.M.P.I | ISO-FLEX | http://www.ampi.co.il/isoflex.html |
Sucrose | VWR International Ltd. | 102745C | https://es.vwr-cmd.com/ex/downloads/magazine/lupc_userguide_uk.pdf |
Tubing for carbogen, perfusion and suction lines 1 | Warner Instruments | 64-0167 | Tygon tubing (TY-50) for standard valve systems |
Tubing for carbogen, perfusion and suction lines 2 | Fisher Scientific | 800/100/200 & 800/100/280 | Smiths Medical Portex Fine Bore LDPE Tubing |
Vacuum pump | home made – Generic | N/A | |
8 valve multi-barrel perfusion system | home made | N/A | consists of barrels, tubing and a self-made automated valve control (specifications of all purchased parts can be found in this Table) |
Magnetic valves (to control the perfusion lines) | NResearch Inc. | p/n 161P011 | https://nresearch.com/ |
Vibratome | Leica | 14912000001 | Semi-automatic vibrating blade microomei VT1200 |
Water bath | Memmert | WNB 7 | https://www.memmert.be/wp-content/uploads/2019/09/Memmert-Waterbath-WNB-7.en_.pdf |
Water purification system | Merck | Synergy millipore | to obtain highly purified water |
12-well plates | Greiner Bio-One | CELLSTAR, 665180 | http://www.greinerbioone.com/UserFiles/File/Catalogue%202010_11/UK/3680_005-Kapitel1_UK.pdf |