Dieses Protokoll wird bei der Etablierung und Aufrechterhaltung von gnotobitischen amerikanischen Kakerlaken (Periplaneta americana) verwendet, indem die Eierhüllen (Oothecae) vor dem Schlüpfen an der Oberfläche sterilisiert werden. Diese gnotobitischen Insekten enthalten ihre vertikal übertragenen Blattabacterium-Endosymbionten, haben aber axenische Eingeweide.
Gnotobitische Tiere sind ein leistungsfähiges Werkzeug für die Untersuchung von Kontrollen der Struktur und Funktion des Mikrobioms. Hier wird ein Protokoll für die Etablierung und Erhaltung von gnotobitischen amerikanischen Kakerlaken (Periplaneta americana )vorgestellt. Dieser Ansatz umfasst integrierte Sterilitätsprüfungen für die laufende Qualitätskontrolle. Gnotobitische Insekten werden hier als Kakerlaken definiert, die noch ihr vertikal übertragenes Endosymbiont (Blattabacterium) enthalten, aber keine anderen Mikroben haben, die sich normalerweise auf ihrer Oberfläche und in ihrem Verdauungstrakt befinden. Für dieses Protokoll werden Eihüllen (Oothecae) aus einer (nichtsterilen) Stammkolonie entfernt und oberflächensterilisiert. Nach dem Sammeln und Sterilisieren werden die Oothecae bei 30 °C für ca. 4-6 Wochen auf Brain-Heart Infusion (BHI) Agar inkubiert, bis sie schlüpfen oder aufgrund einer Kontamination entfernt werden. Geschlüpfte Nymphen werden in einen Erlenmeyerkolben überführt, der einen BHI-Boden, steriles Wasser und steriles Rattenfutter enthält. Um sicherzustellen, dass die Nymphen keine Mikroben beherbergen, die unter den gegebenen Bedingungen nicht auf BHI wachsen können, verwendet eine zusätzliche Qualitätskontrollmaßnahme Restriktionsfragmentlängenpolymorphismus (RFLP), um auf nicht-dosdosymbiotische Mikroben zu testen. Gnotobiotische Nymphen, die mit diesem Ansatz erzeugt werden, können mit einfachen oder komplexen mikrobiellen Gemeinschaften geimpft und als Werkzeug in Darmmikrobiomstudien verwendet werden.
Gnotobitische Tiere haben sich als unschätzbare Werkzeuge für Mikrobiomstudienerwiesen 1,2,3. Keimfreie und definierte Flora-Tiere haben die Aufklärung von Wirt-Mikroben-Interaktionen ermöglicht, einschließlich immunologischer Reaktionen des Wirts, der Epithelreifung des Darms und des Wirtsstoffwechsels1,4,5,6,7. Gnotobitische Tiere, die mit einer vereinfachten Gemeinschaft geimpft wurden, haben auch zu einem vollständigeren Verständnis der Mikroben-Mikroben-Interaktionen in einer Darmgemeinschaft beigetragen, insbesondere bei der Entschlüsselung von Kreuzfütterung und antagonistischen Beziehungen8,9,10,11. Das derzeit bevorzugte Modellsystem für Untersuchungen im Darmmikrobiom von Säugetieren ist das murine Modell. Während dieses System bei den oben beschriebenen Entdeckungen von entscheidender Bedeutung war, sind die damit verbundenen Kosten ein wesentliches Manko. Spezialisierte Ausrüstung und hochqualifizierte Techniker sind notwendig, um eine gnotobitische Einrichtung einzurichten und zu warten. Dies, in Kombination mit zusätzlicher Sorgfalt, die jedem Aspekt der gnotobitischen Tierpflege gewidmet werden muss, führt dazu, dass ein gnotobiotisches Tier zehn- bis zwanzigmal mehr kostet als ein Standardtiermodell12. Aufgrund hoher Kosten können sich viele Forscher möglicherweise kein gnotobiotisches Mausmodell leisten. Während murine Modelle die am weitesten verbreitete Wahl für Studien sind, die auf die menschliche Gesundheit übertragen werden sollen, gibt es immer noch viele physiologische und morphologische Unterschiede zwischen menschlichen und Mausdärmen13. Offensichtlich reicht kein singuläres Modell aus, um die ständig wachsende Anzahl von Fragen zu den vielen Aspekten des Darmmikrobioms zu beantworten.
Insektenmodelle sind aufgrund ihrer geringeren Wartungskosten im Vergleich zu Säugetierarten eine günstigere Alternative. Umfangreiche keimfreie und gnotobiotische Forschung an einer Vielzahl von Insektenarten hat zur Entwicklung mehrerer häufig verwendeter Modelle geführt. Mücken und Drosophila sind aufgrund ihrer Relevanz für globale Krankheiten und genetische Traktierbarkeit gängige Modelle für keimfreies Arbeiten14,15. Ein weiteres aufkommendes Modellsystem ist das der Honigbiene (Apis mellifera), da es für die Bestäubungs- und Sozialitätsforschungvon Bedeutung ist 16. Vielen dieser häufig verwendeten Insekten fehlt jedoch die taxonomische Komplexität, die in Säugetier-Darmgemeinschaften17beobachtet wird, was ihre Fähigkeit einschränkt, Interaktionen höherer Ordnung zu modellieren. Nicht nur, dass die gesamte Vielfalt der Mikroben, die im Darm von amerikanischen Kakerlaken gefunden werden, Säugetieren ähnlicher ist, sondern viele der im Kakerlakendarm vorhandenen Mikroben gehören zu Familien und Phyla, die häufig in der Darmmikrobiota von Säugetieren und Menschen gefunden werden18. Das Hinterdarm der Kakerlake ist auch funktionell analog zum Dickdarm von Säugetieren, da es sich um eine Fermentationskammer handelt, die dicht mit Bakterien gefüllt ist, um die Extraktion von Nährstoffen zu unterstützen19,20. Schließlich ermöglicht die Allesfresser-Natur von Kakerlaken eine Vielfalt von Diätregimen, die mit Diätspezialisten nicht möglich wären.
Amerikanische Kakerlaken können ein nützliches Modellsystem zum Verständnis der mikrobiellen Darmgemeinschaften in höheren Organismen sein, aber der Status der Kakerlake als Schädling macht dieses System auch für die Schädlingsbekämpfung relevant21. Die Nutzung grundlegender Kenntnisse über den Einfluss der Darmgemeinschaft auf die Gesundheit und Physiologie von Kakerlaken hilft bei der Entwicklung neuer Techniken zur Schädlingsbekämpfung.
Das Ziel dieser Methode ist es, eine umfassende Beschreibung der Etablierung und Aufrechterhaltung von gnotobitischen amerikanischen Kakerlaken (Periplaneta americana) zu skizzieren, aber dieses Protokoll könnte verwendet werden, um Nymphen jeder oviparen Kakerlake zu erzeugen. Es umfasst eine Methode zur effizienten, nichtinvasiven Sammlung reifer Oothekanen und eine zerstörungsfreie Technik zur Überwachung des gnotobitischen Status der Insekten22,23,24. Während frühere Methoden zur Erreichung und Aufrechterhaltung von gnotobiotischen Kakerlaken die Oothekasammlung23,24,25,26,27beschreiben, wird die Oothekareife entweder in Form von artspezifischen Hinweisen interpretiert (in Blattella germanica22,24,25) oder nicht explizit beschrieben27,28, was die Implementierung für diejenigen, die mit dem System nicht vertraut sind, erschwert. Da die hier beschriebene Methode natürlich fallengelassene Oothekanen verwendet, fehlt der Fehler, Eier vorzeitig zu entfernen. Dieses Protokoll enthält sowohl kulturabhängige als auch kulturunabhängige Methoden der Qualitätskontrolle, und die kulturabhängige Methode erfordert keine Opfer von Insekten. Schließlich führt diese Methode Informationen aus mehreren gnotobiotischen Kakerlakenstudien zusammen, um ein umfassendes Protokoll mit allen notwendigen Informationen zur Erreichung und Aufrechterhaltung von gnotobitischen Kakerlaken zu erstellen.
Andere Methoden, die die Erzeugung von gnotobitischen Kakerlaken beschreiben, beschrieben entweder nicht die Oothecae-Sammlung oder verwendeten Benchmarks, die für andere Kakerlakenarten spezifisch waren, um anzugeben, wann die Ootheken von der Mutter entfernt werdenkonnten23,25,26. Ursprünglich wurden Oothekane aus der Hackschnitzeleinstreuung in den Lagertanks gesammelt, was zu sehr niedrigen Lukenraten (~ 10%) im Vergleich zu nichtsterilisierten Oothecae (47%)29. Dies ist wahrscheinlich auf die Tatsache zurückzuführen, dass sich ungeschlüpfte Ootheken im Laufe der Zeit im Bestandskäfig ansammeln, und es gibt keine Möglichkeit, das Alter oder die Lebensfähigkeit der Ootheka zu überprüfen. Die Implementierung des Ansatzes der “Entbindungsstation” ermöglicht die Sammlung von frisch abgelagerten Oothekanen bekannten Alters. Dies erleichtert die experimentelle Planung weiter, da der Forscher wahrscheinliche Brutzeiten für einzelne Oothecae vorhersehen kann. Eine weitere Modifikation der ursprünglichen und veröffentlichten Protokolle umfasst die Inkubation von Ootheken und Nymphen in halbversiegelten Kammern, die auch eine übersättigte Natriumchloridlösung enthalten. Das Vorhandensein der Lösung hält eine relative Luftfeuchtigkeit von etwa 75%30aufrecht. Oothecae werden routinemäßig bei 30 °C inkubiert, was nachweislich die Anzahl der für die Inkubation erforderlichen Tage minimiert und gleichzeitig die Lebensfähigkeit der Embryonen und die Anzahl der pro Oothek produzierten Nymphen maximiert31. Nach dem Schlüpfen werden gnotobitische Nymphen routinemäßig auf dem Tisch bei Laborraumtemperatur und Umgebungsbedingungen kultiviert, obwohl feuchtigkeitsgesteuerte Kammern wiederum für kritische Experimente verwendet werden. Nach Feststellung dieser Veränderungen bei der Oothekasammlung und -inkubation stiegen die Schlupfraten auf etwa 41% (n = 51), ohne Ootheken, die aufgrund von Kontamination entfernt wurden. Ein möglicher Weg zur weiteren Optimierung der Lukenraten kann die Verlängerung der Zeit zwischen Oothekensammlung und Sterilisation sein. Die Nagelhaut des Eikoffers ist bei der ersten Freisetzung32möglicherweise nicht vollständig gebräunt und kann daher innerhalb von 24 h nach dem Fallen durchlässig für Lösungen sein, die während der Sterilisation verwendet werden.
Das Sterilisationsprotokoll mit 0,1% Peressigsäure wurde von Doll et al.25adaptiert. Andere Studien haben alternative Techniken zur Sterilisation von Oothecaedokumentiert 23,26. Die Kontaminationsraten basieren auf der zerstörungsfreien Methode der Inkubation der Oothecae auf einer BHI-Neigung. Dieser Ansatz ist sehr vorteilhaft, da er eine schnelle Identifizierung und Entfernung von kontaminierten Ootheken ermöglicht. Die meisten früheren Protokolle testen auf kultivierbare Organismen, indem Kot oder Nymphenhomogenat auf bakteriologischen Medien plattiert und auf Wachstum überprüft wird22,23,25,27,28,33. In mindestens einem Fall wurde die Methode zur Prüfung des gnotobitischen Status nicht vollständig beschrieben26. Mit Ausnahme von Clayton, der eine kleine Platte Sterilitätstestmedium zu Aufzuchtflaschen24hinzufügte, beherbergten frühere Methoden22,23 gnotobitische Insekten nur für kurze Zeit auf bakteriologischen Medien, um das Sterilisationsprotokoll zunächst zu bewerten.
Die fortgesetzte Unterbringung der resultierenden Nymphen auf BHI-Medium als integrierte Qualitätskontrollmaßnahme ermöglicht es, ihren gnotobitischen Status in Halb-Echtzeit zu überwachen – eine Technik, die in den meisten vorherigen Methoden nicht zu sehen war22,23. Dies ist besonders nützlich für Langzeitexperimente, bei denen auf gnotobiotische Nymphen zugegriffen werden muss. Wenn der BHI-Boden unter Nymphen mit Bakterien- oder Pilzwachstum kontaminiert erscheint, sollte der Kolben entsorgt werden. Diese Art der Kontamination tritt typischerweise auf, wenn die Kolben zu Wassernymphen aufgedeckt werden, aber sie kann auch aus dem Kot im Falle von unzureichend sterilisierten Ootheken oder Lebensmitteln entstehen. Die Verwendung einer Laminar-Flow-Haube beim Gießen verbessert die Kontaminationsrate, die durch das Aufdecken von Kolben verursacht wird.
Da nicht alle kontaminierenden Organismen auf BHI-Medium aerob wachsen können, ist eine zusätzliche kulturunabhängige Methode der Sterilitätsprüfung erforderlich. Ein möglicher Ansatz ist dieMikroskopie 27, aber dieser Ansatz kann arbeitsintensiv sein. Andere Protokolle verwenden sequenzbasierte Techniken, um Organismen nachzuweisen, die der Kultur14,23,27,28entkommen können. Solche Ansätze sind jedoch oft teuer und schwer zu interpretieren, da die Ergebnisse von Hochdurchsatz-Sequenzierungsansätzen leicht durch eine geringe Kontamination von Reagenzien34 und Barcode-Hopping35beeinflusst werden können. Stattdessen wurde ein neuer Ansatz entwickelt, der die PCR-Amplifikation des 16S-rRNA-Gens in Kombination mit einem Restriktionsfragmentlängenpolymorphismus verwendet, um sowohl den Endosymbionten als auch alle kontaminierenden Darmsymbionten sichtbar zu machen. Diese Technik beinhaltet eine interne PCR-Kontrolle, da das 16S-Gen von Blattabacteriumsequenziert wurde und sein Bandierungsmuster sowohl bei gnotobitischen als auch bei nichtsterilen Insekten vorhanden sein sollte. Da das Restriktionsmuster des Endosymbionten anhand seiner Genomsequenz36vorhergesagt werden kann, besteht keine Notwendigkeit, die Amplicons oder die Restriktionsfragmente zu sequenzieren, es sei denn, die Identifizierung eines Schadstoffs ist erwünscht. Die aktuelle Version dieses Protokolls fordert, dass eine Nymphe für PCR / RFLP geopfert wird, aber diese Technik könnte auch bei Kot als zerstörungsfreie Maßnahme verwendet werden. Es wird jedoch keine eingebaute Kontrolle enthalten, da der Kot nicht viel Blattabacteriumenthalten sollte.
Eine zusätzliche leicht modifizierbare, aber kritische Komponente der Aufzucht von gnotobitischen Tieren ist die Ernährung. Während BHI-Agar als vorübergehende Nahrungsquelle für die Insekten dienen kann, wurde festgestellt, dass es zu erheblichen Wachstumsdefiziten bei Nymphen führt, wenn es für längere Zeit als einzige Nahrungsquelle verwendet wird. Während verschiedene Diäten ausprobiert wurden, wird autoklavierbares Rattenchow als Routinediät für die Erhaltung von gnotobiotischen Insekten empfohlen. Diäten, die nicht speziell für die Sterilisation formuliert wurden, waren oft schwer vollständig steril zu machen, und viele sterile oder autoklavierbare Labortierdiäten zeigten unter nichtsterilen Bedingungen ein schnelles Pilzwachstum. Diese Tendenz zum Abbau unter nichtsterilen Bedingungen machte sie ungeeignet für Experimente, in denen gnotobiotische und nichtgnotobitische Insekten direkt verglichen wurden. Die empfohlene Diät ermöglicht die Verwendung einer konsistenten Diät zwischen gnotobitischen und Standardnymphen, was den Vergleich von Merkmalen – wie Wachstumsraten – zwischen den beiden Gruppen erleichtert.
Wie andere beobachtet haben27, wachsen die gnotobitischen Nymphen langsamer als ihre nichtsterilen Gegenstücke. Ein Vergleich zwischen Körperlängen von gnotobitischen (n = 105) und nichtsterilen Nymphen (n = 50), die mit der gleichen, autoklavierten Nagetiernahrung gefüttert und bei Raumtemperatur gehalten werden, zeigt, dass nichtsterile Nymphen durchschnittlich 0,059 mm / Tag wachsen, während gnotobitische Nymphen 0,028 mm / Tag wachsen (p < 0,0001) (Abbildung 5). Es wurde gezeigt, dass das Vorhandensein von Darmmikrobiota in P. americana die Stoffwechselrate der Insekten verändert37, und es wird angenommen, dass Darmgemeinschaften im Allgemeinen die Nährstoffaufnahme beeinflussen38,39. Diese Gründe unterstützen die beobachteten Unterschiede in der Wachstumsrate von gnotobitischen und nichtsterilen Nymphen.
Eine mögliche Einschränkung dieser Technik ist, dass gnotobitische Nymphen möglicherweise nicht die Geschlechtsreife erreichen, da die ältesten sterilen Kohorten mehr als 10 Monate alt sind und nur den siebten Instar (von 10; 11 im Erwachsenenalter) erreicht haben, wie durch Körperlänge40angenähert. Diese ältesten Kohorten sind nicht auf der Autoklavenrattendiät, sondern essen stattdessen bestrahltes Rattenchow, eine Diät, die zu viel Feuchtigkeit enthält, um nichtsterile Kohorten ohne übermäßiges Schimmelwachstum zu füttern. Es wurde festgestellt, dass nichtsterile Nymphen auf einer nichtsterilisierten Hundefutterdiät nach 9-10 Monaten unter Laborbedingungen (Raumtemperatur und Luftfeuchtigkeit) das Erwachsenenalter erreichen. Kohorten von gnotobitischen und nichtsterilen Nymphen auf dem gemeinsamen, autoklavierten Rattenchow sind derzeit weniger als 7 Monate alt, nichtsterile Insekten werden auf den siebten Instar geschätzt (Durchschnitt: 16,7 mm), während sterile Insekten auf den fünften Instar geschätzt werden (Durchschnitt: 11,2 mm). Infolgedessen können wir noch nicht überprüfen, ob sich unsere gnotobiotischen Kakerlaken erfolgreich vermehren können. Angesichts der Leichtigkeit, mit der neue gnotobitische Kohorten mit diesem Ansatz etabliert werden können, ist diese Methode jedoch auch ohne nachgewiesene Fortpflanzung von gnotobitischen Insekten vielversprechend.
Zusammenfassend bietet dieses Protokoll ein vielseitiges Werkzeug, das es Mikrobiomforschern ermöglicht, ihre eigene, kostengünstige gnotobiotische “Einrichtung” mit gängigen Labormaterialien zu betreiben. Dieser Ansatz kann verwendet werden, um gnotobiotische Kakerlaken für Experimente zu generieren, die die Rolle der Mikrobiota bei der Gestaltung des Wirtsverhaltens, der Immunität, der Entwicklung und der Stressreaktionen untersuchen21,26,27. Diese gnotobitischen Insekten können auch mit synthetischen oder xenobiotischen Gemeinschaften geimpft und anschließend als Probanden für Darmmikrobiomstudien verwendet werden23,28. Darüber hinaus sind Elemente dieses Ansatzes, einschließlich der Verwendung bakteriologischer medienarmer Inkubationskammern als integrierte Sterilitätsprüfung, auf andere Modellsysteme verallgemeinerbar und können die routinemäßige Wartung von gnotobitischen Tieren in kleineren Einrichtungen erleichtern.
The authors have nothing to disclose.
Diese Publikation wurde vom National Institute of General Medical Sciences der National Institutes of Health unter der Vergabenummer R35GM133789 unterstützt. Der Inhalt liegt ausschließlich in der Verantwortung der Autoren und stellt nicht unbedingt die offizielle Ansicht der National Institutes of Health dar. Die Autoren möchten Josey Dyer für die Verfolgung von Sterilisationsraten, Lukenraten und Wachstumsraten der gnotobiotischen Kakerlaken danken.
2X master mix | New England BioLabs | M0482 | OneTaq MasterMix |
Autoclavable rat chow | Zeigler | NIH-31 Modified Auto | |
Bacterial DNA extraction kit | Omega Bio-Tek | D-3350 | E.Z.N.A. Bacterial DNA kit; includes lysozyme, glass beads, proteinase K, buffers (proteinase K, binding, wash, elution), DNA columns, 2-mL collection tube |
binding buffer | Omega Bio-Tek | PD099 | included in Omega Biotek's bacterial DNA extraction kit ("HBC" buffer) |
brain-heart infusion (BHI) broth | Research Products International | B11000 | |
Delicate task wipes | KimWipe | JS-KCC-34155-PK | KimWipes |
DNA purification kit | Omega Bio-Tek | D6492 | E.Z.N.A. Cycle Pure kit; D6493 may also be used; includes buffers (purifying ,wash, elution) |
elution buffer | Omega Bio-Tek | PDR048 | included in Omega Biotek's bacterial DNA extraction kit |
glass beads | Omega Bio-Tek | n/a | included in Omega Biotek's bacterial DNA extraction kit |
Hybridization oven | UVP | 95-0330-01 | we use a hybridization oven for preheating elution buffer, but a water bath could probably also be used |
Laminar flow biological safety cabinet | NuAire, Inc. | NU-425-400 | Protocol refers to this as "laminar flow hood" for brevity |
lysozyme | Omega Bio-Tek | n/a | included in Omega Biotek's bacterial DNA extraction kit |
peracetic acid stock solution (32%) | Sigma-Aldrich | 269336 | |
Petroleum jelly | Vaseline | n/a | |
proteinase K buffer | Omega Bio-Tek | PD061 | included in Omega Biotek's bacterial DNA extraction kit ("TL buffer") |
purifying buffer | Omega Bio-Tek | PDR042 | included in Omega Biotek's CyclePure kit ("CP" buffer) |
RsaI | New England BioLabs | R0167 | Includes CutSmart (digestion) buffer |
Secondary container | n/a | n/a | a plastic container with a lid (such as a Kritter Keeper) works well for this (25cm long x 15cm wide x 22cm high); it should be large enough to fit BHI slants and test tubes |
spectrophotometer | ThermoFisher | ND-2000 | Catalog info is for NanoDrop2000 |
thermal shaker | Eppendorf | EP5386000028 | Thermomixer R |
Tris-EDTA | Fisher | BP1338-1 | 10 nm Tris, 1 mM EDTA, pH 8 |
wash buffer | Omega Bio-Tek | PDR044 | included in Omega Biotek's bacterial DNA extraction kit ("DNA wash" buffer) |
Woodchip bedding | P.J. Murphy Forest Products | Sani-Chips |