提出了一种利用超高磁场磁共振显微镜(MRM)以高空间分辨率研究生物组织的协议。提供了微科的特征分步说明。最后,在植物根上演示了成像的优化。
该协议描述了电磁微线圈与生物样品结合的信号噪声比(SNR)校准和样品制备方法,设计用于高分辨率磁共振成像(MRI),也称为MR显微镜(MRM)。它可用于临床前的MRI光谱仪,在医学 根部样品上 演示。 Microcoil 通过将 RF 振振器的大小与感兴趣的样本大小相匹配来提高灵敏度,从而在给定的数据采集时间实现更高的图像分辨率。由于设计相对简单,电磁微胶的构造简单且价格低廉,易于适应样品要求。系统地,我们解释如何使用参考解决方案校准新的或自建的微型可可。校准步骤包括:使用螺母曲线确定脉冲功率;射频场同质性估计;并使用标准脉冲序列计算体积规范化信噪比 (SNR)。讨论了小型生物样品样品制备的重要步骤,以及可能的缓解因素,如磁易感性差异。优化电磁线圈的应用通过高分辨率(13 x 13 x 13 μmμm 3, 2.2 pL) 根样品的 3D 成像得到证明。
磁共振成像是一种多功能工具,可对各种生物标本进行无创成像,从人类到单细胞1、2、3。虽然用于医学成像应用的 MRI 扫描仪通常使用场强度为 1.5 T 至 3 T 的磁铁,但单细胞应用的图像图像具有更高的场强度 1、3、4。以低于一百微米的分辨率对样品的研究称为磁共振显微镜(MRM)5。然而,与其他可用的显微镜或成像技术(如光学显微镜或CT)相比,MRM的声噪比(SNR)较低。可以采用几种方法来优化SNR6。一种方法是使用更高的磁场强度,而补充方法是优化单个样品的信号检测器。对于后者,应调整探测器的尺寸,以匹配感兴趣的样品的尺寸。对于直径为 ≈0.5-2 mm(例如根组织)的小样品,微线圈很有用,因为 SNR 与线圈直径6、7 成反比。使用专用微科8在动物细胞上实现了高达7.8 x7.8 x 15 μm3的分辨率。存在多种微线圈类型,其中平面线圈和电磁线圈最常用,具体取决于应用和组织几何9。平面线圈表面具有高灵敏度,可用于薄片的应用。例如,一种专为成像活体组织而设计的方法被描述为平面微科10。然而,平面线圈具有高灵敏度的落点,并且没有明确定义的参考脉冲功率。电磁阀线圈是圆柱形的,具有更广泛的应用范围,更受较厚样品的青睐。在这里,我们描述了电磁线圈的特性,一种为微线圈MRI准备样品的协议,以及电磁阀微线圈的校准(图1A)。
电磁阀线圈由一根导电丝(如螺丝钉)组成,缠绕在固定样品的毛细管周围(图1B)。微可可组件只能使用电容铜线、各种电容器和用于焊接组件的合适底座(图1B) 来建造。主要优点是简单、成本低,单位体积SNR和B1场均质性好。易于构建,可快速迭代线圈设计和几何形状。电磁阀微线圈设计和探针特性的具体要求(即电子理论、工作台测量和各种线圈几何的光谱仪测量)已在其他地方广泛描述7、11、12、13、14。
电磁线圈可以按照其他地方描述的准则15,16,记住所需尺寸的设计规则来制造。在此特定情况下,使用内径为 1.5 mm 的线圈,由带电皮的铜线制成,直径为 0.4 mm,绕在 1.5 mm 外径的毛细管周围。此电磁阀位于制造电路的基板上,由调谐电容器 (2.5 pF)、可变匹配电容器 (1.5-6 pF) 以及铜连接线(图 1A、1C) 组成。选择调谐电容器以实现所需的谐振频率950 MHz,而选择匹配电容器以实现50欧姆阻抗下的最大信号传输。较大的电容器是可变的,允许更精细的调整。在正常操作中,使用探头底座中的电容器进行调谐和匹配。组装的微可可需要安装在探头上,以便可以插入磁铁。可能需要额外的支架,具体取决于系统。在这里,我们使用 22.3 T 磁铁组合与布鲁克控制台 Avance III HD 与 Micro5 探头相结合。在这种情况下,我们使用已修改的支撑插入件,该插入件配备了必要的连接,以连接到探头的 1H 通道(图 1A)。
线圈的易感性匹配设计包括一个带全氟液体的储液罐,以减少由于铜线圈靠近样品17而引起的易感性不匹配。一个储液罐是由一个塑料注射器,以包围线圈,并充满fomblin。由于全氟液体需要将线圈封闭,样品的可用直径减少到 1 mm 的外径。为了便于更换样品,样品是在外径为 1 mm 且内径为 700 μm 的毛细管中制备的。图 2A显示了样品制备所需的工具。
基本实验 MR 参数高度依赖于使用的系统的硬件,包括梯度系统、场强度和控制台。几个参数可以用来描述系统性能,其中90°脉冲长度和功率,B1-均匀性和SNR每单位体积(SNR/mm3),是最实际相关的。SNR/mm3可用于比较同一系统18上不同线圈的性能。虽然系统之间可能存在硬件差异,但基准测试协议的统一应用也便于比较系统性能。
该协议侧重于校准和样品制备。显示电磁阀微胶性能的逐步表征:校准90°脉冲长度或功率;评估射频场的同质性;并计算单位体积的 SNR (SNR/mm3)。介绍了使用幻像的标准化自旋回波测量,以便于对线圈设计进行比较,从而优化不同的应用。描述了幻影和生物样品样品制剂,具体用于微可可。该协议可在任何合适的窄孔(≤60毫米)垂直磁铁上实施,该磁体配有市售的微成像系统。对于其他系统,它可以作为准则,并可以与一些调整一起使用。
MRI 测量的生物标本制备通常不是很广泛,因为样本的图像尽可能完整。然而,生物组织中的空气空间会导致图像伪影,因为磁易感性的差异19。效果随磁场强度的增加而增加20。因此,在高场强度下应避免空气空间,这可能需要将样品浸入流体中,以避免组织周围的空气和组织结构内空气空间的去除。具体来说,当使用微可可时,可能需要切除所需的样品组织,然后将其淹没在合适的液体中。随后将样品插入预切毛细管,最后用毛细管蜡密封毛细管。使用蜡作为密封剂,而不是胶水、火焰密封或替代品,意味着样品可以很容易地提取。这个过程在小腿植物 Mededago特伦卡 图拉的根部上得到证明。此协议的一个优点是有可能随后将 MRI 数据与光学显微镜共同注册,因为样品在 MRI 测量过程中不会被破坏。
所提出的协议适用于高空间分辨率的原位测量,更精细的设计可以允许在体内成像样品,其中需要解决与生命支持系统相关的挑战。
该协议最适合生物样品,因为许多材料和地质样品的T2松弛时间明显缩短,无法由此处使用的序列成像。甚至一些生物组织,表现出高样品磁易性异质性,可能很难在超高场成像,因为影响与场强度24相关。该协议不仅可用于新线圈,还有助于排除故障和诊断潜在问题。在测试新的或未知的样品时,可以事先在参考解决方案上执行此协议,以验证实验设置是否根据规范运行。这有助于故障排除,因为光谱仪可以排除为伪影和故障的来源。此外,这会将探头上的调谐和匹配电容器设置为微可可的典型值。
当第一次实验时没有记录到任何信号时,可以放大本地化器扫描的视场,以检查是否看到样品。接下来,重新检查线圈是否正确调整,然后尝试另一个定位器扫描。线圈可能表现出其他意外的振振模式,在这种情况下,需要确定正确的振振模式。如果仍然无法获取图像,则拆下样品以检查其在微可可组件中的位置,并验证样品是否完好无损(即,密封件中不存在气泡或泄漏)。最后,样品可以用水代替PFD制备。如果样品在局部扫描中发出很少的可检测信号,仍然可以检测到毛细管中的周围水。
由于微线圈理想中非常接近样品,因此空气和导线之间的磁易性差异可能会导致额外的信号丢失,如图7B 所示。潜在伪影包括空间错位和异常信号强度变化。特别是梯度-回声型脉冲序列受此非均匀信号损耗的影响。因此,我们提出了一个易感性匹配的线圈,通过将导线淹没在氟化物液体(Fomblin 或 FC-43)中。该协议中包含的B1估计方法可帮助确定 B 1易感性差异是否值得在线圈组件设计中加入易感性匹配策略。构建易感性匹配线圈的替代方法是使用易感性匹配线25。此外,只有由于线圈造成的易感性问题通过这种方法得到解决。样品内部的易感性不匹配(例如,由于空气空间)仍然具有挑战性。
气囊或气泡构成实验性挑战,导致大量信号丢失,由空气和流体或试样接口的易感性差异引起 (图5A)。样品制备成功的一个关键方面是样品和毛细管的淹没。但是,即使是小气泡也可能导致信号丢失,尤其是对于梯度回声类型序列。移动气泡可以通过毛细管迁移,直到它们与样品接触。其中一些效果可以通过稍微倾斜毛细管来缓解,使一端高于另一端。倾斜可确保在较高端放置潜在的气泡,而不会干扰样品。同样重要的是检查毛细管蜡是否形成良好的密封,因为脱水会导致形成大气泡。
对于样品内的空气空间,PFD 用于填充细胞间空气空间,同时不穿透细胞膜26。然而,即使采用这种方法,我们也无法移除所有空气空间。此外,这种方法意味着我们需要一个额外的代理,这通常不是首选,因为希望研究一个系统尽可能无创。
毛细血管的圆柱形意味着灌注设置应该是可行的,特别是对于容易腐烂的组织,如活检或活根材料研究过程。两个步骤可以实现灌注设置。首先,连接中进给管以及毛细管两侧的排水管将足以创建一个化疗器。其次,在样品毛细管中添加压痕可以根据流动方向保持样品的位。这类似于为平面微科10发布的协议。
MR 成像的非侵入性,结合本协议中使用的惰性液体(PFD 或 Fomblin)意味着在完成实验后,样品可从毛细管中去除,以作进一步研究。组合包括光学或电子显微镜和其他破坏性成像技术。我们最近演示了与光学显微镜在医疗根结核27的组合。
我们演示了一种在超高场 NMR 光谱仪上使用专用微coil对植物材料进行成像的方法。相对较大的样品量可以以高分辨率研究,具有良好的射频均匀性。此外,光谱成像可以执行更高的分辨率,否则可行。通过一种有效的方法来确定线圈性能特性,可使微线圈设计适应样品。电磁线圈方法也可以很容易地应用于植物以外的其他样品,包括动物组织。
The authors have nothing to disclose.
950 MHz仪器的实验得到了荷兰NWO资助的国家路线图大型设施uNMR-NL的支持(项目184.032.207)。R.S. 得到了 BioSolarCells 财团项目 U2.3 的支持。J.R.K.得到了荷兰磁共振研究学院(NMARRS)研究生院[022.005.029]的支持。我们感谢申德峰和托·比塞林提供 梅迪戈特伦卡图拉 样品。我们进一步感谢克拉特杰·胡本、玛丽·雷诺和约翰·范德兹万在UNMR-NL工厂的技术支持。我们还要感谢沃尔克·莱曼、亨尼·詹森和彼得·德·瓦德的技术支持。我们感谢弗兰克·韦尔格德特、约翰·菲利普和卡西克·赛·桑卡尔·古普塔的建议。最后,我们感谢杰西卡·德·鲁伊特为视频提供画外音。
Reference solution preparation | |||
CuSO4 | Sigma-aldrich | 469130 | Crystalline powder for creating reference solution |
D2O | Sigma-aldrich | 151882 | Liquid used to prepare reference sample |
Weigh Scale | Sartorius | PRACTUM513-1S | Scale for weighing compounds |
Sample preparation | |||
Capillary 1000 μm (Outer diameter) | Hilbenberg GmbH | 1408410 | Sample capillaries |
Capillary wax | Hampton Research | HR4-328 | Solid wax used to seal samples |
Disposable Scalpel | Swann-Morton | No. 11 | Used to excise samples |
Perfluorodecalin | Sigma-aldrich | P9900 | Liquid used for submerging sample |
Stereo Microscope | Olympus | SZ40 | Tabletop binocular microscope |
Syringe | Generic | – | Used to apply PFD and manipulate the sample |
Vacuum Pump | Vacuubrand | MZ2C | Two-stage membrane vacuumpump used for removing air pockets from samples. |
Wax pen | Hampton Research | HR4-342 | Handheld wax pen used to melt and apply capillary wax to samples |
Imaging Hardware | |||
22.3 T Magnet | Bruker GmbH | 950 US2 | Narrowbore superconducting magnet |
Air cooler | Bruker GmbH | – | Used to regulate probe temperature |
Console | Bruker GmbH | Avance III HD | Controls operation of the spectrometer |
Micro5 gradient coils | Bruker GmbH | Mic5 | Removable gradient coils mount on the Micro5 probe body |
Micro5 Probe body | Bruker GmbH | Mic5 | Holds microcoils and gradient coils |
RF microcoil | Home-built | – | contains Fomblin |
Vector Network Analyzer | Copper Mountain Technologies | TR1300/1 | Used to perform S11 reflectance test, frequency range 300kHz to 1.3 GHz |
Water cooler | Bruker GmbH | BCU-20 | Open loop watercooling to dissipate heat from gradient coil operation. |