We beschrijven het gebruik van een nieuwe, frequentie-domein luminescentie Lifetime camera voor het in kaart brengen van 2D O2 -distributies met optische sensor folies. Het camerasysteem en beeldanalyse procedures worden beschreven samen met de voorbereiding, kalibratie en toepassing van sensor folies voor het visualiseren van de O2 micro-omgeving in de rizosfeer van waterplanten.
We beschrijven een methode voor het beeld opgeloste zuurstof (O2), in 2D bij hoge ruimtelijke (< 50-100 μm) en temporale (< 10 s) resolutie. De methode maakt gebruik van O2 gevoelige lichtgevende sensor folies (planaire optodes) in combinatie met een gespecialiseerd camerasysteem voor Imaging luminescentie levensduur in het frequentiedomein. Planaire optodes worden bereid door het oplossen van de O2-gevoelige indicatorkleur stof in een polymeer en het verspreiden van het mengsel op een solide ondersteuning in een gedefinieerde dikte via mes coating. Na verdamping van het oplosmiddel wordt de planaire optode in nauw contact gebracht met het monster van de belangstelling-hier gedemonstreerd met de wortels van de aquatische plant Littorella uniflora. De O2 -concentratieafhankelijke verandering in de luminescentie levensduur van de indicator kleurstof binnen de planaire optode wordt via de achterzijde van de doorzichtige draagfolie en de aquarium wand met behulp van een speciale camera afgebeeld. Deze camera meet de luminescentie levensduur (μs) via een verschuiving in fasehoek tussen een gemoduleerd excitatie signaal en een emissie signaal. Deze methode is superieur aan beeldvormingsmethoden voor luminescentie intensiteit, omdat het signaal onafhankelijk is van de kleurstof concentratie of-intensiteit van de excitatie bron, en uitsluitend afhankelijk is van de luminescentie vervaltijd, wat een intrinsiek gerefereerde parameter is. Bijgevolg is een aanvullende referentie kleurstof of andere wijzen van verwijzing niet nodig. We demonstreren het gebruik van het systeem voor macroscopische O2 -Imaging van plant rhizospheres, maar het camerasysteem kan ook gemakkelijk aan een microscoop worden gekoppeld.
De verdeling en dynamiek van opgeloste gassen en ionen in sedimenten en bodems bieden belangrijke informatie over biogeochemische processen zoals microbiële ademhaling1,2of radiaal zuurstof verlies uit de wortels van de plant3,4,5en de chemische micro omgeving van microben6,7, plant rhizospheres5,8,9 en dierlijke Burrows10, 11,12. Biologische en chemische activiteit in dergelijke diffusie-beperkte omgevingen kunnen steile hellingen van chemische substraten of producten van biogeochemische processen te creëren. In het bijzonder, O2 beschikbaarheid heeft een enorme impact op biogeochemische processen en dus de biologie en ecologie van een systeem13. Daarom is het analyseren van O2 concentraties bij hoge ruimtelijke en temporele resolutie van primordiaal belang in aquatische en terrestrische wetenschappen. Eerst werden elektrochemische en optische micro sensoren14,15 ontwikkeld om deze belangrijke analyt te meten. Later werd 2 dimensionale (2D) beeldvorming van o2 met planaire optodes geïntroduceerd12,16,17,18,19, die de visualisatie en kwantificering van de heterogene O2 verdeling in bodems en sedimenten mogelijk maakte.
Planar O2 optodes bestaan uit een O2-gevoelige indicatorkleur stof20, die wordt opgelost in een geschikt polymeer21. De indicatorkleur stof is enthousiast over specifieke optische golflengten en zendt rood-verschoven licht bij ontspanning in de vorm van luminescentie. In aanwezigheid van O2, de opgewonden indicatorkleur stof kan zijn energie overbrengen naar de O2 molecuul op botsing, die wordt aangeduid als botsing gebaseerde luminescentie afschrikken22. Daarom worden de luminescentie intensiteit en de levensduur van de luminescentie verlaagd met een toenemende O2 -concentratie23. In een ideaal geval volgt de verandering in intensiteit en levensduur de Stern-Volmer-vergelijking (vergelijking 1) met behulp van de luminescentie intensiteit of de levensduur bij afwezigheid (I0; τ0) of aanwezigheid (i, τ) van O2 bij een bepaalde concentratie [Q]. De Stern-Volmer constante (KSV) is een maat voor de gevoeligheid van de optode in de richting van O2; KSV is afhankelijk van omgevingsvariabelen zoals temperatuur en druk.
1
Het opnemen van dergelijke veranderingen in luminescentie over een vlakke sensor folie met een camerasysteem kan worden gebruikt om de overeenkomstige veranderingen in de distributie van O2 te visualiseren. In eerste instantie werd een eenvoudige luminescentie-intensiteit van O2 gebruikt18. Deze methodologie is echter zeer gevoelig voor externe interferenties, die de betrouwbaarheid van de resultaten in gevaar brengen als gevolg van heterogene verlichting, schommelingen in de excitatie bron of camera, evenals een ongelijke verdeling van de indicator kleurstof binnen de planaire optode.
Sommige van deze beperkingen kunnen worden verlicht door gebruik te maken van planaire optodes voor ratiometrische beeldvorming17,24, waarbij de o2-gevoelige indicatorkleur stof wordt geïmmobiliseerd in de polymeer laag van de planaire optode met een ongevoelige referentie kleurstof die in een ander spectrum bereik dan de o2-indicator wordt uitgestald. Op basis van emissie beelden die in twee spectrale vensters zijn verworven, wordt het O2-gevoelige emissie signaal gedeeld door het referentiesignaal, waardoor een ratio afbeelding wordt gegenereerd die minder gevoelig is voor de bovengenoemde interferenties5,17. De methode vereist het gebruik van een tweede kleurstof, die idealiter kan worden opgewonden door dezelfde excitatie bron, maar zendt op een andere golflengte (zonder significante spectrale overlapping), in een ander spectrale venster van de camera (bijvoorbeeld in een ander kleurkanaal van een RGB-camera).
Als alternatief kan O2 -beeldvorming worden gebaseerd op het kwantificeren van de o2-afhankelijke verandering in de luminescentie levensduur van de indicator kleurstof, die niet wordt beïnvloed door ongelijke belichting of heterogeneities in de indicator concentratie25. De eerste luminescentie-levensduur-gebaseerde O2 -beeldvormingssystemen waren gebaseerd op tijdsdomein metingen met een Gate-able-camerasysteem met opgeladen apparaat (CCD)26, waar een gepulseerde excitatie bron wordt gebruikt en luminescentie beelden worden genomen over gedefinieerde tijdsintervallen binnen de excitatie of emissie van de indicator8,23,27. Uit dergelijke beelden kan de luminescentie levensduur worden bepaald en gecorreleerd met de overeenkomstige O2 -concentratie in een kalibratie. Vervolgens kunnen luminescentie levensduur beelden voor een gegeven monster dat tegen de planaire optode wordt gedrukt, worden omgezet in afbeeldingen van de overeenkomstige 2D-verdeling van O2 -concentratie. Dit systeem is gebruikt in vele toepassingen zowel in het laboratorium als in situ16,28, maar de essentiële poort-able CCD camera is niet langer commercieel beschikbaar.
Onlangs werd een ander luminescentie Lifetime camerasysteem uitgebracht, dat beelden verwerft in de frequentie-domein8. Het systeem is gebaseerd op een continu gemoduleerde lichtbron voor excitatie. Dit kan een sinusvormige of vierkante Golf in plaats van een gepulseerde excitatie, die wordt gebruikt voor het verzamelen van afbeeldingen in de tijd-domein. Deze modulatie resulteert in een gemoduleerde luminescentie-emissie van de O2 indicator kleurstof, die geleidelijk wordt verschoven door een hoek, φ, die afhankelijk is van de luminescentie levensduur van de indicator kleurstof (τ) (Zie vergelijking 2).
2
De verandering tussen excitatie en emissie amplitude (d.w.z. de zogenaamde modulatie-index of diepte (amplitude gedeeld door het constante luminescentie gedeelte) is ook afhankelijk van de luminescentie levensduur. Door het instellen van een bekende modulatie frequentie kan de speciale CMOS-beeldsensor in de camera de luminescentie levensduur in het NS-naar-μs-bereik meten, zoals beschreven in detail elders 8,29,30. Een algemene leidraad over het werkingsprincipe kan worden gevonden (via de volgende link https://www.YouTube.com/watch?v=xPAB_eVWOr8).
In het volgende protocol demonstreren we het gebruik van het nieuwe camerasysteem voorbeeld vorming van de verdeling van de O2 -concentratie rond de wortels van de aquatische zoet water plant Littorella uniflora in 2D9,31. Wij willen benadrukken dat deze methode geenszins beperkt is tot deze toepassing. Zuurstof gevoelige optodes of sensor deeltjes27 in combinatie met verschillende beeldvormingsmethoden zijn gebruikt in medisch onderzoek32, in bioprinten33, voor drukgevoelige verven34,35, of om fotosynthetische systemen2,36,37te bestuderen, om maar een paar andere toepassingsgebieden te noemen.
In dit protocol wordt de volledige werkstroom van optode voorbereiding tot O2 beeldanalyse gedekt. Door dit protocol te volgen, kunnen chemische beelden worden verkregen met behulp van de nieuwe frequentie-domein gebaseerde luminescentie Lifetime camera. Afhankelijk van de toepassing, de Planar optodes kunnen worden vervaardigd in verschillende maten en laagdikte van de sensor laag, variërend van robuuste 50-100 μm dik Planar optodes van verschillende tienden van vierkante centimeter tot Microscoop dekken stroken met < 1 μm dikke sensor lagen6,40. Het potentieel van deze methode werd aangetoond met een bepaalde toepassing, maar is niet alleen beperkt tot O2 beeldvorming in plant rhizospheres12,28.
Deze methode heeft verschillende voordelen in vergelijking met zuivere luminescentie-intensiteit gebaseerde chemische beeldvormingsmethoden. Luminescentie Lifetime Imaging is niet, of in ieder geval veel minder, beïnvloed door ongelijke belichting, ongelijke optode dikte en foto bleken25. Deze methode vermijdt ook het gebruik van een extra referentie kleurstof die vaak voorkomt in ratiometrische beeldvorming17,37. In vergelijking met andere levenslang gebaseerde camerasystemen, zoals veelgebruikte gated time-Domain camera’s8,26, het nieuwe camerasysteem en protocol gepresenteerd hier kan vergelijkbare resultaten opleveren. In een recente publicatie werden de analytische kenmerken van deze twee systemen vergeleken en bleek dat het op frequentie-domein gebaseerde luminescentie Lifetime camerasysteem op zijn minst vergelijkbaar is met de beëindigde tijd-domein-gebaseerde voorganger8.
We hebben de eenvoudigste O2 optode gepresenteerd die alleen bestaat uit een indicator in een polymeer matrix. Naast meerdere andere mogelijke O2 -indicatoren20 die kunnen worden gebruikt, kunnen additieven worden opgenomen, d.w.z. verstrooiings middelen zoals Tio2 of Diamond Powder2 om het sensorsignaal te verhogen en tegelijkertijd de transparantie van de optode te verminderen. Ook kunnen extra kleurstoffen worden gebruikt om de signaalintensiteit te verbeteren via energie overdracht41.
Voor planaire optode fabricage raden we aan een spleet te gebruiken in het mes-coating apparaat van 75-120 μm om een uiteindelijke sensorlaag dikte te leveren van ongeveer 7,5 tot 12 μm na het verdampen van het oplosmiddel (ongeveer 10% van de gebruikte kloof), bij gebruik van de beschreven sensor cocktail samenstelling. Dit is een goed compromis tussen de signaalintensiteit, die kan worden gewijzigd door een hogere kleurstof belasting, of door indicator-en referentie kleurstoffen van hogere helderheid en responstijd te kiezen. Een toename van de laagdikte resulteert in een toename van de responstijd, omdat de tijd die nodig is voor de analyt om een thermodynamisch evenwicht in de sensorlaag te bereiken met de omringende media12stijgt.
Optodes, zoals hier beschreven, reageren op veranderingen in O2 concentratie binnen een paar seconden17 terwijl nog steeds een voldoende sterke luminescentie signaal. Ultradunne sensor coatings met subseconde responstijden kunnen worden gerealiseerd met spin-coating6. Als de ondersteuning of het mes-coating apparaat niet goed gereinigd is, kan dit resulteren in inhomogene sensor lagen. Ook wanneer de cocktail niet volledig homogeen is of te snel wordt aangebracht na verspreiding vóór de coating, kan een ongewenst resultaat worden waargenomen. Daarom is het wellicht wat oefening nodig om optimale optodes voor te bereiden.
De methode kan worden gebruikt voorbeeld monsters die in nauw contact kunnen worden gebracht met de optode, zoals bepaalde zeedieren42, biofilms6 en bodems31 om er maar een paar te noemen. We presenteren een standalone Setup met een doel, maar de camera kan gemakkelijk worden gekoppeld aan een Microscoop voor een hogere resolutie chemische Imaging43.
Terwijl Time-Domain gebaseerd luminescentie levensduur Imaging ingeschakeld onderdrukking van achtergrond fluorescentie26, dit is een probleem bij het gebruik van de nieuwe frequentie-domein-gebaseerde camerasysteem8. Door de continue beeld verwerving zal deze camera elke achtergrond fluorescentie van het monster opnemen die kan worden opgewekt door de geselecteerde LED en uitzendt in het geselecteerde spectrale venster zoals gedefinieerd door het emissie filter op de camera doelstelling. Dit zal resulteren in een schijnbaar lagere levensduur en dus in valse lezingen. In het geval dat u met monsters werkt met een significante intrinsieke fluorescentie die overlapt met de O2 sensor excitatie en-emissie, is het essentieel om een extra optische isolatie toe te passen bovenop de optode, door een extra laag met Carbon Black2,17te coaten. Zo zal alleen de luminescentie die uit de planaire optode wordt uitgezonden de camera bereiken. Om te controleren op achtergrond luminescentie kan een afbeelding zonder de optode worden genomen, die dan uitsluitend intrinsieke luminescentie van het monster zou vertonen. Het is ook mogelijk om verstrooiings middelen zoals Tio2 of Diamond Powder2,44toe te voegen aan de cocktail van de sensor, om de luminescentie intensiteit van de indicator kleurstof te verhogen. Dit kan echter ook leiden tot een snellere bleken van Foto’s en Tio2 is een bekende Photo-Catalyst, die de foto stabiliteit van een kleurstof41kan aantasten. Een ander aspect om te overwegen is achtergrondlicht. Als de levensduur van de Imaging wordt verlicht, moet het achtergrondlicht zo efficiënt mogelijk worden vermeden. Daarom vereist deze beeldvormings methode dat de instellingen in een donkere omgeving worden geplaatst en dat elke externe lichtbron tijdelijk moet worden uitgeschakeld tijdens het verzamelen van afbeeldingen.
Kortom, luminescentie Lifetime Imaging is een robuuste chemische beeldvormings methode die kan worden aangepast aan veel verschillende toepassingen. Dit protocol (zie paragraaf 1-5) behandelt alle essentiële stappen voor het genereren van een afbeelding O2 en maakt gebruik van het momenteel meest flexibele frequentie-domein luminescentie levensduur beeldvormings systeem, dat de beëindigde gated time-Domain camera voor 2D O2 Imaging met Planar optodes kan vervangen.
The authors have nothing to disclose.
We danken Sofie Lindegaard Jakobsen (Universiteit van Kopenhagen) en Lars Borregaard Pedersen (Universiteit van Aarhus) voor technische assistentie. De financiering van deze studie werd verkregen uit een sapere-Aude Advanced Grant van het onafhankelijke onderzoeksfonds Denemarken (DFF-1323-00065B; MK), projectsubsidies van het onafhankelijke onderzoeksfonds Denemarken | Natuurwetenschappen (DFF-8021-00308B; MK) & technische en productie Wetenschappen (DFF-8022-00301B en DFF-4184-00515B; MK), de Deense National Research Foundation (DNRF136), en de Poul Due Jensen Foundation (KK).
Air pump with air stone and water pump | Local aquarium store | ||
Chloroform | Sigma Aldrich | 67-66-3 | |
DC4 silicone compound | Dow Corning GmbH | 2793695 | |
Gas mixer | Vögtlin Instruments GmbH | red-y compact meter GCM | This is just one possible instrument. Several companies offer gas mixing devices |
Glass plates and aquaria | Local aquarium or hardware store | ||
ImageJ Software | ImageJ | Freely available imaging software (imagej.nih.gov/ij/index.html) | |
Knife-coating device | BYK-GARDNER GMBH byk.com |
2021 | This is a four sided film applicator enabling easy variation of the film thickness. Other versions are also available. We recommend a thickness of the applied film between 75-120 µm, which yields a final sensor layer thickness of ~10% of the applied thickness before solvent evaporation. |
LED lamp, Reflector PAR38 | Megaman | MM17572 | |
LED LEDHUB | Omicon Laserage, Germany | Can be configured with a variety of LEDs. For the presented example, the green LED (528 nm) is essential | |
LOCTITE AA 3494 | Henkel AG & Co. KGaA | NA | Acrylic-based instant adhesive |
NIS Elements AR Software | Nikon Inc | Software package used for image acquisition | |
pco.flim | PCO AG, Germany | Frequency domain based luminescence lifetime camera | |
platinum(II)-5,10,15,20-tetrakis-(2,3,4,5,6-pentafluorphenyl)-porphyrin (PtTFPP) | Frontier Scientific | PtT975 | O2 indicator |
polyethylene terephthalate (PET) foil | Goodfellow | 320-992-72 | Such foils might also be found from other providers and serve as solid support |
Polystyrene (PS) | Sigma Aldrich | 9003-53-6 | Polymer matrix |
Schott RG610 filter | www.uviroptics.com | Here 52mm screw on Filters can obtained. Other sources offer square glass filters from Schott glass that can be fixed in front of the objective | |
Vinyl electrical tape | Scotch, Super 33+ | NA | |
Zeiss Makro Planar 2/100 with Hama C for Nikon adaptor | delivered with the camera | Here any other objective might also be used in combination with an adaptor if the objective does not have a C-mount |