Nós apresentamos um protocolo usando uma aproximação genética para a frente à tela para os mutantes que exibem a neurodegeneração no melanogaster de Drosophila. Incorpora um ensaio de escalada, uma análise da histologia, um mapeamento do gene e um sequenciamento do ADN para identificar finalmente genes novos relativos ao processo de neuroprotection.
Há muito a entender sobre o aparecimento e progressão de doenças neurodegenerativas, incluindo os genes subjacentes responsáveis. A triagem genética direta usando mutagénicos químicos é uma estratégia útil para mapear fenótipos mutantes para genes entre a Drosophila e outros organismos modelo que compartilham vias celulares conservadas com seres humanos. Se o gene mutado de interesse não é letal em estágios iniciais de desenvolvimento de moscas, um ensaio de escalada pode ser conduzido para a tela para os indicadores fenotípicos de funcionamento do cérebro diminuído, tais como baixas taxas de escalada. Subseqüentemente, a análise histológica secundária do tecido de cérebro pode ser executada a fim verificar a função neuroprotetor do gene marcando phenotypes do neurodegeneração. As estratégias de mapeamento do gene incluem o mapeamento meiótico e de deficiência que dependem desses mesmos ensaios podem ser seguidos por sequenciamento de DNA para identificar possíveis alterações de nucleotídeo no gene de interesse.
Os neurônios são para a maior parte pós-mitótico e incapaz de dividir1,2. Na maioria dos animais, existem mecanismos neuroprotetores para manter essas células ao longo da vida útil do organismo, especialmente na velhice, quando os neurônios são mais vulneráveis a danos. Genes subjacentes a esses mecanismos podem ser identificados em mutantes exibindo neurodegeneração, um indicador fenotípico para a perda de neuroproteção, usando um protocolo genético para a frente. As telas genéticas da frente usando mutagénicos químicos tais como o Methanesulfonate do Ethyl (EMS) ou N-Ethyl-N-nitrosourea (ENU) são particular úteis devido às mutações de ponto aleatórias que induzem, tendo por resultado uma aproximação inerentemente imparcial que derramou a luz sobre funções numerosas do gene em organismos modelo eucarióticas3,4,5 (no contraste, o mutagênese do raio X cria rupturas do ADN e pode conduzir ao rearranjo um pouco do que mutações do ponto6).
A mosca de fruto comum Drosophila melanogaster é um assunto ideal para estas telas devido à sua alta qualidade, seqüência de genoma bem anotado, sua longa história como um organismo modelo com ferramentas genéticas altamente desenvolvidas, e mais significativamente, sua compartilhada história evolucionária com seres humanos7,8. Um fator limitante na aplicabilidade deste protocolo é a letalidade precoce causada pelos genes mutados, o que evitaria o teste na velhice9. No entanto, para mutações não letais, um ensaio de escalada, que aproveita os geotaxis negativos, é um método simples, embora extenso, de quantificar o funcionamento do motor prejudicada10. Para expor a suficiente reatividade locomotora, as moscas dependem das funções neurais para determinar a direção, sentir sua posição e coordenar o movimento. A incapacidade de moscas para escalar suficientemente em resposta a estímulos pode, portanto, indicar defeitos neurológicos11. Uma vez que um phenotype de escalada defeituoso particular é identificado, uns testes mais adicionais usando uma tela secundária tal como a análise histológica do tecido de cérebro, podem ser usados para identificar a neurodegeneração em moscas de escalada-defeituosas. O traço subseqüente do gene pode então ser usado para revelar a região genomic no cromossoma que carreg o gene neuroprotetor defeituoso do interesse. Para restringir a região cromossômica de interesse, o mapeamento meiótico usando linhas de mosca mutante que transportam genes de marcadores dominantes com locais conhecidos no cromossomo pode ser realizado. Os genes do marcador servem como um ponto de referência para a mutação como a freqüência do recombinação entre dois loci fornece uma distância mensurável que possa ser usada para mapear a posição aproximada de um gene. Finalmente, cruzar as linhas do mutante com as linhas que carregam deficiências equilibradas na região cromossomática meioticamente mapeada de interesse cria um teste da complementação em que o gene do interesse pode ser verificado se seu phenotype conhecido é expressado5. Sequências de nucleotídeo polimorfónicos no gene identificado, possivelmente resultando em sequências de aminoácidos alteradas, podem ser avaliadas por sequenciamento do gene e comparando-a com a seqüência do genoma da Drosophila . A caracterização subseqüente do gene do interesse pode incluir o teste de alelos adicionais do mutante, de experiências do salvamento da mutação e da examinação de phenotypes adicionais.
As telas genéticas para diante em Drosophila têm sido uma abordagem eficaz para identificar genes envolvidos em diferentes processos biológicos, incluindo a neuroproteção dependente da idade5,23,24, 25. using esta estratégia, nós éramos bem sucedidos em identificar o Brat como um gene neuroprotetor novo17.
Um passo cr…
The authors have nothing to disclose.
Estamos particularmente gratos ao Dr. Barry Ganetzky, no laboratório de quem a tela genética foi realizada, permitindo a identificação e caracterização do pirralho como um gene neuroprotetor. Agradecemos ao Dr. Steven Robinow por gentilmente fornecer a coleção de ENU-mutagenized moscas usadas na tela genética apresentada neste artigo. Agradecemos aos membros do laboratório Ganetzky, Drs. Grace Boekhoff-Falk e David Wassarman para discussões úteis durante toda a duração deste projeto, Ling Ling Ho e Bob Kreber para assistência técnica, Dr. aki Ikeda para o uso de sua instalação de micrótomo no Universidade de Wisconsin e Dr. Kim Lackey e a instalação óptica da análise na Universidade de Alabama.
Major equipment | |||
Fume hood for histology | |||
Light Microscope | Nikon | Eclipe E100 | Preferred objective for imaging is X20 |
Imaging software | Nikon | ||
Microscope Camera | Nikon | ||
Thermal cycler | Eppendorf | ||
Fly pushing and climbing assay | |||
VWR® Drosophila Vial, Narrow | VWR | 75813-160 | |
VWR® General-Purpose Laboratory Labeling Tape | VWR | 89097-912 | |
Standard mouse pad | |||
Stereoscope | Motic | Model SMZ-168 | |
CO2 anesthesia station (Blowgun, foot valve, Ultimate Flypad) | Genesee Scientific | 54-104, 59-121, 59-172 | Doesn’t iinclude CO2 tank |
Fine-Tip Brushes | SOLO HORTON BRUSHES, INC. | ||
Drosophila Incubator | VWR | 89510-750 | |
Gene mapping | |||
CantonS | Bloomington Drosophila Stock Center | 9517 | |
w1118 | Bloomington Drosophila Stock Center | 5905 | |
yw | Bloomington Drosophila Stock Center | 6599 | |
Drosophila line used for recombination mapping | Bloomington Drosophila Stock Center | 3227 | Genotype: wg[Sp-1] J[1] L[2] Pin[1]/CyO, P{ry[+t7.2]=ftz/lacB}E3 |
CyO/sno[Sco] | Bloomington Drosophila Stock Center | 2555 | Drosophila balancer line used for recombination mapping |
Deficiency Kit for chromosome 2L | Bloomington Drosophila Stock Center | DK2L | Cook et al., 2012 |
Histology analysis | |||
Ethanol, (100%) | Thermo Fischer Scientific | A4094 | |
Chloroform | Thermo Fischer Scientific | C298-500 | |
Glacial Acetic Acid | Thermo Fischer Scientific | A38-500 | |
Fisherbrand™ Premium Microcentrifuge Tubes: 1.5mL | Thermo Fischer Scientific | 05-408-129 | |
Histochoice clearing agent 1X | VWR Life Sciences | 97060-934 | |
Harris Hematoxylin | VWR | 95057-858 | |
Eosin | VWR | 95057-848 | |
Thermo Scientific™ Richard-Allan Scientific™ Mounting Medium | Thermo Scientific™ 4112 | 22-110-610 | CyO/sna[Sco] |
Unifrost Poly-L-Lysine microscope slides, 75x25x1mm, EverMark Select Plus | Azer Scientific | ||
Fisherbrand™ Cover Glasses: Rectangles | Fisherbrand | 12-545M | Dimensions: 24×60 mm |
Traceable timer | VWR | ||
Slide Warmer | Barnstead International | model no. 26025 | |
Slide tray and racks | DWK Life Sciences | Rack to hold 20 slides | |
Fisherbrand™ General-Purpose Extra-Long Forceps | Fisherbrand | 10-316A | |
Kimwipes™ | Kimberly-Clark™ Professional | ||
6 inch Puritan applicators | Hardwood Products Company, Guilford, Maine | 807-12 | |
VWR® Razor Blades | VWR | 55411-050 | |
Tupperware or glass containers for histology liquids | 16 + 1 for running water | ||
High Profile Coated Microtome Blades | VWR | 95057-834 | |
Corning™ Round Ice Bucket with Lid, 4L | Corning™ | ||
Beaker | Or other container for ice water and cassettes | ||
Tissue Bath | Precision Scientific Company | 66630 | |
Microtome | Leica Biosystems | ||
Molecular analysis | |||
Wizard® SV Gel and PCR Clean-Up System | Promega | A9282 | |
Ex Taq DNA polymerase | TaKaRa | 5 U/μl | |
Invitrogen™ SYBR™ Safe™ DNA Gel Stain | Invitrogen™ | ||
UltraPure™ Agarose | Invitrogen™ | ||
1 Kb Plus DNA Ladder | Invitrogen™ | ||
ApE-A plasmid Editor software | Available for free download | ||
Statistical analysis | |||
R software package | |||
Further analysis | |||
y[1] w[*]; wg[Sp-1]/CyO; Dr[1]/TM3, Sb[1] | Bloomington Drosophila Stock Center | 59967 |