Nematode Caenorhabditis elegans er en fremragende model for dissekere vært-patogen interaktioner. Beskrevet her er en protokol til at inficere orm med medlemmer af mitis gruppe streptokokker og bestemme aktivering af oxidative stress reaktion mod H2O2 produceret af denne gruppe af organismer.
Caenorhabditis elegans (C. elegans), en fritlevende nematode, fremstod som en attraktiv model til at studere vært-patogen interaktioner. Den præsenterede protokol bruger denne model til at bestemme patogenicitet forårsaget af mitis gruppe streptokokker via produktion af H2O2. Mitis gruppe streptokokker er en spirende trussel, der forårsager mange menneskelige sygdomme såsom bakteriæmi, endocarditis, og orbital cellulitis. Beskrevet her er en protokol til at bestemme overlevelse af disse orme som svar på H2O2 produceret af denne gruppe af patogener. Ved at bruge gen skn-1 kodning for en oxidativ stress reaktion transskription faktor, er det vist, at denne model er vigtige for at identificere vært gener, der er væsentlige mod streptokok infektion. Desuden er det vist, at aktivering af oxidative stressrespons kan overvåges i nærværelse af disse patogener ved hjælp af en transgene reporter orm stamme, hvor SKN-1 er sammenvokset til grøn fluorescerende proteiner (NGL). Disse assays giver mulighed for at studere oxidative stress reaktionen på H2O2 afledt af en biologisk kilde i modsætning til eksogent tilføjet reaktive ilt arter (ROS) kilder.
Mitis gruppe streptokokker er menneskelige latente i svælg cavity1. Men, disse organismer kan undslippe denne niche og forårsage en række invasive sygdomme2. Infektioner forårsaget af disse mikroorganismer omfatter bakteriæmi, endocarditis, og orbital cellulitis2,3,4,5,6. Desuden, de dukker op som agenser af infektioner i blodet i immunkompromitterede, neutropeni, og kræftpatienter, der har undergået kemoterapi5,7,8,9 .
Mekanismerne underliggende mitis gruppe patogenesen er uklare, fordi få virulens faktorer er blevet identificeret. Gruppen mitis er kendt for at producere H2O2, som har vist sig for at spille en vigtig rolle i mundtlig mikrobielle samfund10. For nylig, flere undersøgelser har fremhævet en rolle for H2O2 som en cytotoxin, der inducerer epitelcelle død11,12. S. lungebetændelse, der tilhører denne gruppe, har vist sig at producere høje niveauer af H2O2 der inducerer DNA-skader og apoptose i alveolær celler13. Ved hjælp af en akut lungebetændelse dyremodel, vist de samme forskere, at produktionen af H2O2 af bakterier giver en virulens fordel. Undersøgelser på pneumokok-meningitis har også vist, at patogenet-afledte H2O2 virker synergistisk med pneumolysin til at udløse neuronal celle død14. Disse observationer fastsætter klart, at H2O2 produceret af denne gruppe af bakterier er vigtig for deres sygdomsfremkaldende evne.
Interessant, har det også vist sig at medlemmer af mitis gruppe S. mitis og S. oralis medføre døden af den ødelægge C. elegans via produktion af H2O215,16. Denne fritlevende nematode har været brugt som en enkel, genetisk tractable model til at studere mange biologiske processer. Mere nylig, ormen er opstået som en model til at studere vært-patogen interaktioner17,18. Derudover har flere undersøgelser fremhævet vigtigheden af at studere oxidativt stress ved hjælp af denne organisme19,20,21. Dens korte livscyklus, evne til knockdown gener af interesse af RNAi og brug af grønne fluorescerende proteiner (NGL)-sammensmeltet reportere til overvågning af genekspression er nogle af de attributter, der gør det til en attraktiv modelsystem. Endnu vigtigere, er de veje, der regulerer oxidativ stress og medfødt immunitet i ormen meget bevaret med pattedyr20,22.
I denne protokol, er det vist hvordan C. elegans til at belyse patogenicitet forårsaget af streptokok-afledte H2O2. En modificeret overlevelse assay er vist, og medlemmer af gruppen mitis er i stand til at dræbe ormene hurtigt via produktion af H2O2. Ved hjælp af medlemmer af gruppen mitis, en vedvarende biologisk kilde af reaktive ilt arter er (ROS) fastsat, i modsætning til kemiske kilder, der inducerer oxidativt stress i worms. Endvidere, bakterier er at kolonisere orme hurtigt, hvilket gør til H2O2 rettes direkte til tarmens celler (sammenlignet med andre kilder, der er nødt til at krydse flere barrierer). Analysen er valideret, enten 1) ved fastsættelsen overlevelse af skn-1 mutant stamme eller 2) ved at banke ned skn-1 ved hjælp af RNAi i orme i forhold til N2 vildtype og vektor kontrol behandles orme. SKN-1 er en vigtige transkriptionsfaktor, der regulerer oxidative stressrespons i C. elegans23,24,25. Ud over overlevelsen assays bruges en orm stamme at udtrykke en SKN-1B/C::GFP transgene reporter til at overvåge aktivering af oxidative stress respons via produktion af H2O2 af gruppen mitis.
De beskrevne metoder kan bruges til andre patogene bakterier såsom Enterococcus faecium, som også producerer H2O2 dyrkes under anaerob eller microaerophilic betingelser26. Typisk for de fleste sygdomsfremkaldende organismer tager det flere dage til uger at gennemføre overlevelse assays. Den robuste produktion af H2O2 af medlemmer af gruppen mitis, kunne disse assays afsluttes inden for 5-6 h under de beskrevne betingelser. Dette sikrer evnen …
The authors have nothing to disclose.
Vi takker Dr. Bing-Yan Wang, Dr. Gena Tribble (The University of Texas, Tandlægeskolen), Dr. Richard Lamont (University of Louisville, Tandlægeskolen), og Dr. Samuel Shelburne (MD Anderson Cancer Center) for at give laboratorie- og klinisk stammer af mitis gruppe streptokokker. Vi takker også Dr. Keith Blackwell (Institut for genetik, Harvard Medical School) for C. elegans stammer. Endelig, vi takker Dr. Danielle Garsin og hendes lab (The University of Texas, McGovern Medical School) for at give reagenser og ormen stammer til at gennemføre undersøgelsen. Nogle orm stammer blev leveret af CGC-udvalg, som er finansieret af NIH Office for forskning infrastruktur programmer (P40 OD010440).
Media and chemicals | |||
Agarose | Sigma Aldrich | A9539-50G | |
Bacto peptone | Fisher Scientific | DF0118-17-0 | |
BD Bacto Todd Hewitt Broth | Fisher Scientific | DF0492-17-6 | |
BD BBL Sheep Blood, Defibrinated | Fisher Scientific | B11947 | |
BD Difco Agar | Fisher Scientific | DF0145-17-0 | |
BD Difco LB Broth | Fisher Scientific | DF0446-17-3 | |
Blood agar (TSA with Sheep Blood) | Fisher Scientific | R01200 | |
Calcium Chloride | Fisher Scientific | BP510-500 | |
Carbenicillin | Fisher Scientific | BP26481 | |
Catalase | Sigma Aldrich | C1345-1G | |
Cholesterol | Fisher Scientific | ICN10138201 | |
IPTG | Fisher Scientific | MP21021012 | |
Magnesium sulfate | Fisher Scientific | BP213-1 | |
Nystatin | Acros organics | AC455500050 | |
Potassium Phosphate Dibasic | Fisher Scientific | BP363-500 | |
Potassium phosphate monobasic | Fisher Scientific | BP362-500 | |
Sodium Azide | Sigma Aldrich | S2002-25G | |
Sodium chloride | Fisher Scientific | BP358-1 | |
Sodium Hydroxide | Fisher Scientific | SS266-1 | |
8.25% Sodium Hypochlorite | |||
Sodium Phosphate Dibasic | Fisher Scientific | BP332-500 | |
Streptomycin Sulfate | Fisher Scientific | BP910-50 | |
Tetracyclin | Sigma Aldrich | 87128-25G | |
(−)-Tetramisole hydrochloride | Sigma Aldrich | L9756 | |
Yeast extract | Fisher Scientific | BP1422-500 | |
Consumables | |||
15mL Conical Sterile Polypropylene Centrifuge Tubes | Fisher Scientific | 12-565-269 | |
Disposable Polystyrene Serological Pipettes 10mL | Fisher Scientific | 07-200-574 | |
Disposable Polystyrene Serological Pipettes 25mL | Fisher Scientific | 07-200-575 | |
Falcon Bacteriological Petri Dishes with Lid (35 x 10 mm) | Fisher Scientific | 08-757-100A | |
No. 1.5 18 mm X 18 mm Cover Slips | Fisher Scientific | 12-541A | |
Petri Dish with Clear Lid (60 x 15 mm) | Fisher Scientific | FB0875713A | |
Petri Dishes with Clear Lid (100X15mm) | Fisher Scientific | FB0875712 | |
Plain Glass Microscope Slides (75 x 25 mm) | Fisher Scientific | 12-544-4 | |
Software | |||
Prism | Graphpad | ||
Bacterial Strains | |||
S. oralis ATCC 35037 | |||
S. mitis ATCC 49456 | |||
S. gordonii DL1 Challis | |||
E. coli OP50 | |||
E. coli HT115 | |||
Worm Strains | |||
Strain | Genotype | Transgene | Source |
N2 | C. elegans wild isolate | CGC | |
EU1 | skn-1(zu67) IV/nT1 [unc-?(n754) let-?] (IV;V) | CGC | |
LD002 | IdIs1 | SKN-1B/C::GFP + rol-6(su1006) | Keith Blackwell |