Summary

昆虫の出現パターンの検出の正確かつ自律システム

Published: January 09, 2019
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Summary

昆虫の出現パターンの測定精度が必要です。既存のシステムがのみ半自動およびサンプルのサイズは制限されます。我々 はマイクロ コント ローラーを使用して新たな昆虫の多数の出現の時間を正確に測定するシステムを設計することでこれらの問題に対処。

Abstract

昆虫の出現パターンを測定する既存のシステム制限があります。彼らはのみ部分的に自動化されているし、検出できる新たな昆虫の最大数が制限されます。昆虫の出現の正確な測定を得るためには、半自動と新興の昆虫の大きい数を測定することができるシステムにする為です。我々 は設計は自動化されており、1200 昆虫までの出現を測定できるシステムを構築してこれらの問題に対処。私たちは、Arduino マイクロ コント ローラーを使用してデータ収集を自動化し、複数のデータ チャネルをサンプル サイズを展開する既存の「落下ボール」システム変更。複数のデータ チャネルだけでなく、サンプル サイズを増加するユーザーを有効にするが、単一の実験で同時に実行する複数の治療ができます。さらに、我々 は自動的に出現の平均日のも計算しながらバブル プロットとしてデータを視覚化する R スクリプトを作成しました。現在のシステムは、3 D プリントを使用してユーザーが異なる種の昆虫のために調整するシステムを変更できるように設計されました。このプロトコルの目標は、時間生物学、ストレスの生理学、昆虫の出現パターンを測定するこの正確で自動化されたシステムを使用しての重要な質問を調査するためです。

Introduction

実験設定で地上の昆虫出現のタイミングを正確に測定が困難とある程度の自動化が必要です。過去には、いくつかのメカニズムを設計されている落下のボールとセンサー、またはファンネル型システム1,2,3を使用して「ビッグバン ボックス」を使用していずれかの「落下ボール」原則を組み込みます。既存の設計の 2 つの制限があります: 1) データ収集は部分的にのみ自動化されており 2) サンプル サイズまたは検出ことができる緊急の昆虫の数は限られています。これらの問題には、羽化または出現パターンのタイミングを勉強することが重要であるデータ収集の精度が します。我々 は良い環境手がかりに応えて出現リズムを視覚化するユーザーを有効にするは自動化され、サンプル サイズによって制限されていないシステムを設計することによって、これらの問題に対処。

当社のシステムは、落ちるボールの原則として、最新バージョンは 6 分単位2の昆虫の出現を検出する赤外線センサーを使用する改善です。体制はまだ赤外線センサーを使用するが、日付と最も近い秒に各出現イベントの時刻を記録する Arduino マイコンが組み込まれています。データは、分析用にコンマ区切りファイルとしてエクスポートすることができますをセキュリティで保護されたデジタル (SD) カードに自動的に格納されます。分析を自動化スクリプトを使用して、カスタム R、バブル プロットとしてデータをグラフ化し、出現の日と中央の時間を確認します。

複数のチャネルより柔軟にデータ集録ユーザーを有効にします。たとえば、当社の複数のチャネルの設計だけでなく「詰まっている」センサーの影響を最小限に抑える、サンプル サイズを増やすにも使用できます。さらの複数のチャネルでは、彼らは実験で同時に実行できるように、特定のチャネルに治療を指定できます。すべての六つのチャンネルを使用して単一の実験記録に約 1200 の新興ミツバチのことができます。私たちの知る限りでは、昆虫の出現を測定任意の現在のシステムの最大サンプル サイズで、環境のキューに対して微細出現パターンを観察することができました。最後に、体制の恩恵の部分の大半が 3 D 印刷であるという事実を。これは正確にサイズのコンポーネント (検出器の詰まり) などの操作中に発生したエラーの可能性を低減するを作成します。また、他の研究システムのカスタマイズできます。

このプロトコルの目標は、時間生物学、ストレスの生理学を調査するため、昆虫の出現を測定する自動化されたシステムの正確な質問カスタム ビルドすることです。このシステムは、されているし、環境手がかりに応えて昆虫出現パターンに関連する未解決の問題の調査に重大であり続けます。ここでそのアセンブリ使い出現アルファルファ切葉蜂、第被害の研究室での実験設定の検出について述べる。システムが自動化されたプログラム可能なマイクロ コント ローラーを使用して、3 D プリント パーツを使用してカスタマイズ可能です。印刷されたラックは金属 BB 蜂巣細胞を含む場所管で保持します。出現時に金属の BB は日付と SD カードへの出現の時間記録する赤外線センサーを通過、ラックから解放されます。現在のデザインはM. 被害、最適ですが、昆虫の他の種のためのマイナーな調整とを合わせることができます。

Protocol

1. システム構築 次の構築される各チャネルの部品数を印刷 PLA フィラメントを使用して: 1 コレクター マニホールド (collector_manifold.stl)、1 エンド キャップ (end_cap.stl)、6 のプラットフォーム サポート (platform_support.stl)、4 管ラック ベース プレート (base_plate.stl)、4チューブ ラック面板 (face_plate.stl)。プリンターは印刷する前にアイテムを印刷するのに十分な大きさであることを確認します。補足データですべて *.stl ファイルがあります。 3 プラットフォーム サポートとプラダンの 33 × 30 cm の部分は、図 2に示すように、構築されるチャネルあたり 2 管ラック プラットフォームを組み立てるためホット接着剤を使用します。段ボール プラスチックは、各コーナーの曲げを可能にする 1 つの側面に得点できます。 コレクター マニホールドにエレクトロニクスをインストールします。 赤外線エミッタと赤外線検出器と両方のカソードに 22 GA ワイヤーの ~ 5 cm の長さの両方のアノード (長い脚) に 120 Ω 抵抗をはんだ付けします。後の手順で混乱を避けるために配線の異なる色を使用します。 慎重に 1 つのソケット (図 3に青色で強調表示) コレクター マニホールドと (赤色で強調表示) 2 番目のソケットにエミッタに検出器を挿入します。両方のコンポーネントは、ぴったりとフィットする必要があります。 検出器ワイヤ (図 3に黄色で強調表示) ケーブル チャネルを介してフィード、(緑色で強調表示) のアクセス穴を介してすべての 4 つの線を引き出します。裸電線に触れておらず、ホット接着剤を使用して場所でそれらを確保することを確認します。 RJ45 すべて 4 本のワイヤをはんだ付け (イーサネット) ジャック、ピンの後ろの行を使用します。両方の陽極は、一番左の端子、一番右の端子にエミッタの陰極とセンター ピン (図 4) のいずれかに検出器のカソードに半田付けする必要があります。 マニホールド内裸線が触れていないことを確認、ホット接着剤で (図 3の緑色で強調表示) コレクター マニホールド アクセス穴に RJ45 ジャックを固定します。 図 5に示すように、立ち下がりボール コレクター (構築されるチャネルごとの 1) の構築します。 1 つの有線コレクター マニホールド、1 つのエンド キャップ、プラダンの 24 x 30 cm 断面とユニット (赤、緑、および光灰色のコンポーネント図 5) のベースを接続するのにホット接着剤を使用します。 プラダンの 8 × 27 cm] セクションを使用して、コレクター (図 5の暗い灰色コンポーネント) に落下ボール ランプを追加します。エンド キャップとコレクターのマニホールド デザインには、適切な配置を確保するための棚が含まれます。使用中に渋滞を避けるためにコレクターにランプからのスムーズな移行を確認します。 (図 6の詳細な) システムの中央処理装置を構築します。 システム構築のためのカスタムのプリント回路ボードを印刷します。補足データでは、PCB 基板の印刷に必要なすべてのファイルがあります。 はんだスルーホールというラベルの付いた次のインストール済みの女性のヘッダー: Arduino ナノ、温度、時計、SD モジュール、液晶ディスプレイ (LCD) スクリーン (ラベルのない 2 x 5 貫通穴エリア PCB 基板の左上隅の)。 カチッと PCB 基板の下端に沿って六つの RJ45 ジャックをはんだ付けします。 RJ45 ジャックのすぐ上にある穴を通してサイトに 6 470 k ω プルダウン抵抗器をはんだ。 Arduino ナノ、DHT 温度と湿度センサー、時計、および PCB 基板上に SD モジュールをインストールします。DHT 温度および湿度センサーは、精度を確保するための実験で使用する前にテスト必要があります。 10 コネクタ リボン線を PCB 基板の液晶スクリーン コネクタに接続します。図 4に示すように画面ピンが Arduino のピンに対応するように液晶画面にリボン線のもう一方の端をはんだ付けします。液晶配線に関する詳細は https://Learn.adafruit.com/character-lcds/wiring-a-character-lcd でご利用いただけます。 システム プログラミング ダウンロードして www.arduino.cc から適切なオペレーティング システムのための Arduino IDE の最新バージョンをインストールします。 初めて使用するとき、リアル タイム クロック (github.com/adafruit/RTClib)、温度/湿度センサー (github.com/adafruit/DHT-sensor-library) のための Arduino のライブラリをインストールします。ライブラリに含まれている ds1307 スクリプトを使用して、現在のローカル時刻に時計を設定します。 システム Arduino スクリプト、補足データをアップロードします。 2. システムの使用 図 7に示すように、システムを構築してください。各チャネルで使用されている、(5.1 の手順で組み立て) ラック プラットフォームによって、どちら側 (1.4 の手順で組み立て) 1 つの落下ボール コレクターを並ぶ必要があります。作品を一緒に保持してラック プラットフォームで滑らかな丸みを帯びたエッジを作成するのには、包装テープを使用します。 偽の肯定的な信号を避けるために使用されていないチャンネルを構成します。システムは、イベント (赤外線検出器赤外線エミッタからシグナルを受信しない) を検出する信号に依存しているので、偽肯定的な信号を避けるために未使用チャネルを適切に構成する必要があります。これは、2 つの方法のいずれかによって達成することがあります。 ソフトウェアで使用されていないチャンネルを無効するには、使用されていないチャンネルに対応するループをコメント アウトします。Arduino IDE でこれは、追加することによって実現できます”/*”不要なループの前と”*/”に端。 簡単なハードウェアの宿泊施設を通じて未使用チャネルを無効にします。単に線 #6 #8 (通常固体茶色と固体緑のワイヤ市販猫 6 ケーブル) を一緒にはんだ付けし、中央処理装置の空の RJ45 ジャックに挿入します。 すぐに実験を実行する前にチューブのラックの負荷と場所 すべての穴に 0.5 mL 遠心チューブ含む削除キャップとチューブがぴったりと合うことを確認します。 最後に 1 つ金属 BB 1 つエアガン ペレットや繭蛹ケース 1 つの昆虫のひな細胞で各管を埋めます。くよくよセルのフラット端面 (キャップ) にエアガン ペレットと金属 BB に向かって直面していることを確認します。1/4 インチ ナイロンねじを使用して、ラックの下部に向かって丸みを帯びたエッジと管ラック プレートを貼ります。 場所管ラック ラック プラットフォームで落ちるボール コレクターの方を向いて開口を有する。ラックは金属の BB はコレクターに構造 (図 7) の別の部分に対してバウンスすることがなく自由に落ちることができるので、プラットフォームの非常に端に配置必要があります。ラックを置くとき上向きオープニングで始まり、金属板が解放されないように所定の位置にゆっくり回します。ラックは、チューブの斜めより少し後方に正しく配置すると、金属板の偶発的なリリースのチャンスを減らすように設計されています。 アダプターに SD カードを挿入し、Arduino と任意の適切な USB アダプターに、もう一方の端にマイクロ USB コネクタを差し込むことで中央のプロセッサを開始します。液晶画面から 6 ができたら 1 つの数字が表示されます。各チャネルの時計画面に表示に対応する数と画面の下部に表示する正しい時間ボール コレクターに単一金属の BB をドロップします。 正しい時刻が表示されない場合は、1.6.3 とクロックをリセットして 1.6.4 の手順を繰り返します。 テスト金属 BB が記録されていない場合は、コレクターがブロックされます。閉塞を視覚的に確認し、システムを再起動します。 チャネル「カウント」1 つのイベントを 1 秒ごと、チャンネルが正しく接続されていないことを示します。すべての接続をチェックし、システムを再起動します。 3. 実験終了とデータ解析 羽化後は終了しました (結果図 8 および 9時間スケールの例を参照)、装置の電源を Arduino を抜いて。ラックは、逆アセンブル、きれいに再利用の可能性があります。 実験では、データは R のプログラミング言語によってコンマ区切りファイル (CSV) アクセス可能で SD カード上に格納されます。SD カードを使用して、コンピューターおよびデータのバブル プロットを自動生成するのに RStudio にデータを転送します。 イベントと温度の両方のデータは、データの整合性を同じファイルに保存されます。したがって、分析の前にいくつかの処理を完了する必要があります。カンマ区切りファイルをスプレッドシート ・ プログラムにインポートします。I と J が日付と蜜蜂の出現の時間列2 つ目のスプレッドシートに列 A E を切り取って貼り付けて、A と B の列を作るし、保存別のファイルとして、温度データです。 タイトル列 A に、「日付」と列 B「時間」列 A、B. 保存 csv 形式でデータの並べ替えファイル。 ダウンロードして https://www.r-project.org/ から、RStudio の最新バージョンをインストールします。RStudio を使用してアップロードするを支援し、データの分析は、こちら https://cran.r-project.org/doc/manuals/r-release/R-intro.html で。 補足データで使用可能な R のスクリプトを使用して、RStudio にデータをアップロードします。場所に合わせて R スクリプトで働く先を変更、excel *。CSV ファイルがあります。スクリプトを実行し、分析するデータ ファイルを選択します。R コンソールに「プロット」を入力します。バブル プロットは”高解像度;「作業目的地に位置する高解像度 tiff (300 dpi) ファイルとして保存するファイルの名前を変更します。

Representative Results

M. 被害の出現は、出現4日目全体で一様に発生する非同期環境のキューへの露出なしです。ただし、矩形波温度 (温度 4 ° C) に露出されたとき、出現が thermophase4、5の同期になります。この結果は他の研究に類似した出現、肉フライツノアカニクバエ能力6タマネギのはえデリア atiqua7 ゾウムシなどを調節する温度的な合図を使用する昆虫が見つかって、Anthonomus グランディス グランディス8。1 つの研究は、 S. crassipaplpis9で羽化の同調を開発中のストレスに影響を示しています。開発時にこの治療法が羽化のずれを引き起こすこと仮説をテスト、ストレスにさらされたM. 被害から結果を紹介します。 実行成功 ユーザーは、昆虫は、もはや浮上しているかどうかを確認するインキュベーターを開く前に、液晶画面を見てください。実験が完了すると、SD カードが削除され、前述のとおり別バブル プロットとして視覚化されるコンマ区切りファイルとして RStudio にデータをエクスポートすることができます。図 8には、開発中に寒冷ストレスへの暴露後 4 ° C の温度下で蜂の出現が表示されます。赤の十字を示す期間中央値ありの出現とファイル名がタイトル。この R のスクリプトはデータの視覚化に使用する必要がありますが、唯一の分析としてはなりません。リズムの分析できる、データ環境のキューに出現応答を分析する (解析を参照してください). 合併症 センサーを金属板で目詰まりすると、複数の偽のデータ ポイントに上昇を与える信号の欠如は繰り返しカウントされます。図 9は、図 8ではなく、したがってグラフに大きな泡を作成する掲示板で詰まっている六つのチャネルの 1 つを発表した同じデータセットを示しています。詰まっているセンサーが発生した場合、分析からこのチャネルからのデータを簡単に削除できます。実験で複数のチャネルを組み込むことは、詰まっているセンサーの影響を最小限に抑えることで有益です。 解析 同期の存在のためのデータの分析は、「パラメーター R」出現がリズミカルなまたは不整脈10、11,12の場合を識別するスカラー統計量を計算することによって行うことができます。これは、最高羽化 100 によって増加し、8 時間の窓の外の数でこの数を割る 8 時間で羽化成虫数を計算することによって行われます。浮上したすべての個人は、一日の時間ごとの羽化成虫数を計算するプールする必要があります。パラメーター R の理論的な範囲は 0 (ゲート内はすべて出現が発生します) から 200 (出現は均一に分布終日)10。R 値 < 60 60 リズミカルな出現である < R 90 ある不整脈。> 150 を示す R 値出現10の分布が均等します。図 8は、その出現はパラメーター R とリズミカルな 20.21 < 60 を =。この種類のデータが繰り返し 24 時間クロックを中心に配布されるという事実のためにより堅牢な分析 (ベネットら2018年5で詳しく説明します) の円形の統計が必需品です。これは RStudio の円形統計パッケージの利用によって達成されることができます (パッケージ ‘円形’-クラン。R-project.org)。 図 1: 添加物製造コンポーネント。PLA フィラメントを使用すると、3 D 印刷、システムに必要な部品です。各チャネルで構築されている、必要なパーツが 1 コレクター マニホールド (緑)、1 エンド キャップ (赤) 6 プラットフォーム サポート (オレンジ)、4 管ラック (紫)、ベース プレートと 4 管ラック面板 (黄色)。この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください。 図 2: 管ラック プラットフォーム アセンブリ。ホット接着剤を使用すると、構築されるチャネルごとの 2 つの管ラック プラットフォームを組み立てます。プラダン (灰色で表示) のセクションに 3 つのプラットフォーム サポート (オレンジで表示) を使用します。この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください。 図 3: x 線コレクター マニホールド。1 つの赤外線検出器を (青で示されている) コレクターとエミッタ (赤色で表示) 2 番目のソケットに 1 つのソケットに挿入します。検出器ワイヤ (黄色表示) ケーブル チャネルを介してフィード、(緑色で強調表示) のアクセス穴を介してすべての 4 つの線を引き出します。裸電線に触れておらず、ホット接着剤を使用して場所でそれらを確保することを確認します。この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください。 図 4: コネクタ配線。ジャックと液晶画面を中央処理装置に接続するための配線テーブルの下から見られるようにコレクター マニホールドに貼付前に RJ45 ジャックの配線図。この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください。 図 5: ボール コレクタアセンブリ。プラダン (薄いグレーで表示) の部分 1 つのエンド キャップ (赤で表示)、1 つのコレクター マニホールド (緑色で表示)、24 x 30 cm を使用してボール コレクター アセンブリのシェルを組み立てます。プラダン (暗い灰色で表示) の 8 × 27 cm 部分を使用すると、ランプを追加します。この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください。 図 6: 中央プロセッサ プリント基板ボード。セントラル プロセッサの PCB ボードは (緑で表示) 底層、上層 (赤で表示)、および (青で描かれている) シルク スクリーン層から成っています。女性のヘッダー (下部) RJ45 ジャック、プルダウン抵抗 (真上 RJ45 パッド) を除いて、すべてパススルーの穴をはんだ付けします。この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください。 図 7: 最終的なアセンブリ。使用とき、に、装置は、使用されている各ボール コレクターのどちら側管ラック プラットフォームと組み立てられる必要があります。跳ね返る装置落下掲示板の可能性を減らす管ラック プラットフォームの非常に端にいるので付属のフェイス プレートで管ラックする必要があります。組み立て装置の設置面積は約 25 cm × 35 cm、高さ 20 cm. のこの図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください。 図 8: r. での処理後の典型的な実験的実行のグラフこの図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください。 図 9: 4 日に比較的大きな泡で示すように、詰まっている検出器に苦しんで実験のグラフ。詰まっているチャネルは、それにより残りのデータ ポイントの保持の分析から削除できます。この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください。

Discussion

アセンブリおよび昆虫の出現のタイミングの精密測定では、システムの使用のためのプロトコルを提案します。このシステムは限られた以前のデザインを 2 つの問題を解決する: 部分的な自動化と限られたサンプルのサイズ。マイクロ コント ローラーは、複数のチャネルを使用してサンプル サイズを増加させてもを使用したデータ収集を自動化することでこれらの問題を解決しました。現在の設計では、1200 蜂の合計を保持することができます六つのチャンネルを持っています。追加チャンネルに加算または減算増加し、サンプルのサイズだけでなく、同時に複数の治療法の効果を調査するためもできる必要な場合することができます。将来のアプリケーションの制限、変更の重要なステップを以下に示します。

自動化されていないシステムの唯一の部分は、ひなセル、メタル掲示板実験の先頭にエアガン ペレットとラックを読み込んでいます。ラックは、彼らが傾くように設計されていますが、金属板の偶発的な放出を防止する、後ろ金属板のラックが立って直立、ケアを転倒防止に少しはラックを配置する場合取られなければなりません。また、ラックは、滑走路と金属の BB の落下軌道整列、棚の端と同じ高さであることを確認します。最後に、葉の破片は、滑走路から消去されるべきだ、以前の実験から金属板を保持して足回りをクリアしてセンサーがブロックされないようにする必要があります。CSV ファイルとして SD カードにデータを自動的に記録し、SD カードがある限り、Arduino が実行されないように、スクリプトを記述。データ ファイルは RStudio と可視化スクリプトを使用して、前述のように R に手動でインポートします。このスクリプトは自動的にバブル プロットとしてデータをグラフ化し、期間中央値および出現の日を識別します。Arduino のスクリプトを記述して、イベント データを電源障害発生時のデータ損失を防止するファイルの末尾に追加します。ただし、これはまた、一度 SD カードからデータを抽出すると、次の実験の前にすべてのファイルをクリアするかを意味します。

SketchUp ファイルへの変更は、変更されたラックで使用される異なるサイズのチューブと、異なるサイズの昆虫のラックのサイズを調整させることができます。さらに、昆虫がチューブを離れるを防ぐために同様に異なるサイズのペレットが必要、エアソフト ペレットのサイズが重要です。さまざまな変化はバブル プロットおよび他のグラフィックの変数の外観を変更する R スクリプトさせることができます。

BB は金属検出された複数のデータ ポイントとしてカウントされているから単一金属 BB を防ぐ後 1 秒の任意の特定のチャネルを無効にしますデバウンス コードを記述して偽陽性のリスクを低減します。これにより、一度に多くの蜂が出てくる場合に惜しまれつつデータ ポイントがチャネルは独立であるという事実の可能性がこのリスクが軽減されます。現在のシステムのもう一つの制限は、個々 のデータ ポイントが認識されない、すなわち、落ちる金属 BB さかのぼることができない特定の個人です。さらに、現在のシステム測定の出現がないの羽化リズムにおけるM. 被害出現と羽化が同義である種の羽化リズムを測定するが。最後に、現在のデザインは、耐候性、制御された環境にその使用を制限することではありません。

今後の用途は、 M. 被害のタイミング出現の他の非生物と生物の環境手がかりの効果を調べるします。さらに、昆虫は、多様な環境を占有、関連する環境手がかりは種によって異なります。したがって、複数の昆虫種の設立は分類群を越えた進化した調査方法の概日システムに重要です。少しはどのように発達条件について; 羽化のタイミングに影響を与える知られています。したがって、出現に治療の効果を解読する当社のシステムを使用できます。さらに、環境手がかりの組み合わせは昆虫の応答に影響を与える、従って今後の実験計画の出現への相対的な影響を理解する複数の環境のキューを組み込む必要があります。最後に、展開を観察するフィールドで出現リズムは、自然の設定を仲介する方法。このシステムと添加剤の製造、オープン ソースのプログラミング、および監視可能な生物学的特性のユニークな組み合わせの使いやすさは、教育の設定に使用する候補。

Divulgations

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

説明システムを用いた実験で、有益なフィードバックのファーゴ、ノースダコタで昆虫の低温生物と生態作業のグループを認識したいと思います。

Materials

PLA printer filament www.lulzbot.com various Catalog number varies by color
0.5 mL microcentrifuge tubes www.daigger.com EF4254C
4.5 mm size "bb" metal pellets www.amazon.com B00419C1IA Daisy 4.5 mm metal size bb pellets
6.0 mm plastic "softair" pellets www.amazon.com B003QNELYE Crosman 6 mm airsoft pellets
Plastic corregated sheet www.lowes.com 345710 Corrugated plastic sheet
Infrared emmiter/detector pair www.amazon.com B00XPSIT3O 5 mm diameter, 940 nm wavelength
120 ohm resisitors www.amazon.com B01MSZK8DV 120 ohm, 1/4 watt
22 GA hookup wire www.adafruit.com 1311
RJ45 jacks www.sparkfun.com PRT-00643
Custom PCB board www.pcbexpress.com n/a Can be printed from files included in the supplimental data
Arduino Nano v 3.0 www.roboshop.com RB-Gra-01
SD card module www.amazon.com DFR0071 DFRobot SD card module
Real Time Clock module www.adafruit.com 264 DS1307 real time clock breakout board
Temperature/humidity sensor www.tinyosshop.com G4F4494F29ED05 DHT11 temperature/humidity sensor on breakout board
470k ohm resistors www.amazon.com B00EV2R39Y
Female headers www.adafruit.com 598 Break off to desired length
Male headers www.adafruit.com 392 Break off to desired length
Ribbon wire www.amazon.com B00X77964O 10 wire ribbon wire with connectors
LCD screen www.adafruit.com 198
Cat6 cable www.amazon.com B00N2VISLW
SD card www.amazon.com B00E9W1URM

References

  1. Lankinen, P. Geographical variation in circadian eclosion rhythm and photoperiodic adult diapause in Drosophila littoralis. Journal of Comparative Physiology A. 159, 123-142 (1986).
  2. Watari, Y. Comparison of the circadian eclosion rhythm between non-diapause and diapause pupae in the onion fly, Delia antiqua. Journal of Insect Physiology. 48, 83-89 (2002).
  3. Zimmerman, W. F., Pittendrigh, C. S., Pavlidis, T. Temperature compensation of the circadian oscillation in Drosophila pseudoobscura and its entrainment by temperature cycles. Journal of Insect Physiology. 14, 669-684 (1968).
  4. Yocum, G. D., Rinehart, J. P., Yocum, I. S., Kemp, W. P., Greenlee, K. J. Thermoperiodism synchronizes emergence in the alfalfa leafcutting bee (Hymenoptera: Megachilidae). Environmental Entomology. 45, 245-251 (2016).
  5. Bennett, M. M., Rinehart, J. P., Yocum, G. D., Doetkott, C., Greenlee, K. J. Cues for cavity nesters: Investigating relevant Zeitgebers for emerging leafcutting bees, Megachile rotundata (Hymenoptera: Megachilidae). Journal of Experimental Biology. 221, jeb175406 (2018).
  6. Miyazaki, Y., Goto, S. G., Tanaka, K., Saito, O., Watari, Y. Thermoperiodic regulation of the circadian eclosion rhythm in the flesh fly, Sarcophaga crassipalpis. Journal of Insect Physiology. 57, 1249-1258 (2011).
  7. Watari, Y., Tanaka, K. Effects of background light conditions on thermoperiodic eclosion rhythm of onion fly Delia antiqua. Entomological Science. 17, 191-197 (2014).
  8. Greenberg, S. M., Armstrong, J. S., Setamou, M., Coleman, R. J., Liu, T. X. Circadian rhythms of feeding, oviposition, and emergence of the boll weevil (Coleoptera: Curculionidae). Insect Science. 13, 461-467 (2006).
  9. Yocum, G. D., Zdarek, J., Joplin, K. H., Lee, R. E., Smith, D. C., Manter, K. D., Denlinger, D. L. Alteration of the eclosion rhythm and eclosion behavior in the flesh fly, Sarcophaga crassipalpis, by low and high temperature stress. Journal of Insect Physiology. 40, 13-21 (1994).
  10. Winfree, A. Integrated view of resetting a circadian clock. Journal of Theoretical Biology. 28, 327-374 (1970).
  11. Watari, Y., Tanaka, K. Interacting effect of thermoperiod and photoperiod on the eclosion rhythm in the onion fly, Delia antiqua supports the two-oscillator model. Journal of Insect Physiology. 56, 1192-1197 (2010).
  12. Short, C. A., Meuti, M. E., Zhang, Q., Denlinger, D. L. Entrainment of eclosion and preliminary ontogeny of circadian clock gene expression in the flesh fly, Sarcophaga crassipalpis. Journal of Insect Physiology. 93, 28-35 (2016).

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Citer Cet Article
Bennett, M. M., Rinehart, J. P., Yocum, G. D., Yocum, I. A Precise and Autonomous System for the Detection of Insect Emergence Patterns. J. Vis. Exp. (143), e58362, doi:10.3791/58362 (2019).

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