昆虫の出現パターンの測定精度が必要です。既存のシステムがのみ半自動およびサンプルのサイズは制限されます。我々 はマイクロ コント ローラーを使用して新たな昆虫の多数の出現の時間を正確に測定するシステムを設計することでこれらの問題に対処。
昆虫の出現パターンを測定する既存のシステム制限があります。彼らはのみ部分的に自動化されているし、検出できる新たな昆虫の最大数が制限されます。昆虫の出現の正確な測定を得るためには、半自動と新興の昆虫の大きい数を測定することができるシステムにする為です。我々 は設計は自動化されており、1200 昆虫までの出現を測定できるシステムを構築してこれらの問題に対処。私たちは、Arduino マイクロ コント ローラーを使用してデータ収集を自動化し、複数のデータ チャネルをサンプル サイズを展開する既存の「落下ボール」システム変更。複数のデータ チャネルだけでなく、サンプル サイズを増加するユーザーを有効にするが、単一の実験で同時に実行する複数の治療ができます。さらに、我々 は自動的に出現の平均日のも計算しながらバブル プロットとしてデータを視覚化する R スクリプトを作成しました。現在のシステムは、3 D プリントを使用してユーザーが異なる種の昆虫のために調整するシステムを変更できるように設計されました。このプロトコルの目標は、時間生物学、ストレスの生理学、昆虫の出現パターンを測定するこの正確で自動化されたシステムを使用しての重要な質問を調査するためです。
実験設定で地上の昆虫出現のタイミングを正確に測定が困難とある程度の自動化が必要です。過去には、いくつかのメカニズムを設計されている落下のボールとセンサー、またはファンネル型システム1,2,3を使用して「ビッグバン ボックス」を使用していずれかの「落下ボール」原則を組み込みます。既存の設計の 2 つの制限があります: 1) データ収集は部分的にのみ自動化されており 2) サンプル サイズまたは検出ことができる緊急の昆虫の数は限られています。これらの問題には、羽化または出現パターンのタイミングを勉強することが重要であるデータ収集の精度が します。我々 は良い環境手がかりに応えて出現リズムを視覚化するユーザーを有効にするは自動化され、サンプル サイズによって制限されていないシステムを設計することによって、これらの問題に対処。
当社のシステムは、落ちるボールの原則として、最新バージョンは 6 分単位2の昆虫の出現を検出する赤外線センサーを使用する改善です。体制はまだ赤外線センサーを使用するが、日付と最も近い秒に各出現イベントの時刻を記録する Arduino マイコンが組み込まれています。データは、分析用にコンマ区切りファイルとしてエクスポートすることができますをセキュリティで保護されたデジタル (SD) カードに自動的に格納されます。分析を自動化スクリプトを使用して、カスタム R、バブル プロットとしてデータをグラフ化し、出現の日と中央の時間を確認します。
複数のチャネルより柔軟にデータ集録ユーザーを有効にします。たとえば、当社の複数のチャネルの設計だけでなく「詰まっている」センサーの影響を最小限に抑える、サンプル サイズを増やすにも使用できます。さらの複数のチャネルでは、彼らは実験で同時に実行できるように、特定のチャネルに治療を指定できます。すべての六つのチャンネルを使用して単一の実験記録に約 1200 の新興ミツバチのことができます。私たちの知る限りでは、昆虫の出現を測定任意の現在のシステムの最大サンプル サイズで、環境のキューに対して微細出現パターンを観察することができました。最後に、体制の恩恵の部分の大半が 3 D 印刷であるという事実を。これは正確にサイズのコンポーネント (検出器の詰まり) などの操作中に発生したエラーの可能性を低減するを作成します。また、他の研究システムのカスタマイズできます。
このプロトコルの目標は、時間生物学、ストレスの生理学を調査するため、昆虫の出現を測定する自動化されたシステムの正確な質問カスタム ビルドすることです。このシステムは、されているし、環境手がかりに応えて昆虫出現パターンに関連する未解決の問題の調査に重大であり続けます。ここでそのアセンブリ使い出現アルファルファ切葉蜂、第被害の研究室での実験設定の検出について述べる。システムが自動化されたプログラム可能なマイクロ コント ローラーを使用して、3 D プリント パーツを使用してカスタマイズ可能です。印刷されたラックは金属 BB 蜂巣細胞を含む場所管で保持します。出現時に金属の BB は日付と SD カードへの出現の時間記録する赤外線センサーを通過、ラックから解放されます。現在のデザインはM. 被害、最適ですが、昆虫の他の種のためのマイナーな調整とを合わせることができます。
アセンブリおよび昆虫の出現のタイミングの精密測定では、システムの使用のためのプロトコルを提案します。このシステムは限られた以前のデザインを 2 つの問題を解決する: 部分的な自動化と限られたサンプルのサイズ。マイクロ コント ローラーは、複数のチャネルを使用してサンプル サイズを増加させてもを使用したデータ収集を自動化することでこれらの問題を解決しました。現在の設計では、1200 蜂の合計を保持することができます六つのチャンネルを持っています。追加チャンネルに加算または減算増加し、サンプルのサイズだけでなく、同時に複数の治療法の効果を調査するためもできる必要な場合することができます。将来のアプリケーションの制限、変更の重要なステップを以下に示します。
自動化されていないシステムの唯一の部分は、ひなセル、メタル掲示板実験の先頭にエアガン ペレットとラックを読み込んでいます。ラックは、彼らが傾くように設計されていますが、金属板の偶発的な放出を防止する、後ろ金属板のラックが立って直立、ケアを転倒防止に少しはラックを配置する場合取られなければなりません。また、ラックは、滑走路と金属の BB の落下軌道整列、棚の端と同じ高さであることを確認します。最後に、葉の破片は、滑走路から消去されるべきだ、以前の実験から金属板を保持して足回りをクリアしてセンサーがブロックされないようにする必要があります。CSV ファイルとして SD カードにデータを自動的に記録し、SD カードがある限り、Arduino が実行されないように、スクリプトを記述。データ ファイルは RStudio と可視化スクリプトを使用して、前述のように R に手動でインポートします。このスクリプトは自動的にバブル プロットとしてデータをグラフ化し、期間中央値および出現の日を識別します。Arduino のスクリプトを記述して、イベント データを電源障害発生時のデータ損失を防止するファイルの末尾に追加します。ただし、これはまた、一度 SD カードからデータを抽出すると、次の実験の前にすべてのファイルをクリアするかを意味します。
SketchUp ファイルへの変更は、変更されたラックで使用される異なるサイズのチューブと、異なるサイズの昆虫のラックのサイズを調整させることができます。さらに、昆虫がチューブを離れるを防ぐために同様に異なるサイズのペレットが必要、エアソフト ペレットのサイズが重要です。さまざまな変化はバブル プロットおよび他のグラフィックの変数の外観を変更する R スクリプトさせることができます。
BB は金属検出された複数のデータ ポイントとしてカウントされているから単一金属 BB を防ぐ後 1 秒の任意の特定のチャネルを無効にしますデバウンス コードを記述して偽陽性のリスクを低減します。これにより、一度に多くの蜂が出てくる場合に惜しまれつつデータ ポイントがチャネルは独立であるという事実の可能性がこのリスクが軽減されます。現在のシステムのもう一つの制限は、個々 のデータ ポイントが認識されない、すなわち、落ちる金属 BB さかのぼることができない特定の個人です。さらに、現在のシステム測定の出現がないの羽化リズムにおけるM. 被害出現と羽化が同義である種の羽化リズムを測定するが。最後に、現在のデザインは、耐候性、制御された環境にその使用を制限することではありません。
今後の用途は、 M. 被害のタイミング出現の他の非生物と生物の環境手がかりの効果を調べるします。さらに、昆虫は、多様な環境を占有、関連する環境手がかりは種によって異なります。したがって、複数の昆虫種の設立は分類群を越えた進化した調査方法の概日システムに重要です。少しはどのように発達条件について; 羽化のタイミングに影響を与える知られています。したがって、出現に治療の効果を解読する当社のシステムを使用できます。さらに、環境手がかりの組み合わせは昆虫の応答に影響を与える、従って今後の実験計画の出現への相対的な影響を理解する複数の環境のキューを組み込む必要があります。最後に、展開を観察するフィールドで出現リズムは、自然の設定を仲介する方法。このシステムと添加剤の製造、オープン ソースのプログラミング、および監視可能な生物学的特性のユニークな組み合わせの使いやすさは、教育の設定に使用する候補。
The authors have nothing to disclose.
説明システムを用いた実験で、有益なフィードバックのファーゴ、ノースダコタで昆虫の低温生物と生態作業のグループを認識したいと思います。
PLA printer filament | www.lulzbot.com | various | Catalog number varies by color |
0.5 mL microcentrifuge tubes | www.daigger.com | EF4254C | |
4.5 mm size "bb" metal pellets | www.amazon.com | B00419C1IA | Daisy 4.5 mm metal size bb pellets |
6.0 mm plastic "softair" pellets | www.amazon.com | B003QNELYE | Crosman 6 mm airsoft pellets |
Plastic corregated sheet | www.lowes.com | 345710 | Corrugated plastic sheet |
Infrared emmiter/detector pair | www.amazon.com | B00XPSIT3O | 5 mm diameter, 940 nm wavelength |
120 ohm resisitors | www.amazon.com | B01MSZK8DV | 120 ohm, 1/4 watt |
22 GA hookup wire | www.adafruit.com | 1311 | |
RJ45 jacks | www.sparkfun.com | PRT-00643 | |
Custom PCB board | www.pcbexpress.com | n/a | Can be printed from files included in the supplimental data |
Arduino Nano v 3.0 | www.roboshop.com | RB-Gra-01 | |
SD card module | www.amazon.com | DFR0071 | DFRobot SD card module |
Real Time Clock module | www.adafruit.com | 264 | DS1307 real time clock breakout board |
Temperature/humidity sensor | www.tinyosshop.com | G4F4494F29ED05 | DHT11 temperature/humidity sensor on breakout board |
470k ohm resistors | www.amazon.com | B00EV2R39Y | |
Female headers | www.adafruit.com | 598 | Break off to desired length |
Male headers | www.adafruit.com | 392 | Break off to desired length |
Ribbon wire | www.amazon.com | B00X77964O | 10 wire ribbon wire with connectors |
LCD screen | www.adafruit.com | 198 | |
Cat6 cable | www.amazon.com | B00N2VISLW | |
SD card | www.amazon.com | B00E9W1URM |