Neste artigo, vamos demonstrar o estabelecimento de culturas clonais de espécies de algas conjugação unicelulares coletadas de um site de campo natural.
É essencial para estabelecer culturas clonais de microalgas para uso em estudos de vários temas, tais como fisiologia, genética, taxonomia e Microbiologia. Assim, é extremamente importante desenvolver técnicas para estabelecer culturas clonais. Neste artigo, vamos demonstrar o estabelecimento de culturas clonais de uma alga de conjugação. São coletadas amostras de água do campo. Posteriormente, as células são isoladas, usando uma pipeta capilar de vidro, colocado na mídia e cresceu em condições adequadas para a geração de uma cultura clonal.
Conjugação de algas (da ordem Zygnematales), também conhecido como conjugatophytes, ocupam uma posição-chave filogenética como os parentes vivos mais próximos dos antepassados imediatos da terra plantas1,2. Estabelecidas culturas clonais de algas têm levado a uma grande variedade de estudos taxonômicos, fisiológicos e genéticos ao longo dos últimos anos. As técnicas de isolamento de microorganismos de um campo natural têm uma longa tradição de3,4. Nos últimos anos, isolamento automatizado técnicas usando citometria de fluxo foram também estabelecidos5. O método mais comum usado para obter uma única célula para o estabelecimento de uma cultura clonal é isolamento de célula única usando uma pipeta capilar de vidro6. Esse método tradicional requer habilidade e um protocolo experimental preciso.
Neste artigo, demonstramos a amostragem de algas de amostras de campo e o estabelecimento de culturas clonais de algas unicelulares de conjugação, tais como a espécie Closterium , usando uma pipeta capilar de vidro. Uma amostra de água contendo as células vegetativas é coletada de um site de campo (por exemplo, um lago, lagoa ou arrozal). As células são isoladas da amostra de água usando uma pipeta capilar de vidro e em seguida lavadas. As células são cultivadas em um tubo de ensaio contendo meio de nitrogênio-completada (médio CA) a 24 ° C, sob uma luz: 8 16-h-h regime de escuro. Esse método também é apropriado para isolar outras microalgas para gerar culturas clonais.
Usando o método presente, cepas de 9 cultura clonal de SP. Closterium foram estabelecidas de 15 células isoladas da amostra de água (Inba1), que representa uma taxa de sucesso de 60%. Identificação de espécies realizarão no futuro por observação morfológica, bem como análises de ADN, tais como análise filogenética molecular8.
No presente método, o frescor da amostra de água é importante para a taxa de sucesso. É melhor isolar as células a partir das amostras de água logo que possível após a coleta de campo. Embora as células da espécie Closterium (por exemplo, c. ehrenbergii, c. peracerosum-strigosum-littorale complexo) podem ser mantidas na amostra de água para cerca de 7 d armazenando-a 4-8 ° C, o isolamento das células é desejável no dia da coleção ou no dia seguinte. Também é importante remover todos os contaminadores que não sejam as células alvo, aumentando assim o número de repetições de lavagem (i.e., > 3 x) podem impedir a contaminação das culturas por microorganismos no solo e células.
Uma limitação dessa técnica é que os meios de cultura utilizados neste protocolo (CA ou condicionados CA médio) nem sempre são adequados para todas as algas de conjugação. Em alguns casos, pode ser necessário considerar o uso de outro meio, bem como a luz diferente e a condições de temperatura. Além disso, como é difícil provar se uma cultura cresceu de uma única célula, é necessário buscar com precisão apenas 1 célula ao transferir células para um tubo de ensaio. Portanto, a transferência deve ser feito com uma nova pipeta capilar de vidro cada vez.
Estabelecer uma cultura clonal com este método de lavagem de pipeta é um método clássico/padrão e é o método mais confiável para usar para isolar as células desejadas para um estudo. Estabeleceram-se as culturas clonais de conjugação algas usadas em muitos estudos8,9,10,11 usando o método actual. É difícil analisar a conjugação algas sem uma cultura clonal. Além disso, nos últimos anos, sequências do genoma inteiro de novo tornou-se fácil de obter (por exemplo, usando o MinION nanopore sequencer), e estabelecer culturas clonais facilitará ainda mais o sequenciamento de novo . Em outras palavras, esse método é o primeiro passo no futuro estudar destas algas para compreender melhor a sua biodiversidade.
A fim de estabelecer uma tensão estável de cultura, é necessário realizar determinadas etapas críticas com precisão dentro do protocolo. O passo mais importante é a preparação de uma pipeta capilar de vidro com uma abertura ideal para permitir a passagem de apenas uma única célula. A abertura da pipeta capilar de vidro deve ser ligeiramente mais do que o comprimento do eixo menor da célula de interesse. A pipeta capilar de vidro ideal pode aspirar a uma única célula por ação capilar. No entanto, se o diâmetro da abertura é muito grande, o capilar também desenhará em materiais de contaminantes não-vivos ou mesmo (um) outro microrganismo, além da célula-alvo.
Para obter uma pipeta capilar de vidro com um ideal de abertura, os seguintes pontos são importantes para observação. Primeiro, o pilar de fogo deve ser estreito ao aquecer a pipeta capilar de vidro. Em seguida, quando puxar a pipeta Pasteur, tem que ser removido da chama; caso contrário, a abertura da pipeta Pasteur entrará em colapso.
Os equipamentos e recipientes mostrados neste protocolo são básicos e podem ser modificados. Por exemplo, usando placas multi bem em vez de vidros de relógio com um poço, a lavagem da célula pode ser feita mais eficiente. Além disso, os recipientes podem ser substituídos por outros semelhantes. Através da transferência de uma única célula para o meio de cultura para a última etapa, uma cultura clonal pode ser estabelecida.
Preparar um recipiente esterilizado e trabalhando em um capuz estabelecerá axénica cepas (não contaminadas). Para evitar a contaminação, é necessário repetir a etapa de lavagem com alíquotas frescas mais de 3x. Às vezes, as bactérias também são esterilizadas pela adição de antibióticos15.
Esse método focado em gênero (Zygnematales) isolamento, mas alterando o tamanho da abertura da pipeta capilar de vidro, pode ser aplicado para o isolamento de diferente tamanho plâncton.
Agradecemos Hisayoshi Nozaki (Universidade de Tóquio), Takashi Nakada (Keio University), Yuka Marukawa Hashimoto (Universidade feminina do Japão) e Hiroyuki Sekimoto (Universidade feminina do Japão). Gostaríamos de agradecer os revisores para suas observações. Este estudo foi suportado por um subsídio para investigação científica (n. º 26440223 e 15H 04413) da sociedade para a promoção da ciência, Japão, Japão e por uma concessão da Fundação de desenvolvimento de nova tecnologia para Yuki Tsuchikane.
Sampling | |||
Plankton net | RIGO, Japan | N-NO380T | Mesh size: 32 µm |
Portable microscope (e.g., Nature Scope FABRE) | Nikon, Japan | JAN: 4960759 206725 | Magnification: 20× |
Loupe (e.g., Peak 1985 Steinheil System Magnifier) | Tohkai Sangyo Co. Ltd., Japan | 1985-20 | Magnification: 20× |
Spuit | EIKEN CHEMICAL CO. LTD. Japan | Sterile spuit No.4 | |
50 mL Tube (50 mL centrifuge tubes with screw caps) | Labcon, USA | 3181-345-008 | |
Bottle (100 mL Polycarbonate bottle) | AS ONE Corporation, Japan | 1-7403-01 | |
60 mm dish | Asahi glass Co. Ltd., Japan | 1010-060 | For observation of algae. 60 mm/non-treated dish |
Preparation of a micropipette | |||
Pasteur pipettes (cotton plugged 9” Pasteur Pipettes) | Fisher Scientific, USA | 13-678-8B | 7 × 225 mm |
Rubber bulb (SPOID SILICONE, 1 cc) | AS ONE Corporation, Japan | 5-5669-01 | 10 × 40 mm |
Stainless forceps | AS ONE Corporation, Japan | PT-09 | 110 mm |
Single-cell isolation | |||
Watch glass (Blood reaction board) | Sekiya Rika Co., Ltd, Japan | F14-155-030 | to rinse cells during isolation. 22 mm diameter and 1 mm depth |
Threaded test tubes | Fujimotorika, Co., Ltd, Japan | XX142 | 18 Ø × 170 mm |
Inverted light microscope | Olympus, Tokyo, Japan | CKX41N | for isolation of algae. |
Plastic dish | Asahi glass Co. Ltd., Japan | SH90-15E | 90 × 15 mm |