Moleküler görüntüleme matris yardımlı lazer desorpsiyon/iyonlaşma tabanlı görüntüleme kütle spektrometresi (maldı-IMS) ile birden çok analitler eş zamanlı haritalama biyolojik örnekleri sağlar. Burada, Alzheimer hastalığı ve serebral amiloid angiopathy örnekleri maldı-IMS kullanarak beyin dokuları algılama ve görselleştirme amiloid β protein için bir iletişim kuralı mevcut.
Alzheimer hastalığı (Ah) nevropatoloji birikimi ve amiloid β (Aβ) peptidler toplama içine beyin hücre dışı plaklar ile karakterizedir. 40 amino asitleri, oluşan Aβ peptidler amiloid habercisi proteinler (APP) β – ve γ-secretases tarafından oluşturulur. Aβ sadece beyin parankimi zamanda leptomeningeal ve serebral damar duvarları, serebral amiloid angiopathy (CAA) bilinen yatırılır. Aβ peptidler çeşitli tespit edildi iken, detaylı üretimini ve dağıtımını bireysel Aβ peptidler reklam patolojik dokularda ve CAA değil tam olarak ele. Burada, bir protokol matris yardımlı lazer desorpsiyon/iyonlaşma tabanlı görüntüleme kütle spektrometresi (maldı-IMS) kapsamlı protein eşleme elde etmek için insan otopsi beyin dokuları üzerinde geliştirmek. Bu amaçla, insan kortikal numuneler Tokyo Metropolitan Gerontoloji Enstitüsü, beyin bankadan elde edilmiştir. Donmuş cryosections kes ve indiyum-teneke-oksit (ITO) transfer-kaplı cam slaytlar. Spectra elde maldı sistemini kullanarak uzamsal çözünürlük ile ilâ 20 µm. Sinapinic asit (SA) düzgün yatırılır ya otomatik ya da el ile bir püskürtme kullanarak slayt üzerinde. MALDI-IMS geçerli teknik avantajları ile çeşitli Aβ tür aynı bölümleri içinde insan beyni bakılırsa tipik bir veri kümesi belirli probları elde edilebilir. Ayrıca, yüksek çözünürlüklü (20 µm) görüntüleme bir reklam beyin ve şiddetli CAA örnek açıkça gösterir iken Aβ1-42 ve Aβ1-43 beyin parankimi Senil plak (SP) tevdi tevdi Aβ1-36 Aβ1-41 leptomeningeal damarlarının. Reklam, CAA, patoloji anlamada, genetik, klinik ve patolojik gözlemleri ile birlikte standart bir yaklaşım olarak maldı-IMS benimsemeye uygun ve diğer nörolojik hastalıklar üzerinde mevcut strateji tabanlı.
Tanı yapmak için ve nörodejeneratif hastalıkların patogenezinde anlamak için hassas moleküler patolojik mevduat gerekli1tanımlamasıdır. Reklam sırasında Aβ SPs beyin parankimi yapmak için üretilen ve damarlarının yatırılır çok önce hastalık başlangıcından2,3,4,5,6. Aβ1-42 AD beyin SP baskın peptid olmakla birlikte, N-terminal veya C-terminal gibi diğer Aβ türevleri kesildi veya Aβs değiştirilmiş, aynı zamanda etkilenen reklam beyin7,8,9‘tespit, 10. Tam bir resim insan beynindeki geniş Aβ dizi türlerin özellikle reklam ve serebral amiloid angiopathy (CAA)11, yardımcı olacaktır Aβ üretim, metabolizma ve ifade anlamak bilim adamları.
Nevropatoloji klasik yaklaşım, immünhistokimya (IHC) beyin dokuları12,13,14,15Aβs konumunu belirlemek için en kesin yöntem olmuştur. Genel olarak, ne zaman aynı anda çeşitli epitopları arada IHC molekülleri ayırt edemez. Buna karşılık, ortaya çıkan bir kütle spektrometresi tabanlı proteomik analiz özellikle Aβ türler antikorlar16,17ile ayrıştırılan beyin dokularında çeşitli analiz etmek için değerli bir yaklaşımdır. Beyin lysates ve immün çöktürülmüş örnekleri geleneksel kütle spektrometresi tabanlı analizi küçük Aβ peptidler algılamak başarısız olur ve Aβ dağıtım bilgileri beyin dokusu içinde kaybeder.
Önceki eserlerinde Aβ mevduat fare beynindeki görselleştirme reklam, APP23 gibi bir transgenik hayvan modelini kullanma başarılı olmuştur. Ancak, bu işlem hala teknik gelişmeler ile ilgili olarak çözünürlük ve hassasiyet18,19,20IMS ve IHC karşılaştırmak gerekir. Reklam nevropatoloji insan beyin eğitimi aldı ve biz maldı-IMS teknoloji insan otopsi beyin dokuları üzerinde kapsamlı protein eşleme21elde etmek için kullanılır. Bu amaçla, biz onun hız, hassasiyet ve tekrarlanabilirlik avantajları vardır kütle spektrometresi gelişmiş bir tür için bir iletişim kuralı geliştirilmiştir.
Burada biz Aβ ve onun izoformlarının görselleştirme sonuçlarını ve detaylı bir iletişim kuralı üzerinden reklam ile birkaç autopsied beyin gösterdi ve CAA maldı-IMS ile. Aβs ifade profil büyük ölçüde N ve C-terminal çeşitleri Aβ1-42 değiştirildi. Aβ1-41 ilk tespit ve geçerli protokol ile insan beynindeki görüntülenir ve daha fazla IHC21ile doğrulandı. IMS tarafından yatırılan Aβ morfolojisi yüksek çözünürlüklü analiz (20 mikron) IHC ile iyi anlaşma olması gerektiğini düşünüyor, IMS ve IHC eşit Aβ mevduat onların konumu ve protein içeriği, yanı sıra onların morfolojisi ayırt için katkıda bulunur. Burada açıklanan tüm oksipital korteksi yapılan gibi farklı beta-amiloid türlerin yerelleştirme tüm beyin bölgeleri arasında eğitim gelecekteki deneyler geçerli iletişim kuralını kullanarak Genelleştirilmiş.
Kritik protokol içinde insan beyin dokularında toplanan proteinlerin etkili bir iyonizasyon elde etmek için doku hazırlık adımları adımlardır. Bir matris tabaka lazer enerjisini absorbe ederek, desorpsiyon ve analitler iyonlaşma ikna etmek için gereklidir. Bu süreçte, bir tüm doku bölümü homojen küçük kristallerle kaplı. Analit matrix ile homojen cocrystallization yüksek-duyarlı ve yapı içermeyen görüntüleme için önemlidir. Üç sprey yöntemlerin her biri kendi avantajları vardır. El ile sprey kaplama en sık kullanılan yöntemlerden biridir. Pistole uygundur; Ancak, usta işlem gerektirir. Hassas ve tekrarlanabilir deneysel teknik gerekli olduğu gibi ultrasonik bir püskürtücü ve/veya otomatik bir püskürtücü geçerli iletişim kuralları’nda açıklandığı gibi kullanılması önerilir. Bir odanın içine püskürtülür çünkü ultrasonik bir püskürtücü ile ilgili olarak bu nem ve sıcaklık Oda tarafından etkilenir değil. Bu arada, otomatik bir püskürtücü ile iyi tekrarlanabilirlik ile nispeten korunmuş Uzaysal çözünürlük elde edilir. Genel olarak, üç yöntem artarak 1) airbrush, 2) otomatik cihaz ve 3) ultrasonik püskürtme sırasına göre elde edilen Uzaysal çözünürlük.
En önemlisi, bu protokolü ilk olarak algılayıp Aβs insan beyninin bakılırsa örneklerinde görselleştirmek için oluşturuldu. İnsan APP İsveç tipi mutasyon dayalı reklam hayvan bir model olarak oluşturulan görselleştirme maldı-IMS ile Aβs için APP23 fareler, daha önce başkaları tarafından bir varolan yöntem18,19ile bildirilmiştir. Ancak, APP23 için uygulanan eski protokol onun yanal çözünürlük ve hassasiyet Aβ görselleştirmek için yeterli değildi. Önceki işleri yüksek Aβ konsantrasyonlarda doku sınır dışında açıkça APP23 ile onların iletişim kuralı18,19görüntüleme aktarımında açıklanmıştır. Yani sözde ‘gerçek SPs ve IMS arasında matris ayıklama adım nedeniyle görüntü Bulanıklığı’ maldı-tipi görüntüleme ile kaçınılmazdı. Ancak, geçerli protokolündeki görüntü kayboldu ve her spektrum beyin parankimi tek her SP temsil.
Burada gösterildiği gibi biz reklam ilk kez Aβ1-41 izleyebilirsiniz ve CAA beyin maldı-IMS yanı sıra IHC, spesifik bir antikor kendi üretimi21tarafından. Aβ1-41 Aβ1-45 türeyen γ-secretase kademeli bölünme27,28,29,30‘,31 iken Aβ işleme modeline göre Aβ1-45 ile Aβ1-42, Aβ1-38 türer . Bu geçerli protokol bu model desteklediği anlamına gelir. Bu teknik sınırlamalar gelince, biz insan otopsi beyin örneklerinden heterojen göz önünde bulundurulmalıdır. Bir anlamda, en kritik adım nitelikli otopsi beyin dokusu ile etik kanıt değerlendirmek etmektir. Tam otopsi beyin dokuların geçerli protokol ile maldı-IMS ayrı ayrı birden çok değişiklikler yanı sıra henüz olacaksın düzenleyen reklam, patogenezi bilinmeyen factor(s) sahip karmaşık molekülleri tüm dağıtım izleyebilirsiniz tanımlı. Ayrıca, yaşlı insan beynindeki çeşitli nevropatoloji genel patogenezinde anlamakta, nörolojik hastalıklar, genetik, klinik ve patolojik gözlemleri ile standart bir yaklaşım olarak maldı-IMS benimsemeye uygun olmalı .
Başka bir kritik maldı-IMS elde edilen veri kümesinden veri madenciliği işlemi her zaman zaman alıcı olduğu adımdır. El ile veri madenciliği her tepe dağıtım her görüntüyü tıklatın ve analiz örnek morfolojisi ilişkilendirmek dağıtımları arayın açmasını gerektirir. Otomatik uzamsal ayrılmasını madencilik, veri kümesinin bir özetini sağlar ve belirgin özellikleri hızlı algılama sağlayan veri ilk adımı olarak kullanılabilir. Bu yaklaşım, belirli bir bölge spectra arasındaki benzerlikler istatistiksel olarak belirlenir ve benzer spectra bir küme gruplandırılmıştır. Tüm pikseller onların küme atama (şekil 5) göre renk kodlu. Reklam/CAA çalışmanın, ilgi alanı Aβ işlemimiz parenkima plak ve subaraknoid ve parenkimal vasküler yapılar alanıdır. Daha fazla IHC ile doğrulanmış iki farklı zirveleri Aβ1-40 ve Aβ1-4221m/z değerleri vardı. Böylece, colocalized m/z Aβ1-40 ve N C terminali için ek açıklama eklenen kesilmiş Aβ yanı sıra daha fazla çözümleme için bilinmeyen peptidler zaten Aβ1-42 ile bulmak kolaydır.
Weller ve meslektaşları Aβ çevresinde21damarları daha fazla arterler etrafında damar duvarlarında birikir bildirdin. İnterstisyel sıvı (ISF) lenf nodu yolu ile için bir Perivasküler drenaj yolu22,23,24,25 beyin parankimi atılır Aβs içerir önerilmiştir Ayrıca, ,26. CAA için reklam21 ‘ önemli ölçüde katkıda Perivasküler drenaj yolları (şekil 5), beynin olası varlığı 20 µm çözünürlükte maldı-IMS veri kümesini temel alan bir bölümleme harita oluşturmak için geçerli protokolü destekler , 32. Ayrıca, plak ve subaraknoid damarlara ile korelasyon her m/z değerlerini hesaplayarak colocalized işaretçisi proteinler keşfedebilirsiniz. Yaşlı insan beynindeki çeşitli nevropatoloji genel patogenezinde anlamakta, klinik, genetik kurulan IHC veri ile birlikte güçlü bir yaklaşım olarak maldı-IMS ve nörolojik olarak patolojik gözlemlere benimsemeye uygun olmalıdır hastalıklar.
The authors have nothing to disclose.
Bu eser kısmen yenilikçi alanlar üzerinde bilimsel araştırma için Grant-in-Aid tarafından desteklenmiştir (beyin Protein eskime ve demans denetim 26117004; M.I. ve m.). Bu araştırma kısmen stratejik araştırma programı tarafından beyin Bilimleri Japonya ajansı için tıbbi araştırma ve geliştirme (AMED) için desteklenen bir durumdu. Tüm deneyler varış yönergelere uygun olarak yapılmıştır.
Cryostat | Leica Microsystems, Wetzlar, Germany | CM1950 | |
Indium tin oxide (ITO)-coated microscope glass slide | Bruker Daltonics | #237001 | |
Blade (disposable) | Leica Microsystems, Wetzlar, Germany | #117394 | |
O.C.T. Compound | Leica Microsystems, Wetzlar, Germany | FSC 22 Blue | |
Scanner | EPSON | GT-980 | |
Air-Brush | GSI Creos | PS274 | |
Compressor | MRHOBBY | Mr.Linear compressor L5 | |
Ultrasonic sprayer | Bruker Daltonics | ImagePrep | |
Automatic sprayer | HTX Technologies | TM Sprayer | |
Confocal-laser-scanning-microscope | Carl Zeiss Inc. | LSM 700 | |
Ultra high speed MALDI instrument | Bruker Daltonics | rapifleX MALDI Tissuetyper | |
MALDI control software | Bruker Daltonics | FlexControl 3.8 | |
Data analysis software | Bruker Daltonics | FlexImaging 5.0 | |
Molecular histology software | SCiLS, Bremen, Germany | SciLS Lab 2016a | |
Statistical software | SCiLS, Bremen, Germany | SciLS Lab 2016a | |
Sinapinic acid (SA) | Nacalai tesque | 30494-91 | |
Alpha-Cyano-4-hydroxyl-cinnamic acid (CHCA) | Wako | 037-19261 | |
Calibration standard | Bruker Daltonics | ||
Biotinylated anti-mouse IgG antibodies | Vector Laboratories, Inc., Burlingame, CA | ||
Biotinylated anti-rabbit IgG antibodies | Vector Laboratories, Inc., Burlingame, CA | ||
Avidin and biotinylated HRP complex. | Vector Laboratories, Inc., Burlingame, CA | Vectastain Elite ABC kit | |
3,3-diaminobenzidine (DAB) | Vector Laboratories, Inc., Burlingame, CA | Vectastain Elite ABC kit |