Molti sistemi sperimentali sono stati utilizzati per comprendere i meccanismi che regolano lo sviluppo delle cellule T e la funzione in una risposta immunitaria. Qui un approccio genetico mediante trasduzione retrovirale è descritto, che è economica, tempo efficiente e, soprattutto, altamente informativo nell'identificare vie di regolazione.
Helper T cell development and function must be tightly regulated to induce an appropriate immune response that eliminates specific pathogens yet prevents autoimmunity. Many approaches involving different model organisms have been utilized to understand the mechanisms controlling helper T cell development and function. However, studies using mouse models have proven to be highly informative due to the availability of genetic, cellular, and biochemical systems. One genetic approach in mice used by many labs involves retroviral transduction of primary helper T cells. This is a powerful approach due to its relative ease, making it accessible to almost any laboratory with basic skills in molecular biology and immunology. Therefore, multiple genes in wild type or mutant forms can readily be tested for function in helper T cells to understand their importance and mechanisms of action. We have optimized this approach and describe here the protocols for production of high titer retroviruses, isolation of primary murine helper T cells, and their transduction by retroviruses and differentiation toward the different helper subsets. Finally, the use of this approach is described in uncovering mechanisms utilized by microRNAs (miRNAs) to regulate pathways controlling helper T cell development and function.
The immune response must be highly regulated to eliminate infections but prevent attacks on self-tissue that lead to autoimmunity. Helper T cells play an essential role in regulating the immune response, and a great deal of effort has been undertaken to understand their development and function (illustrated in several recent reviews 1-3). However, many questions remain, and many approaches have been utilized to study the mechanisms controlling helper T cell development and function. These have ranged from the use of in vitro cell culture systems to whole animals. Cell culture systems, especially those using cell lines, offer the benefit of ease of use and the ability to generate large amount of material to do sophisticated biochemical analyses. However, they suffer from their limited ability to reproduce the actual conditions occurring in an immune response. In contrast, whole animal experiments offer the benefit of relevance, but they can suffer from difficulties in manipulation and the ability to perform precise controls in addition to their large costs and ethical implications. Nevertheless, the vast majority of helper T cells studies today still require the use of whole animal experiments involving primary T cells because of the inability of cell lines to duplicate the exact steps occurring in the whole animal. Therefore, it is essential to utilize cost effective approaches that are highly informative.
Genetics is one powerful tool to study helper T cell development and function, yet traditional methods involving gene knockouts or transgenes are time consuming and expensive so they are often out of reach of small labs. However, retroviral transduction offers a powerful, rapid and, cost effective genetic approach to study the mechanisms of specific gene products. Therefore, it is commonly used in papers studying helper T cell development and function.
We have optimized a procedure for retroviral transduction of helper T cells. It utilizes the pMIG (Murine stem cell virus-Internal ribosomal entry site-Green fluorescent protein) retroviral expression vector, in which the gene of interest can be cloned and thereby expressed from the retrovirus long terminal repeat (LTR) 4. In addition, downstream of the inserted gene of interest is an internal ribosome entry sequence (IRES) followed by the green fluorescent protein (GFP) gene so transduced cells can easily be followed by their expression of GFP. The vector was originally derived from the Murine Stem Cell Virus (MSCV) vectors, which contain mutations in repressor binding sites in the LTRs making them resistant to silencing and thus, giving high expression in many cell types including helper T cells 5,6. Production of high titer retrovirus requires a simple transient transfection protocol of human embryonic kidney (HEK) 293T cells with the MIG vector and a helper virus vector that expresses the retroviral GAG, Pol, and Env genes. For this the pCL-Eco helper virus vector 7 works well in producing high titer replication incompetent retroviruses.
Here these protocols for retroviral production and transduction of primary murine T cells are described in addition to some of our results using this approach to study miRNA regulation of gene expression controlling helper T cell differentiation. miRNAs are small RNAs of approximately 22 nucleotides in length that post-transcriptionally regulate gene expression by targeting homologous sequences in protein encoding messenger RNAs and suppressing translation and inducing message instability 8,9. miRNAs play critical roles in developmental gene regulation. They are essential in the earliest stages of development, as embryos that cannot produce miRNAs die at a very early stage 10. In addition miRNAs are important later on in the development of many tissues. They are thought to function by fine-tuning the expression of genes required for developmental programs 1. In helper T cells miRNAs play multiple roles and are required for regulatory T cell (Treg) development 11-14. We used retroviral transduction as a means to dissect the mechanisms of miRNA regulation of Treg differentiation 15. Through such studies important individual miRNAs were determined by retroviral-mediated overexpression. Subsequently, relevant genes regulated by these miRNAs were identified in order to understand the molecular pathways regulated by miRNAs in helper T cell differentiation.
Retrovirali mediata sovraespressione dei geni è un potente strumento per analizzare la funzione delle cellule T helper, come il loro sviluppo e la funzione è spesso determinato dal livello di espressione di regolatori chiave. Tuttavia, cauta interpretazione dei risultati è necessario perché i livelli di espressione significativamente superiori a quelli del gene endogeno possono introdurre molti manufatti. Pertanto, questa tecnica dovrebbe essere combinato con altri per verificare la pertinenza della funzione. Ad esempio, la sovraespressione dovrebbe essere integrata da un'espressione ridotta utilizzando siRNA o knockout genici, se disponibile. Con miRNA, abbiamo completato gli esperimenti iperespressione con quelli del blocco utilizzando virus che overexpressed miRNA artificiale siti che hanno agito come inibitori competitivi per un miRNA 15 targeting. cellule trasdotte retrovirali possono anche essere utilizzati in saggi biochimici che coinvolgono RNA e analisi di proteine. Tuttavia, un grosso limite di questi esperimenti è l'efficienza di trasduzione resulting in una popolazione mista di cellule trasdotte e non trasdotte. Pertanto, questi test saranno molto probabilmente richiederà l'ordinamento della GFP + popolazione. Infine, in vitro di differenziazione dovrebbero essere combinati con esperimenti in vivo, e un modo questo può essere realizzato è trasferendo adoptively cellule T trasdotte in topi e dopo la loro differenziazione e il loro effetto sulla risposta immunitaria.
Uno dei limiti principali di questo sistema è la dimensione del genoma di RNA che può essere confezionato in capside retrovirale. Nella nostra esperienza, la dimensione massima di inserimento per il sistema retrovirale MIG che dà buona produzione virus è 3-3,5 kb. Pertanto, i geni più grandi non possono essere analizzati con questo sistema, in quanto forniscono poveri titoli di virus. Tuttavia, la maggior parte dei geni sono più piccole di questa dimensione così questo sistema è utile per un'ampia varietà di studi gene.
Con trasduzione retrovirale, diverse alternative all'interno di questi protocosono stati utilizzati ls. Molti ricercatori hanno utilizzato linee cellulari di confezionamento che esprimono stabilmente i geni retrovirali (per esempio riferimento 16). Tuttavia, abbiamo ottenuto i titoli più alti utilizzando cellule HEK 293T standard, con il co-trasfezione del vettore virus helper PCL-Eco. Isolamento di cellule T helper naive può essere ottenuta anche attraverso cell sorting piuttosto che il tallone e separazione cellulare magnetica protocollo colonna, ma questo richiede l'accesso a un cell sorter, ei costi per tempo specie sono tipicamente superiori ai reagenti tallone. Infine, ci sono variazioni su condizioni di attivazione utilizzati per differenziare le cellule T helper nei diversi sottoinsiemi. Ad esempio, TCR stimolazione delle cellule per troppo tempo prima dell'esposizione Treg condizioni che inducono può inibire la loro induzione 16. Questo può essere un problema perché espressione retrovirale richiede divisione cellulare indotta dalla stimolazione di cellule. Tuttavia, abbiamo trovato efficiente induzione Treg utilizzando questo protocollo con O / N activzione prima di trasduzione retrovirale.
All'interno di questi protocolli, applicazione di successo richiede diversi fattori. preparati retrovirus ad alto titolo hanno bisogno di efficienza trasfezione delle cellule 293T HEK DNA così alta qualità e precisione preparato 2x HBS sono importanti. Inoltre, la densità cellulare delle cellule HEK 293T deve essere circa il 50% al punto di trasfezione causa buona espressione del DNA trasfettato richiede che le cellule sono in attiva crescita, e questo saranno inibiti se le cellule sono troppo scarsi o densi. Le cellule presso la densità ottimale durante trasfezione dovrebbero raggiungere confluenza ad un certo punto durante le fasi di raccolta dei virus, ma continuerà a produrre le riserve di virus ad alto titolo tutto il percorso attraverso l'ultima collezione. Differenziazione efficiente delle cellule T helper richiede una buona qualità cellulare così garantire che le cellule isolate sono la purezza di figura 1. Analogamente, la qualità delle cellule dipende dalla fr topiom cui sono stati isolati. Per questi studi, abbiamo utilizzato 6-8 settimane di età C57BL 6 topi /. topi più anziani possono avere cellule meno ingenuo, e altri ceppi possono differire nella loro differenziazione. Ad esempio, topi BALB / c sono più inclini a risposte Th2 di topi C57BL / 6 17 così come indicato in precedenza, C57BL / 6 cellule T possono essere difficili da indurre una risposta Th2. Inoltre, una delle condizioni di differenziazione può variare leggermente da laboratorio a laboratorio, e l'effetto del gene sovraespressione può diventare evidente in condizioni sub-ottimali solo così può avere bisogno di essere titolato concentrazioni di citochine nelle diverse condizioni di polarizzazione. Infine, gli effetti del gene overexpressed o le condizioni di polarizzazione sulla proliferazione cellulare può influenzare l'efficienza di trasduzione così effetti misurazione del gene di interesse possono richiedere ottimizzare i tempi e la concentrazione dei reagenti polarizzanti. Ottimizzazione tutti questi fattori dovrebbe portare a risultati informativi con questo sistema.
The authors have nothing to disclose.
This work was supported by a Biotechnology and Biological Sciences Research Council (BBSRC) grant (BB/H018573/1) and a BD Biosciences grant.
RPMI | Sigma | R8758 | |
DMEM | Sigma | D5671 | |
Penicillin Streptomycin solution | Sigma | P4333 | |
L-Glutamine | Sigma | G7513 | |
β-mercaptoethanol | Sigma | M3148 | |
DPBS | Sigma | D8537 | |
MIG vector | Addgene | Plasmid 9094 | |
pCL-Eco vector | Addgene | Plasmid 12371 | |
Cell strainer | BD Falcon | 352350 | |
Magnetic beads mouse CD4 cell kit | Invitrogen (Dynabeads) | 11415D | |
Streptavidin Beads | Miltenyi Biotech | 130-048-102 | |
MS cell separation columns | Miltenyi Biotech | 130-042-201 | |
LS cell separation columns | Miltenyi Biotech | 130-042-401 | |
CD25 Biotenylated MAb | BD Biosciences | 85059 | clone 7D4 |
CD62L Biotenylated MAb | BD Biosciences | 553149 | clone MEL-14 |
Polybrene (Hexadimethrine Bromide) | Sigma | 107689 | |
Anti-CD3 | eBiosciences | 16-0031-85 | clone 145-2C11 |
Anti-CD28 | eBiosciences | 16-0281-85 | clone 37.51 |
Anti-IL-4 | BD Biosciences | 559062 | clone 11B11 |
Anti-IFN-gamma | BD Biosciences | 559065 | clone XMG1.2 |
Anti-IL-2 | BD Biosciences | 554425 | cloneJES6-5H4 |
Recombinant IL-12 p70 | eBiosciences | 14-8121 | |
Recombinant IL-4 | BD Biosciences | 550067 | |
Recombinant TGF-beta | eBiosciences | 14-8342-62 | |
Recombinant IL-6 | eBiosciences | 14-8061 | |
Recombinant IL-2 | eBiosciences | 14-8021 | |
PMA | Sigma | P8139 | |
Ionomycin | Sigma | I0634 | |
Brefeldin A | eBiosciences | 00-4506 | |
Paraformaldehyde | Sigma | 16005 | Paraformaldehyde is toxic so use appropriate caution when handling |
Foxp3 staining buffer set | eBiosciences | 00-5523 | |
Anti-CD4 FITC | eBiosciences | 11-0041 | clone GK1.5 |
Anti-CD8a perCP-cy5.5 | eBiosciences | 45-0081-80 | clone 53-6.7 |
Anti-MHCII PE | eBiosciences | 12-0920 | clone HIS19 |
Anti-CD25 PE | eBiosciences | 12-0251-82 | clone PC61.5 |
Anti-CD62L PE | eBiosciences | 12-0621-82 | clone MEL-14 |
Anti-CD44 APC | eBiosciences | 17-0441 | clone IM7 |
Anti-IFN-gamma FITC | eBiosciences | 11-7311-81 | clone XMG1.2 |
Anti-IL-4 PE | BD Biosciences | 554435 | clone 11B11 |
Anti-IL-9 PE or APC | eBiosciences/Biolegend | 50-8091-82/514104 | clone RM9A4 |
Anti-IL-17a PE | BD Biosciences | 559502 | clone TC11-18H10 |
Anti-Foxp3 APC or PE | eBiosciences | 17-5773-82/12-5773-80 | clone FJK-16s |
NaCl | Sigma | S7653 | |
KCl | Sigma | P9333 | |
Na2HPO4-2H2O | Sigma | 71643 | |
Dextrose/Glucose | Sigma | G7021 | |
HEPES, free acid | Sigma | H3375 | |
NH4Cl | Sigma | A9434 | |
Disodium EDTA | Sigma | D2900000 | |
KHCO3 | Sigma | 237205 | |
CaCl2 | Sigma | C5670 |