フルーツフライを飼育<em>キイロショウジョウバエ</em>無菌およびノトバイオート条件の下で

ほとんどの動物は密接誕生から死¹に細菌（ '細菌叢'）に関連付けられています。微生物フリー（ '純粋'）および微生物関連（ '従来'）動物の比較は、微生物が代謝、栄養、血管、肝臓、呼吸器系、免疫学、内分泌、および神経機能²を含む動物の健康の多様な側面に影響を示しています。果実はキイロショウジョウバエを飛ぶ微生物^3,4の存在下で、これらのプロセスの多くを理解し、動物の健康の^5,6上の微生物の影響を研究するための重要なモデルです。いいえ細菌種は、すべての個人（「コア」）に存在しないが、 アセトバクター及びラクトバチルス種が数値的に両方の実験室で飼育し、野生キャッチDの微生物叢を支配しますメラノ 。 （Komagataeibacterとグルコノ含む）その他Acetobacteraceae、Firmi（このような腸球菌およびロイコノストックなど）cutisの複数形、および腸内細菌は、低量のいずれかでショウジョウバエの個体で頻繁に存在している、または多量^7-12で不規則に存在します。

ショウジョウバエや哺乳類の微生物叢は、世代^14,19内および全体の不定です。微生物叢に依存する特性を測定する際の微生物叢の心変わりは、表現型のノイズにつながることができます。例えば、 ショウジョウバエ ^15-18でAcetobacteraceae影響脂質（トリグリセリド）の記憶。 Acetobacteraceaeは、別の¹⁹に比べて1つのバイアルのハエで、より豊富である場合は、同質遺伝子ハエは異なる表現型^20を持つことができ^ます 。マウス¹⁴内細菌叢の心変わりの問題の解決策は、仔マウスに、それぞれの新しい世代（変更されたSchaedler叢）を8優勢微生物種の定義されたコミュニティを導入することで、1960年代から実践してきました各子犬をマウス細菌叢の同じキーメンバーにさらされていることを保証します。微生物叢は、研究³²の主要な目標ではなく、実験条件の様々な重要な微生物の存在を確実にするために先例を設定した場合でも、この練習は、細菌叢の組成を制御します。

ショウジョウバエの栄養上の微生物の影響を定義するには、純粋フライラインを導出するためのいくつかのプロトコルは、胚の次亜塩素酸dechorionation（いずれかの派生デノボ各世代または滅菌ダイエットへの転送によって世代的に維持）と抗生物質治療^13を含む、開発されてきました。このような抗生物質治療とシリアル転送、 デノボ dechorionationとの交絡変数（ 例えば 、卵の密度、残留汚染する微生物、オフターゲット抗生物質の効果）の対より細かく制御の両方のための使いやすさと迅速性などの異なるアプローチの利点があります。かかわらず、方法の胚を無菌ために、指定された微生物種の準備、導入が定義されている（ 'ノトバイオート'）コミュニティとショウジョウバエの文化を可能にします。また、Schaedler叢の使用を模倣し、このコミュニティは、各バイアル中の形質に影響を及ぼす微生物の存在を確保し、細菌叢の心変わりの合併症を回避するために（ステップのみ6-7以下）従来から産卵された卵に接種することができました。ここでは、胚のデノボ dechorionationにより無菌とノトバイオートショウジョウバエを上げるためのプロトコルを記述し、導入や、汚染微生物の分類群の存在を確認するため。