Here, we present a protocol for determination of dalbavancin susceptibility of clinically relevant Gram-positive bacteria using a broth microdilution reference methodology.
Teste de susceptibilidade antimicrobiana (AST) é realizada para avaliar a actividade in vitro dos agentes antimicrobianos contra várias bactérias. Os resultados da AST, que são expressos em concentrações inibitórias mínimas (MICs) são usados em pesquisas para desenvolvimento antimicrobiana e acompanhamento do desenvolvimento de resistência e no contexto clínico para orientação terapêutica antimicrobiana. Dalbavancin é um lipoglycopeptide semi-sintético agente antimicrobiano que foi aprovado em Maio de 2014 pela Food and Drug Administration (FDA) para o tratamento da pele e da estrutura da pele infecções bacterianas agudas causadas por organismos Gram-positivos. A vantagem de dalbavancin sobre terapias anti-estafilococos actuais é a sua longa meia-vida, o que permite uma dosagem de uma vez por semana. Dalbavancin tem atividade contra Staphylococcus aureus (incluindo tanto sensível à meticilina S. aureus [MSSA] e resistente à meticilina S. aureus [MRSA]), estafilococos coagulase-negativo, <em> Streptococcus pneumoniae, Streptococcus grupo anginosus, estreptococos β-hemolíticos e os enterococos sensíveis à vancomicina. Tal como outros agentes lipoglycopeptide recentes, a optimização de métodos de ensaio e de caldo de susceptibilidade do CLSI ISO inclui o uso de dimetilsulfóxido (DMSO) como solvente quando se preparam soluções de reserva e de polissorbato 80 (P80) para aliviar a adesão do agente de plástico. Antes dos estudos clínicos e durante o desenvolvimento inicial de dalbavancin, estudos de susceptibilidade não foram realizados com a utilização de P-80 e os resultados de MIC tendiam a ser 2-4 vezes mais elevada e da mesma forma superior MIC resultados foram obtidos com o método de diluição em ágar susceptibilidade. Dalbavancin foi incluída pela primeira vez no CLSI tabelas metodologia caldo de microdiluição em 2005 e alterada em 2006 para esclarecer o uso de DMSO e P-80. O procedimento de microdiluição de caldo (DMO) mostrado aqui é específico para dalbavancin e está de acordo com os métodos do CLSI e ISO, com detalhe passo-a-passo e foc-nos sobre os passos críticos para maior clareza.
Dalbavancin é um lipoglycopeptide semi-sintético que foi aprovado pela FDA em Maio de 2014 no tratamento da pele e da estrutura da pele infecções bacterianas agudas causadas por organismos Gram-positivos 1. O principal objetivo de detalhar esse método em um formato de vídeo é fornecer uma orientação clara para os cientistas de laboratório e de pesquisa clínica para testes e relatórios de resultados precisos e reprodutíveis dalbavancin suscetibilidade.
A determinação de um agente antimicrobiano MIC por métodos comerciais é realizada rotineiramente em laboratórios clínicos para a avaliação da atividade in vitro de um agente contra bactérias patogênicas. O método descrito aqui é o método de microdiluição do caldo como recomendado pelo CLSI e ISO 2,3,4. Desde dalbavancin métodos de suscetibilidade comerciais não estão disponíveis no momento (no momento desta publicação) e de difusão de disco e métodos de diluição de agar não são atualmente recomendadas fou dalbavancin, métodos de diluição de caldo de referência são as atuais opções disponíveis 12,14. Como este método de referência não é um comercial e FDA apuradas in vitro método de diagnóstico, laboratórios de análises clínicas nos EUA que usar este procedimento para testes paciente deve respeitar os requisitos regulamentares para um teste de laboratório desenvolvido (LDT). Prevê-se que como a utilização dalbavancin aumenta, mais laboratórios terá uma necessidade de testar este composto. Vancomicina teste como um substituto para a determinação da susceptibilidade de S. dalbavancin aureus foi validado 5. No entanto, dalbavancin podem ser activos contra vancomicina S. intermediário aureus (VISA) e, portanto, os médicos podem solicitar resultados dalbavancin MIC. Além disso, pode ser requerida resultados de MIC para as outras espécies bacterianas.
O ponto de interrupção suscetível FDA para dalbavancin contra S. aureus foi estabelecida em ≤0.12 ug / ml. FDA atribuído apenas uma suscepticategoria ble por causa da falta de dados sobre os isolados resistentes. A distribuição normal de MIC entre tipo selvagem S. aureus é entre 0,03-0,12 ug / ml, com uma MIC modal clara de 0,06 ug / ml. Uma ligeira variação nos resultados de MIC, devido ao método de diferença, para além da variação de DMO inerente de ± uma diluição, poderia potencialmente ter um impacto significativo sobre as taxas de susceptibilidade. 6 À semelhança de outros agentes lipoglycopeptide, testes de susceptibilidade dalbavancin pode ser um desafio, como resultado de solubilidade e a dimensão relativamente grande da molécula e as suas propriedades de ligação 7,8,9. O método DMO referência aqui descrito inclui dois passos específicos que são únicas para agentes insolúveis e / ou agentes lipoglycopeptide: (1) a utilização de DMSO, para preparação de soluções de reserva e (2) adição de 0,002% de P-80 no painel MIC definitiva diluições. O objetivo desta publicação de vídeo é fornecer clareza para o método BMD dalbavancin e specifically focar essas etapas-chave, para garantir resultados precisos e reprodutíveis MIC.
Os seguintes detalhes do método são apresentados para considerações adicionais quando se preparava para testes dalbavancin MIC. O design do painel de MIC dependerá do número de agentes antimicrobianos para ser testado (isto é., Dalbavancin sozinho ou vários agentes) e as espécies de bactérias a ser testado. As concentrações dalbavancin deve englobar os pontos de quebra de interpretação para todas as espécies bacterianas a serem testados e toda a gama de diluições esperada para pelo menos uma estirpe de CQ. A série de diluição antimicrobiana podem ser organizados em linhas ou colunas, dependendo do número de agentes anti-microbianos e / ou isolados / placa e método de inoculação. O volume de dalbavancin pó e caldo deve ser calculado para assegurar que quantidades ideais são produzidos e dos resíduos é mínima. Para o exemplo utilizado na presente publicação, os volumes são baseados na preparação de dois painéis de MIC. Cátion ajustado caldo Mueller Hinton deve ser preparado e autoclavado de acordo com homeminstruções e esterilidade dos meios de comunicação de ufacturer verificada. MIC painéis pode ser feito e utilizado na preparação do mesmo dia, ou podem ser testadas com os organismos de controlo de qualidade adequados e os painéis validados armazenado congelado para uso futuro. É importante a utilização de técnicas de esterilidade durante todo o procedimento.
Não há critérios estritos para a verificação da concentração de inóculo com contagem de colônias. Contagens de colónias pode ser verificado inicialmente para cada espécie testada e / ou periodicamente para validar o passo de diluição realizada no passo 4.2. É importante que a validade do padrão 0,5 de McFarland também é verificado rotineiramente com E. coli ATCC 25922, utilizando um procedimento semelhante ao passo 4.5. Se os resultados não são equivalentes a 1-2 x 10 8 CFU / ml, um novo padrão de 0,5 McFarland deve ser obtida. Se as contagens de colónias a partir de poços de CIM estão fora da gama aceitável (2-8 x 10 5 resultados UFC / mL e de MIC para o isolado clínico (s) pode variar de the esperado distribuição normal (ex. 0,03-0,12 ug / ml para S. aureus) e / ou resultados de MIC para o isolado de controle de qualidade (s) estão fora dos limites esperados, o teste de validação é necessário e modificação método pode ser garantido. Sugere-se que um padrão McFarland 0,5 validado é utilizada para repetir a contagem (s) de colónias e se os resultados são mais uma vez fora dos resultados esperados, a diluição do inoculo, realizada no passo 4.2 deve ser ajustado em conformidade e a MIC repetido. Note-se que uma verificação de pureza é necessário, mesmo se um número de colónias é realizada porque o procedimento de contagem de colónia utiliza um volume diluídos que podem não ser necessariamente detectar concentrações mais baixas de organismos contaminantes.
Para um teste MIC seja considerado válido, o crescimento aceitável deve ocorrer no controle do crescimento bem. Para a maioria das bactérias que irá ser testados contra dalbavancin (isto é., Os estafilococos, estreptococos e enterococos, o crescimento irá ser visto como um botão (tipicamente> 2 mm) e menos frequently, o crescimento pode aparecer como turbidez no poço. Ao contrário de alguns agentes antimicrobianos que podem apresentar fuga efeito que as concentrações de aumentar, endpoints dalbavancin são tipicamente bem definido. Existem vários dispositivos de visualização, destinadas a facilitar a leitura testes de microdiluição, que podem ser usados para ler dalbavancin placas contendo desde que não há nenhum compromisso na capacidade de discernir o crescimento nos poços.
Os passos críticos dentro do protocolo estão relacionadas com as partes do procedimento que estão relacionados com a solubilidade do dalbavancin e adição de P80. É importante que a concentração máxima de dalbavancin utilizada não é maior do que 1.600 ug / ml, que o DMSO é utilizado como um solvente e que as concentrações intermédias são preparadas em DMSO, antes de fazer as diluições de caldo de modo a que a concentração final de DMSO no MIC painel poços não é maior do que 1%. DMSO é higroscópico e, por conseguinte, a utilização de garrafas mais velhos de DMSO foi de um consideratíon que diz respeito à dalbavancin solubilidade. No entanto, não enquanto um estudo BMD pequeno com cepas de controle de qualidade tem mostrado que isso seja uma variável importante (ver secção Resultados), é uma boa prática para usar garrafas novos ou recentemente abertos de DMSO. É também importante que P80 é adicionado ao caldo no passo final da preparação de diluição da droga e é a uma concentração final de 0,002% na MIC bem.
O processo da DMO incluído aqui utiliza preparação de painéis de MIC utilizando 50 ul / poço em dalbavancin e P-80 concentrações, duas vezes a concentração final e da adição de inoculo com 50 ul / poço de modo a que o volume final / poço é 100 ul. Este método permite a um formato de painel MIC a ser produzida para o ensaio de ambos S. aureus e S. pneumoniae, porque o sangue de cavalo lisado pode ser adicionado ao inoculo. Métodos alternativos para a preparação de painéis de MIC utilizando 100 uL / poço com a adição de até 10 ul / poço são descritos naCLSI e ISO procedimentos.
O ponto de interrupção suscetível dalbavancin para S. aureus é ≤0.12 ug / ml (FDA folheto informativo). Como é mostrado na vigilância recente, a maioria dos isolados são inibidos por dalbavancin em níveis de 0,06 ug / ml 15. Com um ponto de interrupção suscetível perto do MIC modal, qualquer variação de MIC como resultado de diferenças de método pode afetar as taxas de susceptibilidade. Porque o procedimento de BMD para dalbavancin inclui alguns passos únicos (especificamente, o uso de DMSO na preparação de estoque e diluições do fármaco intermédios e 0,002% de P80 na MIC bem, é imperioso que o método é seguido exactamente. O organismo S. aureus QC (ATCC 29213), com uma muito clara MIC dalbavancin modal de 0,06 mg / ml, tem sido um bom indicador de variação método e deve ser usado rotineiramente para validar o método de BMD. Se os resultados MIC estão com o intervalo esperado de 0,03-,12 ug / ml, mas são tendências, quer ao baixo ou high lado desta gama, é garantido uma validação adicional do método.
A adição de 0,002% de P80 é recomendada para todos os organismos relevantes Gram-positivo (staphylococcci, enterococos e estreptococos.) No entanto, é de notar que foi demonstrado que lisadas sangue de cavalo age semelhante a P-80 relativamente ao seu anti-obrigatório capacidade e que a adição de P-80 de CAMHB + LHB não tem qualquer efeito suplementar sobre os resultados de MIC dalbavancin estreptococos.
Não há atualmente nenhum método de difusão em disco para testes dalbavancin e por causa da fraca correlação da DMO e os resultados AD, testes de susceptibilidade de dalbavancin usando o método AD não é recomendada 12, 14. O método de BMD devem ser utilizados para a avaliação futura do dalbavancin susceptibilidade e como um padrão-ouro para o desenvolvimento de testes comerciais de susceptibilidade aos antimicrobianos.
The authors have nothing to disclose.
Prior work with regard to susceptibility testing of dalbavancin has been valuable in development of a standardized methods and acknowledgement for this work is given to JMI Laboratories, Robert Rennie and Beth Goldstein.
Dalbavancin | Metrics, Inc. | Greenville, NC | BI-397 |
Vancomycin | Sigma-Aldrich | St. Louis, MO | C5793 |
Cation Adjusted Mueller Hinton Broth | Becton Dickinson | Sparks, MD | 212322 |
Lysed horse blood | Cleveland Scientific | Bath, OH | |
Dose-it peristaltic pump | Integra Biosciences | Hudson, NH | |
Multi-channel pipet (Viaflo II) | Integra | Hudson, NH | 4164 |
12 channel pipet (Matrix) | ThermoFisher Scientific | Waltham, MA | |
Single channelpPipets (Ovation 10 µL – 100 µL) | VistaLab | Brewster, NY | |
96 well microplate | Greiner Bio-one | Monroe, NC | 650161 |
50 mL flat cap conical bottom centrifuge tubes | ThermoFisher Scientific | Waltham, MA | |
16x125mm disposable glass tubes | ThermoFisher Scientific | Waltham, MA | |
12x17mm snap cap, polystyrene tubes | ThermoFisher Scientific | Waltham, MA | |
16 mL centrifuge tubes | BioExpress | Kaysville, UT | C-3394-2 |
Reagent reservoirs | Integra Biosciences | Hudson, NH | 4312 |
Disposable sterilelLoops (1 uL & 10 uL) | Biologix | Lenexa, KA | 65-0001,65-0010 |
Tryptic soy agar + 5% sheep blood | Becton Dickinson | Sparks, MD | |
Incubator (ambient) | Sanyo | ||
Incubator (5% CO2) | Sanyo | ||
Analytical balance | ThermoFisher Scientific | Waltham, MA | |
Gloves | Kimberly-Clark | 52817 | |
Lab coats |