Verfahren zur Biopsie des Vastus lateralis, Herstellung von gereinigtem Mitochondrien und respirometrischen Profiling beschrieben. Die Verwendung von kleinen Muskelvolumen macht diese Technik für klinische Forschung.
Respirometrische Profilierung von isolierten Mitochondrien wird allgemein zur Atmungskette Funktion zu untersuchen. Wir beschreiben eine Methode zur Gewinnung von Proben menschlichen Vastus lateralis, Isolierung von Mitochondrien minimale Mengen an Skelettmuskelgewebe und Platte basiert respirometrischen Profilerstellung mit einer extrazellulären Fluss (XF) Analysator. Vergleichs respirometrischer Profile erhalten unter Verwendung von 1,0, 2,5 und 5,0 ug Mitochondrien zeigen, daß 1,0 ug ausreichend ist, um die Atmung zu messen, und daß 5,0 ug liefert konstante Ergebnisse basierend auf dem Vergleich der Standardfehler. Western-Blot-Analyse der isolierten Mitochondrien für mitochondriale Marker COX IV und nicht-mitochondrialen Gewebemarker GAPDH darauf hin, dass es nur begrenzte nicht-mitochondrialen Kontamination mit diesem Protokoll. Die Fähigkeit, mitochondriale respirometry in so wenig wie 20 mg des Muskelgewebes studieren ermöglicht Benutzern individuelle Biopsien mehrerer Endpunkte der Studie wurden in der klinischen NutzungForschungsprojekte.
Mitochondrien sind die Primärenergieproduktionsstandorte in der Zelle und eine wichtige Rolle bei der Alterung sowie verschiedene altersbedingte Erkrankungen wie Herz-Kreislauf-Krankheit, Alzheimer-Krankheit, Diabetes, Krebs und Fettleibigkeit. Respirometrische Profilierung von isolierten Mitochondrien bietet direkte Analyse der Elektronentransportkette (ETC) Funktion und hat wesentlich zu unserem Verständnis der mitochondrialen Biologie und ihre Rolle in Gesundheit und Krankheit beigetragen. Isolierten Mitochondrien werden verwendet, um verschiedene Aspekte des bioenergetischen dergleichen Substrattransport, ATP-Synthase-Aktivität, Protonenleck usw. Die in diesem Manuskript beschriebenen Methodik wurde optimiert, um respirometrischen Analyse von Mitochondrien aus Skelettmuskelgewebe Biopsien aus humanen Probanden isoliert ermöglichen studieren. Die in dieser Handschrift beschrieben Biopsie-Protokoll wurde von unseren Mitarbeitern für die letzten 12 Jahre genutzt. Unsere Gruppe hat über 700 Verfahren durchgeführt bei Erwachsenen unterschiedlichen Alters,bis zu 90 Jahre alt, und mit verschiedenen chronischen Krankheitszuständen ohne nachteilige Sicherheitsfragen. Ein wichtiger Aspekt dieses Protokolls ist, dass es speziell für die minimale Mengen von Gewebe zu verwenden, wodurch ihre Verwendung in klinischen Studien erleichtert.
Verschiedene Protokolle zur Isolierung von Mitochondrien entwickelt. Fernandez-Vizarra et al. 1,2 beschrieben, ein Verfahren zur Isolierung von Mitochondrien aus verschiedenen Rattengeweben sowie kultivierte Zellen. Garcia-Cazarin et al. 3 haben ein Verfahren zur Isolierung von Mitochondrien aus Skelettmuskeln von Ratten und Mäusen berichtet. Verfahren zur Isolierung von Mitochondrien aus Rattenhirn wurde auch von Iglesias-Gonzales et al. 4 Gross berichtet, et al. 5 über ein Verfahren zur Isolierung von Mitochondrien mit der barocycler und / oder der PCT Schredder. Kürzlich Franko et al. 6 über ein Verfahren zur Isolierung von hochangereichertem Mitochondrien mit Anti-TOM22 Magnetischen Kügelchen.
Während diese Protokolle liefern hervorragende Ergebnisse sind Gewebe Größenanforderungen hoch im Vergleich zu dem in dieser Handschrift beschriebenen Methode. Zum Beispiel, Gross et al. 5 verwendet 1,5-1,8 g des M. gastrocnemius und etwa 2 g des Nierengewebes. Ebenso Franco et al. 6 verwendet 500 mg Mauslebergewebe. Aus unserer Erfahrung, typische Ausbeuten von perkutanen Nadelbiopsie der Skelettmuskulatur (Vastus lateralis) erwarten reichen von 100 bis 200 mg. Die Fähigkeit, die Funktion der Mitochondrien in 20 bis 50 mg mit der hier beschriebenen Protokoll Muskelgewebe zu bewerten ermöglicht Benutzern, mehrere Assessments pro Biopsie und zur Lagerung von Proben für die spätere Verwendung in anderen molekularbiologische Experimente durchführen. Dies ist ein entscheidendes Merkmal in der klinischen Forschung und anderen Studien, die sorgfältige Verwendung von Proben erfordern. Es sei darauf hingewiesen, dass die zuvor eingefroren Mitochondrien sind nicht gut für die Untersuchung gekoppelt Atmung aufgrund oute werdenr Mitochondrienmembran Beschädigung und Verlust von Cytochrom-C-Aktivität. Unsere Methode wurde angepasst und von der von Chappell und Perry 7 veröffentlichte Methode modifiziert.
Mit den in dieser Handschrift beschriebenen Methoden, haben wir vor kurzem berichtet, dass die respirometrischen Profil von Mitochondrien aus menschlichen Vastus lateralis isoliert ist direkt mit Behinderung, gemessen als Gehgeschwindigkeit 8 korreliert.
Isolierten Mitochondrien werden oft in Studien, die die Rolle von ETC-Funktion, sowie andere mitochondriale Aktivitäten, einschließlich Substrattransport und TCA-Zyklus-Funktion zu untersuchen genutzt. Respirometrische Tests unter Verwendung von isolierten Organellen ermöglichen direkte Untersuchung der grundlegenden Prozesse der oxidativen Phosphorylierung und intrinsischen Eigenschaften des ETC. Respirometrische Profilierung von isolierten Mitochondrien im Vergleich zu ganzen Zellen oder permeabilisierten Muskelfasern hat den Vorteil, relativ einfach die Interpretation der Daten und das Fehlen von "Einmischung" von nicht-mitochondrialen Prozesse oder Veränderungen im mitochondrialen Masse / Biogenese. Die Normalisierung der Daten auf der mitochondrialen Proteingehalt, wodurch einfache Quervergleich der Mitochondrien zwischen den Proben ermöglicht. Respirometrische Profilierung von isolierten Mitochondrien ist eine bevorzugte Vorgehensweise, wenn das Ziel der Studie ist es, festzustellen, zu Grunde liegenden Mechanismen und die Ermittlung konkreter Ziele wie ETC Komponentes / Komplexen oder mitochondrialen Transportmechanismen.
Beschrieben ist ein Protokoll zur Muskelbiopsie und Isolierung von funktionellen Mitochondrien aus kleinen Gewebeproben. Diese Methode führt zu reproduzierbaren Ergebnissen zwischen den Benutzern durch die Nutzung eines automatisierten Homogenisator gegenüber Hand bedient Dounce-Homogenisator. Isolierung von Mitochondrien können mit so wenig wie 20 mg des Muskelgewebes geführt werden. Die Menge an isolierter Mitochondrien, die aus dieser Stichprobengröße erhalten werden kann, ist ausreichend, um Seahorse Platte-basierte Respirometrie laufen, während überschüssige Mitochondrien für andere Experimente und die Lagerung für die weitere molekulare Analysen. Es sei darauf hingewiesen, dass dieses Verfahren zum XF 96, wobei auch kleinere Mengen von Mitochondrien kann verwendet werden (1-2 & mgr; g pro Vertiefung) übersetzt werden kann.
Mehrere Protokolle zur Isolierung von Mitochondrien setzen auf Dounce-Homogenisator für die erste Gewebezerstörung. Ein Nachteil dieses Verfahrens ist die praktische Art der AusgangsgewebeHomogenisierung. Die Kraft und Geschwindigkeit der Stößel im Homogenisator deutlich zwischen den Betreibern 6 variieren. Dies kann im Experiment zu Experiment Variation sowie Labor zu Labor Variation führen, und führt zu Schwierigkeiten beim Vergleich von Daten zwischen den Experimenten. Dies ist von besonderer Bedeutung in Interventionsstudien, wenn Daten von den Teilnehmern an getrennten Zeitpunkten typischerweise vor und nach der Behandlung und möglicherweise an mehreren Stellen gesammelt. Wir verwenden eine automatisierte Homogenisator für einen einheitlicheren Ansatz, der mehr reproduzierbare Ergebnisse mit begrenzten Mensch-zu-Mensch-Variante ergibt. Die Geschwindigkeit der Herstellung macht diesen Ansatz für den Umgang mit mehreren Proben gleichzeitig. Typischerweise können bis zu drei Versuche an einem einzigen Tag durchgeführt werden.
Potentielle Einschränkungen der hier beschriebenen Technik ergeben sich aus der Verwendung von isolierten Organellen und der Verwendung eines plattenbasierten Format. Beispielsweise Picard et al. haben Dämonstrated dass isolierten Mitochondrien besitzen funktionellen Eigenschaften, die sich grundlegend von denen des intakten Mitochondrien in permeabilisierten Muskelfasern unterscheiden. Sie schlugen vor, dass die mitochondriale Isolationstechniken führen zu veränderten bioenergetischen Funktion, wie deutlich erhöht RCR Vergleich zu permeabilisierten Muskelfasern und verstärkte Produktion reaktiver Sauerstoffspezies 13. Im Vergleich zu permeabilisierten Muskelfasern, Isolierung von Mitochondrien ist erfordern längere Vorbereitungszeit. Auch Verlust zellulären Gehalt vermindert physiologische Relevanz, etwas, das in ganzen Zellen und sogar permeabilisiert Fasern zurückgehalten wird. Die Verwendung von Plattenbasis Respirometrie mit den beschriebenen Technik ermöglicht replizieren Läufe pro Probe. Jedoch müssen Mitochondrien zum Boden jeder Vertiefung haften. Diese Konfiguration unterscheidet sich von ihrer gewohnten Umgebung und können funktionelle Eigenschaften zu beeinflussen. Außerdem sollte beachtet werden, dass unter Verwendung dieses Protokolls für mitochondriale Isolierung there können noch Verunreinigungen von endoplasmatischen Retikulum (ER) in der mitochondrialen Präparation sein. Unterschiede in der ER eine Verunreinigung die Bestimmung der mitochondrialen Ertrag und Einfluss Ergebnisse beeinflussen.
Abschließend dieser Studie präsentiert Daten, die bestätigt, dass die Mitochondrien aus Gewebe mit diesem Verfahren isoliert sind funktionell aktiv und kann für Studien / Anwendungen, die hochwertige isoliert Mitochondrien aus minimalen Skelettmuskelproben erfordern. Der Vorteil dieser Methode ist, dass: i) ist es möglich, den Mitochondrien von minimalen Mengen an Skelettmuskulatur zu isolieren, ii) das Verfahren ist schnell, iii) mit der Platte auf der Basis-Technologie ist es möglich, mehrere Proben gleichzeitig laufen, und iv) es gibt genug überschüssige Gewebe und isolierten Mitochondrien nach der bioenergetischen Test zur Probenlagerung und andere molekularbiologische Untersuchungen.
The authors have nothing to disclose.
We would like to thank Dr. Marc Liesa, Boston University School of Medicine, helpful discussions; Ms. Karin Murphy, Ms. Heather Gregory, and Mr. John Stone, all from Wake Forest School of Medicine, for helpful technical assistance in the development of this protocol.
Equipment | ||
Name of the Equipment | Company | |
Homogenizer Bio-Gen PRO200 | BioExpress | |
Eppendorf Centrifuge 5804 R | Fisher Scientific | |
Deepwell late Rotor | Fisher Scientific | |
6mm University College Hospital Needle | Cadence | |
60cc syringe | Fisher Scientific | |
96-well plate reader | Tecan (Genios-basic) | |
Seahorse XF 24-3 analyzer | Seahorse Biosciences, Inc. | |
Protein gel system | Life Technologies (Invitrogen) | |
Kodak Gel Logic 112 | Carestream Health, Inc | |
Kodak camera assembly | Carestream Health, Inc | |
Consumables | ||
Name | Company | Catalog Number |
XF24 V7 Cell Culture Microplate and XF24 sensor cartridge | Seahorse Bioscience | 100850-001 |
100867-100 | ||
Potassium hydroxide (KOH) | Sigma-Aldrich Co | 221473 |
Hydrochloric acid (HCl) | Acros | 12421-0010 |
Dulbecco's Phosphate buffered saline | Lonza | 17-512F |
Potassium chloride (KCl) | Fisher Scientific | P333 |
MOPS | Fisher Scientific | BP308 |
EDTA | Fisher Scientific | BP118 |
Magnesium sulfate (MgSO4) | Sigma-Aldrich Co | M7506 |
ATP | Sigma-Aldrich Co | A9187 |
Fatty acid-free BSA | Calbiochem | 126575 |
Sucrose | Sigma-Aldrich Co | S0389 |
Bacterial proteinase | Sigma-Aldrich Co | P-8038 |
D-Mannitol | Sigma-Aldrich Co | M9546 |
KH2PO4 | Fisher Scientific | P284 |
Magnesium chloride (MgCl2) | Sigma-Aldrich Co | M9272 |
HEPES | Sigma-Aldrich Co | H3784 |
EGTA | Sigma-Aldrich Co | E3889 |
BCA protein assay kit | Sigma-Aldrich Co | PI23227 |
Succinic Acid* | Sigma-Aldrich Co | S3674 |
Pyruvic acid* | Sigma-Aldrich Co | P5280 |
Malic acid* | Sigma-Aldrich Co | 2288 |
ADP(K+ salt)* | Sigma-Aldrich Co | A5285 |
XF Cell mito stress test kit | Seahorse Biosciences | 101706 |
Tween-20 | Santa Cruz Biotechnology, Inc. | SC-29113 |
NuPAGE 12% Bis-Tris Gel | Life Technologies (Invitrogen) | NP0343BOX |
Immobilin Transfer Membranes (0.45um) | Millipore | IPVH20200 |
MOPS SDS Running Buffer (20X)-500 ml | Life Technologies (Invitrogen) | NP0001 |
NuPAGE Transfer Buffer (20X)-1 liter | Life Technologies (Invitrogen) | NP0006-1 |
Primary antibodies (mAB to VDAC1/Porin) | Abcam | ab14734 |
Primary antibodies (mAB to GAPDH) | Abcam | ab9484 |
Anti-Mouse IgG (Goat), HRP-labeled | PerkinElmer | NEF822E001EA |
Anti-Rabbit IgG (Goat), HRP-labeled | PerkinElmer | NEF812E001EA |
*ADP, succinic acid, pyruvic acid, and malic acid should be adjusted to pH 7.4 with KOH only |