Méthodes pour la biopsie du vaste externe, préparation de mitochondries purifiées, et le profilage respirométrique sont décrits. L'utilisation de petit volume musculaire rend cette technique convient pour des applications de recherche clinique.
Respirométrique profilage des mitochondries isolées est couramment utilisé pour étudier la fonction électronique de la chaîne de transport. Nous décrivons une méthode pour obtenir des échantillons de vaste externe humaines, isoler les mitochondries des quantités minimes de tissu musculaire squelettique, et la plaque profilage respirométrique base en utilisant un flux extracellulaire (XF) analyseur. Comparaison des profils respirométriques obtenus en utilisant 1,0, 2,5 et 5,0 pg de mitochondries indiquent que 1,0 ug est suffisant pour mesurer la respiration et que 5,0 ug fournit des résultats plus constants sur la base de la comparaison des erreurs standard. Analyse par Western blot des mitochondries isolées pour le marqueur mitochondrial COX IV et non mitochondrial marqueur de tissu GAPDH indiquer qu'il ya contamination non limitée mitochondriale utilisant ce protocole. La possibilité d'étudier respirométrie mitochondrial en aussi peu que 20 mg de tissu musculaire permet aux utilisateurs d'utiliser biopsies individuels pour plusieurs paramètres de l'étude en cliniqueprojets de recherche.
Les mitochondries sont les sites de production d'énergie primaire dans la cellule et ont un rôle important dans le vieillissement ainsi que divers troubles liés à l'âge comme les maladies cardiovasculaires, la maladie d'Alzheimer, le diabète, le cancer et l'obésité. Respirométrique profilage des mitochondries isolées fournit une analyse directe de la fonction de la chaîne de transport d'électrons (ETC) et a contribué de manière significative à notre compréhension de la biologie mitochondriale et son rôle dans la santé et la maladie. Mitochondries isolées sont utilisées pour étudier divers aspects de la bioénergétique comme, transport de substrat, l'activité de l'ATP synthase, fuite de protons, etc. La méthodologie décrite dans ce manuscrit a été optimisé pour permettre une analyse respirométrique des mitochondries isolées de biopsies de tissus du muscle squelettique obtenus à partir de sujets humains. Le protocole de biopsie décrit dans ce manuscrit a été utilisé par notre personnel pour les 12 dernières années. Notre groupe a effectué plus de 700 procédures sur les adultes de différents âges,jusqu'à 90 ans, et avec diverses maladies chroniques sans aucun problème de sécurité défavorables. Un aspect clé de ce protocole est qu'il est spécifiquement conçu pour utiliser des quantités minimes de tissu, ce qui facilite son utilisation dans les études de recherche clinique.
Divers protocoles ont été développés pour isoler les mitochondries. Fernandez-Vizarra et al. 1,2 décrit un procédé pour isoler les mitochondries à partir de différents tissus de rat ainsi que des cellules en culture. Garcia-Cazarin et al. 3 ont fait état d'une méthode pour isoler les mitochondries à partir de muscles squelettiques de rat et la souris. Procédé pour isoler les mitochondries à partir de cerveau de rat a également été rapporté par Iglesias-Gonzales et al. 4 Gross, et al. Ont rapporté 5 un procédé pour isoler les mitochondries à l'aide du barocycler et / ou le destructeur de PCT. Récemment, Franko et al. 6 rapporté un procédé pour isoler les mitochondries fortement enrichis utilisant des anticorps anti-TOM22 Billes magnétiques.
Bien que ces protocoles donnent d'excellents résultats, les exigences de taille de tissu sont élevées par rapport à la méthode décrite dans ce manuscrit. Par exemple, Gross et al., 5 g de 01/05 à 01/08 utilisé le muscle gastrocnémien, et environ 2 g de tissu rénal. De même, Franco et al. 6 utilisé 500 mg de tissu de foie de souris. D'après notre expérience, les rendements typiques à attendre de la biopsie percutanée du muscle squelettique (vaste externe) vont de 100 à 200 mg. La capacité à évaluer la fonction mitochondriale dans 20-50 mg de tissu musculaire en utilisant le protocole décrit ici permet aux utilisateurs d'effectuer des évaluations multiples par biopsie et à conserver les échantillons pour une utilisation future dans d'autres expériences de biologie moléculaire. Ce est une caractéristique essentielle dans la recherche clinique et d'autres études qui nécessitent l'utilisation diligente des échantillons. Il convient de noter que les mitochondries préalablement congelés ne sont pas bonnes pour l'étude de la respiration couplé en raison de outEr dommages de la membrane mitochondriale et la perte de l'activité du cytochrome C. Notre méthode a été adaptée et modifiée de la méthode publiée par Chappell et Perry 7.
En utilisant les méthodes décrites dans ce manuscrit, nous avons récemment rapporté que le profil respirométrique des mitochondries isolées à partir Vastus humaine lateralis est directement corrélée avec la capacité physique, mesurée comme la vitesse de marche 8.
Mitochondries isolées sont souvent utilisés dans les études qui examinent le rôle de la fonction ETC, ainsi que d'autres activités mitochondriales, y compris le transport de substrat et la fonction du cycle TCA. Dosages respirométriques utilisant organites isolés permettent examen direct des processus fondamentaux de la phosphorylation oxydative et les propriétés intrinsèques de la ETC. Respirométrique profilage des mitochondries isolées par rapport aux cellules entières ou fibres musculaires perméabilisées a les avantages de relativement facile l'interprétation des données et l'absence d '"ingérence" de processus non mitochondriaux ou des changements de masse mitochondriale / biogenèse. Normalisation des données est basée sur la teneur en protéine mitochondriale, permettant ainsi simple comparaison croisée des mitochondries entre les échantillons. Respirométrique profilage des mitochondries isolées est une approche privilégiée lorsque le but de l'étude est de déterminer les mécanismes sous-jacents et identifier des cibles spécifiques tels que composante de ETCs / complexes, ou des mécanismes de transport mitochondriales.
L'invention concerne un protocole de biopsie musculaire et l'isolement des mitochondries fonctionnelles à partir de petits échantillons de tissu. Cette méthode donne des résultats reproductibles entre les utilisateurs en raison de l'utilisation d'un homogénéisateur automatisé par rapport à main homogénéisateurs de Dounce. Isolement des mitochondries peut être effectuée avec aussi peu que 20 mg de tissu musculaire. La quantité de mitochondries isolées qui peut être obtenu à partir de cette taille d'échantillon est suffisant pour exécuter Seahorse respirométrie base plaque tout en laissant mitochondries excédentaires à d'autres expériences et de stockage pour d'autres analyses moléculaires. On peut noter que cette méthode peut être traduit à la XF 96, où même de petites quantités de mitochondries peuvent être utilisés (1-2 ug par puits).
Plusieurs protocoles d'isolement pour les mitochondries se appuient sur homogénéisateurs de Dounce pour la perturbation initiale du tissu. Un inconvénient de cette méthode est la pratique de la nature du tissu initialhomogénéisation. La force et la vitesse du pilon dans le homogénéisateur peuvent varier considérablement entre les opérateurs 6. Ceci peut entraîner des variations expérience à l'expérience, ainsi que la variation laboratoire à laboratoire, et conduit à des difficultés dans la comparaison des données entre les expériences. Ce est particulièrement préoccupante dans les études d'intervention humaine lorsque les données des participants sont collectées à des moments distincts, généralement avant et après traitement, et potentiellement à des sites multiples. Nous utilisons un homogénéisateur automatisé pour une approche plus cohérente qui donne des résultats plus reproductibles avec une variation limitée de personne à personne. La vitesse de préparation rend également cette approche appropriée pour le traitement de plusieurs échantillons en même temps. En général, un maximum de trois expériences peuvent être effectuées en une seule journée.
Limitations potentielles de la technique décrite ici résultent de l'utilisation des organites isolés et l'utilisation d'un format à base de plaque. Par exemple, Picard et al. ont démontré que les mitochondries isolées possèdent des caractéristiques fonctionnelles qui diffèrent fondamentalement de celles des mitochondries intactes dans myofibres perméabilisées. Ils ont proposé que les techniques d'isolement mitochondriales résultent en fonction bioénergétique altérée, comme l'augmentation significative par rapport à RCR myofibres perméabilisées accompagnés de plus d'oxygène production d'espèces réactives 13. Par rapport aux fibres musculaires perméabilisées, l'isolement des mitochondries ne nécessite plus de temps de préparation. En outre, la perte de la teneur cellulaire diminue pertinence physiologique, ce qui est retenu dans des cellules entières perméabilisées même et les fibres. L'utilisation de respirométrie base plaque avec les permis de répliquer pistes technique décrite par échantillon. Cependant, les mitochondries doivent adhérer au fond de chaque puits. Cette configuration est différente de leur environnement normal et peut affecter les caractéristiques fonctionnelles. En outre, il convient de noter que l'utilisation de ce protocole pour l'isolement des mitochondries, there peut encore être contamination de réticulum endoplasmique (RE) dans la préparation mitochondriale. Les différences dans la contamination de ER peuvent affecter la détermination du rendement et d'influencer les résultats mitochondriales.
En conclusion, cette étude présente des données qui confirment que les mitochondries isolées à partir de tissus en utilisant cette procédure sont fonctionnellement actifs et peuvent être utilisés pour des études / applications qui nécessitent une haute qualité à partir de mitochondries isolées quantité minimale d'échantillons de muscles squelettiques. L'avantage de cette méthode est que: i) il est possible d'isoler les mitochondries à partir de quantités minimales de muscle squelettique, ii) la procédure est rapide, iii) avec la technologie de plaque sur la base, il est possible d'exécuter plusieurs échantillons en même temps, et iv) il ya assez de tissu excédentaire et les mitochondries isolées après l'analyse bioénergétique pour le stockage de l'échantillon et d'autres enquêtes de biologie moléculaire.
The authors have nothing to disclose.
We would like to thank Dr. Marc Liesa, Boston University School of Medicine, helpful discussions; Ms. Karin Murphy, Ms. Heather Gregory, and Mr. John Stone, all from Wake Forest School of Medicine, for helpful technical assistance in the development of this protocol.
Equipment | ||
Name of the Equipment | Company | |
Homogenizer Bio-Gen PRO200 | BioExpress | |
Eppendorf Centrifuge 5804 R | Fisher Scientific | |
Deepwell late Rotor | Fisher Scientific | |
6mm University College Hospital Needle | Cadence | |
60cc syringe | Fisher Scientific | |
96-well plate reader | Tecan (Genios-basic) | |
Seahorse XF 24-3 analyzer | Seahorse Biosciences, Inc. | |
Protein gel system | Life Technologies (Invitrogen) | |
Kodak Gel Logic 112 | Carestream Health, Inc | |
Kodak camera assembly | Carestream Health, Inc | |
Consumables | ||
Name | Company | Catalog Number |
XF24 V7 Cell Culture Microplate and XF24 sensor cartridge | Seahorse Bioscience | 100850-001 |
100867-100 | ||
Potassium hydroxide (KOH) | Sigma-Aldrich Co | 221473 |
Hydrochloric acid (HCl) | Acros | 12421-0010 |
Dulbecco's Phosphate buffered saline | Lonza | 17-512F |
Potassium chloride (KCl) | Fisher Scientific | P333 |
MOPS | Fisher Scientific | BP308 |
EDTA | Fisher Scientific | BP118 |
Magnesium sulfate (MgSO4) | Sigma-Aldrich Co | M7506 |
ATP | Sigma-Aldrich Co | A9187 |
Fatty acid-free BSA | Calbiochem | 126575 |
Sucrose | Sigma-Aldrich Co | S0389 |
Bacterial proteinase | Sigma-Aldrich Co | P-8038 |
D-Mannitol | Sigma-Aldrich Co | M9546 |
KH2PO4 | Fisher Scientific | P284 |
Magnesium chloride (MgCl2) | Sigma-Aldrich Co | M9272 |
HEPES | Sigma-Aldrich Co | H3784 |
EGTA | Sigma-Aldrich Co | E3889 |
BCA protein assay kit | Sigma-Aldrich Co | PI23227 |
Succinic Acid* | Sigma-Aldrich Co | S3674 |
Pyruvic acid* | Sigma-Aldrich Co | P5280 |
Malic acid* | Sigma-Aldrich Co | 2288 |
ADP(K+ salt)* | Sigma-Aldrich Co | A5285 |
XF Cell mito stress test kit | Seahorse Biosciences | 101706 |
Tween-20 | Santa Cruz Biotechnology, Inc. | SC-29113 |
NuPAGE 12% Bis-Tris Gel | Life Technologies (Invitrogen) | NP0343BOX |
Immobilin Transfer Membranes (0.45um) | Millipore | IPVH20200 |
MOPS SDS Running Buffer (20X)-500 ml | Life Technologies (Invitrogen) | NP0001 |
NuPAGE Transfer Buffer (20X)-1 liter | Life Technologies (Invitrogen) | NP0006-1 |
Primary antibodies (mAB to VDAC1/Porin) | Abcam | ab14734 |
Primary antibodies (mAB to GAPDH) | Abcam | ab9484 |
Anti-Mouse IgG (Goat), HRP-labeled | PerkinElmer | NEF822E001EA |
Anti-Rabbit IgG (Goat), HRP-labeled | PerkinElmer | NEF812E001EA |
*ADP, succinic acid, pyruvic acid, and malic acid should be adjusted to pH 7.4 with KOH only |