Dieser Artikel enthält ein Protokoll für die Extraktion von Gift von Spinnen mit Elektrostimulation, um 1) durchzuführen Proteom Charakterisierung, 2) stimulieren Giftdrüse Genexpression, und 3) durchführen funktionelle Studien von Giften. Dies wird durch eine Beschreibung der Giftdrüse Mikrodissektionen für Genexpressionsstudien gefolgt.
Gifte sind chemisch komplexe Sekrete typischerweise aus zahlreichen Proteinen und Peptiden mit unterschiedlichen physiologischen Aktivitäten. Funktionelle Charakterisierung Gift Proteine hat wichtige biomedizinische Anwendungen, einschließlich der Identifizierung von Leitstrukturen oder Sonden für zelluläre Rezeptoren. Spinnen sind die meisten Arten reichen Clade von giftigen Organismen, aber die Gifte von nur wenigen Arten gut verstanden, teilweise aufgrund der Schwierigkeit, mit dem Sammeln von winzigen Mengen Gift von kleinen Tieren verbunden. Dieser Beitrag stellt ein Protokoll für die Sammlung von Gift von Spinnen mit Elektrostimulation, was die Prozedur auf dem westlichen Schwarzen Witwe (Latrodectus hesperus). Die gesammelte Gift ist nützlich für abwechslungsreiche Downstream-Analysen einschließlich direkter Proteinidentifizierung mittels Massenspektrometrie, funktionelle Assays und Stimulation von Gift Genexpression für transkriptomischen Studien. Diese Technik hat den Vorteil gegenüber Protokolle, isoSpätgift aus ganzen Drüse Homogenate, die nicht trennen echten Giftkomponenten von zellulären Proteinen, die nicht als Teil des Giftes sezerniert werden. Repräsentative Ergebnisse zeigen die Detektion von bekannten Gift-Peptiden aus der gesammelten Probe mittels Massenspektrometrie. Das Gift Sammelprozedur wird durch ein Protokoll zum Präparieren Spinnengiftdrüsen, wobei die Ergebnisse zeigen, dass dies zur Charakterisierung Gift-exprimierte Proteine und Peptide auf Sequenzebene folgt.
Gifte sind tierische Sekrete vorwiegend in ein anderes Tier für die Zwecke der Plünderung oder verteidigungs injiziert, und haben auch wichtige biologische Anwendungen mit biomedizinischer Relevanz 1-3. Nur bestimmte Tiere synthetisieren Gift, aber seine Produktion ist taxonomisch auf wirbellose Tiere (zB Nesseltiere, Kegelschnecken, Skorpione und Spinnen) und Wirbeltieren (zB Schlangen, einige Fische und Säugetiere) weit verbreitet, weil sie unabhängig voneinander entwickelt hat mehrfach 1,4 . Biochemische Charakterisierung Gifte Regel zeigen sie aus einer Vielzahl von Proteinen und Peptiden, die im Wesentlichen auf den Kreislauf und das Nervensystem von injizierten Tieren handeln schnell liefern Bestand Toxine 1 zusammengesetzt. Ein kleiner Bruchteil der giftigen Tieren eine Gefahr für den Menschen, vor allem Arten mit synanthrop Verteilungen 5 darstellen. Die Studie von Gift Zusammensetzung und funktionelle Aktivitäten eine wichtige Rolle spielenDie funktionelle Charakterisierung von Wirbel zellulären Komponenten (insbesondere neuronalen Ionenkanäle) 6 und bei der Aufklärung grundlegender zellulärer Prozesse (zB Neurosekretion) 7. Darüber hinaus wählen Sie Gift Peptide haben nützliche Eigenschaften in der biomedizinischen Kontexten, einschließlich ihrer Verwendung als Behandlungen für Krebs und Schmerzen 8,9 und sind für Arzneimittelkandidat Leads und Gegengift Entwicklung abgebaut. Venoms spielen eine herausragende Rolle in ökologischen und evolutionären Forschung 1,4,10,11, damit die Sammlung dieser gefährlichen Sekret hat viele Versorgungsunternehmen.
Es gibt> 40.000 beschriebenen Spinnenarten (Order Araneae), und alle, aber einer der mehr als 100 Spinnenfamilien besitzen gepaart Giftdrüsen, die Reißzähnen in der 12 zu beenden. Die hohe Artenvielfalt von Spinnen legt nahe, dass sie die größte Clade von giftigen Organismen darstellen. , Biochemische Charakterisierung von Spinnengifte hat jedoch largely auf einer kleinen Anzahl von Arten, die am häufigsten mit menschlichen envenomation zugeordnet engt. Aktuelle Proteom und Transkriptom-Studien von Spinnengiften zeigen sie enthalten typischerweise viele einzigartige Proteine und Peptide 2,13,14. Fortschritte in der Hochdurchsatz-Sequenzierung und cDNA-Massenspektrometrie Peptidfingerprinting hat stark die Entdeckung dieser Giftproteine 15 erleichtert. Dennoch beginnt diese Arbeit mit der Sammlung von ausreichender Gift und / oder Giftdrüsen aus den Spinnen und detaillierte Dokumentation für solche Techniken sind einige 16.
Dieser Beitrag stellt ein Protokoll für die Sammlung von Gift und Giftdrüsen von Schwarzen Witwen, die zu ähnlich großen Spinnen angewendet werden können. Die Sammlung von Gift getrennt von den Drüsen ermöglicht die Identifizierung von Proteinen, die in dem Gift abgesondert werden, im Gegensatz zu Proteinen, die Ausführung anderer zellulärer Funktionen. Schwarz Witwen und andere Latrodectus Arten werden weitgehend als einer der gefährlichsten Spinnen aufgrund ihrer hoch neurotoxische Gift, die starke Schmerzen beim Menschen verursacht, die manchmal durch starkes Schwitzen, Muskelkontraktionen, Bluthochdruck, Atembeschwerden und lücken Lähmung 5 begleitet wird anerkannt. Die hier vorgestellte Gift Sammlung Protokoll verwendet Elektrostimulation, um elektrischen Strom zu anästhesie Spinnen liefern an Muskelkontraktionen und die Freisetzung von Gift entlocken. Venom Tröpfchen schnell mit Mikro-Kapillaren gesammelt und in Rohre für Tiefkühllagerung verzichtet. Da das Protokoll beinhaltet gefährliche Verfahren, sollte es nur von gut ausgebildeten Personen durchgeführt werden und Vorsicht ist bei wichtigen Schritten gedrängt. Die gesammelten Gift hat zahlreiche Anwendungen, wie die Charakterisierung und Isolierung von konstituierenden Moleküle 2, für physiologische Experimente oder funktionellen Assays 18, und Gift Genexpression 11 stimulieren. Das Protokoll schließt mit einem description der Giftdrüse Präparation und Konservierung, die für die Klonierung von Gift-spezifischen Genen, deren Expression wurde gezeigt, dass 2-3 Tage nach venom Verarmungs in verschiedenen Spinnen 10,11 erfolgen.
Gifte sind eine wesentliche Quelle von physiologisch reaktiven Proteinen, Peptiden und anderen Molekülen mit Anwendungen für die Wirkstoffentwicklung, als auch für grundlegende Aspekte der zellulären und ökologische Forschung 3.1. Allerdings ist die Sammlung von Gift, vor allem aus gefährlichen oder kleine Tiere, ist eine anspruchsvolle Aufgabe. Dieses Protokoll zeigt, wie Gift und Giftdrüsen kann von Schwarzen Witwen gesammelt werden, und bestätigt den Erfolg dieses Ansatzes über eine Kombination aus mudPIT Analyse des Giftes und einem Protein-Datenbank von cDNAs abgeleitet vom Gift geklont Verschraubungen 21. Während dieses Protokoll funktioniert gut für schwarze Witwen und mittelgroße Spinnen, andere Gift Sammlung Techniken für größere mygalomorph (Tarantel-like) Spinnen, wie direkten Absaugen von Gift aus Fänge in Glaspipetten zB 24. Dieser letztere Ansatz verwendet worden, jedoch , wird nicht gut für kleinere Spinnen, die nicht aggressi werden arbeitenve.
Ein besonders wichtiger Aspekt der hier beschriebenen Gift Sammelprotokoll ist die Anfangsphase der Herstellung und Optimierung des Sammelprozesses, so dass es mehr Routine, konsistente und schneller. Das Protokoll ist zunächst schwer zu meistern, jedoch mit wiederholten Versuchen, wird es einfacher und schneller. Vorsicht ist auch bei allen kritischen Phasen, die den Umgang mit gefährlichen Spinnen, die Verwendung von elektrischem Strom, feine Punktglasmikro Kapillaren und Spritzennadeln gedrängt. Es ist wichtig, geeignete persönliche Schutzausrüstung zu tragen wie Nitril-Handschuhe, einen Laborkittel, lange Hosen und geschlossene Schuhe sowie Brillen bei der Gestaltung Mikro Kapillaren.
Eine weitere Herausforderung bei den Gift-Kollektion ist die geringe Menge des Giftes von einem Spinnen, insbesondere Latrodectus-Arten, von denen die Mengen gesammelt werden, können li sein produziertbestenfalls 1-2 Mikroliter pro Einzel grenzten. Erhalten ausreichender Gift für Downstream-Anwendungen, wie zB Protein-Gele oder funktionelle Assays kann die Kombination von Gift aus mehreren Individuen in einem Rohr erforderlich. In solchen Fällen sollte Gift nur von Personen gleichen Geschlechts, ontogenetische Stufe kombiniert werden, und die Bevölkerung angesichts der Anerkennung von intersexuellen, Entwicklungs- und geographische Variabilität in manchen Giften 25, 26. Spinnen kann auch aufweisen, eine beträchtliche Variation in der Menge an Gift unter Individuen, wobei geringere Mengen der letzten Entleerung der Drüse reflektieren hergestellt. So kann es ratsam sein Gift mehrere Tage nach ihrem letzten Fütterung sammeln. Wenn kleine Gift freigesetzt wird, sollte ein übermäßiger Strom nicht an die Spinne, die bewirken können, die Kutikula zu Bruch angelegt, was zur Verunreinigung des Giftes mit Hämolymphe oder Tod.
Die Kontamination von Proben mit Spinnengift silk oder menschlichen Quellen auch durch die Verwendung von sterilen oder sauberen Ausrüstung vermieden werden. Trotz dieser Herausforderungen Sammlung von reinen Gift, so dass die Spinne lebt, ist vorzuziehen, Methoden, die Gift aus Drüsen Homogenate (die nicht trennen Giftkomponenten von anderen zellulären Proteinen) und töten die Spinne zu erhalten. Es ist auch wichtig, um sicherzustellen, dass die Proben schnell eingefroren, um Proteinabbau zu verhindern.
Die Extraktion von Gift fördert spätere Giftproduktion, wodurch Gift Genexpression stimulierende im Giftdrüse. So, da dieses Protokoll ermöglicht Spinnen Gift Verarmungs überleben kann ihre Drüsen seziert werden einige Tage später (die Tötung der Spinne) an einem Punkt, wo Gift Genexpression wird erwartet, ausreichend für genetische Studien, wie Transkript Klonen 10,11 zu sein. Einige wichtige Vorsichtsmaßnahmen müssen auch Giftdrüse Dissektionen genommen werden. Der Schwerpunkt sollte auf mit Labor equipm platziert werdenent und Reagenzien, die frei von RNasen, die RNA abbauen. So wird empfohlen, Zangen und anderen nicht-Einweg-Geräte und Oberflächen mit Lösungen, die RNase und DNA-Kontamination zu beseitigen wischen. Die Sektionen sollte so schnell wie möglich direkt gefrorenen geführt werden, um weiter sicherzustellen, RNA Integrität des Gewebes. Schließlich sollte Dissektionen nur betäubt Spinnen durchgeführt werden, nachdem ihre cephalothorax und Bauch sind schnell getrennt.
Abschließend dieser Artikel bietet eine überprüfte Protokoll zu Spinnengift und Giftdrüsen erhalten. Venom und Giftdrüsen ermöglichen die Isolierung und Charakterisierung ihrer Protein- und Peptid-Komponenten mit proteomischen und transkriptomischen Ansätze. Zusätzlich kann Gift Proben der Ausgangspunkt der funktionellen Assays, die die biomedizinische und pharmakologische Potenzial ihrer konstituierenden Moleküle bestimmen zu vertreten. Fast alle Spinnen produzieren Gift, und die breite Taucherversität Giftkomponenten von einzelnen Spezies synthetisiert schlägt eine große Vielfalt der Giftmoleküle noch nicht entdeckt zu 13 werden. Entsprechend stellt dieses Protokoll Werkzeuge, um die reiche Quelle von im Spinnengifte vorhanden biologisch aktive Moleküle zu untersuchen.
The authors have nothing to disclose.
Ich danke den folgenden Personen für ihre Unterstützung bei der Entwicklung dieses Protokolls: Chuck Kristensen, Greta Binford, Alex K. Lancaster, Konrad Zinsmaier und Mays Imad. Massenspektrometrie und Proteomik-Daten wurden von der Arizona Proteomics-Konsortium durch NIEHS Zuschuss ES06694 zum SWEHSC, NIH / NCI Zuschuss CA023074 zum AZCC unterstützt und von der BIO5 Institut der Universität von Arizona erworben. Die Finanzierung für diese Arbeit wurde von der National Institutes of Health (Nationales Institut für Allgemeinmedizin) aus Zuschüssen 1F32GM83661-01 und 1R15GM097714-01 Jessica E. Garb vorgesehen.
Nerve and muscle stimulator (electro-stimulator) | Grass Technologies | SD9 | http://www.grasstechnologies.com/products/stimulators/stimsd9.html |
Voltmeter | RadioShack | 22-223 | any generic voltmeter/multimeter can be substituted |
Pointed Featherweight Forceps | Bioquip | 4748 | |
Plasti Dip | Performix | Available at Ace Hardware | |
21 G X 1 1/2in Precision Glide hypodermic syringe needle | BD Medical | 305190 | |
Vacuum filter flask 1L | Nalgene | DS4101-1000 | smaller flask sizes may also work |
Buchner Two Piece funnel, 90 mm | Nalgene | 4280-0900 | |
5 microlitter Capillary Bores (Micro capillaries) | VWR | 53508-375 | |
Mounting putty strip | Loctite | Available at Ace Hardware | |
Fisherbrand* General-Purpose Extra-Long Forceps Length: 11-13/16 in. | Fisher | 10-316C | |
SSC Buffer, 20X (pH 7.0), Molecular Grade | Promega | V4261 | can be made from stock chemicals (150 mM NaCl, 15 mM sodium citrate) |
Eppendorf safe-lock tubes 0.5 mL tubes (cryogenic safe) | Eppendorf | 22363611 | |
Nalgene Dewar, 1L, HDPE, Liquid nitrogen benchtop flask | Thermo Scientific | 4150-1000 | |
Rnase Away | VWR | 53225-514 | |
Ultra Fine Tweezers (dissecting forceps) | EMS | 78310-0 | similar high-quality fine point forceps can be substituted |
Foot switch/pedal | Linemaster Switch Corp. | 491-S | |
Two-pronged extension clamp, with vinyl covered sleeves, 8.5 inches | VWR | 21570-007 | similar models could be substituted |
Clamp Holder | VWR | 89084-746 | similar models could be substituted, must accommodate diameter of extension clamp rod |
Magnetic base (holds extension clamp via clamp holder) | VWR | 300042-270 | similar apparatus able to securely hold extension clamp in fixed position may be substituted |
Plastic Collecting Vials (large/40 dram) | Bioquip | 8940 | |
Cotton sewing thread | Threadart.com | THRCOT9 | similar product could be substituted |