Drosophila larven zijn een aantrekkelijk model systeem voor live-imaging vanwege hun doorschijnende cuticula en krachtige genetica. Dit protocol beschrijft hoe u een single-layer PDMS apparaat, genaamd de 'larve chip' voor live-beeldvorming van cellulaire processen binnen neuronen van 3 e instar Drosophila larven benutten.
Live-beeldvorming is een belangrijke techniek voor het bestuderen celbiologische processen, maar dit kan een uitdaging in levende dieren. De doorschijnende cuticula van de Drosophila larve maakt het een aantrekkelijke modelorganisme voor live-imaging studies. Echter, een belangrijke uitdaging voor live-imaging technieken is om niet-invasief te immobiliseren en de positie van een dier op het microscoop. Dit protocol biedt een eenvoudige en makkelijk te gebruiken methode voor het immobiliseren en beeldvorming Drosophila larven op een polydimethylsiloxaan (PDMS) microfluïdische apparaat, dat noemen we de 'larve chip'. De larve chip bestaat uit een gezellige-passende PDMS microkamer dat een dunne glazen dekglaasje, die, op verzoek van een vacuüm via een spuit, immobiliseert het dier en brengt ventrale structuren zoals de zenuw koord, segmentale zenuwen, en het lichaam wordt bevestigd muur spieren, in de nabijheid van het dekglaasje. Dit zorgt voor een hoge resolutie imaging, en belangrijker nog, vermijdt het gebruik van anesthetics en chemicaliën, die het onderzoek van een groot aantal fysiologische processen vergemakkelijkt. Aangezien larven herstellen gemakkelijk van de immobilisatie kunnen ze gemakkelijk worden veelvuldige beeldvorming sessies. Dit zorgt voor longitudinale studies over de tijd cursussen, variërend van uren tot dagen. Dit protocol beschrijft stap voor stap hoe u de chip en hoe de chip voor live-imaging van neuronale gebeurtenissen in larven 3 e instar benutten bereiden. Deze gebeurtenissen zijn het snelle transport van organellen in axonen, calcium reacties op letsel, en time-lapse-studies van de handel in foto-converteerbare eiwitten over lange afstanden en tijdschalen. Een andere toepassing van de chip is om regeneratieve en degeneratieve reacties op axonalverwonding bestuderen, zodat het tweede deel van dit protocol beschrijft een nieuwe en eenvoudige procedure voor het verwonden van axonen binnen perifere zenuwen door een segmentale zenuw crush.
De fruitvlieg, Drosophila melanogaster, is gebruikt als modelorganisme voor meer dan 100 jaar, en is behulpzaam geweest bij het definiëren fundamentele signalering en ontwikkelingstrajecten die geconserveerd van ongewervelde menselijke bewezen. Live-beeldvorming is een belangrijke benadering van het bestuderen van cellulaire mechanismen, en de eenvoudige bouwplan en doorschijnende cuticula van de Drosophila larve maakt het een aantrekkelijk systeem voor live-imaging, met name omdat er veel genetische tools beschikbaar voor het uitdrukken van fluorescent gelabelde eiwitten in specifieke celtypen.
Een belangrijke uitdaging voor live-imaging technieken is om niet-invasief te immobiliseren en de positie van een dier voor microscopie. Conventionele benaderingen omvatten immobilisatie dissectie 1,2 of gebruik van chloroform, beide doden dier. De verdovingsmiddelen ether 4 en isofluorane 5-8 zijn ook gebruikt. Terwijl anesthetica bieden veel voordelen, Ze neurale activiteit en belangrijke fysiologie (inclusief de hartslag) 9-11 remmen ook, dus kan het proces bestudeerd beïnvloeden en stress creëren op het dier. Er zijn ook menselijke bezorgdheid over de veiligheid voor het werken met ether en isofluorane.
We hebben een drugsvrije methode om Drosophila larven te immobiliseren in een enkele laag PDMS microfluïdische apparaat, dat noemen we de 'larve chip' 12 ontwikkeld. Dit protocol beschrijft hoe inwinnen of de larve chip, en hoe deze te gebruiken voor live-imaging in larven 3 e instar vroeg-geënsceneerd. De chip bestaat uit een-gezellige-passende microkamer, die, op verzoek van een vacuüm via een spuit, immobiliseert het dier via zachte mechanische kracht. De immobilisatie methode brengt ventrale structuren zoals de zenuw koord, segmentale zenuwen, en het lichaam muur spieren, in de nabijheid van een glazen dekglaasje. Dit zorgt voor een hoge resolutie afbeelding van dergelijke structuren met hoge numerieke apertuur (hoge vergroting) doelstellingen.
Voordelen van de larve chip opzichte van andere conventionele technieken omvatten de volgende: (i) gebruik van de larve chip vervangt het gebruik van chemische stoffen, waardoor in vivo beeldvorming van niet-verdoofde dieren. (Ii) Larven herstellen direct na vrijlating uit de chip (in tegenstelling tot een 2 uur herstelperiode voor isofluorane 8,13). Dit zorgt voor beeldvorming in brede tijdschalen, variërend van milliseconden tot enkele minuten, uren en dagen. (Iii) het gebruik van PDMS, een gasdoorlatend materiaal zorgt voor continue diffusie van zuurstof / lucht uit de omgeving in de larve lichaam. (Iv) De chip is makkelijk en veilig te gebruiken, en (v) het is herbruikbaar en kan worden vervaardigd tegen minimale kosten.
Naast de gebruiksaanwijzing van de larve chip, dit protocol enkele voorbeelden van het gebruik studeren neuronale gebeurtenissen in 3e instar larven geven. Deze omvatten live-beeldvorming van Axonal transport, calcium reacties op letsel, en time-lapse-studies van de handel in foto-converteerbare eiwitten over lange afstanden en tijdschalen.
Een andere toepassing van de chip neuronale reacties op axonalverwonding bestuderen. Hiervoor is een extra procedure is beschreven (in deel 3) voor het verwonden van axonen binnen perifere zenuwen door een segmentale zenuw crush. Deze eenvoudige bepaling kan zowel snel en reproduceerbaar uitgevoerd onder standaard ontleding stereomicroscoop, die zorgt voor veel dieren tegelijk te verwerken. Cellulaire reacties op de schade kan worden bestudeerd door live-imaging in de larve chip.
Maken of verkrijgen van de larve chip:
De larve chip bestaat uit een PDMS blok is (de zogeheten PDMS chip ') bevestigd aan een glazen dekglaasje. Het protocol in stap 1 beschrijft de procedure voor het maken en gebruiken larve chips, uitgaande van een SU-8 mal is beschikbaar. De SU-8 matrijs microfabricated fotolithografische patroonvorming door een 140 urn dikke SU-8 fotoresistlaag op een silicium wafer (voor details zie Ghannad-Rezaie et al.. 12). Zoals de microfabricage van de SU-8 schimmel toegang tot gespecialiseerde apparatuur nodig is, raden wij het bestellen van een microfabrication faciliteit (bv. De LNF faciliteit aan de Universiteit van Michigan 14), of van een gieterij door toezending van het ontwerp van de chip die wordt verstrekt als een aanvullend bestand. Wil men het ontwerp van de chip PDMS (bijv. voor gebruik met larven van verschillende afmetingen), een CAD-software DXF (bijv. Autocad) behandelt veranderen worden gebruikt. Een SU-8 schimmel kan ook worden gemaakt in eigen huis volgens de instructies in Mondal et al.. Kan 27 Veel lezers vinden het handig om gewoon het verkrijgen van een monster PDMS chip om te proberen de techniek voor het vervaardigen van hun eigen chips. Deze wordt op verzoek ter beschikking worden gesteld.
Gebruik van de microfluïdische 'larve chip' voor live-imaging:
De immobilisatie werkwijze de larve chip vermijdt het gebruik van anesthetica en in plaats daarvan omvat druk, via de toepassing van een vacuüm, om beweging van het dier te beperken. Hoewel dieren immobilisatie kan overleven in de chip voor meerdere uren 12, een kortere immobilisatie periode (5-15 min) wordt aanbevolen. Dit is genoeg tijd voor de beeldvorming van vele cellulaire gebeurtenissen van belang, met inbegrip van veranderingen in de intracellulaire calcium, of snel axonale transport. Dit is ook voldoende tijd voor de gewenste manipulaties in levende dieren, zoals laser gebaseerde microchirurgie, photobleaching en photoconverSion.
Om gebeurtenissen in lengterichting over een langere periode in een enkel dier te bestuderen, dieren kunnen worden in de chip meerdere malen geplaatst en afgebeeld, gescheiden door perioden van rust. Druivensap agar-platen zijn ideaal voor rust tussen beeldvorming sessies, omdat ze zorgen voor een gemakkelijke bron van voedsel en vocht. Meerdere beeldvorming sessies wel invloed larvale overleving tot op zekere hoogte, omdat elke sessie brengt een aantal risico's voor het beschadigen van het dier (zie deel 2 in het oplossen van problemen, hieronder). Dieren kunnen routinematig worden afgebeeld> 5 keer in de loop van twee dagen met een meer dan 50% overlevingskans. Aangezien de dieren niet verdoofd, ze gezond en beweeglijk onmiddellijk na afgifte van het vacuüm in de chip. Er is derhalve geen behoefte aan herstel tussen beeldvorming sessies, dus de tijd afstand tussen sessies is flexibel en kan worden aangepast aan de doelstellingen van het experiment.
Problemen oplossen:
De meest voorkomende technische isvervolgt met larve chip en aanbevolen oplossingen zijn de volgende:
(1) Het dier is te veel bewegen. Te veel mobiliteit kan interfereren met de beeldvorming doelen. De meest voorkomende redenen als de larve chip a) het dier is te klein voor de chip, of b) de toegepaste onderdruk tijdens de immobilisatie stap wordt aangetast. De larve chip beschreven in dit protocol is bedoeld voor de vroege geënsceneerde larven 3 e instar. De optimale grootte van het dier 3.5-4 mm (aan de sagittale as). Om de onderdruk voldoende is, trekt de spuit 2-2,5 ml of totdat weerstand wordt gevoeld in de handgreep. Een indicatie dat het vacuüm werkt, is dat kleine luchtbellen in de perimeter kanaal kan worden gezien bewegen langzaam naar het vacuüm bron. Een andere indicatie dat het dekglaasje altijd moet reizen met de chip wanneer de chip wordt opgetild boven (en dit is de aanbevolen methode voor het transporteren van de kamerzodra de larven is gepositioneerd en het vacuüm is ingeschakeld). Het vacuüm kan worden bemoeilijkt indien er scheuren in de buis, of er olie in de buis. Dit kan gemakkelijk worden opgelost door het vervangen van de 23 G afgeven naaldpunt en polyethyleen-50 buis (van stap 1,6-1,14).
(2) Het dier sterft na beeldvorming in de chip. De procedure is bedoeld om minimale stress veroorzaken bij het dier, en andere dieren, wild-type genotype hebben een> 90% overlevingskans, zelfs na een uur van immobilisatie op de chip 12. Aangezien sommige genotypes minder veerkrachtig om de stress van de chip kan zijn, controleer dan eerst dat wild-type dieren (bijvoorbeeld Canton S) overleven de immobilisatie techniek. a) De meest voorkomende oorzaak van sterfte is onjuist positioneren van de larve (zie figuren 2G-H). Als delen van de cuticula, het hoofd en de luchtpijp zijn niet helemaal in de kamer, dan kunnen ze beschadigd raken tijdens de immobilisatie, en eenlarve dat te groot is voor de chip (> 4 mm) minder kans om te overleven. b) Een minder voorkomende oorzaak voor letaliteit is het gebruik van te veel druk of vacuüm bij het plaatsen van chip. Indien juist gepositioneerd in de chip, de druk die door het vacuüm wordt goed verdragen. Overmatige druk, hetzij van het vacuüm of in de eerste fase van het positioneren van het dier kan een probleem zijn. Het beste is om de mate van druk die nodig is door empirisch onderzoek met wildtype larven van de juiste grootte te leren. c) Als er te veel Halocarbonolie dekt luchtpijp van het dier het dier kan mogelijk problemen met de lange-termijn overleving. De olie speelt een aantal belangrijke rollen in de chip: het is belangrijk voor het creëren van het vacuüm, de optiek tijdens de beeldvorming en uitdroging tegengaat in de chip. Overmatige olie moet worden vermeden. (Dit kan ook leiden tot olie in de buizen en spuit, afbreuk het vacuüm). De voorgestelde protocol lagen gewoon de ventrale zijde van de larve met olie, dan reGaat overtollige olie door plaatsing van de larve op een schoon dekglaasje alvorens naar de uiteindelijke dekglaasje voor de beeldvorming. d) fototoxiciteitstests kan worden ervaren van de opnamesessie. Zoals bij elke live-imaging toepassing, is het ideaal om korte belichtingstijden te gebruiken met een lage intensiteit laserlicht, die het best bereikt met behulp van een zeer gevoelige camera of detector. Probeer om de verlichting te minimaliseren met UV-licht, waaronder een breed spectrum licht gecreëerd door Hg lichtbronnen.
Andere kwesties en toekomstige richtingen:
Aangezien deze methode niet verdovingsmiddelen gebruiken, het hart van het dier blijft kloppen. Dit zorgt voor een aantal onvermijdelijke mobiliteit, die beeldvorming in sommige plaatsen meer dan anderen beïnvloedt. De voorbeelden tonen dat de buikzenuwkoord, segmentale zenuwen en lichaamswand gemakkelijk kan worden afgebeeld zonder tussenkomst van de hartslag. In gevallen waarin de hartslag beïnvloedt beeldvorming, kan de regelmatige bewegingen soms worden gecorrigeerd voor metin analyse software (bijvoorbeeld de Image Stabilizer plugin voor ImageJ). Dit werkt goed als afzonderlijke objecten bewegen op een snelle tijdschaal (bijvoorbeeld ~ 1 micrometer / sec voor snelle axonale transport) of op een zeer langzame tijdschaal (minuten tot uren). Echter, wanneer het object (en) van belang bewegen met een bereik van snelheden en richtingen, kan het moeilijker zijn om te corrigeren voor de hartslag veroorzaakte bewegingen.
Een ander probleem is een lichte variatie in de optica van dier tot dier, of tussen meerdere beeldvorming sessies van hetzelfde dier in de chip. Hoe dieper het voorwerp van belang is in het dier, hoe groter deze variant zal zijn. Segmentale zenuwen en de buikzenuwkoord zijn doorgaans te diep binnen dan dieren af te beelden op een gewone microscoop. Het milde druk ervaren in de larve chip duwt Maar deze structuren zeer dicht bij de nagelriem en dekglaasje. De exacte afstand van deze structuren van het dekglaasje zullen kleine schommelingen van tr hebbenial voor de rechter. De variatie objecten sluit de cuticula, zoals de cellichamen van sensorische neuronen, minder. Daarom is het belangrijk, met name voor het maken van metingen van de intensiteit, een groot aantal dieren en onafhankelijke experimenten gebruiken in verband met de verscheidenheid van optiek.
Hoewel de hier getoonde voorbeelden gericht op processen in neuronen, moet de aanpak vatbaar voor een structuur beeldvorming in het dier dat in de focus diepte van het microscoopobjectief kan worden gebracht zijn. Dit omvat de cuticula, lichaam muur spieren, en hun NMJs. Luchtpijp aan de buikzijde van het dier en mogelijk delen van het spijsverteringskanaal worden afgebeeld. Het dier kan ook worden gepositioneerd met zijn dorsale zijde naar het dekglaasje korte termijn beeldvorming van structuren nabij het dorsale oppervlak. De mogelijkheid om beeld structuren diep in het dier wordt beperkt door de werkafstand van het microscoopobjectief gebruikt. Structuren zoals imaginal schijven zijn niet toegankelijk voor een sterke vergroting (bijv. 40X) doelstellingen.
De larve chips beschreven in dit protocol zijn ontworpen voor larven in de 3 fase vroege derde instar (variërend in grootte 3,5-4 mm). Maar veel interessante vragen vereisen beeldvorming in verschillende larvale stadia. Kleinere chips instar larven nd 2, of groter chips geschikt late 3e stadia plaats kan gemakkelijk worden ontworpen met behulp van hetzelfde principe. (Aanvullende Figuur 1 bevat een gemakkelijk aanpasbaar DXF-bestand voor het maken van siliconen mallen met veranderde kamer maten). De simpele principe van de omkeerbare afdichting kan zelfs worden toegepast op andere organismen zoals C. elegans of zebravis, met de belangrijkste variant zijn de kamergrootte. Een bruikbare toekomstige richting is een chip die veel dieren kunnen immobiliseren tegelijk te gebruiken voor screeningsdoeleinden ontwerpen. Echter, dit zou het ontwerp moeten significant verschillend te zijnvan het huidige apparaat, waarbij de punten van positioneren van de dieren in de chip moet onafhankelijk geregeld voor elk dier.
De zenuw verliefd test voor het bestuderen van letsel reacties in larvale perifere zenuwen:
De zenuw verbrijzeling test beschreven voor larvale segmentale zenuwen is een eenvoudige methode voor het introduceren van een letsel van perifere axonen in Drosophila. Voordelen van deze methode zijn: a) het is eenvoudig uit te voeren met standaard gereedschap in een Drosophila lab (een stereomicroscoop CO2 bron en forceps), b) kan snel worden uitgevoerd voor vele dieren, waardoor biochemische analyse zenuw koorden na verwonding haalbare 14 c) de moleculaire en cellulaire reacties op deze letsels zijn zeer reproduceerbaar 14,15,28 en kan worden gebruikt om processen die belangrijk zijn in gewervelde neuronen 29,30 ontdekken.
Alternatieve werkwijzen voor het verwonden van neuronen te focusa high-power laser, bijvoorbeeld een gepulste UV of femtosecondlaser, een axon te verbreken via laser microchirurgie 17,31-33. De larve chip is een ideale methode voor het positioneren van het dier zoals microchirurgie. Vanwege kleine verschillen in de optica tussen onderzoeken zoals hierboven, de laser gebaseerde methode kan moeilijker te reproduceren larven, vooral in larvale segmentale zenuwen. Ook laser gebaseerde axonalverwonding vergt meer tijd om elk dier te positioneren, dus is moeilijk uit te voeren op grote schaal (met een groot aantal dieren).
Problemen oplossen:
De meest voorkomende technische kwestie van de zenuw te verpletteren is de dood van schade aan inwendige organen. Bij het uitvoeren van de crush, is het belangrijk de buikzenuwkoord, speekselklieren, of darmen niet bekneld raken. Het is ook belangrijk de cuticula niet te doorboren. Deze kwesties worden best vermeden doordat de tang bij een hoek van 45 ° naar de cuticula oppervlakteactievee (zie figuur 3).
De kwaliteit van de tang heeft een grote invloed op de effectiviteit van de crush en overleving daarna. Wij raden Dumostar nummer 5 tang. Om hun scherpte behouden, moet de tang voorzichtig worden behandeld, niet voor andere doeleinden gebruikt, en vervangen zodra zij bot of verbogen.
De grootte van het dier kan ook invloed op de effectiviteit van de crush. Kleine dieren (minder dan 3 mm in lengte) zijn veel minder kans om de schade te overleven. Bij grotere dieren, (zwerven 3e stadia), is het moeilijker om de zenuwen te lokaliseren en schade aan de grote speekselklieren en darmen voorkomen, en er is minder tijd om verwonding respons studie voor de verpopping. De zenuw verliefd is het meest effectief uitgevoerd in larven begin 3 e instar (die ~ 3-4,5 mm in de lengte langs de achterwaartse as staan).
Het voedselbron dat het dier wordt verhoogd op kan rakensterkte van de cuticula en de overleving na de crush. Het wordt aanbevolen om dieren in voedsel gemaakt van een standaard gist-glucose recept verhogen.
De beste methode om te leren hoe je de crush effectief te doen is om te oefenen op veel dieren, eerst met het primaire doel van het bereiken van de overleving (en niet verpopping) 24 uur na de crush. Beginners hebben doorgaans een lage overlevingskans (bijv. 10%), maar zodra de techniek wordt aangeleerd, kan de overlevingskansen bereiken ~ 90%.
Andere kwesties en toekomstige richtingen:
De crush test biedt een krachtige methode om de kiemen van axon proximale bestuderen om de schade plaats en degeneratie van axonen en synapsen distaal van de verwonding. Terwijl de tarieven van degeneratie variëren tussen de verschillende soorten neuronen, ze zijn zeer reproduceerbaar voor een gegeven type neuron, die bewijs van de reproduceerbaarheid van het letsel assay.
In tegenstelling, de regeneratieve 'kiemenrespons waargenomen bij proximale axonen is een grotere uitdaging om te studeren. Alle axonen in de deelzenuwvoor initiëren uitgebreide kiemen dicht om de schade website (zie bijvoorbeeld Figuur 6 en Figuur 3). Maar de omvang van kiemen kan variëren van neuron tot neuron, en is moeilijk te kwantificeren. Een vergelijkbare mate en variabiliteit in het kiemen kan worden waargenomen na meer focale laesies van enkele motoneuronen in segmentale zenuwen geïntroduceerd door middel van een UV-pulsed dye laser. We interpreteren het nondiscriminate gerichtheid van de kiemen wordt veroorzaakt door de afwezigheid van leiding signalen in het segmentale zenuwen. Daarentegen sensorisch neuron axons verwond laser dicht bij hun cellichamen ondergaan nieuwe axonale groei in dezelfde richting als de verloren axon 34. Axonen in deze regio van het dier zijn waarschijnlijk blootgesteld aan meer specifieke positie-informatie voor begeleiding van de regenererende axonen. De omgeving binnen segmentale zenuwen waarschijnlijk veel resemblan hebbence voor het milieu die de axonen oorspronkelijk genavigeerd tijdens hun begeleiding in het embryo, dus naar verwachting geen informatie hoeft te regenererende axonen leiden.
Een andere beperking voor het bestuderen van de regeneratie met behulp van de deelzenuwvoor verliefd test is dat de benadeelde zintuiglijke en motoneuron axonen hebben nog steeds een aanzienlijke afstand tot (0,25-1 mm) om hun doel te bereiken, en een beperkt tijdsbestek (<3 dagen) te dekken voordat het dier ondergaat verpopping. Een recente studie heeft een genetische manipulatie van de prothoraciotropic hormoon receptor die de duur van de 3e instar larvale stadium 35 triples geïdentificeerd. Deze manipulatie is het tijdschema verlengen bestuderen van de terugwinning en degeneratie van neuronen na verwonding significant, 9 in plaats van 3 dagen. Dit kan lang genoeg om nieuwe evenementen, zoals de heraansluiting van een gewonde axon met zijn postsynaptische doel te observeren zijn, vooral als de schade wordt veroorzaakt in de buurt van de synaptische einde.
The authors have nothing to disclose.
Dit werk werd ondersteund door de National Science Foundation, (licentienummer IOS-0842701 om CAC), en het National Institute of Health (R00MH080599 naar BY, R21 NS062313 naar NC, en NS069844 te CAC). We willen graag James Schutt, Emily Han en Leni Truong erkennen voor de technische ondersteuning en de Bloomington Stock centrum voor vlieg lijnen. Alle chips werden gefabriceerd op Lurie Nanofabrication Facility van de Universiteit van Michigan.
0.5 mm Polyethylene tubing | Fisher scientific | 14-170-11B | Polyethylene tubing, I.D. = 0.023’’, O.D. = 0.038’’ |
1 mm Polyurethane tubing | Fisher scientific | BB521-63 | Polyurethane tubing, I.D. = 0.063’’, O.D. = 0.125’’ |
barb to barb connector | Bio Rad | 732-8300 | 0.8 mm barb to barb connector |
3-way stopcock valve | Bio Rad | 732-8104 | Screw on valve for the syringe |
Syringe (20 ml) | Fisher scientific | 14-817-33 | Screw on 20 ml syringe for generating vacuum |
Dispensing needles, 23 G (.4mm I.D., .6mm O.D.) | McMaster-Carr | 75165A684 | Needle for outlet connection |
Dispensing needles, 21 G, (.6mm I.D., .8mm O.D.) | McMaster-Carr | 75165A679 | Needle for outlet connection |
Halocarbon oil | Sigma | H8898 | Halocarbon oil 700 |
Dumostar Number 5 Forceps | Roboz | RS-498 | For nerve crush |
PDMS Kit (Base and curing agent) | Ellsworth | 184 SIL ELAST KIT 0.5KG | Dow Corning Sylgard 184 Silicone Encapsulant 0.5 kg Kit Clear |
Glass Coverslips | Fisher scientific | 12-544-C | 24 x 40 mm (thickness according to recommendation for your microscope objective) |
Disposable Plastic Cup (9 oz.) | |||
Plastic coffee stirrer stick | |||
Razor Blade | |||
Grape juice agar plates | See http://cshprotocols.cshlp.org/content/2007/4/pdb.rec10925 for recipe |