Se describe un método para la pasivación de una superficie de vidrio usando polietilenglicol (PEG). Este protocolo cubre la limpieza de superficies, funcionalización de la superficie, y el recubrimiento de PEG. Se introduce una nueva estrategia para el tratamiento de la superficie con moléculas de PEG en dos rondas, lo que produce una calidad superior de pasivación en comparación con los métodos existentes.
La espectroscopia de fluorescencia de una sola molécula ha demostrado ser fundamental para la comprensión de una amplia gama de fenómenos biológicos a escala nanométrica. Ejemplos importantes de lo que esta técnica puede ceder a las ciencias biológicas son las ideas sobre los mecanismos de proteína-proteína y las interacciones proteína-ácido nucleico. Cuando las interacciones de proteínas se sondean a nivel de una sola molécula, las proteínas o sus sustratos a menudo se inmovilizan sobre una superficie de vidrio, lo que permite una observación a largo plazo. Este esquema de inmovilización puede introducir artefactos no deseados de la superficie. Por lo tanto, es esencial para pasivar la superficie del vidrio para que sea inerte. Recubrimiento de superficies con polietilenglicol (PEG) se destaca por su alto rendimiento en la prevención de las proteínas a partir de la interacción de forma no específica con una superficie de cristal. Sin embargo, el procedimiento de revestimiento de polímero es difícil, debido a la complicación derivada de una serie de tratamientos de superficie y el requisito estricto de que una superficie necesitaestar libre de cualquier moléculas fluorescentes al final del procedimiento. Aquí, ofrecemos un protocolo robusto, con instrucciones paso a paso. Cubre la limpieza de superficies incluyendo el grabado de pirañas, funcionalización de la superficie con grupos amino, y, finalmente, recubrimiento de PEG. Para obtener una alta densidad de una capa de PEG, se introduce una nueva estrategia de tratamiento de la superficie con moléculas de PEG más de dos rondas, lo que mejora notablemente la calidad de pasivación. Proporcionamos resultados representativos, así como consejos prácticos para cada paso crítico para que cualquiera pueda lograr la pasivación de la superficie de alta calidad.
Al realizar un estudio de una sola molécula de proteína es esencial para lograr una alta calidad de pasivación de la superficie de manera que el experimento está libre de cualquier proteína mal funcionamiento inducida por superficie o 1,2 desnaturalización. Mientras que una superficie de vidrio tratada con agentes tensioactivos, tales como albúmina de suero bovino, se utiliza comúnmente para estudios de ácido nucleico de una sola molécula 3, el grado de su pasivación no es lo suficientemente alta como para los estudios de proteínas. Una superficie de vidrio recubierta con polímero (polietilenglicol, PEG) es superior en el rendimiento de pasivación 4-6. De esta manera, se ha convertido universalmente usado para estudios de proteínas de una sola molécula desde que se introdujo en un estudio de fluorescencia de una sola molécula de 7-10. El procedimiento de recubrimiento de polímero requiere de múltiples tratamientos superficiales 7,11,12. Por lo tanto, es difícil de seguir todo el procedimiento sin instrucciones detalladas. A menudo, el grado de pasivación de la superficie varía dependiendo de qué protocolo is siguieron. Aquí se presenta un protocolo robusto con el paso a paso las instrucciones, lo que eliminará uno de los principales cuellos de botella de los estudios de proteínas de una sola molécula. Consulte la Figura 1 para una descripción.
Los pasos críticos dentro de este protocolo
Es esencial para que la superficie hidrófila antes de la reacción amino-silanización. Esto se logró mediante el grabado de pirañas que genera los grupos hidroxilo libres en una superficie de vidrio / cuarzo. Se recomienda no para mantener la superficie grabada piraña expuesta en H 2 O o aire durante un largo período de tiempo desde que la hidrofilicidad de la superficie desciende gradualmente.
Las moléculas de éster de NHS de PEG son reactivos. Se aconseja hacer alícuotas y almacenarlas bajo nitrógeno en -20 º C. La vida útil de la química APTES en la temperatura ambiente es corto. Se aconseja sustituirlo por uno nuevo cada mes.
Las modificaciones de este protocolo
Cuando no se puede utilizar el grabado de pirañas y por la razón práctica, es posible grabar utilizando KOH por un largo período de tiempo (por ejemplo, overnight), que también hará que los grupos hidroxilo expuestos. La trampa de este enfoque alternativo es que la corredera se vuelve inutilizable después de unos recicla debido a arañazos graves.
A menudo se practica para quemar una superficie de vidrio / cuarzo, utilizando soplete de propano, que es eficaz en la eliminación de materiales orgánicos fluorescentes 7. Este procedimiento no se incluyó en este protocolo, ya que es redundante para el grabado de pirañas. Tenga en cuenta que este procedimiento potencialmente conducir a la oxidación de los grupos hidroxilo. Por lo tanto, este procedimiento no debería llevarse a cabo una vez a la superficie estaba grabada usando KOH o solución de pirañas.
Cuando se utiliza un tampón con pH inferior a 7 para la formación de imágenes de una sola molécula, la conformación de PEG cambia de "hongo" a "pincel", que reduce el grado de pasivación. Por lo tanto, cuando se utiliza un pH inferior a 7,0, se recomienda para pasivar aún más la superficie utilizando tartrato de disuccinimidilo <sup> 7.
Perspectivas
Este trabajo ha proporcionado un protocolo robusto para lograr la pasivación superficial de alta calidad. Este protocolo será útil para estudios de fluorescencia de una sola molécula que están involucrados con proteínas de 14, así como los complejos de proteínas dentro de extractos celulares y los inmunoprecipitados 15. Se utiliza ampliamente para otras técnicas de una sola molécula, tales como espectroscopia de fuerza y torque espectroscopía 16. Será también útil para la prevención de las células de adsorción a una superficie 17.
El protocolo previsto en este trabajo es muy exigente con sus procedimientos de varios pasos. Pasivación de superficies utilizando lípidos PEG 8 y poli-lisina PEG 9 están disponibles como un enfoque alternativo. Dado que, no requieren ningún reacciones químicas de que es fácil de implementar. Sin embargo, el grado de pasivación no sea tan alta como la que se consigue a través de modif químicaicación de una superficie.
The authors have nothing to disclose.
COSUDE, ACH, y CJ fueron apoyados por las subvenciones de inicio (ERC-STG-2012 a 309.509) a través del Consejo Europeo de Investigación. J.-MN fue apoyado por la Fundación Nacional de Investigación (NRF) (2011-0.018.198) de Corea; y el Programa del Centro de Investigación de Pioneer (2012-009586) a través de la NRF de Corea financiado por el Ministerio de Ciencia, TIC, y de Planeamiento del Futuro (MSIP). Este trabajo también fue apoyado por el Centro para la Salud BioNano-Guard financiado por MSIP de Corea como el Proyecto Global Frontier (H-GUARD_2013-M3A6B2078947). YKL y J.-HH fueron apoyados por el Programa de Becas de Ciencias de Seúl de la ciudad de Seúl, Corea. La proteína Rep marcado fue un generoso regalo del doctor Sua Myong.
1. Slide preparation and cleaning | |||
Acetone | Sigma | 32201 | 1 L |
Coverslips | VWR | 631-0136 631-0144 631-0147 | 24x32mm2, 22x40mm2, 24x50mm2 (No.1½, Rectangular) |
Diamond drill bits | MTN-Giethoorn, The Netherlands | LA-0564-00DB | 3/4 mm |
Duran slide holder | LGS, The Netherlands | 213170003 | |
Glass staining dishes | Fisher Scientific | 300101 | |
H2O2 | Boom | 6233905 | Opened bottles should be stored at 4 °C. 1 L, hydrogen peroxide 30% |
H2SO4 | Boom | 80900627.9010 | Sulfuric acid 95-98% |
KOH | Sigma | 30603 | Potassium hydroxide |
Methanol | Sigma | 32213 | 1 L |
Sonicator | Branson | Tabletop ultrasonic cleaner, 3510 | |
Quartz slides | Finkenbeiner | 1” x 3”, 1 mm thick | |
2. Coverslip cleaning | |||
Duran slide holder | LGS, The Netherlands | 213170003 | |
KOH | Sigma | 30603 | Potassium hydroxide |
Sonicator | Branson | Tabletop ultrasonic cleaner, 3510 | |
3. Amino-silanization of slides and coverslips | |||
Acetic acid | Sigma | 320099-500ML | Acetic acid, glacial |
APTES | Sigma-Aldrich | 281778-100ML | Store at the room temperature under N2 . Replace once in a month. 3-aminopropyl trimethoxysilane |
Flask (200mL) | VWR | Flask (200 mL) | Have one flask dedicated for aminosilanization. Pyrex flask |
Methanol | Sigma | 32213 | 1 L |
Sonicator | Branson | Tabletop ultrasonic cleaner, 3510 | |
4. Surface passivation using polymer (the first round) | |||
Biotin-mPEG | Laysan Bio | Biotin-PEG-SVA-5000-100mg | Store aliquots of 1-2 mg (enough for 10 slides) at -20 °C under N2. Biotin-PEG-SVA, MW 5,000 Da |
mPEG | Laysan Bio | MPEG-SVA-5000-1g | Store aliquots of 80 mg (enough for 10 slides) at -20 °C under N2. mPEG-succinimidyl valerate (SVA), MW 5,000 Da |
Sodium bicarbonate | Sigma | S6014-500G | |
6. Surface passivation (the second round) | |||
DMSO | Sigma-Aldrich | D8418-100ML | Dimethyl sulfoxide BioReagent, for molecular biology, ≥99.9% |
DST | Pierce | 20589 | Disuccinimidyl tartarate |
MS4-PEG | Pierce | 22341 | Dissolve 100 mg MS4-PEG in 1.1 mL DMSO. Store 20 mL aliquots at -20 °C. Short NHS-ester PEG, MW 333 Da |
Sodium bicarbonate | Sigma | S6014-500G | |
7. Assembling a microfluidic chamber | |||
Double sticky tape | Scotch | 10mm wide | |
Epoxy | Thorlabs | G14250 | Devcon 5 minute epoxy |
NaCl | Sigma-Aldrich | S9888-1 KG | Sodium chloride |
Neutravidin | Pierce | 31000 | Stock in 5 mg/mL in H2O at 4 °C. ImmunoPure NeutrAvidin Biotin-Binding protein |
Streptavidin | Invitrogen | S-888 | Stock 5 mg/mL in H2O or T50 at 4 °C. |
Trizma base | Sigma-Aldrich | T1503-1 KG | Tris |